MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Pyrobaculum aerophilum str. IM2 chromosome

Total Repeats: 5276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_003364	GCTGG	2	10	1197399	1197408	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3002	NC_003364	AAC	2	6	1197428	1197433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_003364	AAT	2	6	1197454	1197459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_003364	CGT	2	6	1197468	1197473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_003364	ATA	2	6	1200226	1200231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_003364	AGT	2	6	1203551	1203556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_003364	GCCCA	2	10	1203596	1203605	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3008	NC_003364	CGC	2	6	1203608	1203613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_003364	GGC	2	6	1203638	1203643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_003364	CGG	2	6	1203662	1203667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_003364	TCC	2	6	1203695	1203700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3012	NC_003364	CCG	2	6	1203712	1203717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_003364	CTC	2	6	1203738	1203743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_003364	GCC	2	6	1203766	1203771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_003364	CTC	2	6	1203799	1203804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_003364	CGTA	2	8	1203825	1203832	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3017	NC_003364	GTGA	2	8	1203846	1203853	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_003364	T	6	6	1204230	1204235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_003364	TTA	2	6	1204248	1204253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_003364	TACTT	2	10	1205761	1205770	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3021	NC_003364	AGA	2	6	1205791	1205796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_003364	C	6	6	1205885	1205890	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3023	NC_003364	AT	3	6	1205906	1205911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_003364	CCGT	2	8	1206960	1206967	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3025	NC_003364	AGCA	2	8	1206980	1206987	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3026	NC_003364	ATA	2	6	1207006	1207011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_003364	TAC	2	6	1207025	1207030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_003364	TTG	2	6	1207033	1207038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_003364	TAC	2	6	1207052	1207057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_003364	TAG	2	6	1207108	1207113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_003364	CCT	2	6	1207173	1207178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3032	NC_003364	AT	3	6	1208050	1208055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_003364	A	6	6	1208138	1208143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_003364	TTA	2	6	1208182	1208187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3036	NC_003364	TAA	2	6	1208210	1208215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_003364	AT	3	6	1208234	1208239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_003364	TAA	2	6	1208241	1208246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_003364	ATA	2	6	1208253	1208258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_003364	TTAA	2	8	1208259	1208266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3042	NC_003364	GAA	2	6	1208346	1208351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_003364	AT	3	6	1208536	1208541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_003364	AAAAG	2	10	1208562	1208571	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_003364	AAAAAT	2	12	1208576	1208587	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_003364	AAT	2	6	1208615	1208620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3048	NC_003364	TAA	2	6	1208660	1208665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_003364	AT	3	6	1208686	1208691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_003364	TGA	2	6	1208742	1208747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_003364	A	6	6	1208752	1208757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_003364	GTA	2	6	1208769	1208774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3054	NC_003364	TA	4	8	1208818	1208825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_003364	AT	4	8	1208842	1208849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_003364	AAAT	2	8	1210006	1210013	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_003364	T	6	6	1213054	1213059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_003364	T	6	6	1217412	1217417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_003364	AC	3	6	1217456	1217461	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3060	NC_003364	TC	3	6	1217506	1217511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3061	NC_003364	C	6	6	1217556	1217561	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3062	NC_003364	C	6	6	1217654	1217659	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3063	NC_003364	CAC	2	6	1217661	1217666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3064	NC_003364	ATT	2	6	1217682	1217687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_003364	CAGC	2	8	1217699	1217706	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3066	NC_003364	CGA	2	6	1217883	1217888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_003364	C	13	13	1217896	1217908	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3068	NC_003364	GAAGGA	2	12	1217923	1217934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_003364	GA	3	6	1218585	1218590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_003364	TCT	2	6	1218644	1218649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3072	NC_003364	TG	3	6	1218746	1218751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_003364	AGGGC	2	10	1218787	1218796	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3074	NC_003364	TAG	2	6	1218895	1218900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3076	NC_003364	TAG	2	6	1218969	1218974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3079	NC_003364	TGA	2	6	1219077	1219082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_003364	AAT	2	6	1219726	1219731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_003364	TAA	2	6	1220987	1220992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_003364	TA	4	8	1221710	1221717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_003364	GTA	2	6	1221722	1221727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_003364	CGG	2	6	1222994	1222999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3086	NC_003364	CG	3	6	1223868	1223873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3087	NC_003364	GTT	2	6	1223907	1223912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_003364	T	6	6	1223966	1223971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_003364	AGAC	2	8	1225296	1225303	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3090	NC_003364	TGT	2	6	1225324	1225329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_003364	ACC	2	6	1225345	1225350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3092	NC_003364	C	6	6	1225887	1225892	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3093	NC_003364	C	12	12	1225895	1225906	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3094	NC_003364	AATG	2	8	1225986	1225993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_003364	CCGG	2	8	1226011	1226018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3096	NC_003364	TAC	2	6	1226070	1226075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_003364	TA	3	6	1226141	1226146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_003364	TTC	2	6	1226152	1226157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_003364	TAA	2	6	1231113	1231118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_003364	TATT	2	8	1232908	1232915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_003364	GAG	2	6	1233434	1233439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_003364	CA	3	6	1233489	1233494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_003364	GCC	2	6	1233544	1233549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_003364	CAGG	2	8	1233619	1233626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3105	NC_003364	AC	3	6	1233631	1233636	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_003364	AT	3	6	1233666	1233671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_003364	TGCA	2	8	1233673	1233680	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3108	NC_003364	ACT	2	6	1233684	1233689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_003364	CT	3	6	1233698	1233703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3110	NC_003364	CTC	2	6	1233726	1233731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3111	NC_003364	CT	3	6	1233738	1233743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_003364	GGT	2	6	1233853	1233858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_003364	GAT	2	6	1233880	1233885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_003364	AT	3	6	1233933	1233938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_003364	TA	3	6	1234002	1234007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_003364	TA	3	6	1234025	1234030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_003364	AACT	2	8	1234048	1234055	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3118	NC_003364	AT	3	6	1235202	1235207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_003364	TCG	2	6	1236279	1236284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_003364	TAT	2	6	1238256	1238261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_003364	GCC	2	6	1238269	1238274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3122	NC_003364	CG	3	6	1238282	1238287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_003364	GCG	2	6	1238302	1238307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_003364	ACA	2	6	1238333	1238338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_003364	GAAG	2	8	1238411	1238418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_003364	ACA	2	6	1238456	1238461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_003364	ATAA	2	8	1238465	1238472	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_003364	CAG	2	6	1238484	1238489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_003364	A	7	7	1238500	1238506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_003364	ATA	2	6	1238552	1238557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_003364	A	6	6	1238570	1238575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_003364	ACG	2	6	1238993	1238998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_003364	GGC	2	6	1239096	1239101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_003364	GCC	2	6	1239105	1239110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3135	NC_003364	CCGG	2	8	1239118	1239125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3136	NC_003364	ATT	2	6	1239137	1239142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_003364	CTTG	2	8	1239176	1239183	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3138	NC_003364	TC	3	6	1239189	1239194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3139	NC_003364	TTA	2	6	1239524	1239529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3141	NC_003364	TGTA	2	8	1240078	1240085	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_003364	ATT	2	6	1240089	1240094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_003364	TGT	2	6	1240101	1240106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3147	NC_003364	AGG	2	6	1242937	1242942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3148	NC_003364	TCA	2	6	1243013	1243018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3149	NC_003364	TAT	2	6	1244262	1244267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3150	NC_003364	CT	3	6	1244281	1244286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3151	NC_003364	TC	3	6	1244287	1244292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3152	NC_003364	CCG	2	6	1244334	1244339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3155	NC_003364	TGG	2	6	1244469	1244474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3164	NC_003364	CCT	2	6	1250118	1250123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3165	NC_003364	AGG	2	6	1250139	1250144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3166	NC_003364	CTC	3	9	1251441	1251449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3167	NC_003364	CTT	2	6	1251450	1251455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3168	NC_003364	CTCCA	2	10	1251457	1251466	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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3230	NC_003364	AT	3	6	1275974	1275979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3231	NC_003364	AAC	2	6	1279041	1279046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3234	NC_003364	CCCCG	2	10	1279269	1279278	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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3237	NC_003364	TAC	2	6	1279363	1279368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3248	NC_003364	CTCTT	2	10	1281523	1281532	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3249	NC_003364	AC	3	6	1281580	1281585	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3250	NC_003364	AAT	2	6	1281592	1281597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_003364	CAGC	2	8	1281651	1281658	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3252	NC_003364	CTT	2	6	1281715	1281720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3253	NC_003364	GGA	2	6	1281750	1281755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3254	NC_003364	GTG	2	6	1281775	1281780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_003364	GCC	3	9	1281808	1281816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3256	NC_003364	AAG	2	6	1281896	1281901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3258	NC_003364	GGC	2	6	1281957	1281962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3259	NC_003364	TGTT	2	8	1282013	1282020	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_003364	ACTGG	2	10	1282830	1282839	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3261	NC_003364	CAT	2	6	1282889	1282894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3262	NC_003364	GGC	2	6	1282905	1282910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3263	NC_003364	CAAA	2	8	1282922	1282929	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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