MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudanabaena sp. PCC 7367 chromosome

Total Repeats: 67895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_019701	ATC	2	6	167202	167207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216411
2502	NC_019701	CAT	2	6	167229	167234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216411
2503	NC_019701	ATCG	2	8	167268	167275	25 %	25 %	25 %	25 %	428216411
2504	NC_019701	G	6	6	167339	167344	0 %	0 %	100 %	0 %	428216411
2505	NC_019701	T	6	6	167369	167374	0 %	100 %	0 %	0 %	428216411
2506	NC_019701	GTG	2	6	167399	167404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216411
2507	NC_019701	AGG	2	6	167440	167445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428216411
2508	NC_019701	TCTT	2	8	167517	167524	0 %	75 %	0 %	25 %	428216411
2509	NC_019701	CTGC	2	8	167540	167547	0 %	25 %	25 %	50 %	428216411
2510	NC_019701	TAT	2	6	167561	167566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428216411
2511	NC_019701	AGGT	2	8	167669	167676	25 %	25 %	50 %	0 %	428216411
2512	NC_019701	CGATC	2	10	167708	167717	20 %	20 %	20 %	40 %	428216411
2513	NC_019701	GCC	3	9	167794	167802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216411
2514	NC_019701	CGC	2	6	167821	167826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216411
2515	NC_019701	ATC	2	6	167875	167880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216411
2516	NC_019701	GAA	2	6	167969	167974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216412
2517	NC_019701	A	6	6	168014	168019	100 %	0 %	0 %	0 %	428216412
2518	NC_019701	CTA	2	6	168021	168026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216412
2519	NC_019701	TAA	2	6	168094	168099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216412
2520	NC_019701	ATTA	2	8	168190	168197	50 %	50 %	0 %	0 %	428216412
2521	NC_019701	TTC	2	6	168200	168205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216412
2522	NC_019701	ACT	2	6	168310	168315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216412
2523	NC_019701	ATT	2	6	168413	168418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428216412
2524	NC_019701	TTC	2	6	168457	168462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216412
2525	NC_019701	ATTT	2	8	168495	168502	25 %	75 %	0 %	0 %	428216412
2526	NC_019701	A	6	6	168512	168517	100 %	0 %	0 %	0 %	428216412
2527	NC_019701	AACT	2	8	168571	168578	50 %	25 %	0 %	25 %	428216412
2528	NC_019701	CCA	3	9	168616	168624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216412
2529	NC_019701	TCC	2	6	168626	168631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428216412
2530	NC_019701	TCG	2	6	168638	168643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216412
2531	NC_019701	TAA	2	6	168645	168650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216412
2532	NC_019701	AAT	2	6	168703	168708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216412
2533	NC_019701	CTT	2	6	168763	168768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216412
2534	NC_019701	TGA	2	6	168906	168911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216412
2535	NC_019701	TTG	2	6	168992	168997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216412
2536	NC_019701	TAGT	2	8	169031	169038	25 %	50 %	25 %	0 %	428216412
2537	NC_019701	TTTA	2	8	169072	169079	25 %	75 %	0 %	0 %	428216412
2538	NC_019701	A	6	6	169205	169210	100 %	0 %	0 %	0 %	428216412
2539	NC_019701	TCA	2	6	169211	169216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216412
2540	NC_019701	ATA	2	6	169318	169323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216412
2541	NC_019701	T	6	6	169544	169549	0 %	100 %	0 %	0 %	428216413
2542	NC_019701	CAA	2	6	169565	169570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216413
2543	NC_019701	GGC	2	6	169616	169621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216413
2544	NC_019701	TCGA	2	8	169635	169642	25 %	25 %	25 %	25 %	428216413
2545	NC_019701	GAA	2	6	169673	169678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216413
2546	NC_019701	CGA	2	6	169723	169728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216413
2547	NC_019701	AAC	2	6	169752	169757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216413
2548	NC_019701	ACC	2	6	169817	169822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216413
2549	NC_019701	TTA	2	6	169893	169898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428216414
2550	NC_019701	CTT	2	6	169913	169918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216414
2551	NC_019701	GCC	4	12	169950	169961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216414
2552	NC_019701	TCT	2	6	170011	170016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216414
2553	NC_019701	TCACT	2	10	170047	170056	20 %	40 %	0 %	40 %	428216414
2554	NC_019701	CG	3	6	170162	170167	0 %	0 %	50 %	50 %	428216414
2555	NC_019701	CATA	2	8	170233	170240	50 %	25 %	0 %	25 %	428216414
2556	NC_019701	AATTAC	2	12	170342	170353	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428216414
2557	NC_019701	GCT	2	6	170355	170360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216414
2558	NC_019701	CCG	2	6	170365	170370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216414
2559	NC_019701	ATC	2	6	170444	170449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216414
2560	NC_019701	CCA	2	6	170530	170535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216414
2561	NC_019701	TCGA	2	8	170550	170557	25 %	25 %	25 %	25 %	428216414
2562	NC_019701	AGTT	2	8	170618	170625	25 %	50 %	25 %	0 %	428216414
2563	NC_019701	TCGA	2	8	170654	170661	25 %	25 %	25 %	25 %	428216414
2564	NC_019701	CGG	2	6	170680	170685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216414
2565	NC_019701	TCT	2	6	170694	170699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216414
2566	NC_019701	CCG	2	6	170750	170755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216414
2567	NC_019701	CACC	2	8	171139	171146	25 %	0 %	0 %	75 %	428216414
2568	NC_019701	GAA	2	6	171153	171158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216414
2569	NC_019701	CA	3	6	171179	171184	50 %	0 %	0 %	50 %	428216414
2570	NC_019701	CGC	2	6	171202	171207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216414
2571	NC_019701	GAT	2	6	171224	171229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216414
2572	NC_019701	CCG	2	6	171256	171261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216414
2573	NC_019701	ACC	2	6	171273	171278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216414
2574	NC_019701	ACC	2	6	171303	171308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216414
2575	NC_019701	GAT	2	6	171358	171363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216414
2576	NC_019701	GCTGG	2	10	171417	171426	0 %	20 %	60 %	20 %	428216414
2577	NC_019701	TCGA	2	8	171567	171574	25 %	25 %	25 %	25 %	428216415
2578	NC_019701	TTC	2	6	171585	171590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216415
2579	NC_019701	TCT	2	6	171594	171599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216415
2580	NC_019701	ACC	2	6	171663	171668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216415
2581	NC_019701	AAT	2	6	171698	171703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216415
2582	NC_019701	CTTG	2	8	171732	171739	0 %	50 %	25 %	25 %	428216415
2583	NC_019701	ATCG	2	8	171950	171957	25 %	25 %	25 %	25 %	428216415
2584	NC_019701	CAACC	2	10	171991	172000	40 %	0 %	0 %	60 %	428216415
2585	NC_019701	CCA	2	6	172018	172023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216415
2586	NC_019701	AATA	2	8	172055	172062	75 %	25 %	0 %	0 %	428216415
2587	NC_019701	CAC	2	6	172079	172084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216415
2588	NC_019701	AGC	2	6	172155	172160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216415
2589	NC_019701	GCC	2	6	172172	172177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216415
2590	NC_019701	GCT	2	6	172251	172256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216415
2591	NC_019701	T	7	7	172411	172417	0 %	100 %	0 %	0 %	428216415
2592	NC_019701	CTT	2	6	172431	172436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216415
2593	NC_019701	TAAT	2	8	172953	172960	50 %	50 %	0 %	0 %	428216416
2594	NC_019701	ATG	2	6	173067	173072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216416
2595	NC_019701	CAC	2	6	173120	173125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216416
2596	NC_019701	TGG	2	6	173249	173254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216416
2597	NC_019701	CAG	2	6	173291	173296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216416
2598	NC_019701	GATT	2	8	173386	173393	25 %	50 %	25 %	0 %	428216416
2599	NC_019701	TAG	2	6	173428	173433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216416
2600	NC_019701	TC	3	6	173486	173491	0 %	50 %	0 %	50 %	428216416
2601	NC_019701	CGCT	2	8	173493	173500	0 %	25 %	25 %	50 %	428216416
2602	NC_019701	AC	3	6	173561	173566	50 %	0 %	0 %	50 %	428216416
2603	NC_019701	CAG	2	6	173579	173584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216416
2604	NC_019701	CGAT	2	8	173614	173621	25 %	25 %	25 %	25 %	428216416
2605	NC_019701	CCCA	2	8	173649	173656	25 %	0 %	0 %	75 %	428216416
2606	NC_019701	CAG	2	6	173712	173717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216416
2607	NC_019701	CTT	2	6	173726	173731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216416
2608	NC_019701	ACC	2	6	173802	173807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216416
2609	NC_019701	GCG	2	6	173824	173829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216416
2610	NC_019701	ATA	2	6	173839	173844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216416
2611	NC_019701	GA	3	6	173867	173872	50 %	0 %	50 %	0 %	428216416
2612	NC_019701	CGC	2	6	173948	173953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216416
2613	NC_019701	GTA	2	6	174091	174096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216416
2614	NC_019701	CCA	2	6	174115	174120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216416
2615	NC_019701	GC	3	6	174142	174147	0 %	0 %	50 %	50 %	428216416
2616	NC_019701	ATCTCG	2	12	174151	174162	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428216416
2617	NC_019701	CTT	2	6	174203	174208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216416
2618	NC_019701	CAG	2	6	174308	174313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216416
2619	NC_019701	GCG	2	6	174324	174329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216416
2620	NC_019701	CCA	2	6	174340	174345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216416
2621	NC_019701	AAT	2	6	174411	174416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216416
2622	NC_019701	TCG	2	6	174520	174525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216416
2623	NC_019701	GCG	2	6	174541	174546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216416
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2747	NC_019701	GGA	2	6	181322	181327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428216422
2748	NC_019701	GTAG	2	8	181331	181338	25 %	25 %	50 %	0 %	428216422
2749	NC_019701	AGTT	2	8	181437	181444	25 %	50 %	25 %	0 %	428216422
2750	NC_019701	TAA	3	9	181537	181545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216422
2751	NC_019701	T	6	6	181613	181618	0 %	100 %	0 %	0 %	428216422
2752	NC_019701	AGA	2	6	181641	181646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216422
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2988	NC_019701	ATC	2	6	195894	195899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216434
2989	NC_019701	GCAA	2	8	195955	195962	50 %	0 %	25 %	25 %	428216434
2990	NC_019701	CTGGGG	2	12	196028	196039	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	428216434
2991	NC_019701	CAT	2	6	196742	196747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216435
2992	NC_019701	AAGTT	2	10	196777	196786	40 %	40 %	20 %	0 %	428216435
2993	NC_019701	AATC	2	8	196811	196818	50 %	25 %	0 %	25 %	428216435
2994	NC_019701	TTC	2	6	196886	196891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216435
2995	NC_019701	GGT	2	6	196894	196899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216435
2996	NC_019701	GGC	2	6	196931	196936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216435
2997	NC_019701	TGG	3	9	197011	197019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216435
2998	NC_019701	TGA	2	6	197093	197098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216435
2999	NC_019701	ACC	2	6	197102	197107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216435
3000	NC_019701	CAG	2	6	197127	197132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216435

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