MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida KT2440 chromosome

Total Repeats: 2156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002947	AAGC	2	8	9017	9024	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_002947	GTTT	2	8	9499	9506	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002947	CCGG	2	8	15800	15807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_002947	TTAA	2	8	16038	16045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002947	CGCC	2	8	16521	16528	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_002947	CGAC	2	8	16855	16862	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_002947	TGGT	2	8	17097	17104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002947	CTTT	2	8	22123	22130	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_002947	GCCC	2	8	25742	25749	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_002947	GGGC	2	8	25770	25777	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_002947	CTCG	2	8	25832	25839	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_002947	CAAA	2	8	29904	29911	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_002947	GCAG	2	8	30231	30238	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_002947	CAGT	2	8	30349	30356	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_002947	CTGC	2	8	32524	32531	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_002947	TCCT	2	8	32867	32874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_002947	TTTG	2	8	35022	35029	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002947	GAAA	2	8	36144	36151	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002947	GTAA	2	8	39091	39098	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002947	GCAT	2	8	39184	39191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_002947	GCAA	2	8	40444	40451	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_002947	GCAA	2	8	41943	41950	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_002947	GTTG	2	8	45585	45592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002947	CTCA	2	8	54991	54998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_002947	AGCG	2	8	55396	55403	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_002947	CTGG	2	8	56093	56100	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_002947	GGGA	2	8	57857	57864	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002947	TAGG	2	8	57969	57976	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002947	GGCC	2	8	58299	58306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_002947	TTGA	2	8	58325	58332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002947	GTCG	2	8	58555	58562	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_002947	ATTG	2	8	59223	59230	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002947	AGTG	2	8	60739	60746	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002947	GCAT	2	8	60759	60766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_002947	GTTC	2	8	64733	64740	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_002947	GTGC	2	8	66601	66608	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_002947	CAAT	2	8	79154	79161	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_002947	CAAG	2	8	80356	80363	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_002947	TGTC	2	8	81424	81431	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_002947	CCAT	2	8	82092	82099	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_002947	GCTC	2	8	95631	95638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_002947	CGTT	2	8	96736	96743	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_002947	GGGC	2	8	100505	100512	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_002947	AGGC	2	8	101103	101110	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_002947	CTGT	2	8	103705	103712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_002947	CGTG	2	8	105122	105129	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_002947	GGCC	2	8	107718	107725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_002947	CAAT	2	8	109953	109960	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_002947	ATTT	2	8	119915	119922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002947	GGCA	2	8	136055	136062	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_002947	GTGG	2	8	137023	137030	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002947	TTTA	2	8	141871	141878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002947	ACTA	2	8	142947	142954	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_002947	TTTA	2	8	142971	142978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002947	AAAG	2	8	143368	143375	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002947	TCAC	2	8	144048	144055	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_002947	TCGC	2	8	144639	144646	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_002947	GCGA	2	8	153608	153615	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_002947	CTCA	2	8	155367	155374	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_002947	ATTT	2	8	155422	155429	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002947	CAGC	2	8	157951	157958	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_002947	CAGG	2	8	165823	165830	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_002947	TGCG	2	8	165909	165916	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_002947	CGGG	2	8	167002	167009	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_002947	ATAC	2	8	167283	167290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_002947	AGGA	2	8	172073	172080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002947	GATA	2	8	173061	173068	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002947	CAGC	2	8	173330	173337	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_002947	GCGA	2	8	173448	173455	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_002947	TGAC	2	8	173628	173635	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_002947	ACTG	2	8	173909	173916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_002947	CGTC	2	8	174152	174159	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_002947	AAAG	2	8	174275	174282	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002947	GTTG	2	8	174642	174649	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002947	AGGA	2	8	177503	177510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002947	GATA	2	8	178491	178498	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002947	CAGC	2	8	178760	178767	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_002947	GCGA	2	8	178878	178885	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_002947	TGAC	2	8	179058	179065	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_002947	ACTG	2	8	179339	179346	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_002947	CGTC	2	8	179582	179589	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_002947	AAAG	2	8	179705	179712	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002947	GTTG	2	8	180072	180079	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002947	GCCT	2	8	186920	186927	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_002947	CTGG	2	8	194045	194052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_002947	GTCG	2	8	194170	194177	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_002947	CAAA	2	8	220837	220844	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_002947	GGGC	2	8	221014	221021	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_002947	GTTC	2	8	225704	225711	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_002947	CTGA	2	8	226609	226616	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_002947	GCTG	2	8	236878	236885	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_002947	CGAG	2	8	248404	248411	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_002947	GGCG	2	8	251778	251785	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_002947	ATCC	2	8	251832	251839	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_002947	CAGA	2	8	252212	252219	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_002947	TGGC	2	8	252564	252571	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_002947	CGCA	2	8	255359	255366	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_002947	TATC	2	8	255465	255472	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_002947	TTTC	2	8	263023	263030	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_002947	AACT	2	8	278677	278684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_002947	TGCA	3	12	281274	281285	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_002947	GGGC	2	8	281457	281464	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_002947	GGCG	2	8	281670	281677	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_002947	ATAA	2	8	288174	288181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002947	TAAA	2	8	289989	289996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002947	TTAT	2	8	290000	290007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002947	AAAC	2	8	295427	295434	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_002947	AGCC	2	8	308842	308849	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_002947	TGGC	2	8	309880	309887	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_002947	AATG	2	8	321718	321725	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002947	CTTG	2	8	324299	324306	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_002947	CTGC	2	8	324369	324376	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_002947	GCAG	2	8	327740	327747	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_002947	CTGG	2	8	333011	333018	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_002947	CAAG	2	8	333899	333906	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_002947	TTGG	2	8	334735	334742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002947	CAGT	2	8	337863	337870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_002947	GCTG	2	8	342873	342880	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_002947	CCAG	2	8	343082	343089	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_002947	CTTC	2	8	343256	343263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_002947	TGGC	2	8	343608	343615	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_002947	GTGA	2	8	343644	343651	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002947	GCAA	2	8	343812	343819	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_002947	AATT	2	8	344234	344241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002947	TCAG	2	8	348008	348015	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_002947	CCCT	2	8	348086	348093	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
127	NC_002947	GGCA	2	8	355210	355217	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_002947	GGGC	2	8	359715	359722	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_002947	GCTC	2	8	360231	360238	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_002947	TTAT	2	8	360286	360293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002947	CCAT	2	8	363570	363577	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_002947	CTTG	2	8	366741	366748	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_002947	GCAA	2	8	367056	367063	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_002947	GATG	2	8	367328	367335	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002947	GCGG	3	12	374919	374930	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_002947	CGAG	2	8	376794	376801	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_002947	CGGC	2	8	379436	379443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_002947	GCAG	2	8	379627	379634	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_002947	CAGT	2	8	394497	394504	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_002947	ATAA	2	8	394589	394596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002947	CTGC	2	8	398569	398576	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_002947	CATA	2	8	401719	401726	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_002947	CATA	2	8	401744	401751	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_002947	GTTG	2	8	410887	410894	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002947	TGTT	2	8	410924	410931	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002947	TGCT	2	8	427821	427828	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_002947	CGAG	2	8	427839	427846	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_002947	TAAC	2	8	429547	429554	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_002947	TAAA	2	8	437309	437316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002947	GGCG	2	8	437338	437345	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
151	NC_002947	CAGG	2	8	438388	438395	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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443	NC_002947	AAAG	2	8	1328389	1328396	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
444	NC_002947	GTTG	2	8	1328756	1328763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
445	NC_002947	AGCA	2	8	1330764	1330771	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
446	NC_002947	CGTA	2	8	1332796	1332803	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
447	NC_002947	GGTC	2	8	1332829	1332836	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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449	NC_002947	GGGC	2	8	1333437	1333444	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
450	NC_002947	TGGC	2	8	1333479	1333486	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
451	NC_002947	TGCA	2	8	1333640	1333647	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
452	NC_002947	TGCC	2	8	1348956	1348963	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
453	NC_002947	GCCG	2	8	1349450	1349457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
454	NC_002947	AAGA	2	8	1349872	1349879	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_002947	GCCA	2	8	1352213	1352220	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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460	NC_002947	CCGC	2	8	1356029	1356036	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
461	NC_002947	GTTC	2	8	1360030	1360037	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
462	NC_002947	CCTG	2	8	1366735	1366742	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
463	NC_002947	ACTG	2	8	1367425	1367432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
464	NC_002947	AGCG	2	8	1373225	1373232	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
465	NC_002947	ACCT	2	8	1374111	1374118	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
466	NC_002947	CCGG	2	8	1374173	1374180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
467	NC_002947	AGCG	2	8	1374240	1374247	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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471	NC_002947	AGCC	2	8	1387799	1387806	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
472	NC_002947	GGGC	2	8	1388231	1388238	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
473	NC_002947	TGCT	2	8	1389803	1389810	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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475	NC_002947	AGGA	2	8	1393633	1393640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_002947	CAGC	2	8	1418498	1418505	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
481	NC_002947	TGAG	2	8	1418921	1418928	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
482	NC_002947	GCCG	2	8	1420076	1420083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
483	NC_002947	AAGG	2	8	1420176	1420183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
484	NC_002947	ATCA	2	8	1420224	1420231	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
485	NC_002947	GAAG	2	8	1425820	1425827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
486	NC_002947	TTTG	2	8	1427652	1427659	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
487	NC_002947	GCCA	2	8	1427799	1427806	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
488	NC_002947	GAAA	2	8	1429496	1429503	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
489	NC_002947	GAAG	2	8	1429680	1429687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
490	NC_002947	AGAA	2	8	1442007	1442014	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
491	NC_002947	TTTG	2	8	1442028	1442035	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
492	NC_002947	ATGC	2	8	1449188	1449195	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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498	NC_002947	CATT	2	8	1474391	1474398	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
499	NC_002947	CCCG	2	8	1477253	1477260	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
500	NC_002947	GCGT	2	8	1482525	1482532	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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