MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Paracoccus aminophilus JCM 7686 plasmid pAMI4

Total Repeats: 9153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022049	TTCC	2	8	222665	222672	0 %	50 %	0 %	50 %	530321941
5002	NC_022049	TTC	2	6	222690	222695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530321941
5003	NC_022049	GCC	2	6	222702	222707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530321941
5004	NC_022049	CGGG	2	8	222721	222728	0 %	0 %	75 %	25 %	530321941
5005	NC_022049	CAC	2	6	222731	222736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530321941
5006	NC_022049	TCG	2	6	222742	222747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530321941
5007	NC_022049	GCTC	2	8	222757	222764	0 %	25 %	25 %	50 %	530321941
5008	NC_022049	GGC	2	6	222769	222774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530321941
5009	NC_022049	TCG	2	6	222837	222842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530321941
5010	NC_022049	GC	3	6	222865	222870	0 %	0 %	50 %	50 %	530321941
5011	NC_022049	TGA	2	6	222871	222876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530321941
5012	NC_022049	GAA	2	6	222887	222892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530321941
5013	NC_022049	GCG	2	6	222904	222909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530321941
5014	NC_022049	CGC	3	9	222914	222922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530321941
5015	NC_022049	GACCGC	2	12	222926	222937	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	530321941
5016	NC_022049	GCC	2	6	222959	222964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530321941
5017	NC_022049	TCG	2	6	223021	223026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530321941
5018	NC_022049	TGG	2	6	223048	223053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530321941
5019	NC_022049	TCT	2	6	223066	223071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530321941
5020	NC_022049	CTG	3	9	223182	223190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530321941
5021	NC_022049	GC	4	8	223195	223202	0 %	0 %	50 %	50 %	530321941
5022	NC_022049	GTC	2	6	223242	223247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530321941
5023	NC_022049	TCG	2	6	223258	223263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530321941
5024	NC_022049	TGG	2	6	223384	223389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530321941
5025	NC_022049	AGG	2	6	223426	223431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530321941
5026	NC_022049	TC	3	6	223436	223441	0 %	50 %	0 %	50 %	530321941
5027	NC_022049	GGT	2	6	223445	223450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530321941
5028	NC_022049	CTG	3	9	223455	223463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530321941
5029	NC_022049	CTCGA	2	10	223497	223506	20 %	20 %	20 %	40 %	530321941
5030	NC_022049	CGA	2	6	223513	223518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530321941
5031	NC_022049	TCA	2	6	223519	223524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530321941
5032	NC_022049	TGC	2	6	223537	223542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530321941
5033	NC_022049	GTC	2	6	223593	223598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530321941
5034	NC_022049	TGA	2	6	223603	223608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530321941
5035	NC_022049	ATCC	2	8	223617	223624	25 %	25 %	0 %	50 %	530321941
5036	NC_022049	AG	3	6	223691	223696	50 %	0 %	50 %	0 %	530321941
5037	NC_022049	CTG	3	9	223728	223736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530321941
5038	NC_022049	TCG	2	6	223914	223919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530321942
5039	NC_022049	CGG	2	6	223936	223941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530321942
5040	NC_022049	TGA	2	6	223948	223953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530321942
5041	NC_022049	GGGCGT	2	12	223958	223969	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	530321942
5042	NC_022049	CAG	2	6	224009	224014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530321942
5043	NC_022049	CAG	2	6	224063	224068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530321942
5044	NC_022049	CCA	2	6	224095	224100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530321942
5045	NC_022049	GC	4	8	224119	224126	0 %	0 %	50 %	50 %	530321942
5046	NC_022049	ACC	2	6	224152	224157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530321942
5047	NC_022049	TCG	2	6	224163	224168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530321942
5048	NC_022049	CG	3	6	224180	224185	0 %	0 %	50 %	50 %	530321942
5049	NC_022049	GCGG	2	8	224199	224206	0 %	0 %	75 %	25 %	530321942
5050	NC_022049	GCC	2	6	224416	224421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530321943
5051	NC_022049	CGC	2	6	224442	224447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530321943
5052	NC_022049	GC	3	6	224479	224484	0 %	0 %	50 %	50 %	530321943
5053	NC_022049	CAGCG	2	10	224530	224539	20 %	0 %	40 %	40 %	530321943
5054	NC_022049	CGC	2	6	224540	224545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530321943
5055	NC_022049	CAG	2	6	224613	224618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530321943
5056	NC_022049	GAA	2	6	224625	224630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530321943
5057	NC_022049	CG	3	6	224653	224658	0 %	0 %	50 %	50 %	530321943
5058	NC_022049	CCG	2	6	224710	224715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530321943
5059	NC_022049	GC	3	6	224735	224740	0 %	0 %	50 %	50 %	530321943
5060	NC_022049	CGAT	2	8	224761	224768	25 %	25 %	25 %	25 %	530321943
5061	NC_022049	GCG	2	6	224840	224845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530321943
5062	NC_022049	CATC	2	8	224879	224886	25 %	25 %	0 %	50 %	530321943
5063	NC_022049	GCG	2	6	224932	224937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530321943
5064	NC_022049	CGCC	2	8	224954	224961	0 %	0 %	25 %	75 %	530321943
5065	NC_022049	GCGA	2	8	224977	224984	25 %	0 %	50 %	25 %	530321943
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5067	NC_022049	CG	3	6	225050	225055	0 %	0 %	50 %	50 %	530321943
5068	NC_022049	GGTT	2	8	225067	225074	0 %	50 %	50 %	0 %	530321943
5069	NC_022049	GCG	2	6	225092	225097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530321943
5070	NC_022049	GC	4	8	225108	225115	0 %	0 %	50 %	50 %	530321943
5071	NC_022049	CCG	2	6	225124	225129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530321943
5072	NC_022049	CGAGGC	2	12	225153	225164	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	530321943
5073	NC_022049	CG	3	6	225260	225265	0 %	0 %	50 %	50 %	530321943
5074	NC_022049	CAGAT	2	10	225283	225292	40 %	20 %	20 %	20 %	530321943
5075	NC_022049	GCG	2	6	225299	225304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530321943
5076	NC_022049	TGG	2	6	225400	225405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530321943
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5078	NC_022049	GA	3	6	225448	225453	50 %	0 %	50 %	0 %	530321943
5079	NC_022049	CGT	2	6	225459	225464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530321943
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5082	NC_022049	GC	3	6	225535	225540	0 %	0 %	50 %	50 %	530321943
5083	NC_022049	CCGG	2	8	225553	225560	0 %	0 %	50 %	50 %	530321943
5084	NC_022049	TCG	2	6	225620	225625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530321943
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5086	NC_022049	CGC	2	6	225725	225730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530321943
5087	NC_022049	CCAA	2	8	225745	225752	50 %	0 %	0 %	50 %	530321943
5088	NC_022049	GCC	2	6	225792	225797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530321943
5089	NC_022049	TCAT	2	8	225823	225830	25 %	50 %	0 %	25 %	530321943
5090	NC_022049	ATCGG	2	10	225874	225883	20 %	20 %	40 %	20 %	530321943
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5092	NC_022049	GCCA	2	8	225997	226004	25 %	0 %	25 %	50 %	530321943
5093	NC_022049	TCC	2	6	226030	226035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530321943
5094	NC_022049	AGATC	2	10	226121	226130	40 %	20 %	20 %	20 %	530321943
5095	NC_022049	AGC	2	6	226174	226179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530321943
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5101	NC_022049	CGG	2	6	226337	226342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530321943
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5103	NC_022049	CTGT	2	8	226357	226364	0 %	50 %	25 %	25 %	530321943
5104	NC_022049	CCA	2	6	226500	226505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530321943
5105	NC_022049	TTG	2	6	226510	226515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530321943
5106	NC_022049	GTC	2	6	226531	226536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530321943
5107	NC_022049	CGG	2	6	226571	226576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530321943
5108	NC_022049	GCC	3	9	226806	226814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530321944
5109	NC_022049	GAA	2	6	226866	226871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530321944
5110	NC_022049	CG	3	6	226903	226908	0 %	0 %	50 %	50 %	530321944
5111	NC_022049	GC	3	6	226946	226951	0 %	0 %	50 %	50 %	530321944
5112	NC_022049	GAT	2	6	226974	226979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530321944
5113	NC_022049	GCG	2	6	226998	227003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530321944
5114	NC_022049	CGA	2	6	227044	227049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530321944
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5117	NC_022049	GCT	2	6	227153	227158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530321944
5118	NC_022049	GGC	2	6	227164	227169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530321944
5119	NC_022049	CT	3	6	227196	227201	0 %	50 %	0 %	50 %	530321944
5120	NC_022049	TGC	2	6	227317	227322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530321944
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5122	NC_022049	CG	3	6	227386	227391	0 %	0 %	50 %	50 %	530321944
5123	NC_022049	GCTC	2	8	227407	227414	0 %	25 %	25 %	50 %	530321944
5124	NC_022049	GGTCGG	2	12	227432	227443	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	530321944
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5241	NC_022049	TCT	2	6	232596	232601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530321948
5242	NC_022049	CG	4	8	232611	232618	0 %	0 %	50 %	50 %	530321948
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5244	NC_022049	CGA	2	6	232764	232769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530321948
5245	NC_022049	CAG	2	6	232771	232776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530321948
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5361	NC_022049	CG	3	6	238388	238393	0 %	0 %	50 %	50 %	530321954
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5366	NC_022049	ACG	2	6	238541	238546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530321954
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5368	NC_022049	T	6	6	238612	238617	0 %	100 %	0 %	0 %	530321954
5369	NC_022049	GAT	2	6	238618	238623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530321954
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5397	NC_022049	TGG	2	6	240052	240057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530321955
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5403	NC_022049	CGA	2	6	240316	240321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530321955
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5443	NC_022049	CG	3	6	242513	242518	0 %	0 %	50 %	50 %	530321958
5444	NC_022049	GGCAA	2	10	242532	242541	40 %	0 %	40 %	20 %	530321958
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5448	NC_022049	GC	3	6	242709	242714	0 %	0 %	50 %	50 %	530321958
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5460	NC_022049	CGCCC	2	10	243184	243193	0 %	0 %	20 %	80 %	530321958
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5482	NC_022049	GCG	3	9	243941	243949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530321960
5483	NC_022049	TGCGCC	2	12	243960	243971	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	530321960
5484	NC_022049	CGC	2	6	243976	243981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530321960
5485	NC_022049	CGA	2	6	243997	244002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530321960
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5487	NC_022049	TGC	2	6	244063	244068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530321960
5488	NC_022049	GC	3	6	244067	244072	0 %	0 %	50 %	50 %	530321960
5489	NC_022049	TCG	2	6	244098	244103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530321960
5490	NC_022049	TGGC	2	8	244120	244127	0 %	25 %	50 %	25 %	530321960
5491	NC_022049	GCG	2	6	244142	244147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530321960
5492	NC_022049	GCG	2	6	244175	244180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530321960
5493	NC_022049	GC	3	6	244197	244202	0 %	0 %	50 %	50 %	530321960
5494	NC_022049	GCA	2	6	244204	244209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530321960
5495	NC_022049	GCG	2	6	244301	244306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530321960
5496	NC_022049	GCG	2	6	244346	244351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530321960
5497	NC_022049	GGC	3	9	244354	244362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530321960
5498	NC_022049	GCG	2	6	244373	244378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530321960
5499	NC_022049	CGG	2	6	244409	244414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530321960
5500	NC_022049	GGGC	2	8	244430	244437	0 %	0 %	75 %	25 %	530321960

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