MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas stutzeri RCH2 chromosome

Total Repeats: 94592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019936	CG	3	6	25440	25445	0 %	0 %	50 %	50 %	431925233
502	NC_019936	TGC	2	6	25650	25655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925233
503	NC_019936	CGCT	2	8	25664	25671	0 %	25 %	25 %	50 %	431925233
504	NC_019936	TGCC	2	8	25791	25798	0 %	25 %	25 %	50 %	431925234
505	NC_019936	CTG	2	6	25838	25843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925234
506	NC_019936	GCCA	2	8	25915	25922	25 %	0 %	25 %	50 %	431925234
507	NC_019936	GCC	2	6	26000	26005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925234
508	NC_019936	CTGG	2	8	26011	26018	0 %	25 %	50 %	25 %	431925234
509	NC_019936	AGC	2	6	26019	26024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925234
510	NC_019936	TCTGC	2	10	26035	26044	0 %	40 %	20 %	40 %	431925234
511	NC_019936	GAC	2	6	26048	26053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925234
512	NC_019936	CTGCT	2	10	26064	26073	0 %	40 %	20 %	40 %	431925234
513	NC_019936	GCC	2	6	26092	26097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925234
514	NC_019936	GCT	2	6	26098	26103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925234
515	NC_019936	GCC	2	6	26160	26165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925234
516	NC_019936	TCA	3	9	26229	26237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925234
517	NC_019936	TCA	2	6	26272	26277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925234
518	NC_019936	GC	3	6	26280	26285	0 %	0 %	50 %	50 %	431925234
519	NC_019936	CG	3	6	26362	26367	0 %	0 %	50 %	50 %	431925234
520	NC_019936	TCG	2	6	26373	26378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925234
521	NC_019936	GGC	2	6	26381	26386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925234
522	NC_019936	CGC	2	6	26421	26426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925234
523	NC_019936	ATC	2	6	26456	26461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925234
524	NC_019936	TGG	2	6	26484	26489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925234
525	NC_019936	GTCC	2	8	26499	26506	0 %	25 %	25 %	50 %	431925234
526	NC_019936	CG	3	6	26524	26529	0 %	0 %	50 %	50 %	431925234
527	NC_019936	GCC	2	6	26534	26539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925234
528	NC_019936	CAT	2	6	26579	26584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925234
529	NC_019936	TCA	2	6	26602	26607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925234
530	NC_019936	GCG	2	6	26624	26629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925234
531	NC_019936	TGG	2	6	26631	26636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925234
532	NC_019936	TGGC	2	8	26668	26675	0 %	25 %	50 %	25 %	431925234
533	NC_019936	CGG	2	6	26688	26693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925234
534	NC_019936	CCGG	2	8	26716	26723	0 %	0 %	50 %	50 %	431925234
535	NC_019936	GCT	2	6	26731	26736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925234
536	NC_019936	GCT	2	6	26743	26748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925234
537	NC_019936	AGC	2	6	26762	26767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925234
538	NC_019936	TGG	2	6	26844	26849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925234
539	NC_019936	GTG	2	6	26870	26875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925234
540	NC_019936	GCA	2	6	27063	27068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925235
541	NC_019936	CGG	2	6	27090	27095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925235
542	NC_019936	CCGA	2	8	27109	27116	25 %	0 %	25 %	50 %	431925235
543	NC_019936	TGC	2	6	27161	27166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925235
544	NC_019936	CTG	2	6	27169	27174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925235
545	NC_019936	GGA	2	6	27249	27254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431925235
546	NC_019936	CTGG	2	8	27309	27316	0 %	25 %	50 %	25 %	431925235
547	NC_019936	CGGC	2	8	27327	27334	0 %	0 %	50 %	50 %	431925235
548	NC_019936	GGC	2	6	27353	27358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925235
549	NC_019936	GC	3	6	27410	27415	0 %	0 %	50 %	50 %	431925235
550	NC_019936	GCCG	2	8	27451	27458	0 %	0 %	50 %	50 %	431925235
551	NC_019936	GC	3	6	27466	27471	0 %	0 %	50 %	50 %	431925235
552	NC_019936	GAC	2	6	27539	27544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925235
553	NC_019936	GCA	2	6	27658	27663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925236
554	NC_019936	GGT	2	6	27677	27682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925236
555	NC_019936	GCC	2	6	27690	27695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925236
556	NC_019936	ATC	2	6	27771	27776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925236
557	NC_019936	TCG	2	6	27786	27791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925236
558	NC_019936	AGCC	2	8	27826	27833	25 %	0 %	25 %	50 %	431925236
559	NC_019936	CAG	2	6	27926	27931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925236
560	NC_019936	CG	3	6	27934	27939	0 %	0 %	50 %	50 %	431925236
561	NC_019936	ACC	2	6	27993	27998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925236
562	NC_019936	T	6	6	28004	28009	0 %	100 %	0 %	0 %	431925236
563	NC_019936	CGAT	2	8	28056	28063	25 %	25 %	25 %	25 %	431925236
564	NC_019936	GC	3	6	28132	28137	0 %	0 %	50 %	50 %	431925236
565	NC_019936	GC	4	8	28143	28150	0 %	0 %	50 %	50 %	431925236
566	NC_019936	CGC	2	6	28174	28179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925236
567	NC_019936	AATG	2	8	28218	28225	50 %	25 %	25 %	0 %	431925236
568	NC_019936	GCA	2	6	28234	28239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925236
569	NC_019936	GTG	2	6	28334	28339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925236
570	NC_019936	CGG	2	6	28466	28471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925236
571	NC_019936	CG	3	6	28534	28539	0 %	0 %	50 %	50 %	431925236
572	NC_019936	GC	3	6	28555	28560	0 %	0 %	50 %	50 %	431925236
573	NC_019936	CCG	2	6	28596	28601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925236
574	NC_019936	GCTG	2	8	28603	28610	0 %	25 %	50 %	25 %	431925236
575	NC_019936	CTGCG	2	10	28839	28848	0 %	20 %	40 %	40 %	431925237
576	NC_019936	GGC	2	6	28864	28869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925237
577	NC_019936	GC	4	8	28868	28875	0 %	0 %	50 %	50 %	431925237
578	NC_019936	GGC	2	6	28906	28911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925237
579	NC_019936	GC	3	6	28940	28945	0 %	0 %	50 %	50 %	431925237
580	NC_019936	GCG	2	6	28958	28963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925237
581	NC_019936	GCC	2	6	28995	29000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925237
582	NC_019936	CAGC	2	8	29003	29010	25 %	0 %	25 %	50 %	431925237
583	NC_019936	CTT	2	6	29115	29120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925237
584	NC_019936	GAAG	2	8	29130	29137	50 %	0 %	50 %	0 %	431925237
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587	NC_019936	TAC	2	6	29185	29190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925237
588	NC_019936	CG	3	6	29226	29231	0 %	0 %	50 %	50 %	431925237
589	NC_019936	GC	3	6	29240	29245	0 %	0 %	50 %	50 %	431925237
590	NC_019936	GTG	2	6	29280	29285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925237
591	NC_019936	CG	3	6	29321	29326	0 %	0 %	50 %	50 %	431925237
592	NC_019936	GGC	2	6	29332	29337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925237
593	NC_019936	TTC	2	6	29341	29346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925237
594	NC_019936	GAC	2	6	29347	29352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925237
595	NC_019936	TGCG	2	8	29390	29397	0 %	25 %	50 %	25 %	431925237
596	NC_019936	GCG	2	6	29439	29444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925237
597	NC_019936	GCGAGC	2	12	29462	29473	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	431925237
598	NC_019936	GCT	2	6	29484	29489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925237
599	NC_019936	GGCG	2	8	29557	29564	0 %	0 %	75 %	25 %	431925237
600	NC_019936	ATCC	2	8	29571	29578	25 %	25 %	0 %	50 %	431925237
601	NC_019936	GCC	2	6	29589	29594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925237
602	NC_019936	CGC	2	6	29812	29817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925238
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604	NC_019936	CGGTG	2	10	29986	29995	0 %	20 %	60 %	20 %	431925238
605	NC_019936	GAA	2	6	30004	30009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925238
606	NC_019936	ACA	2	6	30036	30041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431925238
607	NC_019936	CTG	3	9	30107	30115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925238
608	NC_019936	CGG	2	6	30121	30126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925238
609	NC_019936	GCG	2	6	30135	30140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925238
610	NC_019936	CGC	2	6	30169	30174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925238
611	NC_019936	ATC	2	6	30179	30184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925238
612	NC_019936	ATC	2	6	30290	30295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925238
613	NC_019936	CGG	2	6	30316	30321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925238
614	NC_019936	CCAG	2	8	30352	30359	25 %	0 %	25 %	50 %	431925238
615	NC_019936	ATG	2	6	30380	30385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925238
616	NC_019936	GCA	2	6	30422	30427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925238
617	NC_019936	TGG	2	6	30462	30467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925238
618	NC_019936	TGGCG	2	10	30494	30503	0 %	20 %	60 %	20 %	431925238
619	NC_019936	TAGC	2	8	30550	30557	25 %	25 %	25 %	25 %	431925238
620	NC_019936	GATG	2	8	30576	30583	25 %	25 %	50 %	0 %	431925239
621	NC_019936	TCG	2	6	30602	30607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925239
622	NC_019936	CGG	2	6	30615	30620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925239
623	NC_019936	CGC	2	6	30664	30669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925239
624	NC_019936	CCA	2	6	30717	30722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925239
625	NC_019936	CAGCG	2	10	30728	30737	20 %	0 %	40 %	40 %	431925239
626	NC_019936	GCC	2	6	30761	30766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925239
627	NC_019936	CATC	2	8	30948	30955	25 %	25 %	0 %	50 %	431925239
628	NC_019936	CATCG	2	10	30979	30988	20 %	20 %	20 %	40 %	431925239
629	NC_019936	CAGGC	2	10	31012	31021	20 %	0 %	40 %	40 %	431925239
630	NC_019936	GTC	2	6	31042	31047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925239
631	NC_019936	GGC	2	6	31071	31076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925239
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634	NC_019936	GTC	2	6	31108	31113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925239
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645	NC_019936	TGG	2	6	31898	31903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925241
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661	NC_019936	GCCG	2	8	32571	32578	0 %	0 %	50 %	50 %	431925241
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664	NC_019936	GCT	2	6	32652	32657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925241
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703	NC_019936	CAGCT	2	10	34220	34229	20 %	20 %	20 %	40 %	431925243
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737	NC_019936	GCG	2	6	35489	35494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925244
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752	NC_019936	CGG	2	6	36174	36179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925244
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