MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Pseudomonas mendocina ymp chromosome

Total Repeats: 1598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009439	TCGC	2	8	6242	6249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009439	CCGA	2	8	17039	17046	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009439	GCCA	2	8	18999	19006	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009439	TCGC	2	8	19093	19100	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009439	ACCC	2	8	19217	19224	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_009439	TCGG	2	8	19247	19254	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009439	GATG	2	8	20080	20087	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009439	TGGA	2	8	20092	20099	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009439	CGCT	2	8	22812	22819	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009439	CAGT	2	8	26267	26274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009439	CCTG	2	8	26315	26322	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009439	TGGC	2	8	26394	26401	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009439	CAGG	2	8	26404	26411	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009439	GGCA	2	8	30060	30067	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009439	GGCC	2	8	30236	30243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009439	TTGT	2	8	31481	31488	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009439	GCCG	2	8	31566	31573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009439	GATC	2	8	33310	33317	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009439	TACC	2	8	35490	35497	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009439	GGCT	2	8	35661	35668	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009439	TGAA	2	8	35829	35836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009439	TCCA	2	8	36153	36160	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009439	CTTC	2	8	57298	57305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009439	CGGT	2	8	65766	65773	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009439	GTTG	2	8	69620	69627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009439	GGGT	2	8	69661	69668	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009439	GCCG	2	8	71610	71617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009439	AGTG	2	8	73008	73015	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009439	CCGG	2	8	73950	73957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009439	CCTT	2	8	75237	75244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009439	CCAA	2	8	76305	76312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009439	CGCC	2	8	76476	76483	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_009439	CAGC	2	8	79096	79103	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009439	TACG	2	8	80840	80847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009439	CGGC	2	8	83895	83902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009439	CTGG	2	8	84218	84225	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009439	CACT	2	8	97097	97104	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009439	TGGC	2	8	112591	112598	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009439	GGCA	2	8	113053	113060	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009439	TAGA	2	8	113089	113096	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009439	TGGT	2	8	113123	113130	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009439	CAGG	2	8	116867	116874	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009439	CGGG	2	8	119335	119342	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009439	CGTC	2	8	121494	121501	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009439	CGTT	2	8	122680	122687	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009439	CGTT	2	8	122846	122853	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009439	GGGT	2	8	128452	128459	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009439	ACCC	2	8	128509	128516	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_009439	ACGC	2	8	130099	130106	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009439	AAGG	2	8	133809	133816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009439	CCAG	2	8	138521	138528	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009439	TCCC	2	8	155559	155566	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_009439	CTCC	2	8	155631	155638	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_009439	GGTG	2	8	156437	156444	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009439	TCCC	2	8	156647	156654	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_009439	GCCC	2	8	156966	156973	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_009439	TTTC	2	8	164839	164846	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009439	CGGC	2	8	164928	164935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009439	CTTG	2	8	166778	166785	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009439	GCGG	2	8	168044	168051	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009439	GATA	2	8	168074	168081	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009439	AGGC	2	8	174252	174259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009439	TGCG	2	8	179634	179641	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009439	CTTT	2	8	179771	179778	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009439	AAAG	2	8	179787	179794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009439	CAAC	2	8	180475	180482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009439	GAGT	2	8	185673	185680	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009439	CGGT	2	8	188518	188525	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009439	GTGC	2	8	189603	189610	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009439	CGTC	2	8	189728	189735	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009439	CGTG	2	8	198590	198597	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009439	GCTG	2	8	198612	198619	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009439	GCCT	2	8	198699	198706	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009439	CAAA	2	8	198803	198810	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009439	CCAA	2	8	199114	199121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009439	GGAG	2	8	203360	203367	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009439	TCGT	2	8	207659	207666	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009439	TTTC	2	8	207765	207772	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009439	TGCT	2	8	207808	207815	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009439	CTTT	2	8	211103	211110	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009439	GCCG	2	8	220302	220309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009439	GGAA	2	8	221574	221581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009439	GGGC	2	8	222793	222800	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009439	GTGG	2	8	222850	222857	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009439	CCGG	2	8	222887	222894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009439	ACGG	2	8	226757	226764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009439	CGGC	2	8	230159	230166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009439	ACGG	2	8	230332	230339	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009439	GTTG	2	8	232183	232190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009439	TTCA	2	8	233938	233945	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009439	GCTG	2	8	240710	240717	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009439	TTTG	2	8	246604	246611	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009439	GCAG	2	8	246721	246728	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009439	CGCA	2	8	252714	252721	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009439	GCTT	2	8	260063	260070	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009439	TCGG	2	8	260794	260801	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009439	ACCC	2	8	261415	261422	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
98	NC_009439	GATC	2	8	263503	263510	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009439	CCGG	2	8	272667	272674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009439	TAAC	2	8	272701	272708	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009439	TTGT	2	8	273151	273158	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009439	GCCC	2	8	277839	277846	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_009439	CGGG	2	8	279638	279645	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_009439	CGCC	2	8	283902	283909	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
105	NC_009439	CTGC	2	8	285087	285094	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009439	GGCA	2	8	286602	286609	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009439	CCGG	2	8	286672	286679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009439	GCGG	2	8	292754	292761	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009439	TCCC	2	8	292867	292874	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
110	NC_009439	CGCA	2	8	293486	293493	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009439	AGAT	2	8	293561	293568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009439	TGTC	2	8	294196	294203	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009439	GCTG	2	8	303262	303269	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009439	CCCA	2	8	303377	303384	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_009439	GCCC	2	8	306188	306195	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_009439	ATTC	2	8	316104	316111	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009439	CGCT	2	8	317571	317578	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009439	GCCC	2	8	317691	317698	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
119	NC_009439	CGGG	2	8	320155	320162	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009439	GTTC	2	8	321767	321774	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009439	GCGG	2	8	321803	321810	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009439	ATGG	2	8	321871	321878	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009439	CTGG	2	8	327299	327306	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009439	CATT	2	8	327309	327316	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009439	CGGT	2	8	329764	329771	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009439	GGCA	2	8	330964	330971	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009439	GGGA	2	8	331505	331512	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009439	AGGC	2	8	334822	334829	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_009439	CTCA	2	8	336525	336532	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009439	TGCG	2	8	336915	336922	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009439	GGCA	2	8	337493	337500	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009439	GGAT	2	8	344937	344944	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009439	GGTT	2	8	346960	346967	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009439	GGCA	2	8	347040	347047	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009439	CGGC	2	8	347065	347072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009439	TCTG	2	8	348742	348749	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009439	GCCT	2	8	348886	348893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_009439	CAGC	2	8	348949	348956	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009439	GGGC	2	8	349163	349170	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009439	CGGC	2	8	350583	350590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009439	CGGC	2	8	350602	350609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009439	AGCC	2	8	352101	352108	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_009439	CGCC	2	8	353293	353300	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_009439	GACC	2	8	363361	363368	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009439	TCGG	2	8	365107	365114	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_009439	GAGC	2	8	370608	370615	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009439	CGCT	2	8	370652	370659	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_009439	CACT	2	8	372078	372085	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_009439	CGAT	2	8	378721	378728	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_009439	AGCG	2	8	388074	388081	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_009439	TTTC	2	8	389627	389634	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_009439	GCCT	2	8	390027	390034	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_009439	GCTT	2	8	393309	393316	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_009439	TCGA	2	8	416766	416773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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171	NC_009439	AAAC	2	8	468127	468134	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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176	NC_009439	CTGC	2	8	491592	491599	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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179	NC_009439	GCAG	2	8	509261	509268	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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181	NC_009439	GGAT	2	8	509426	509433	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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