MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Pseudomonas fluorescens Pf0-1 chromosome

Total Repeats: 1932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007492	AAGC	2	8	67	74	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007492	CCAA	2	8	89	96	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007492	CTGT	2	8	220	227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007492	GTCG	2	8	430	437	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007492	AAAT	2	8	9344	9351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007492	GAGC	2	8	20117	20124	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007492	CCCG	2	8	32849	32856	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_007492	AAAC	2	8	36598	36605	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007492	GTCA	2	8	38523	38530	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_007492	GCGG	2	8	45991	45998	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_007492	GGCA	2	8	47589	47596	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007492	GGTT	2	8	47627	47634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007492	TACG	2	8	47679	47686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007492	CGCA	2	8	47761	47768	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007492	CGGG	2	8	54261	54268	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007492	CAGA	2	8	58821	58828	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007492	GCAC	2	8	58952	58959	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007492	CAGC	2	8	59905	59912	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007492	GGGA	2	8	60796	60803	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007492	AAAT	2	8	71417	71424	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007492	CTCC	2	8	75314	75321	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_007492	CCGA	2	8	75479	75486	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007492	CTCC	2	8	75591	75598	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_007492	AGTG	2	8	79562	79569	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007492	CGGC	2	8	86825	86832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007492	GTCA	2	8	87685	87692	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_007492	CTTC	2	8	95786	95793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007492	TTTC	2	8	98869	98876	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_007492	ATTA	2	8	103917	103924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007492	CAAC	2	8	104355	104362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007492	CAAA	2	8	113975	113982	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007492	GTCT	2	8	117270	117277	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007492	ACTC	2	8	118400	118407	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007492	GAAA	2	8	120908	120915	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007492	AGGA	2	8	122168	122175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007492	GCCT	2	8	123217	123224	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007492	GTTC	2	8	123346	123353	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007492	GCGA	2	8	123759	123766	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007492	TGAC	2	8	123939	123946	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007492	ACTG	2	8	124220	124227	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007492	CGTC	2	8	124463	124470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007492	AAAG	2	8	124586	124593	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007492	GTTG	2	8	124951	124958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007492	GACA	2	8	125851	125858	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007492	AGCC	2	8	128183	128190	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007492	CTGC	2	8	132565	132572	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_007492	TCAA	2	8	140205	140212	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007492	TGAA	2	8	140587	140594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007492	GGGA	2	8	140910	140917	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007492	TCAC	2	8	165979	165986	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007492	GATT	2	8	166179	166186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007492	TGCG	2	8	169901	169908	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007492	AATC	2	8	169909	169916	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007492	TCCT	2	8	187729	187736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007492	GGGC	2	8	191853	191860	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_007492	GCGG	2	8	191884	191891	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_007492	CGGC	2	8	192236	192243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_007492	TTTG	2	8	210919	210926	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007492	GCCA	2	8	212683	212690	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007492	GGCA	2	8	224739	224746	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007492	AGGG	2	8	228350	228357	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007492	GAGC	2	8	238375	238382	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007492	GCTC	2	8	238968	238975	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007492	CAGG	2	8	238979	238986	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_007492	CTCC	2	8	246797	246804	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_007492	GGGC	2	8	246816	246823	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007492	ATAG	2	8	253294	253301	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007492	CATG	2	8	256105	256112	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007492	ATAA	3	12	257165	257176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007492	TAAG	2	8	259768	259775	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007492	TGCC	2	8	265847	265854	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007492	TCCT	2	8	270056	270063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007492	AGGA	2	8	270181	270188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007492	TACC	2	8	284164	284171	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007492	TAAA	2	8	284260	284267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007492	GGTT	2	8	284306	284313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007492	GTTA	2	8	285300	285307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007492	TCCA	2	8	285543	285550	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007492	GAGC	2	8	288035	288042	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007492	TCTG	2	8	290172	290179	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_007492	TTCA	2	8	290310	290317	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_007492	CTCG	2	8	294058	294065	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007492	AGAT	2	8	298788	298795	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007492	CTCC	2	8	298930	298937	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_007492	ATAA	2	8	302583	302590	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007492	GCTC	2	8	308399	308406	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007492	TGAA	2	8	316140	316147	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007492	CTTG	2	8	317543	317550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_007492	TTGA	2	8	318896	318903	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007492	TGGC	2	8	318976	318983	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_007492	GCCA	2	8	319329	319336	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_007492	GAAA	2	8	320302	320309	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007492	GCTC	2	8	329775	329782	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_007492	GAGC	2	8	329810	329817	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_007492	AGGG	2	8	340914	340921	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007492	AACA	2	8	341212	341219	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_007492	TTCT	2	8	346038	346045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_007492	ATTG	2	8	350415	350422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007492	ACCT	2	8	351476	351483	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007492	GAGG	2	8	351791	351798	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007492	GGGC	2	8	354166	354173	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_007492	GGCA	2	8	356960	356967	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_007492	TTGG	2	8	358585	358592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007492	TCGT	2	8	358877	358884	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_007492	ACCC	2	8	362609	362616	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
106	NC_007492	AATT	2	8	363735	363742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007492	TGGC	2	8	367652	367659	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_007492	AGTC	2	8	374816	374823	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_007492	CGAA	2	8	377035	377042	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_007492	GGCG	2	8	378372	378379	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_007492	GCCC	2	8	378407	378414	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
112	NC_007492	GCCT	2	8	382372	382379	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007492	CGGG	2	8	382398	382405	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007492	CCTG	2	8	382451	382458	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007492	GCCT	2	8	382517	382524	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007492	GGGT	2	8	382543	382550	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007492	CTTT	2	8	388126	388133	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007492	GGAG	2	8	393420	393427	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007492	TCGG	2	8	393533	393540	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_007492	CATT	2	8	394173	394180	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_007492	CGCT	2	8	394285	394292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_007492	AGCC	2	8	405916	405923	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007492	TGCC	2	8	408413	408420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007492	TGTA	2	8	410065	410072	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007492	GGTT	2	8	410174	410181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007492	TTGA	2	8	414532	414539	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007492	GGCC	2	8	416259	416266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007492	GCTC	2	8	416280	416287	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_007492	GAGC	2	8	416315	416322	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_007492	CTCC	2	8	419700	419707	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
131	NC_007492	CGTT	2	8	425482	425489	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_007492	GGAG	2	8	430128	430135	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007492	GGCC	2	8	436738	436745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_007492	TTTG	2	8	443408	443415	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007492	GATT	2	8	448709	448716	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007492	GCAG	2	8	453890	453897	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_007492	CGGT	2	8	456209	456216	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_007492	GGCC	2	8	458933	458940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_007492	GAAT	2	8	461488	461495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007492	GCGA	2	8	467133	467140	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007492	GCAA	2	8	470219	470226	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_007492	GTCT	2	8	499681	499688	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_007492	CAAG	2	8	506007	506014	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_007492	GGAG	2	8	507939	507946	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007492	CGCA	2	8	509850	509857	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_007492	CTTG	2	8	518703	518710	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_007492	ACGT	2	8	519000	519007	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_007492	CGCC	2	8	520690	520697	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
149	NC_007492	GACC	2	8	524122	524129	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_007492	CTCC	2	8	524252	524259	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
151	NC_007492	CCAC	2	8	524310	524317	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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464	NC_007492	TTGT	2	8	1538426	1538433	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_007492	CTGA	2	8	1570178	1570185	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
474	NC_007492	ACGG	2	8	1572287	1572294	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
475	NC_007492	TGCC	2	8	1572340	1572347	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
476	NC_007492	CGGG	2	8	1584264	1584271	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_007492	CAGG	2	8	1613449	1613456	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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486	NC_007492	GCTC	2	8	1616641	1616648	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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488	NC_007492	AGCG	2	8	1618351	1618358	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
489	NC_007492	ATTA	2	8	1618845	1618852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_007492	CTTT	2	8	1622625	1622632	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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496	NC_007492	CACT	2	8	1636401	1636408	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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498	NC_007492	AAGA	2	8	1646374	1646381	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
499	NC_007492	AGCC	2	8	1647576	1647583	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
500	NC_007492	GCGA	2	8	1654629	1654636	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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