MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Photobacterium profundum SS9 chromosome 1

Total Repeats: 15277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006370	ATA	2	6	1200990	1200995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_006370	AAG	2	6	1200996	1201001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_006370	TGG	2	6	1201017	1201022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_006370	A	6	6	1201025	1201030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_006370	TCA	2	6	1201031	1201036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_006370	ATT	2	6	1201047	1201052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_006370	A	6	6	1201066	1201071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_006370	TTG	2	6	1201083	1201088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_006370	AAG	2	6	1201212	1201217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_006370	TA	3	6	1201274	1201279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_006370	G	7	7	1201309	1201315	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_006370	CTT	2	6	1201327	1201332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_006370	GTA	2	6	1201397	1201402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_006370	ACC	2	6	1201450	1201455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_006370	TGG	2	6	1201458	1201463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_006370	TAAAG	2	10	1203017	1203026	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_006370	T	6	6	1203059	1203064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_006370	ATT	2	6	1203103	1203108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_006370	ATT	2	6	1203146	1203151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_006370	TC	3	6	1203158	1203163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4021	NC_006370	CGTA	2	8	1203837	1203844	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4022	NC_006370	A	6	6	1203862	1203867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_006370	ATA	2	6	1206166	1206171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_006370	ATG	2	6	1206303	1206308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_006370	A	6	6	1211471	1211476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_006370	TTTAT	2	10	1211512	1211521	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_006370	TCC	2	6	1211566	1211571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_006370	GAT	3	9	1211587	1211595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_006370	ATT	2	6	1211628	1211633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_006370	GTATA	2	10	1211640	1211649	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_006370	GT	3	6	1211666	1211671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_006370	ATT	2	6	1211742	1211747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_006370	GAG	2	6	1211807	1211812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_006370	GAT	2	6	1211853	1211858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_006370	TAA	2	6	1211881	1211886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_006370	T	6	6	1211890	1211895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_006370	TTG	2	6	1211908	1211913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_006370	TTC	2	6	1211923	1211928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_006370	TTG	4	12	1211938	1211949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_006370	T	6	6	1212001	1212006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_006370	GTT	2	6	1212009	1212014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_006370	ATT	2	6	1212034	1212039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_006370	TGT	2	6	1212078	1212083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_006370	AAC	2	6	1212108	1212113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_006370	T	6	6	1212121	1212126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_006370	T	6	6	1212133	1212138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_006370	GTAT	2	8	1212139	1212146	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_006370	AGTA	2	8	1212153	1212160	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_006370	GGC	2	6	1212181	1212186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_006370	AAT	2	6	1212199	1212204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_006370	AAGT	2	8	1212227	1212234	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_006370	TGC	2	6	1212293	1212298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_006370	GAA	2	6	1214086	1214091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_006370	TAA	2	6	1214125	1214130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_006370	TGA	2	6	1214134	1214139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_006370	GATT	2	8	1214281	1214288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_006370	ATA	2	6	1214303	1214308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_006370	TGT	2	6	1214326	1214331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_006370	AT	3	6	1214343	1214348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_006370	AGG	3	9	1214377	1214385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_006370	T	7	7	1215281	1215287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_006370	TAA	2	6	1216683	1216688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_006370	GTAC	2	8	1216793	1216800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4064	NC_006370	AC	3	6	1218218	1218223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4065	NC_006370	GTAA	2	8	1218227	1218234	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_006370	GT	3	6	1218237	1218242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_006370	ATG	2	6	1218255	1218260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_006370	TAT	2	6	1218533	1218538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_006370	C	6	6	1218571	1218576	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4070	NC_006370	ATT	2	6	1218604	1218609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_006370	ATA	2	6	1218617	1218622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_006370	AATA	2	8	1219708	1219715	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_006370	A	6	6	1219785	1219790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_006370	T	6	6	1219835	1219840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_006370	TTG	2	6	1219842	1219847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_006370	TTGA	2	8	1219856	1219863	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_006370	AAAT	2	8	1219886	1219893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_006370	ACAA	2	8	1219899	1219906	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4079	NC_006370	TTC	2	6	1220747	1220752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_006370	A	8	8	1220763	1220770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_006370	CAT	2	6	1220813	1220818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_006370	AGG	2	6	1220826	1220831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_006370	TTA	2	6	1220832	1220837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_006370	T	6	6	1220899	1220904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_006370	TAA	2	6	1221608	1221613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_006370	A	6	6	1221612	1221617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_006370	CTT	2	6	1221626	1221631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_006370	CATT	2	8	1221657	1221664	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4089	NC_006370	GGA	2	6	1221713	1221718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_006370	ATT	2	6	1221732	1221737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_006370	ATG	2	6	1221743	1221748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_006370	AGA	2	6	1221790	1221795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_006370	CCA	2	6	1221801	1221806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4094	NC_006370	TCGT	2	8	1221848	1221855	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4095	NC_006370	TAA	2	6	1221859	1221864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_006370	T	6	6	1221984	1221989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_006370	ACTT	2	8	1222050	1222057	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_006370	AATT	2	8	1222166	1222173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_006370	TG	3	6	1222221	1222226	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_006370	TTG	2	6	1222235	1222240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_006370	GCC	2	6	1222261	1222266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_006370	ATT	2	6	1225053	1225058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_006370	TGG	2	6	1225072	1225077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_006370	T	7	7	1225079	1225085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_006370	TGC	2	6	1225133	1225138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_006370	AT	3	6	1225893	1225898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_006370	ATTG	2	8	1225912	1225919	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_006370	TAA	2	6	1225954	1225959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_006370	ATG	2	6	1226006	1226011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_006370	AAAT	2	8	1226021	1226028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_006370	GTAG	2	8	1226053	1226060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_006370	GCA	2	6	1226672	1226677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_006370	GGTA	2	8	1226699	1226706	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_006370	AGG	2	6	1226722	1226727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_006370	A	6	6	1226742	1226747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_006370	TCA	2	6	1229307	1229312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_006370	TC	3	6	1230093	1230098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4118	NC_006370	AGA	2	6	1230101	1230106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_006370	GCG	2	6	1230125	1230130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_006370	A	7	7	1230143	1230149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_006370	AAAAT	2	10	1231159	1231168	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_006370	TGT	2	6	1231938	1231943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_006370	TAA	3	9	1232022	1232030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_006370	AAC	2	6	1232038	1232043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_006370	GAA	2	6	1232067	1232072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_006370	CCG	2	6	1232074	1232079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_006370	CT	3	6	1232981	1232986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4128	NC_006370	AAG	2	6	1233081	1233086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_006370	T	7	7	1233132	1233138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_006370	GAAT	2	8	1233221	1233228	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_006370	GTA	2	6	1235115	1235120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_006370	TGGT	2	8	1235955	1235962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_006370	ACGA	2	8	1235984	1235991	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4134	NC_006370	AAT	2	6	1236530	1236535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_006370	TTGC	2	8	1236542	1236549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4136	NC_006370	AGC	2	6	1236572	1236577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4137	NC_006370	GCT	2	6	1236583	1236588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4138	NC_006370	AT	3	6	1236619	1236624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_006370	ATA	2	6	1236655	1236660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_006370	GTTA	2	8	1236662	1236669	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4141	NC_006370	TTA	2	6	1236672	1236677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4142	NC_006370	TAAA	2	8	1236685	1236692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_006370	CAA	2	6	1236704	1236709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4145	NC_006370	T	6	6	1238197	1238202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4146	NC_006370	GAAT	2	8	1238215	1238222	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4147	NC_006370	ATC	2	6	1238223	1238228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4148	NC_006370	ATCC	2	8	1238268	1238275	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4149	NC_006370	TGT	2	6	1240024	1240029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4150	NC_006370	AGGCA	2	10	1240035	1240044	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4151	NC_006370	TTAT	2	8	1240046	1240053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4152	NC_006370	CAA	2	6	1240100	1240105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4153	NC_006370	TGT	2	6	1240154	1240159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4155	NC_006370	TAGC	2	8	1240297	1240304	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4160	NC_006370	TGGA	2	8	1240651	1240658	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4161	NC_006370	TCTA	2	8	1240665	1240672	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4166	NC_006370	GGTA	2	8	1240824	1240831	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4167	NC_006370	GT	3	6	1240876	1240881	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4168	NC_006370	TGC	2	6	1240889	1240894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4170	NC_006370	TC	3	6	1241040	1241045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4171	NC_006370	CTTT	2	8	1243178	1243185	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4175	NC_006370	AAC	2	6	1243262	1243267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4177	NC_006370	ATT	2	6	1243388	1243393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4204	NC_006370	GGCTT	2	10	1250307	1250316	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4211	NC_006370	T	8	8	1250495	1250502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4212	NC_006370	T	7	7	1250506	1250512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4213	NC_006370	TGT	2	6	1250514	1250519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4219	NC_006370	T	7	7	1251908	1251914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4221	NC_006370	CAT	2	6	1251948	1251953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4249	NC_006370	AT	3	6	1253604	1253609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4252	NC_006370	A	6	6	1255545	1255550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4254	NC_006370	A	7	7	1259511	1259517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_006370	ATTA	2	8	1259544	1259551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_006370	TTA	2	6	1259629	1259634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_006370	TAAT	2	8	1259779	1259786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_006370	AT	3	6	1259799	1259804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_006370	TTAA	2	8	1259811	1259818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_006370	TAAA	2	8	1259839	1259846	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_006370	ACAA	2	8	1259872	1259879	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4262	NC_006370	TAT	2	6	1262028	1262033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_006370	AT	3	6	1262036	1262041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_006370	ATC	3	9	1263582	1263590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4265	NC_006370	T	6	6	1263594	1263599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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