MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas stutzeri RCH2 chromosome

Total Repeats: 94592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019936	GC	3	6	187312	187317	0 %	0 %	50 %	50 %	431925398
4002	NC_019936	CGTC	2	8	187424	187431	0 %	25 %	25 %	50 %	431925398
4003	NC_019936	GAT	2	6	187438	187443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925398
4004	NC_019936	CGT	2	6	187452	187457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925398
4005	NC_019936	GCT	2	6	187485	187490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925398
4006	NC_019936	GAC	2	6	187571	187576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925398
4007	NC_019936	CGG	2	6	187588	187593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925398
4008	NC_019936	CGC	2	6	187617	187622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925398
4009	NC_019936	TG	3	6	187686	187691	0 %	50 %	50 %	0 %	431925398
4010	NC_019936	TGA	2	6	187695	187700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925398
4011	NC_019936	CAG	2	6	187708	187713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925398
4012	NC_019936	CAG	2	6	187735	187740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925398
4013	NC_019936	CAG	2	6	187747	187752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925398
4014	NC_019936	CG	3	6	187804	187809	0 %	0 %	50 %	50 %	431925398
4015	NC_019936	TCA	2	6	187821	187826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925398
4016	NC_019936	TCC	2	6	187865	187870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431925398
4017	NC_019936	AGC	2	6	187871	187876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925398
4018	NC_019936	CGGT	2	8	187955	187962	0 %	25 %	50 %	25 %	431925398
4019	NC_019936	GTC	2	6	187963	187968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925398
4020	NC_019936	GGT	2	6	188067	188072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925398
4021	NC_019936	GCT	2	6	188091	188096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925398
4022	NC_019936	GAT	2	6	188107	188112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925398
4023	NC_019936	GTT	2	6	188119	188124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431925398
4024	NC_019936	CAG	3	9	188176	188184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925398
4025	NC_019936	TCA	2	6	188202	188207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925398
4026	NC_019936	AAT	2	6	188225	188230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431925398
4027	NC_019936	TGC	2	6	188414	188419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925399
4028	NC_019936	ATC	2	6	188455	188460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925399
4029	NC_019936	TGC	2	6	188461	188466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925399
4030	NC_019936	GAT	2	6	188472	188477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925399
4031	NC_019936	CG	3	6	188481	188486	0 %	0 %	50 %	50 %	431925399
4032	NC_019936	ACG	2	6	188491	188496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925399
4033	NC_019936	GGC	2	6	188576	188581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925399
4034	NC_019936	ACGA	2	8	188593	188600	50 %	0 %	25 %	25 %	431925399
4035	NC_019936	TCC	2	6	188632	188637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431925399
4036	NC_019936	CGG	2	6	188652	188657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925399
4037	NC_019936	TGA	2	6	188669	188674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925399
4038	NC_019936	GCGCG	2	10	188767	188776	0 %	0 %	60 %	40 %	431925399
4039	NC_019936	TGAA	2	8	188812	188819	50 %	25 %	25 %	0 %	431925399
4040	NC_019936	GCA	2	6	188822	188827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925399
4041	NC_019936	TCG	2	6	188863	188868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925399
4042	NC_019936	GCC	2	6	188880	188885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925399
4043	NC_019936	CTT	2	6	189012	189017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925399
4044	NC_019936	CG	3	6	189042	189047	0 %	0 %	50 %	50 %	431925399
4045	NC_019936	CAT	2	6	189138	189143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925399
4046	NC_019936	CGCTG	2	10	189170	189179	0 %	20 %	40 %	40 %	431925399
4047	NC_019936	GCT	2	6	189233	189238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925399
4048	NC_019936	GGC	2	6	189240	189245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925399
4049	NC_019936	GCATC	2	10	189305	189314	20 %	20 %	20 %	40 %	431925399
4050	NC_019936	CGG	2	6	189317	189322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925399
4051	NC_019936	CCG	2	6	189329	189334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925399
4052	NC_019936	CAC	2	6	189351	189356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925399
4053	NC_019936	CTG	2	6	189384	189389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925399
4054	NC_019936	GCTG	2	8	189483	189490	0 %	25 %	50 %	25 %	431925399
4055	NC_019936	TCA	2	6	189494	189499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925399
4056	NC_019936	TCC	2	6	189514	189519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431925399
4057	NC_019936	CGC	2	6	189546	189551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925399
4058	NC_019936	CCA	2	6	189560	189565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925399
4059	NC_019936	CCG	2	6	189577	189582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925399
4060	NC_019936	CGT	2	6	189588	189593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925399
4061	NC_019936	CGC	2	6	189981	189986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925400
4062	NC_019936	TGCAGC	2	12	190004	190015	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	431925400
4063	NC_019936	ATC	2	6	190051	190056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925400
4064	NC_019936	GCT	2	6	190078	190083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925400
4065	NC_019936	AGC	2	6	190091	190096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925400
4066	NC_019936	CG	3	6	190146	190151	0 %	0 %	50 %	50 %	431925400
4067	NC_019936	GC	3	6	190218	190223	0 %	0 %	50 %	50 %	431925400
4068	NC_019936	AGC	2	6	190737	190742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925401
4069	NC_019936	ATC	2	6	190894	190899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925402
4070	NC_019936	CAT	2	6	190902	190907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925402
4071	NC_019936	GGT	2	6	190927	190932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925402
4072	NC_019936	CG	3	6	191027	191032	0 %	0 %	50 %	50 %	431925402
4073	NC_019936	CTGG	2	8	191442	191449	0 %	25 %	50 %	25 %	431925403
4074	NC_019936	T	6	6	191452	191457	0 %	100 %	0 %	0 %	431925403
4075	NC_019936	GCC	2	6	191473	191478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925403
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4077	NC_019936	CTG	2	6	191507	191512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925403
4078	NC_019936	TGA	2	6	191567	191572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925403
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4080	NC_019936	GC	3	6	191650	191655	0 %	0 %	50 %	50 %	431925403
4081	NC_019936	CGT	2	6	191674	191679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925403
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4083	NC_019936	GC	3	6	191793	191798	0 %	0 %	50 %	50 %	431925403
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4085	NC_019936	GCA	2	6	191913	191918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925403
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4087	NC_019936	CCA	2	6	191963	191968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925403
4088	NC_019936	CTG	2	6	191989	191994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925403
4089	NC_019936	GGT	2	6	192033	192038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925403
4090	NC_019936	TGC	2	6	192065	192070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925403
4091	NC_019936	GCT	2	6	192087	192092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925403
4092	NC_019936	GTC	2	6	192126	192131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925403
4093	NC_019936	ATC	2	6	192163	192168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925403
4094	NC_019936	GTC	2	6	192178	192183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925403
4095	NC_019936	GC	3	6	192185	192190	0 %	0 %	50 %	50 %	431925403
4096	NC_019936	TCG	2	6	192218	192223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925403
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4099	NC_019936	TCG	2	6	192380	192385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925403
4100	NC_019936	TGG	2	6	192488	192493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925403
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4102	NC_019936	CGGTG	2	10	192549	192558	0 %	20 %	60 %	20 %	431925403
4103	NC_019936	GC	3	6	192590	192595	0 %	0 %	50 %	50 %	431925403
4104	NC_019936	TGG	2	6	192596	192601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925403
4105	NC_019936	ATC	2	6	192616	192621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925403
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4107	NC_019936	TTC	2	6	192646	192651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925403
4108	NC_019936	CGC	2	6	192805	192810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925404
4109	NC_019936	CAG	2	6	192834	192839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925404
4110	NC_019936	TCGG	2	8	192877	192884	0 %	25 %	50 %	25 %	431925404
4111	NC_019936	GC	3	6	192886	192891	0 %	0 %	50 %	50 %	431925404
4112	NC_019936	CTG	2	6	192903	192908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925404
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4115	NC_019936	CAG	2	6	192990	192995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925404
4116	NC_019936	TCT	2	6	193001	193006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925404
4117	NC_019936	CG	3	6	193061	193066	0 %	0 %	50 %	50 %	431925404
4118	NC_019936	TCG	2	6	193117	193122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925404
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4120	NC_019936	TCCA	2	8	193186	193193	25 %	25 %	0 %	50 %	431925404
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4241	NC_019936	CGTT	2	8	198961	198968	0 %	50 %	25 %	25 %	431925407
4242	NC_019936	GATC	2	8	199005	199012	25 %	25 %	25 %	25 %	431925407
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4361	NC_019936	GCCA	2	8	203630	203637	25 %	0 %	25 %	50 %	431925410
4362	NC_019936	CACCAG	2	12	203638	203649	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	431925410
4363	NC_019936	GC	3	6	203701	203706	0 %	0 %	50 %	50 %	431925410
4364	NC_019936	GCA	2	6	203784	203789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925410
4365	NC_019936	ACGC	2	8	203800	203807	25 %	0 %	25 %	50 %	431925410
4366	NC_019936	GC	3	6	203836	203841	0 %	0 %	50 %	50 %	431925410
4367	NC_019936	TCG	2	6	203855	203860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925410
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4369	NC_019936	GTA	2	6	203938	203943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925410
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4373	NC_019936	GCA	2	6	204159	204164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925410
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4380	NC_019936	GTCAGC	2	12	204417	204428	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	431925411
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4382	NC_019936	GCT	2	6	204487	204492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925411
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4385	NC_019936	TCG	2	6	204579	204584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925411
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4388	NC_019936	TCAGCA	2	12	204634	204645	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	431925411
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4390	NC_019936	CGG	2	6	204760	204765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925411
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4392	NC_019936	CGG	2	6	204799	204804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925411
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4431	NC_019936	GTGC	2	8	206722	206729	0 %	25 %	50 %	25 %	431925413
4432	NC_019936	CGA	2	6	206751	206756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925413
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4452	NC_019936	GCT	2	6	207630	207635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925414
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4460	NC_019936	TGCCGC	2	12	207797	207808	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	431925414
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4462	NC_019936	CTG	2	6	207823	207828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925414
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4465	NC_019936	TCG	2	6	207933	207938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925415
4466	NC_019936	GCT	3	9	207976	207984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925415
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4471	NC_019936	GC	3	6	208145	208150	0 %	0 %	50 %	50 %	431925415
4472	NC_019936	CTGTCG	2	12	208172	208183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925415
4473	NC_019936	GTTC	2	8	208191	208198	0 %	50 %	25 %	25 %	431925415
4474	NC_019936	GCA	2	6	208203	208208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925415
4475	NC_019936	GCG	2	6	208221	208226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925415
4476	NC_019936	GCT	2	6	208243	208248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925415
4477	NC_019936	CGG	2	6	208275	208280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925415
4478	NC_019936	TGA	2	6	208293	208298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925415
4479	NC_019936	GCCT	2	8	208310	208317	0 %	25 %	25 %	50 %	431925415
4480	NC_019936	GGC	2	6	208319	208324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925415
4481	NC_019936	GTG	2	6	208469	208474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925415
4482	NC_019936	CTT	2	6	208480	208485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925415
4483	NC_019936	CTG	2	6	208502	208507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925415
4484	NC_019936	GCT	2	6	208558	208563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925415
4485	NC_019936	GGCGAT	2	12	208721	208732	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	431925415
4486	NC_019936	GGC	2	6	208744	208749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925415
4487	NC_019936	CAA	2	6	208762	208767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431925415
4488	NC_019936	CAC	2	6	208825	208830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925415
4489	NC_019936	TGA	2	6	208836	208841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925415
4490	NC_019936	GC	3	6	208845	208850	0 %	0 %	50 %	50 %	431925415
4491	NC_019936	ACA	2	6	208860	208865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431925415
4492	NC_019936	GCT	2	6	208879	208884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925415
4493	NC_019936	AAC	2	6	208890	208895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431925415
4494	NC_019936	CTG	2	6	208949	208954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925415
4495	NC_019936	TGA	2	6	208956	208961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925415
4496	NC_019936	GGTC	2	8	208972	208979	0 %	25 %	50 %	25 %	431925415
4497	NC_019936	CGA	2	6	209022	209027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925415
4498	NC_019936	GAT	2	6	209176	209181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925415
4499	NC_019936	TGG	2	6	209376	209381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925416
4500	NC_019936	CGC	2	6	209386	209391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925416

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