MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Pyrobaculum aerophilum str. IM2 chromosome

Total Repeats: 5276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003364	GTA	2	6	165511	165516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_003364	CT	3	6	165525	165530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
503	NC_003364	ACT	2	6	165582	165587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_003364	TAA	2	6	165620	165625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_003364	GAG	2	6	165631	165636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_003364	GAGG	2	8	165642	165649	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
507	NC_003364	GAG	2	6	165654	165659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_003364	GA	3	6	165808	165813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_003364	AG	3	6	165834	165839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
510	NC_003364	GAG	2	6	165848	165853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_003364	TGG	2	6	165861	165866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_003364	GCG	2	6	165875	165880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_003364	TTC	2	6	166176	166181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_003364	GGT	2	6	166190	166195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_003364	TA	3	6	166423	166428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_003364	AT	4	8	166438	166445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_003364	CCTG	2	8	167428	167435	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
518	NC_003364	CCT	2	6	167974	167979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_003364	CTC	2	6	167983	167988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_003364	CGC	2	6	167992	167997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_003364	CAA	2	6	169270	169275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_003364	GAA	2	6	169311	169316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_003364	AGA	2	6	169330	169335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_003364	AG	3	6	169338	169343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
525	NC_003364	CTC	2	6	171364	171369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_003364	CCT	2	6	171393	171398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_003364	CAA	2	6	171567	171572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_003364	CTC	2	6	171583	171588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_003364	AAC	2	6	171635	171640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_003364	AAAT	2	8	171646	171653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_003364	TAA	2	6	171672	171677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_003364	GCG	2	6	171690	171695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_003364	TC	3	6	172143	172148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_003364	TTA	2	6	173226	173231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_003364	TGG	2	6	173287	173292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_003364	CGC	2	6	173302	173307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_003364	AC	3	6	173319	173324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
538	NC_003364	TATC	2	8	173331	173338	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
539	NC_003364	CG	3	6	173362	173367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
540	NC_003364	CT	3	6	174193	174198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_003364	AAT	2	6	174201	174206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_003364	CTG	2	6	174218	174223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_003364	TAC	2	6	175160	175165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_003364	TAT	2	6	175322	175327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_003364	GTA	2	6	175343	175348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_003364	CGG	3	9	175404	175412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_003364	TAT	2	6	175472	175477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_003364	TTA	2	6	175567	175572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_003364	TAA	2	6	175589	175594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_003364	GGC	2	6	177277	177282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_003364	GGC	2	6	177294	177299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_003364	GCC	2	6	177638	177643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_003364	TATT	2	8	177652	177659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_003364	T	6	6	183361	183366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_003364	ATT	2	6	183378	183383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_003364	T	6	6	183382	183387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_003364	A	7	7	183401	183407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_003364	TTG	2	6	183520	183525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_003364	CTT	2	6	183577	183582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_003364	AAC	2	6	186000	186005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_003364	TGT	2	6	186032	186037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_003364	A	6	6	186949	186954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_003364	T	6	6	186980	186985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_003364	GGA	2	6	186993	186998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_003364	TGA	2	6	187010	187015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_003364	TA	3	6	189300	189305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_003364	TTTC	2	8	189306	189313	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
568	NC_003364	CCG	2	6	189316	189321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_003364	CT	3	6	190667	190672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
570	NC_003364	TACT	2	8	190749	190756	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
571	NC_003364	TGA	2	6	191737	191742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_003364	GGC	2	6	191746	191751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_003364	TAA	2	6	191753	191758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_003364	GCC	2	6	191760	191765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_003364	A	6	6	193396	193401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_003364	ATT	2	6	193405	193410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_003364	T	7	7	193462	193468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_003364	CGC	2	6	193715	193720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_003364	T	7	7	199026	199032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_003364	ATG	2	6	199054	199059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_003364	GCC	2	6	199066	199071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_003364	ACA	2	6	199082	199087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_003364	T	6	6	199240	199245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_003364	ACG	2	6	199279	199284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_003364	GA	3	6	199285	199290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_003364	GGA	2	6	199322	199327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_003364	GCGAT	2	10	199342	199351	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
588	NC_003364	AG	3	6	199484	199489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
589	NC_003364	TC	3	6	199493	199498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
590	NC_003364	TCA	2	6	199558	199563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_003364	TTA	2	6	199686	199691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_003364	GTA	2	6	199726	199731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_003364	TGA	2	6	199747	199752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_003364	AAT	2	6	199777	199782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_003364	TTA	2	6	199840	199845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_003364	ACT	2	6	200171	200176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_003364	TTA	2	6	200205	200210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_003364	T	7	7	200257	200263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_003364	T	6	6	200768	200773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_003364	GTT	2	6	200892	200897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_003364	GTT	2	6	200915	200920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_003364	TCG	2	6	200924	200929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_003364	ATT	2	6	200956	200961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_003364	AACTT	2	10	201620	201629	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
605	NC_003364	CTC	2	6	201774	201779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_003364	CGGGG	2	10	201788	201797	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
607	NC_003364	ATT	2	6	201881	201886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_003364	TAG	2	6	201901	201906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_003364	TTAA	2	8	201937	201944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_003364	AG	3	6	201978	201983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_003364	CGG	2	6	202005	202010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_003364	A	6	6	203236	203241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_003364	CT	3	6	205685	205690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
614	NC_003364	AAG	2	6	205893	205898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_003364	TCC	2	6	208164	208169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_003364	GCC	2	6	210267	210272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_003364	GCTGT	2	10	210307	210316	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
618	NC_003364	GTA	2	6	210401	210406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_003364	TG	3	6	210425	210430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_003364	CGT	2	6	210439	210444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_003364	GGC	2	6	210476	210481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_003364	ATA	2	6	210510	210515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_003364	CAT	2	6	213085	213090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_003364	CGGC	2	8	213131	213138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
625	NC_003364	TA	3	6	213222	213227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_003364	TTC	2	6	213235	213240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_003364	GAA	2	6	213260	213265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_003364	CCG	2	6	217229	217234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_003364	AGTA	2	8	217324	217331	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
630	NC_003364	TGT	2	6	217345	217350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_003364	TATT	2	8	217387	217394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_003364	GA	3	6	217447	217452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_003364	TCC	2	6	217474	217479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_003364	CTC	2	6	217511	217516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_003364	GCC	2	6	217527	217532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_003364	GGGA	2	8	217543	217550	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
637	NC_003364	ATTAA	2	10	217581	217590	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_003364	ACG	2	6	217591	217596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_003364	A	6	6	217604	217609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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641	NC_003364	A	6	6	218402	218407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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676	NC_003364	TG	3	6	226336	226341	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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686	NC_003364	AT	3	6	232154	232159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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771	NC_003364	T	6	6	258150	258155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
772	NC_003364	ACG	2	6	258173	258178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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