MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Pelotomaculum thermopropionicum SI chromosome

Total Repeats: 457

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009454	GGCCG	2	10	8721	8730	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009454	CCGGC	2	10	8781	8790	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3	NC_009454	GTATA	2	10	16492	16501	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009454	TTGAA	2	10	19205	19214	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009454	AGGCA	2	10	26204	26213	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009454	CTCGA	2	10	27937	27946	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_009454	AAAGA	2	10	35380	35389	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009454	AAATA	2	10	46345	46354	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009454	GCAAG	2	10	52718	52727	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009454	AGGGA	2	10	73805	73814	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009454	GGCCG	2	10	107696	107705	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_009454	TGCTA	2	10	109123	109132	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009454	AGGCG	2	10	110873	110882	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009454	AAGGG	2	10	110925	110934	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009454	TAAAA	2	10	123560	123569	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009454	TTTTC	2	10	127387	127396	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009454	ATAAA	2	10	129172	129181	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009454	AAAGA	2	10	157990	157999	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009454	CGGAA	2	10	162781	162790	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009454	CTTCT	2	10	170951	170960	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009454	GGAGC	2	10	171504	171513	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009454	CTTTT	2	10	175946	175955	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009454	ATTTC	2	10	180952	180961	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009454	TTAAA	2	10	185835	185844	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009454	GTTAA	2	10	186026	186035	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009454	GCGGA	2	10	189586	189595	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009454	AAAGG	2	10	190952	190961	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009454	GCCTT	2	10	194757	194766	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_009454	TTATA	2	10	201356	201365	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009454	AAATT	2	10	201526	201535	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009454	GGTTC	2	10	203543	203552	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009454	TATAG	2	10	212090	212099	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009454	GGCCC	2	10	221228	221237	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_009454	AAATT	2	10	223060	223069	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009454	TGCCG	2	10	224611	224620	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_009454	TAATA	2	10	233762	233771	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009454	AATTT	2	10	237294	237303	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009454	CCTGA	2	10	250422	250431	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_009454	TTTTC	2	10	251557	251566	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_009454	TCGTG	2	10	266488	266497	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009454	GGGAG	2	10	267983	267992	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009454	TAAAG	2	10	268311	268320	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009454	AGGGG	2	10	269880	269889	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009454	GACAG	2	10	270076	270085	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_009454	TTAAA	2	10	277006	277015	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009454	TTTAT	2	10	297096	297105	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009454	GGGCG	2	10	309824	309833	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
48	NC_009454	CAAAA	2	10	327169	327178	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009454	CAGCG	2	10	354899	354908	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_009454	TAGAA	2	10	357703	357712	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009454	AAAAT	2	10	359820	359829	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009454	AGTGC	2	10	374262	374271	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009454	ACTAT	2	10	374413	374422	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009454	ACAAA	2	10	374586	374595	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009454	CCATA	2	10	385146	385155	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_009454	GTTAC	2	10	385241	385250	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_009454	ATAAA	2	10	388830	388839	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009454	TGCCG	2	10	403839	403848	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_009454	CGGCT	2	10	406720	406729	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_009454	CGCCC	2	10	414125	414134	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
61	NC_009454	TTCCT	2	10	416117	416126	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_009454	ATTTT	2	10	429489	429498	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009454	CGGAC	2	10	429606	429615	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_009454	CGATA	2	10	435186	435195	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009454	TAATT	2	10	450356	450365	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009454	GCAGG	2	10	453236	453245	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009454	CCGGA	2	10	453375	453384	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_009454	GCGAG	2	10	457701	457710	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009454	AAAGG	2	10	459687	459696	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009454	TTCTT	2	10	460784	460793	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009454	ATGGG	2	10	478350	478359	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009454	AGAAA	2	10	497701	497710	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009454	ATATT	2	10	497804	497813	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009454	GCCCA	2	10	502671	502680	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_009454	AAGGA	2	10	502826	502835	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009454	TTTTC	2	10	507480	507489	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009454	TAAAA	2	10	513648	513657	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009454	TTAAC	2	10	515076	515085	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009454	ATAAA	2	10	530763	530772	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009454	TTCCG	2	10	535645	535654	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_009454	AAAAT	2	10	546108	546117	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009454	ATAAA	2	10	550714	550723	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009454	ATTTA	2	10	550724	550733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009454	TGCAT	2	10	551124	551133	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_009454	AAATT	2	10	569945	569954	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009454	TCATA	2	10	572999	573008	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009454	CATAA	2	10	573694	573703	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_009454	GGTTC	2	10	585626	585635	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_009454	AAATG	2	10	608278	608287	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009454	GCCGC	2	10	608461	608470	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
91	NC_009454	TGTCC	2	10	610279	610288	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_009454	GCTTT	2	10	617831	617840	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_009454	GGTTT	2	10	626195	626204	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009454	TAAAA	2	10	627804	627813	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009454	GCCCC	2	10	629252	629261	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
96	NC_009454	GAAAA	2	10	638331	638340	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009454	ATTAT	2	10	638793	638802	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009454	AGGTT	2	10	638921	638930	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009454	TGTTC	2	10	640715	640724	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_009454	GCTTT	2	10	657063	657072	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_009454	AGAGA	2	10	657131	657140	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009454	GTTTT	2	10	660227	660236	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009454	TAACT	2	10	665038	665047	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_009454	AAATA	2	10	666054	666063	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009454	GCTTT	2	10	670059	670068	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009454	ACTTA	2	10	672974	672983	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009454	ACTTT	2	10	688381	688390	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_009454	GAAAG	2	10	689645	689654	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009454	CTTTT	2	10	744760	744769	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009454	AGGAA	2	10	746125	746134	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009454	CGGGG	2	10	752808	752817	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
112	NC_009454	ATAGT	2	10	758547	758556	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009454	TTATT	2	10	758741	758750	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009454	CCGGG	2	10	758824	758833	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
115	NC_009454	TTATT	2	10	770655	770664	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009454	TATTT	2	10	785265	785274	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009454	GTTTT	2	10	791982	791991	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009454	CCCTG	2	10	791992	792001	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
119	NC_009454	TGCCG	2	10	793931	793940	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_009454	AGTGG	2	10	807629	807638	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009454	ATAAA	2	10	807646	807655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009454	ATAAA	2	10	813214	813223	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009454	TCTTG	2	10	822433	822442	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_009454	CCTTT	2	10	830524	830533	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_009454	CCGGG	2	10	843959	843968	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
126	NC_009454	GCAAA	2	10	848509	848518	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_009454	CGGAA	2	10	857685	857694	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_009454	AAATA	2	10	862448	862457	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009454	ATATT	2	10	872846	872855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009454	CTTTG	2	10	896380	896389	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009454	AAAGT	2	10	901147	901156	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009454	CGTTT	2	10	903670	903679	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_009454	ATCTA	2	10	903976	903985	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_009454	TATTG	2	10	904865	904874	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009454	CGGGC	2	10	914890	914899	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
136	NC_009454	ATATA	2	10	918324	918333	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009454	TTTGC	2	10	924432	924441	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_009454	GTTTT	2	10	927984	927993	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009454	GCAGG	2	10	933831	933840	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
140	NC_009454	TCCGG	2	10	953770	953779	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_009454	GAAAA	2	10	957914	957923	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009454	ATTTT	2	10	957994	958003	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009454	TAAAT	2	10	965261	965270	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009454	AGGCC	2	10	966859	966868	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
145	NC_009454	TTTTC	2	10	969199	969208	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_009454	TTCAG	2	10	970282	970291	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_009454	ATAAA	2	10	971601	971610	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009454	CAATA	2	10	971792	971801	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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289	NC_009454	TACCG	2	10	2006593	2006602	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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291	NC_009454	CTGCG	2	10	2011983	2011992	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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424	NC_009454	TACCA	2	10	2685234	2685243	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
425	NC_009454	ATTAT	2	10	2689333	2689342	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_009454	GGGCA	2	10	2704659	2704668	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
430	NC_009454	GGCAA	2	10	2705563	2705572	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
431	NC_009454	ATTAT	2	10	2707768	2707777	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_009454	ATTAT	2	10	2707779	2707788	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_009454	CCGGC	2	10	2936000	2936009	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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454	NC_009454	TATAA	2	10	2936041	2936050	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_009454	GATAT	2	10	2985791	2985800	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_009454	AAAAG	2	10	3002185	3002194	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.