MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 391

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000868	TTAA	2	8	76	83	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000868	CCCT	2	8	2458	2465	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_000868	CCAA	2	8	4118	4125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_000868	TATT	2	8	5248	5255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000868	CCCA	2	8	13623	13630	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_000868	TAAA	2	8	13693	13700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000868	ATTT	2	8	27965	27972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000868	TAAA	2	8	28074	28081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000868	CTAT	2	8	28164	28171	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_000868	ATCC	2	8	32970	32977	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_000868	ATGC	2	8	34056	34063	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_000868	CTTC	2	8	35945	35952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_000868	AGTT	2	8	35958	35965	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000868	TAAA	2	8	49558	49565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000868	GAAT	2	8	57385	57392	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000868	TAAA	2	8	58715	58722	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000868	GTGA	2	8	59037	59044	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000868	AGCA	2	8	59141	59148	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_000868	GGCT	2	8	59386	59393	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_000868	TGGA	2	8	65027	65034	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000868	GATG	2	8	65050	65057	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000868	CGAT	2	8	67975	67982	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_000868	GCTC	2	8	77105	77112	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_000868	CAAG	2	8	77162	77169	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_000868	GTGA	2	8	91197	91204	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000868	TTTA	2	8	95590	95597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000868	CCCT	2	8	98403	98410	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_000868	GGAA	2	8	123013	123020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000868	TTCA	2	8	123035	123042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_000868	AAGG	2	8	129335	129342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000868	TTTC	2	8	139539	139546	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_000868	AATT	2	8	140740	140747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000868	ATTT	2	8	147897	147904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000868	CTTT	2	8	149330	149337	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_000868	TAAT	2	8	149524	149531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000868	ACAT	2	8	149618	149625	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_000868	AGGA	2	8	150100	150107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000868	TTTA	2	8	153078	153085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000868	TCAA	2	8	160715	160722	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_000868	TACT	2	8	162889	162896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_000868	ACTT	2	8	171399	171406	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_000868	AATT	2	8	171422	171429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000868	ATTT	3	12	184534	184545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000868	GTTT	2	8	191337	191344	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000868	TAAA	2	8	195936	195943	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000868	AAAC	2	8	197364	197371	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_000868	AGGC	2	8	204965	204972	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_000868	CGAG	2	8	206106	206113	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_000868	TCCC	2	8	206135	206142	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_000868	GGGA	2	8	206147	206154	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000868	GGGC	2	8	206194	206201	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_000868	GCCT	2	8	206588	206595	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_000868	GCAG	2	8	206893	206900	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_000868	AAAG	2	8	207012	207019	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000868	CCGT	2	8	207456	207463	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_000868	GCCG	2	8	208090	208097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_000868	GGCG	2	8	208140	208147	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_000868	CCCG	2	8	208306	208313	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_000868	CCGG	2	8	208927	208934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_000868	TAAA	2	8	209916	209923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000868	CTCC	2	8	224297	224304	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_000868	CCGG	2	8	230524	230531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_000868	ATGT	2	8	241079	241086	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000868	ATCT	2	8	253556	253563	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_000868	AGGA	2	8	255431	255438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000868	GAAA	2	8	255490	255497	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000868	TCCC	2	8	266066	266073	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_000868	CAAA	2	8	266143	266150	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_000868	TCCA	2	8	267067	267074	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_000868	TTAT	2	8	287880	287887	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000868	ACTC	2	8	287972	287979	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_000868	TAAG	2	8	288216	288223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000868	AAAG	2	8	289434	289441	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000868	CTTT	2	8	294871	294878	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_000868	GAGT	2	8	296668	296675	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000868	AAGC	2	8	297105	297112	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_000868	CGCC	2	8	298951	298958	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_000868	TAAT	2	8	307040	307047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000868	ATTA	2	8	307085	307092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000868	AAAT	2	8	311587	311594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000868	CCGC	2	8	318342	318349	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_000868	TTAA	2	8	318410	318417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000868	TTTA	2	8	319017	319024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000868	GAAA	2	8	323566	323573	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000868	TAAT	2	8	337748	337755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000868	ATTT	2	8	340497	340504	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000868	ATTA	2	8	340532	340539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000868	ATAA	2	8	340740	340747	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000868	CTTA	2	8	346048	346055	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_000868	CCCT	2	8	348520	348527	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
91	NC_000868	CATT	2	8	348563	348570	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_000868	AGGG	2	8	365962	365969	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000868	TCTT	2	8	374520	374527	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_000868	TTAA	2	8	380628	380635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000868	AAGT	2	8	380700	380707	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000868	CGGG	2	8	382587	382594	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
97	NC_000868	CAAT	2	8	392211	392218	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_000868	TTTC	2	8	392303	392310	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_000868	TGGA	2	8	392489	392496	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000868	ATGC	2	8	393305	393312	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_000868	GGCC	2	8	393705	393712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_000868	AGTA	2	8	397584	397591	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000868	AATA	2	8	409983	409990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000868	TTAA	2	8	410249	410256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000868	TAAA	2	8	416213	416220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000868	AAGG	2	8	419646	419653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000868	GCTT	2	8	453730	453737	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_000868	CCTT	2	8	463879	463886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_000868	TTCG	2	8	464135	464142	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_000868	CTCG	2	8	470632	470639	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_000868	GAAA	2	8	470817	470824	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000868	GAAA	2	8	470827	470834	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000868	TAAG	2	8	480198	480205	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000868	AAAC	2	8	482620	482627	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_000868	CTAA	2	8	488953	488960	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_000868	TAGT	2	8	500228	500235	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000868	CATT	2	8	504033	504040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_000868	CTTT	2	8	507923	507930	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_000868	TAAG	2	8	518356	518363	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_000868	GCAA	2	8	531201	531208	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_000868	TTTA	2	8	531247	531254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000868	GAAA	2	8	541943	541950	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_000868	TCCC	2	8	553674	553681	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_000868	TCCC	2	8	556004	556011	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
125	NC_000868	TAAA	2	8	574127	574134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000868	CTTA	2	8	574169	574176	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_000868	CCCG	2	8	578200	578207	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_000868	CCGG	2	8	579143	579150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_000868	TTTA	2	8	601448	601455	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000868	ATTT	2	8	605096	605103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000868	AACT	2	8	605662	605669	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_000868	AAAC	2	8	605686	605693	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_000868	TCCC	2	8	607534	607541	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_000868	CAAA	2	8	616058	616065	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_000868	AAAG	2	8	631031	631038	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000868	AGGA	2	8	633786	633793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_000868	CCTA	2	8	634942	634949	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_000868	GGAG	2	8	636844	636851	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_000868	AGGG	2	8	648149	648156	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000868	TTCC	2	8	648665	648672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_000868	CATG	2	8	661157	661164	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_000868	AATT	2	8	689163	689170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000868	GCCC	2	8	690152	690159	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_000868	TAAA	2	8	698528	698535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_000868	GAAT	2	8	709796	709803	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_000868	TGGG	2	8	720301	720308	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
147	NC_000868	TTCT	2	8	741338	741345	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_000868	CGTT	2	8	745615	745622	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_000868	ACTC	2	8	756099	756106	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_000868	AAAT	2	8	756191	756198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_000868	GTTT	2	8	761535	761542	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_000868	ATTC	2	8	761575	761582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.