MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudanabaena sp. PCC 7367 chromosome

Total Repeats: 67895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019701	GGT	2	6	197277	197282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216435
3002	NC_019701	AT	3	6	197447	197452	50 %	50 %	0 %	0 %	428216435
3003	NC_019701	CCA	2	6	197521	197526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216435
3004	NC_019701	ACG	2	6	197579	197584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216435
3005	NC_019701	GGT	2	6	197585	197590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216435
3006	NC_019701	TGGC	2	8	197664	197671	0 %	25 %	50 %	25 %	428216435
3007	NC_019701	TGG	2	6	197708	197713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216435
3008	NC_019701	AT	3	6	197723	197728	50 %	50 %	0 %	0 %	428216435
3009	NC_019701	GGT	2	6	197739	197744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216435
3010	NC_019701	GTT	2	6	197765	197770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216435
3011	NC_019701	TGG	2	6	197797	197802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216435
3012	NC_019701	TAC	2	6	197864	197869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216435
3013	NC_019701	TTA	2	6	197987	197992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428216435
3014	NC_019701	TAA	2	6	198011	198016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216435
3015	NC_019701	CGAT	2	8	198019	198026	25 %	25 %	25 %	25 %	428216435
3016	NC_019701	TGGT	2	8	198032	198039	0 %	50 %	50 %	0 %	428216435
3017	NC_019701	TCGA	2	8	198147	198154	25 %	25 %	25 %	25 %	428216435
3018	NC_019701	CAG	2	6	198167	198172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216435
3019	NC_019701	AT	3	6	198176	198181	50 %	50 %	0 %	0 %	428216435
3020	NC_019701	ATTG	2	8	198227	198234	25 %	50 %	25 %	0 %	428216435
3021	NC_019701	GCT	2	6	198266	198271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216435
3022	NC_019701	TCGA	2	8	198297	198304	25 %	25 %	25 %	25 %	428216435
3023	NC_019701	TCAA	2	8	198310	198317	50 %	25 %	0 %	25 %	428216435
3024	NC_019701	ATG	2	6	198444	198449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216435
3025	NC_019701	CAA	3	9	198651	198659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216436
3026	NC_019701	AAT	2	6	198807	198812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216436
3027	NC_019701	ACA	2	6	198851	198856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216436
3028	NC_019701	ATGT	2	8	198957	198964	25 %	50 %	25 %	0 %	428216436
3029	NC_019701	GAA	2	6	198993	198998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216436
3030	NC_019701	CAA	2	6	199038	199043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216436
3031	NC_019701	GGC	2	6	199059	199064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216436
3032	NC_019701	TGCTA	2	10	199094	199103	20 %	40 %	20 %	20 %	428216437
3033	NC_019701	GATCT	2	10	199116	199125	20 %	40 %	20 %	20 %	428216437
3034	NC_019701	TGA	2	6	199132	199137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216437
3035	NC_019701	GCT	2	6	199263	199268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216437
3036	NC_019701	GTT	2	6	199316	199321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216437
3037	NC_019701	T	8	8	199351	199358	0 %	100 %	0 %	0 %	428216437
3038	NC_019701	GCG	2	6	199359	199364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216437
3039	NC_019701	CGT	2	6	199392	199397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216437
3040	NC_019701	CCG	2	6	199406	199411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216437
3041	NC_019701	CTT	2	6	199447	199452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216437
3042	NC_019701	T	6	6	199451	199456	0 %	100 %	0 %	0 %	428216437
3043	NC_019701	TGG	2	6	199477	199482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216437
3044	NC_019701	TTGA	2	8	199497	199504	25 %	50 %	25 %	0 %	428216437
3045	NC_019701	TG	3	6	199598	199603	0 %	50 %	50 %	0 %	428216437
3046	NC_019701	GGCTCA	2	12	199634	199645	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428216437
3047	NC_019701	TAA	2	6	199724	199729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216437
3048	NC_019701	T	6	6	199730	199735	0 %	100 %	0 %	0 %	428216437
3049	NC_019701	TTC	2	6	199815	199820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216437
3050	NC_019701	CAC	2	6	199841	199846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216437
3051	NC_019701	TGGC	2	8	199924	199931	0 %	25 %	50 %	25 %	428216437
3052	NC_019701	GCTG	2	8	200006	200013	0 %	25 %	50 %	25 %	428216437
3053	NC_019701	CGG	2	6	200024	200029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216437
3054	NC_019701	T	6	6	200046	200051	0 %	100 %	0 %	0 %	428216437
3055	NC_019701	TGA	2	6	200059	200064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216437
3056	NC_019701	GCC	2	6	200188	200193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216437
3057	NC_019701	TGG	2	6	200200	200205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216437
3058	NC_019701	CTGC	2	8	200217	200224	0 %	25 %	25 %	50 %	428216437
3059	NC_019701	TGA	3	9	200453	200461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216438
3060	NC_019701	CA	3	6	200504	200509	50 %	0 %	0 %	50 %	428216438
3061	NC_019701	GGCAGA	2	12	200510	200521	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	428216438
3062	NC_019701	AGA	2	6	200597	200602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216438
3063	NC_019701	GCCTG	2	10	200690	200699	0 %	20 %	40 %	40 %	428216438
3064	NC_019701	CAC	2	6	200707	200712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216438
3065	NC_019701	CAAA	2	8	200918	200925	75 %	0 %	0 %	25 %	428216438
3066	NC_019701	ACCT	2	8	200956	200963	25 %	25 %	0 %	50 %	428216438
3067	NC_019701	TTG	2	6	200982	200987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216438
3068	NC_019701	TTA	2	6	201001	201006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428216438
3069	NC_019701	ATG	2	6	201007	201012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216438
3070	NC_019701	TCGA	2	8	201037	201044	25 %	25 %	25 %	25 %	428216438
3071	NC_019701	TGG	2	6	201046	201051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216438
3072	NC_019701	AGA	2	6	201074	201079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216438
3073	NC_019701	A	6	6	201084	201089	100 %	0 %	0 %	0 %	428216438
3074	NC_019701	GGC	2	6	201153	201158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216438
3075	NC_019701	GCA	2	6	201171	201176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216438
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3077	NC_019701	TCG	2	6	201352	201357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216438
3078	NC_019701	GGC	2	6	201401	201406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216438
3079	NC_019701	TCC	2	6	201411	201416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428216438
3080	NC_019701	CGG	3	9	201421	201429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216438
3081	NC_019701	A	7	7	201470	201476	100 %	0 %	0 %	0 %	428216438
3082	NC_019701	AAG	2	6	201586	201591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216438
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3086	NC_019701	GCAG	2	8	201836	201843	25 %	0 %	50 %	25 %	428216439
3087	NC_019701	CCA	2	6	202346	202351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216440
3088	NC_019701	GTG	2	6	202384	202389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216440
3089	NC_019701	CGAT	2	8	202396	202403	25 %	25 %	25 %	25 %	428216440
3090	NC_019701	CCA	2	6	202450	202455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216440
3091	NC_019701	CTCTGA	2	12	202522	202533	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428216440
3092	NC_019701	CCA	2	6	202673	202678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216440
3093	NC_019701	CAT	2	6	202685	202690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216440
3094	NC_019701	TAAT	2	8	202720	202727	50 %	50 %	0 %	0 %	428216440
3095	NC_019701	TG	3	6	202762	202767	0 %	50 %	50 %	0 %	428216440
3096	NC_019701	CAC	2	6	202805	202810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216440
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3098	NC_019701	GAA	2	6	203085	203090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216440
3099	NC_019701	TGG	2	6	203146	203151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216440
3100	NC_019701	AGCC	2	8	203204	203211	25 %	0 %	25 %	50 %	428216440
3101	NC_019701	CAA	2	6	203256	203261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216440
3102	NC_019701	GCG	2	6	203268	203273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216440
3103	NC_019701	GCA	2	6	203295	203300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216440
3104	NC_019701	TGT	2	6	203305	203310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216440
3105	NC_019701	CAGG	2	8	203322	203329	25 %	0 %	50 %	25 %	428216440
3106	NC_019701	ACT	2	6	203340	203345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216440
3107	NC_019701	AGG	2	6	203353	203358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428216440
3108	NC_019701	GCT	2	6	203448	203453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216440
3109	NC_019701	ACCGAA	2	12	203481	203492	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428216440
3110	NC_019701	ATT	3	9	203580	203588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428216440
3111	NC_019701	GCAA	2	8	203590	203597	50 %	0 %	25 %	25 %	428216440
3112	NC_019701	ACT	2	6	203733	203738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216440
3113	NC_019701	ATG	2	6	203760	203765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216440
3114	NC_019701	AACT	2	8	203864	203871	50 %	25 %	0 %	25 %	428216440
3115	NC_019701	CCT	2	6	203891	203896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428216440
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3117	NC_019701	GCA	2	6	203972	203977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216440
3118	NC_019701	AGT	2	6	203978	203983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216440
3119	NC_019701	TGG	2	6	204205	204210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216440
3120	NC_019701	GGC	2	6	204257	204262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216440
3121	NC_019701	GAT	2	6	204299	204304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216440
3122	NC_019701	CGC	2	6	204320	204325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216440
3123	NC_019701	CCA	2	6	204349	204354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216440
3124	NC_019701	ATT	2	6	204376	204381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428216440
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3126	NC_019701	CTG	2	6	204480	204485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216440
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3149	NC_019701	ATC	2	6	205533	205538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216440
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3152	NC_019701	TGCTT	2	10	205651	205660	0 %	60 %	20 %	20 %	428216440
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3212	NC_019701	AGT	2	6	209136	209141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216441
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3222	NC_019701	T	6	6	209322	209327	0 %	100 %	0 %	0 %	428216441
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3229	NC_019701	AGT	2	6	209550	209555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216441
3230	NC_019701	CTG	2	6	209560	209565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216441
3231	NC_019701	T	6	6	209586	209591	0 %	100 %	0 %	0 %	428216441
3232	NC_019701	CCG	2	6	209616	209621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216441
3233	NC_019701	CTGG	2	8	209661	209668	0 %	25 %	50 %	25 %	428216441
3234	NC_019701	TGG	3	9	209666	209674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216441
3235	NC_019701	AAT	2	6	209733	209738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216441
3236	NC_019701	GCT	2	6	209739	209744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216441
3237	NC_019701	GTG	2	6	209767	209772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216441
3238	NC_019701	ACA	2	6	209809	209814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216441
3239	NC_019701	CGAT	2	8	209887	209894	25 %	25 %	25 %	25 %	428216441
3240	NC_019701	TGGC	2	8	209950	209957	0 %	25 %	50 %	25 %	428216441
3241	NC_019701	CGAT	2	8	209965	209972	25 %	25 %	25 %	25 %	428216441
3242	NC_019701	GTG	2	6	210016	210021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216441
3243	NC_019701	GATCG	2	10	210030	210039	20 %	20 %	40 %	20 %	428216441
3244	NC_019701	TAA	2	6	210077	210082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216441
3245	NC_019701	TGG	3	9	210083	210091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216441
3246	NC_019701	CCCCTG	2	12	210118	210129	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	428216441
3247	NC_019701	GC	3	6	210154	210159	0 %	0 %	50 %	50 %	428216441
3248	NC_019701	ACA	2	6	210169	210174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216441
3249	NC_019701	CTG	2	6	210235	210240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216441
3250	NC_019701	GTA	2	6	210321	210326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216441
3251	NC_019701	TGG	2	6	210332	210337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216441
3252	NC_019701	GGT	2	6	210419	210424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216441
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3256	NC_019701	ATCG	2	8	210624	210631	25 %	25 %	25 %	25 %	428216441
3257	NC_019701	GTT	2	6	210660	210665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216441
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3262	NC_019701	GATC	2	8	210749	210756	25 %	25 %	25 %	25 %	428216441
3263	NC_019701	TGG	2	6	210764	210769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216441
3264	NC_019701	GTAATG	2	12	210829	210840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216441
3265	NC_019701	CTGA	2	8	210855	210862	25 %	25 %	25 %	25 %	428216441
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3272	NC_019701	CGAT	2	8	211533	211540	25 %	25 %	25 %	25 %	428216442
3273	NC_019701	GCT	2	6	211541	211546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216442
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3343	NC_019701	ATC	2	6	214645	214650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216443
3344	NC_019701	GCTG	2	8	214696	214703	0 %	25 %	50 %	25 %	428216443
3345	NC_019701	GGGTCA	2	12	214802	214813	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428216443
3346	NC_019701	ATAA	2	8	214887	214894	75 %	25 %	0 %	0 %	428216443
3347	NC_019701	CGAT	2	8	214921	214928	25 %	25 %	25 %	25 %	428216443
3348	NC_019701	TTC	2	6	214944	214949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216443
3349	NC_019701	TCCA	2	8	215037	215044	25 %	25 %	0 %	50 %	428216443
3350	NC_019701	CGG	2	6	215081	215086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216443
3351	NC_019701	CGG	2	6	215165	215170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216443
3352	NC_019701	TGGT	2	8	215249	215256	0 %	50 %	50 %	0 %	428216443
3353	NC_019701	AGT	2	6	215266	215271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216443
3354	NC_019701	TGC	2	6	215311	215316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216443
3355	NC_019701	AG	3	6	215318	215323	50 %	0 %	50 %	0 %	428216443
3356	NC_019701	CGC	2	6	215504	215509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216444
3357	NC_019701	CCA	2	6	215512	215517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216444
3358	NC_019701	ATGA	2	8	215697	215704	50 %	25 %	25 %	0 %	428216444
3359	NC_019701	TGG	2	6	215800	215805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216444
3360	NC_019701	TGA	2	6	215963	215968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216445
3361	NC_019701	CGC	2	6	216009	216014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216445
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3363	NC_019701	GAA	2	6	216347	216352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216446
3364	NC_019701	TGCTT	2	10	216370	216379	0 %	60 %	20 %	20 %	428216446
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3367	NC_019701	CTTG	2	8	216473	216480	0 %	50 %	25 %	25 %	428216446
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3382	NC_019701	ACT	2	6	217736	217741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216447
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3384	NC_019701	TGG	2	6	217857	217862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216447
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3393	NC_019701	TTA	2	6	218775	218780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428216449
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3473	NC_019701	TCAG	2	8	222953	222960	25 %	25 %	25 %	25 %	428216451
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3476	NC_019701	GATC	3	12	223288	223299	25 %	25 %	25 %	25 %	428216452
3477	NC_019701	TGCCA	2	10	223314	223323	20 %	20 %	20 %	40 %	428216452
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3482	NC_019701	TAA	2	6	223461	223466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216452
3483	NC_019701	TGC	2	6	223495	223500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216452
3484	NC_019701	T	6	6	223566	223571	0 %	100 %	0 %	0 %	428216452
3485	NC_019701	TGC	2	6	223578	223583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216452
3486	NC_019701	ATC	2	6	223594	223599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216452
3487	NC_019701	CCAA	2	8	223643	223650	50 %	0 %	0 %	50 %	428216452
3488	NC_019701	T	6	6	223651	223656	0 %	100 %	0 %	0 %	428216452
3489	NC_019701	ATC	2	6	223659	223664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216452
3490	NC_019701	GCA	2	6	223763	223768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216452
3491	NC_019701	ATTAAT	2	12	223779	223790	50 %	50 %	0 %	0 %	428216452
3492	NC_019701	ATG	2	6	223891	223896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216452
3493	NC_019701	CGG	2	6	223947	223952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216453
3494	NC_019701	ATCG	2	8	224082	224089	25 %	25 %	25 %	25 %	428216453
3495	NC_019701	TGC	2	6	224141	224146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216453
3496	NC_019701	AGCTGG	2	12	224198	224209	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428216453
3497	NC_019701	TCGA	2	8	224222	224229	25 %	25 %	25 %	25 %	428216453
3498	NC_019701	TGC	2	6	224297	224302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216453
3499	NC_019701	TTTG	2	8	224364	224371	0 %	75 %	25 %	0 %	428216453
3500	NC_019701	ATTTT	2	10	224615	224624	20 %	80 %	0 %	0 %	428216454

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