MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Pyrobaculum aerophilum str. IM2 chromosome

Total Repeats: 5276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_003364	TA	3	6	579552	579557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_003364	AG	3	6	581029	581034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_003364	GAG	2	6	581059	581064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_003364	GCG	2	6	581093	581098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_003364	GTG	2	6	581152	581157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_003364	TAG	2	6	581166	581171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_003364	CAG	2	6	581201	581206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_003364	CGG	2	6	581208	581213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_003364	GAG	2	6	581219	581224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_003364	CG	3	6	581254	581259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_003364	TGG	2	6	581263	581268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_003364	ATC	2	6	582590	582595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_003364	GCC	2	6	582631	582636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_003364	GGT	2	6	582693	582698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_003364	A	7	7	582737	582743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_003364	TGA	2	6	584276	584281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_003364	CGG	3	9	584311	584319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_003364	AGT	2	6	584320	584325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_003364	TTCT	2	8	584445	584452	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1520	NC_003364	GCC	2	6	587179	587184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_003364	GCG	2	6	587244	587249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_003364	GCC	2	6	587253	587258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_003364	CGG	2	6	587268	587273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_003364	TA	3	6	587293	587298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_003364	AAT	2	6	587310	587315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_003364	TA	3	6	591472	591477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_003364	CTC	2	6	591503	591508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_003364	CCCCG	2	10	591596	591605	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1529	NC_003364	ACC	3	9	591626	591634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_003364	CAGT	2	8	591668	591675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1531	NC_003364	TGT	2	6	591741	591746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_003364	TTC	2	6	591764	591769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_003364	GAGG	2	8	591770	591777	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_003364	TTC	2	6	591829	591834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_003364	CCCCGG	2	12	591846	591857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_003364	TTC	2	6	591896	591901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_003364	TTC	2	6	591963	591968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_003364	GAA	2	6	591983	591988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_003364	AGA	2	6	591994	591999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_003364	TTC	2	6	592025	592030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_003364	GAA	2	6	592056	592061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_003364	TTC	2	6	592092	592097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_003364	CTT	2	6	592105	592110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_003364	TTC	2	6	592154	592159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_003364	CAG	2	6	592160	592165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_003364	TTC	2	6	592215	592220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_003364	T	6	6	592264	592269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_003364	TCC	2	6	592285	592290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_003364	CGG	2	6	592292	592297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_003364	CGG	2	6	592309	592314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_003364	AAG	2	6	592347	592352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_003364	AG	3	6	592510	592515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_003364	GT	3	6	592516	592521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_003364	ATGC	2	8	592569	592576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_003364	GCG	2	6	592616	592621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_003364	TGT	2	6	592646	592651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_003364	GGC	2	6	592663	592668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_003364	GC	3	6	592808	592813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_003364	ATT	2	6	592831	592836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_003364	CGG	2	6	592970	592975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_003364	CG	3	6	593583	593588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_003364	TA	3	6	593868	593873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_003364	A	6	6	593882	593887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_003364	TAA	2	6	593888	593893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_003364	AAT	2	6	596196	596201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_003364	GGC	2	6	596221	596226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_003364	ACA	2	6	596237	596242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_003364	GC	3	6	596275	596280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_003364	TTG	2	6	596282	596287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_003364	C	6	6	596321	596326	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1571	NC_003364	GAA	2	6	596408	596413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_003364	CGT	2	6	596635	596640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_003364	CG	3	6	596678	596683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_003364	AGTA	2	8	597487	597494	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_003364	TAC	2	6	597935	597940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1578	NC_003364	TAT	2	6	598840	598845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_003364	GCC	2	6	598904	598909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_003364	T	6	6	598922	598927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_003364	AT	3	6	601615	601620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_003364	A	6	6	601660	601665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_003364	TTA	2	6	601666	601671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_003364	GTCT	2	8	603606	603613	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1587	NC_003364	ACT	2	6	603739	603744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1589	NC_003364	TA	3	6	603897	603902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_003364	TTC	2	6	603909	603914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_003364	AAT	2	6	603941	603946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_003364	AAC	2	6	604129	604134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_003364	GCTA	2	8	604226	604233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1594	NC_003364	GGT	2	6	604245	604250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_003364	T	8	8	604267	604274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_003364	GGT	2	6	604299	604304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_003364	GTTAAC	2	12	604308	604319	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1598	NC_003364	CTA	2	6	604473	604478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_003364	ATG	2	6	604484	604489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_003364	T	6	6	606127	606132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_003364	TC	3	6	607794	607799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_003364	CGGG	2	8	607837	607844	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1603	NC_003364	T	6	6	607862	607867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_003364	AAT	2	6	609068	609073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_003364	AT	3	6	609079	609084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_003364	GCT	2	6	612054	612059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_003364	AT	3	6	612060	612065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_003364	CAG	2	6	612068	612073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_003364	A	7	7	612113	612119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_003364	TCT	2	6	612127	612132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_003364	AAC	2	6	614042	614047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_003364	T	6	6	614424	614429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_003364	CGGG	2	8	614447	614454	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1614	NC_003364	TAA	2	6	614487	614492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_003364	T	6	6	614545	614550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_003364	TTG	2	6	614581	614586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_003364	TCC	2	6	617257	617262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_003364	CCG	2	6	617266	617271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1619	NC_003364	A	6	6	617275	617280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_003364	AGG	2	6	617325	617330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_003364	GAC	2	6	617378	617383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_003364	CGG	2	6	618473	618478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_003364	CTT	2	6	618585	618590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_003364	CAG	2	6	620295	620300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_003364	AAG	2	6	620320	620325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_003364	AT	3	6	620351	620356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_003364	CCT	2	6	621126	621131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_003364	GCC	2	6	621174	621179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1629	NC_003364	TAA	2	6	621195	621200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_003364	GCC	2	6	621202	621207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_003364	CGG	2	6	621254	621259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_003364	A	6	6	621279	621284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_003364	CCT	2	6	621332	621337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1634	NC_003364	CGC	2	6	621404	621409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1635	NC_003364	TCC	2	6	621456	621461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1637	NC_003364	T	6	6	621645	621650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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