MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 3112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_000868	CCA	2	6	1687742	1687747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3002	NC_000868	TCC	2	6	1687764	1687769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_000868	CTT	2	6	1687834	1687839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_000868	TAA	2	6	1689248	1689253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_000868	AAAT	2	8	1689254	1689261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_000868	TAA	2	6	1690542	1690547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_000868	CCT	2	6	1691496	1691501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3008	NC_000868	CATG	2	8	1691542	1691549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3009	NC_000868	TTAG	2	8	1691592	1691599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_000868	CATC	2	8	1692186	1692193	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_000868	TGG	2	6	1692204	1692209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_000868	TTA	2	6	1695139	1695144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_000868	TGGG	2	8	1695171	1695178	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_000868	TTC	2	6	1698273	1698278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_000868	TAA	2	6	1699081	1699086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_000868	TTTA	2	8	1700936	1700943	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_000868	AGT	2	6	1700975	1700980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_000868	TGA	2	6	1701667	1701672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_000868	AGA	2	6	1706941	1706946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_000868	TTAG	2	8	1706980	1706987	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_000868	ATT	2	6	1708090	1708095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_000868	ATC	2	6	1708099	1708104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_000868	AGG	2	6	1708108	1708113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_000868	T	6	6	1710584	1710589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_000868	TAA	2	6	1710597	1710602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_000868	ACC	2	6	1713351	1713356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_000868	CATA	2	8	1715342	1715349	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3028	NC_000868	ATT	2	6	1716965	1716970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_000868	CCT	2	6	1720553	1720558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_000868	GTTT	2	8	1720597	1720604	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_000868	TCT	2	6	1720640	1720645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_000868	CTC	2	6	1720657	1720662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_000868	AATT	2	8	1720666	1720673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_000868	GAA	2	6	1720861	1720866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_000868	AAGA	2	8	1720871	1720878	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_000868	TTTTC	2	10	1720899	1720908	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3037	NC_000868	GAAAG	2	10	1720946	1720955	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_000868	GAT	2	6	1720963	1720968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_000868	ATT	2	6	1721946	1721951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_000868	ACC	2	6	1725028	1725033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_000868	CAC	2	6	1726475	1726480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_000868	T	6	6	1727586	1727591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_000868	ATC	2	6	1727642	1727647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_000868	GAA	2	6	1727709	1727714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_000868	AAGAA	2	10	1727717	1727726	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_000868	ACC	2	6	1730539	1730544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3047	NC_000868	TAA	2	6	1730554	1730559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_000868	AATA	2	8	1730589	1730596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_000868	AAATTT	2	12	1730739	1730750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_000868	A	6	6	1730773	1730778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_000868	AGA	2	6	1730803	1730808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_000868	GGAA	2	8	1733674	1733681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_000868	A	6	6	1737954	1737959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_000868	TCC	2	6	1744449	1744454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3055	NC_000868	GAT	2	6	1747269	1747274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_000868	T	6	6	1747315	1747320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_000868	TCAT	2	8	1750538	1750545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3058	NC_000868	AT	3	6	1754524	1754529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_000868	TTTC	2	8	1754690	1754697	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3060	NC_000868	A	6	6	1754707	1754712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_000868	CCA	2	6	1754732	1754737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_000868	ATC	3	9	1755893	1755901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_000868	GAT	2	6	1755933	1755938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_000868	TGA	2	6	1755961	1755966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_000868	AATA	2	8	1758875	1758882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_000868	ATT	2	6	1758895	1758900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_000868	TCTTA	2	10	1759639	1759648	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3068	NC_000868	ATT	2	6	1759771	1759776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_000868	TAAA	2	8	1759830	1759837	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_000868	AGT	2	6	1759842	1759847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_000868	AG	3	6	1759853	1759858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_000868	GGA	2	6	1760014	1760019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_000868	AGT	2	6	1760121	1760126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_000868	GTT	2	6	1760260	1760265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_000868	T	7	7	1760575	1760581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_000868	A	6	6	1760595	1760600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_000868	TCA	2	6	1760647	1760652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_000868	TCA	2	6	1760656	1760661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_000868	CCG	2	6	1760785	1760790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3080	NC_000868	TCG	2	6	1760856	1760861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_000868	AGTT	2	8	1761132	1761139	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_000868	CCG	2	6	1761267	1761272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3083	NC_000868	TTC	2	6	1761345	1761350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_000868	TCGA	2	8	1761454	1761461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3085	NC_000868	CTC	2	6	1761600	1761605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3086	NC_000868	TCA	2	6	1761790	1761795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_000868	AACA	2	8	1761803	1761810	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3088	NC_000868	ATTT	2	8	1761860	1761867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_000868	TAGC	2	8	1761879	1761886	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3090	NC_000868	AAAG	2	8	1761904	1761911	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_000868	CGG	2	6	1761929	1761934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_000868	CTG	2	6	1762016	1762021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_000868	TAA	2	6	1762023	1762028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_000868	GAAA	2	8	1763091	1763098	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_000868	A	6	6	1763106	1763111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_000868	TCACC	2	10	1764509	1764518	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3097	NC_000868	CT	3	6	1764581	1764586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_000868	TAT	2	6	1764604	1764609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_000868	TCG	2	6	1764647	1764652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_000868	GTT	2	6	1764691	1764696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_000868	TCT	2	6	1764717	1764722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_000868	GGA	2	6	1764761	1764766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_000868	ACG	2	6	1764767	1764772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_000868	TACC	2	8	1764812	1764819	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3105	NC_000868	GAA	2	6	1764850	1764855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_000868	CTT	2	6	1764862	1764867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_000868	TCC	2	6	1764905	1764910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_000868	ACT	2	6	1764919	1764924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_000868	CCT	2	6	1764943	1764948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3110	NC_000868	CGC	2	6	1764949	1764954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3111	NC_000868	AGGA	2	8	1765012	1765019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_000868	TG	3	6	1765094	1765099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.