MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 3112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_000868	C	6	6	551011	551016	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1002	NC_000868	CTC	2	6	551038	551043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_000868	GGT	2	6	552000	552005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_000868	TCCC	2	8	553674	553681	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1005	NC_000868	ATC	2	6	553683	553688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_000868	TCCC	2	8	556004	556011	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1007	NC_000868	TTAAT	2	10	556016	556025	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_000868	CCT	2	6	559487	559492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_000868	TA	3	6	559515	559520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_000868	AGG	2	6	559592	559597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_000868	TTC	3	9	569164	569172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_000868	TGA	2	6	569189	569194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_000868	TGG	2	6	571480	571485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_000868	GGT	2	6	571544	571549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_000868	CAC	2	6	574042	574047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_000868	TAAA	2	8	574127	574134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_000868	TA	3	6	574153	574158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_000868	CTTA	2	8	574169	574176	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_000868	TTTTA	2	10	578063	578072	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_000868	TA	3	6	578108	578113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_000868	TAGCC	2	10	578146	578155	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1022	NC_000868	TGG	2	6	578156	578161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_000868	CCCG	2	8	578200	578207	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1024	NC_000868	CGG	2	6	578283	578288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_000868	CCA	2	6	578291	578296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_000868	T	6	6	578300	578305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_000868	TTA	2	6	578326	578331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_000868	AACTTC	2	12	578374	578385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_000868	TGG	2	6	578389	578394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_000868	TA	3	6	579045	579050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_000868	CCGG	2	8	579143	579150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_000868	TAA	2	6	579161	579166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_000868	TA	3	6	579202	579207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_000868	A	6	6	579245	579250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_000868	G	6	6	579257	579262	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_000868	CTT	2	6	588678	588683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_000868	ATG	2	6	590379	590384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_000868	AGA	2	6	590549	590554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_000868	AGAGCT	2	12	590574	590585	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1040	NC_000868	TC	3	6	590639	590644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_000868	TC	3	6	590646	590651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_000868	TCC	2	6	590792	590797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_000868	CTT	3	9	590809	590817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_000868	ACC	2	6	591771	591776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_000868	TTA	2	6	594556	594561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_000868	GTTAA	2	10	594583	594592	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_000868	TTA	2	6	600304	600309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_000868	TA	3	6	600347	600352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_000868	GGT	2	6	600388	600393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_000868	TTTA	2	8	601448	601455	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_000868	CTT	2	6	601462	601467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_000868	T	6	6	601836	601841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_000868	C	6	6	601945	601950	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1054	NC_000868	CAC	2	6	601952	601957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_000868	ATTT	2	8	605096	605103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_000868	A	6	6	605584	605589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_000868	AACT	2	8	605662	605669	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1059	NC_000868	AAAC	2	8	605686	605693	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_000868	G	6	6	605694	605699	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_000868	TCTTT	2	10	606135	606144	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1062	NC_000868	TCCC	2	8	607534	607541	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1063	NC_000868	T	7	7	607592	607598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_000868	CCA	2	6	616012	616017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_000868	CAAA	2	8	616058	616065	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_000868	A	6	6	616063	616068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_000868	ACT	2	6	617475	617480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1069	NC_000868	TTA	2	6	618855	618860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_000868	A	7	7	618890	618896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_000868	ACC	2	6	620808	620813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_000868	TTTAA	2	10	620832	620841	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_000868	AT	3	6	625566	625571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_000868	ATT	2	6	625633	625638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_000868	CT	3	6	630660	630665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_000868	GCC	3	9	630673	630681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1093	NC_000868	TGA	2	6	631550	631555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_000868	GAG	2	6	631591	631596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_000868	TGA	2	6	631616	631621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_000868	TAA	2	6	631676	631681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1102	NC_000868	GAA	2	6	635762	635767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_000868	AAT	2	6	635787	635792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_000868	ATA	2	6	636661	636666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_000868	AAG	2	6	636699	636704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_000868	ATG	2	6	636708	636713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_000868	GAG	2	6	636729	636734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_000868	TGA	2	6	636735	636740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_000868	CCA	2	6	636758	636763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_000868	TCC	2	6	636818	636823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_000868	GGAG	2	8	636844	636851	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_000868	CTTCT	2	10	638212	638221	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1113	NC_000868	TAGCC	2	10	638596	638605	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1114	NC_000868	CCCCG	2	10	638660	638669	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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1119	NC_000868	TA	3	6	639695	639700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_000868	CGG	2	6	639718	639723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_000868	TAC	2	6	639755	639760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1123	NC_000868	GCCTC	2	10	644592	644601	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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1129	NC_000868	GGA	2	6	648157	648162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1131	NC_000868	TTCC	2	8	648665	648672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_000868	AGG	2	6	655153	655158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_000868	TTA	2	6	656661	656666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1135	NC_000868	CTT	2	6	657621	657626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_000868	CTC	2	6	657688	657693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1138	NC_000868	TA	3	6	661025	661030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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