MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 331

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000868	AG	3	6	2483	2488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000868	TA	3	6	2506	2511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000868	TC	3	6	5193	5198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_000868	TC	3	6	5232	5237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_000868	AT	3	6	5273	5278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000868	TG	3	6	5294	5299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000868	AG	3	6	5342	5347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000868	AG	3	6	5396	5401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000868	AG	3	6	5436	5441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000868	TA	3	6	5460	5465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000868	GA	3	6	5713	5718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000868	GA	3	6	6364	6369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000868	AT	3	6	13749	13754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000868	AG	3	6	13850	13855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000868	CA	3	6	16385	16390	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_000868	GT	3	6	27955	27960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000868	TC	4	8	38280	38287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_000868	CT	3	6	39188	39193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_000868	TA	3	6	57252	57257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000868	AG	3	6	59070	59075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000868	TA	3	6	73094	73099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000868	CT	3	6	78907	78912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_000868	AG	3	6	122800	122805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000868	AT	3	6	123028	123033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000868	GA	3	6	129397	129402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000868	TA	3	6	132167	132172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000868	AT	3	6	134772	134777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000868	AT	3	6	134803	134808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000868	AT	3	6	137914	137919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000868	AT	3	6	140730	140735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000868	CA	3	6	148778	148783	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_000868	AG	3	6	148960	148965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000868	AC	3	6	149094	149099	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_000868	TC	3	6	160954	160959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_000868	GA	3	6	162679	162684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000868	AT	3	6	164442	164447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000868	CA	3	6	164459	164464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_000868	TC	3	6	168244	168249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_000868	AT	3	6	168808	168813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000868	CT	3	6	174827	174832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_000868	TA	3	6	176853	176858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000868	AT	3	6	197268	197273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000868	CG	3	6	206240	206245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_000868	CG	3	6	206364	206369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_000868	CG	3	6	206377	206382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_000868	CA	3	6	206405	206410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_000868	GC	3	6	208957	208962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_000868	GA	3	6	230455	230460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000868	TA	3	6	248223	248228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000868	AT	3	6	257419	257424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000868	TA	4	8	259815	259822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000868	CT	3	6	262909	262914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_000868	TC	3	6	269890	269895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_000868	AG	3	6	273453	273458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000868	GA	3	6	288205	288210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000868	AT	3	6	289066	289071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000868	TC	3	6	289395	289400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_000868	CT	3	6	299008	299013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_000868	TA	3	6	307114	307119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000868	GA	3	6	310743	310748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000868	TC	4	8	327290	327297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_000868	TC	3	6	328728	328733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_000868	AG	3	6	340630	340635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000868	TA	3	6	340700	340705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000868	TA	4	8	342461	342468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000868	TA	3	6	352874	352879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000868	TA	3	6	371682	371687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000868	AT	3	6	371697	371702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000868	AT	3	6	392217	392222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000868	CT	3	6	392441	392446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_000868	TC	3	6	392579	392584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_000868	CT	3	6	392658	392663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_000868	TC	3	6	393976	393981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_000868	CT	3	6	394994	394999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_000868	AG	3	6	395112	395117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000868	TG	3	6	395366	395371	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000868	CT	3	6	395562	395567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_000868	AC	3	6	397516	397521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_000868	AC	3	6	397526	397531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_000868	AT	3	6	397919	397924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000868	CT	3	6	409926	409931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_000868	AT	3	6	410017	410022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000868	TG	3	6	410118	410123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000868	TA	4	8	410340	410347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000868	AT	3	6	410836	410841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000868	TC	3	6	414917	414922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_000868	AG	3	6	415397	415402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000868	TA	3	6	419605	419610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000868	TC	3	6	435523	435528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_000868	TA	3	6	449007	449012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000868	GA	3	6	451413	451418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000868	CT	3	6	453745	453750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_000868	TA	3	6	453845	453850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000868	TC	3	6	454108	454113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_000868	GA	3	6	455540	455545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000868	CT	3	6	467528	467533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_000868	GA	3	6	467985	467990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000868	TC	4	8	468225	468232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_000868	TA	3	6	470837	470842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000868	CT	3	6	480144	480149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_000868	GA	3	6	482441	482446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000868	TA	3	6	482877	482882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000868	GA	3	6	482953	482958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000868	TA	3	6	492320	492325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000868	AT	3	6	493648	493653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000868	TA	3	6	518210	518215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000868	GA	3	6	524691	524696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000868	AT	3	6	524843	524848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000868	GA	3	6	526429	526434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000868	AG	3	6	536171	536176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000868	TC	3	6	539814	539819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_000868	AG	3	6	539885	539890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000868	TA	3	6	542009	542014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000868	TA	3	6	543393	543398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000868	TA	3	6	559515	559520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000868	TA	3	6	574153	574158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000868	TA	3	6	578108	578113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000868	TA	3	6	579045	579050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000868	TA	3	6	579202	579207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_000868	TC	3	6	590639	590644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_000868	TC	3	6	590646	590651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_000868	TA	3	6	600347	600352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_000868	TG	4	8	605678	605685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000868	AT	3	6	625566	625571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000868	CG	3	6	630629	630634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_000868	CT	3	6	630660	630665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_000868	TA	3	6	639695	639700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000868	TA	3	6	661025	661030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000868	TC	3	6	682136	682141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_000868	TC	3	6	682293	682298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_000868	CT	3	6	684710	684715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_000868	GA	3	6	686212	686217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000868	GA	3	6	694314	694319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000868	TA	3	6	705610	705615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000868	AG	3	6	725078	725083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000868	AG	3	6	741635	741640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_000868	GA	3	6	741654	741659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000868	AT	3	6	747042	747047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_000868	TA	3	6	747237	747242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000868	AT	3	6	748942	748947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000868	CT	3	6	757613	757618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_000868	AT	3	6	762666	762671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000868	TA	3	6	762773	762778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_000868	AT	3	6	762867	762872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_000868	TC	3	6	784657	784662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_000868	TA	3	6	788994	788999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_000868	TC	3	6	794358	794363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_000868	CT	3	6	794431	794436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_000868	AC	3	6	794577	794582	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_000868	TA	3	6	797595	797600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_000868	GA	3	6	798420	798425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_000868	TC	3	6	798430	798435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_000868	AG	3	6	798454	798459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_000868	TC	4	8	806560	806567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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308	NC_000868	CT	3	6	1612072	1612077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
309	NC_000868	AG	3	6	1613412	1613417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
310	NC_000868	GA	3	6	1613625	1613630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
311	NC_000868	TA	3	6	1614156	1614161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_000868	AT	3	6	1616104	1616109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_000868	CT	3	6	1620908	1620913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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315	NC_000868	AT	3	6	1621072	1621077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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326	NC_000868	TA	3	6	1679142	1679147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
327	NC_000868	AT	3	6	1684131	1684136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
328	NC_000868	AT	3	6	1754524	1754529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
329	NC_000868	AG	3	6	1759853	1759858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_000868	TG	3	6	1765094	1765099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.