MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudanabaena sp. PCC 7367 chromosome

Total Repeats: 67895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019701	TCGA	2	8	102696	102703	25 %	25 %	25 %	25 %	428216362
1502	NC_019701	ACA	2	6	102763	102768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216362
1503	NC_019701	AATG	2	8	102795	102802	50 %	25 %	25 %	0 %	428216362
1504	NC_019701	AAT	2	6	102856	102861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216362
1505	NC_019701	CCT	2	6	103377	103382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428216363
1506	NC_019701	ATCG	2	8	103400	103407	25 %	25 %	25 %	25 %	428216363
1507	NC_019701	T	7	7	103416	103422	0 %	100 %	0 %	0 %	428216363
1508	NC_019701	CAG	2	6	103488	103493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216363
1509	NC_019701	TAA	2	6	103557	103562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216363
1510	NC_019701	AAG	2	6	103589	103594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216363
1511	NC_019701	TGGG	2	8	103612	103619	0 %	25 %	75 %	0 %	428216363
1512	NC_019701	A	6	6	103723	103728	100 %	0 %	0 %	0 %	428216363
1513	NC_019701	TG	3	6	103733	103738	0 %	50 %	50 %	0 %	428216363
1514	NC_019701	CAG	2	6	103813	103818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216363
1515	NC_019701	GGAA	2	8	103836	103843	50 %	0 %	50 %	0 %	428216363
1516	NC_019701	AAT	2	6	103903	103908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216363
1517	NC_019701	GA	3	6	103925	103930	50 %	0 %	50 %	0 %	428216363
1518	NC_019701	G	7	7	104034	104040	0 %	0 %	100 %	0 %	428216363
1519	NC_019701	GGT	2	6	104049	104054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216363
1520	NC_019701	GATC	2	8	104055	104062	25 %	25 %	25 %	25 %	428216363
1521	NC_019701	TTA	2	6	104140	104145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428216363
1522	NC_019701	GCG	2	6	104163	104168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216363
1523	NC_019701	TGC	2	6	104202	104207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216363
1524	NC_019701	C	8	8	104207	104214	0 %	0 %	0 %	100 %	428216363
1525	NC_019701	ATG	3	9	104237	104245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216363
1526	NC_019701	CTG	2	6	104255	104260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216363
1527	NC_019701	AATT	2	8	104270	104277	50 %	50 %	0 %	0 %	428216363
1528	NC_019701	GT	3	6	104285	104290	0 %	50 %	50 %	0 %	428216363
1529	NC_019701	TGG	2	6	104291	104296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216363
1530	NC_019701	CACC	2	8	104339	104346	25 %	0 %	0 %	75 %	428216363
1531	NC_019701	ACCC	2	8	104375	104382	25 %	0 %	0 %	75 %	428216363
1532	NC_019701	GAT	2	6	104532	104537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216363
1533	NC_019701	TGA	2	6	104625	104630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216363
1534	NC_019701	TCT	2	6	104633	104638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216363
1535	NC_019701	CTGCCG	2	12	105736	105747	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	428216364
1536	NC_019701	GGC	2	6	105878	105883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216364
1537	NC_019701	A	6	6	105899	105904	100 %	0 %	0 %	0 %	428216364
1538	NC_019701	TCGA	2	8	105914	105921	25 %	25 %	25 %	25 %	428216364
1539	NC_019701	GCT	2	6	105931	105936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216364
1540	NC_019701	AAG	2	6	105966	105971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216364
1541	NC_019701	CTA	2	6	106071	106076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216364
1542	NC_019701	AC	3	6	106145	106150	50 %	0 %	0 %	50 %	428216364
1543	NC_019701	AATTT	2	10	106204	106213	40 %	60 %	0 %	0 %	428216364
1544	NC_019701	ATC	2	6	106244	106249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216364
1545	NC_019701	TAG	2	6	106263	106268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216364
1546	NC_019701	ATG	2	6	106343	106348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216364
1547	NC_019701	GTA	2	6	106401	106406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216364
1548	NC_019701	TGGC	2	8	106444	106451	0 %	25 %	50 %	25 %	428216364
1549	NC_019701	ACC	2	6	106455	106460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216364
1550	NC_019701	GTA	2	6	106466	106471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216364
1551	NC_019701	CTG	2	6	106502	106507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216364
1552	NC_019701	GC	3	6	106541	106546	0 %	0 %	50 %	50 %	428216364
1553	NC_019701	TCCCT	2	10	106579	106588	0 %	40 %	0 %	60 %	428216364
1554	NC_019701	GCTA	3	12	106718	106729	25 %	25 %	25 %	25 %	428216365
1555	NC_019701	ATC	2	6	106809	106814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216365
1556	NC_019701	CAT	2	6	106816	106821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216365
1557	NC_019701	ACC	3	9	106875	106883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216365
1558	NC_019701	CAT	2	6	106894	106899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216365
1559	NC_019701	TCA	2	6	106965	106970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216365
1560	NC_019701	GTT	3	9	107020	107028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216365
1561	NC_019701	C	6	6	107030	107035	0 %	0 %	0 %	100 %	428216365
1562	NC_019701	GAG	2	6	107087	107092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428216365
1563	NC_019701	CTT	2	6	107104	107109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216365
1564	NC_019701	CTT	2	6	107120	107125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216365
1565	NC_019701	TAAAT	2	10	107186	107195	60 %	40 %	0 %	0 %	428216365
1566	NC_019701	CGG	2	6	107220	107225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216365
1567	NC_019701	ATCG	2	8	107267	107274	25 %	25 %	25 %	25 %	428216365
1568	NC_019701	TCT	2	6	107295	107300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216365
1569	NC_019701	TAC	3	9	107357	107365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216365
1570	NC_019701	ATC	2	6	107445	107450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216365
1571	NC_019701	GAA	2	6	107463	107468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216365
1572	NC_019701	TCA	2	6	107482	107487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216365
1573	NC_019701	ATGT	2	8	107781	107788	25 %	50 %	25 %	0 %	428216366
1574	NC_019701	GAAG	2	8	107934	107941	50 %	0 %	50 %	0 %	428216366
1575	NC_019701	GTGAT	2	10	108092	108101	20 %	40 %	40 %	0 %	428216366
1576	NC_019701	GCCAGA	3	18	108135	108152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216366
1577	NC_019701	AGA	2	6	108183	108188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216366
1578	NC_019701	CCCG	2	8	108213	108220	0 %	0 %	25 %	75 %	428216366
1579	NC_019701	GTA	2	6	108274	108279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216366
1580	NC_019701	CGA	2	6	108330	108335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216366
1581	NC_019701	CGG	2	6	108467	108472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216366
1582	NC_019701	ATT	2	6	108539	108544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428216366
1583	NC_019701	GCGG	2	8	108652	108659	0 %	0 %	75 %	25 %	428216366
1584	NC_019701	TGC	2	6	108747	108752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216366
1585	NC_019701	CTA	2	6	108753	108758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216366
1586	NC_019701	TGG	2	6	108764	108769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216366
1587	NC_019701	TCG	2	6	108777	108782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216366
1588	NC_019701	TAT	2	6	108784	108789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428216366
1589	NC_019701	TGC	2	6	108954	108959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216366
1590	NC_019701	CTT	2	6	108960	108965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216366
1591	NC_019701	ATT	2	6	108970	108975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428216366
1592	NC_019701	TGT	2	6	109064	109069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216366
1593	NC_019701	ATG	2	6	109229	109234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216366
1594	NC_019701	GAT	2	6	109354	109359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216366
1595	NC_019701	G	6	6	109443	109448	0 %	0 %	100 %	0 %	428216366
1596	NC_019701	TAA	3	9	109476	109484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216366
1597	NC_019701	ATT	2	6	109548	109553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428216366
1598	NC_019701	TTC	2	6	109576	109581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216366
1599	NC_019701	CAT	2	6	109588	109593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216366
1600	NC_019701	GAA	2	6	109747	109752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216366
1601	NC_019701	TGA	2	6	109788	109793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216366
1602	NC_019701	GCA	2	6	109818	109823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216366
1603	NC_019701	CGAT	2	8	109880	109887	25 %	25 %	25 %	25 %	428216366
1604	NC_019701	ATT	2	6	110074	110079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428216367
1605	NC_019701	CAG	2	6	110133	110138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216367
1606	NC_019701	CAC	2	6	110178	110183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216367
1607	NC_019701	CGG	2	6	110236	110241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216367
1608	NC_019701	ACT	2	6	110252	110257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216367
1609	NC_019701	GGC	2	6	110291	110296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216367
1610	NC_019701	AAC	2	6	110308	110313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216367
1611	NC_019701	ATT	2	6	110363	110368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428216367
1612	NC_019701	GGC	2	6	110405	110410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216367
1613	NC_019701	ATT	2	6	110510	110515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428216367
1614	NC_019701	TGCC	2	8	110548	110555	0 %	25 %	25 %	50 %	428216367
1615	NC_019701	GGC	2	6	110570	110575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216367
1616	NC_019701	GATC	2	8	110576	110583	25 %	25 %	25 %	25 %	428216367
1617	NC_019701	TTGG	2	8	110722	110729	0 %	50 %	50 %	0 %	428216367
1618	NC_019701	CTAC	2	8	110760	110767	25 %	25 %	0 %	50 %	428216367
1619	NC_019701	GGT	2	6	110777	110782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216367
1620	NC_019701	AGA	2	6	110813	110818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216367
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1622	NC_019701	TCAAT	2	10	110900	110909	40 %	40 %	0 %	20 %	428216367
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1744	NC_019701	A	7	7	119977	119983	100 %	0 %	0 %	0 %	428216373
1745	NC_019701	CTG	2	6	120032	120037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216373
1746	NC_019701	GGC	2	6	120104	120109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216373
1747	NC_019701	CATGAC	2	12	120202	120213	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428216373
1748	NC_019701	TGC	2	6	120222	120227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216373
1749	NC_019701	TGC	2	6	120376	120381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216373
1750	NC_019701	TGT	2	6	120396	120401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216373
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1762	NC_019701	TG	3	6	121646	121651	0 %	50 %	50 %	0 %	428216375
1763	NC_019701	GCC	2	6	121682	121687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216375
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1765	NC_019701	A	6	6	121747	121752	100 %	0 %	0 %	0 %	428216375
1766	NC_019701	CAT	2	6	121800	121805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216375
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1860	NC_019701	TGA	2	6	126971	126976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216380
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1865	NC_019701	CGA	2	6	127381	127386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216380
1866	NC_019701	AGC	2	6	127401	127406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216380
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1868	NC_019701	CAAG	2	8	127539	127546	50 %	0 %	25 %	25 %	428216380
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1879	NC_019701	AAT	2	6	128336	128341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216381
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1985	NC_019701	GTG	2	6	135485	135490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216391
1986	NC_019701	GC	3	6	135491	135496	0 %	0 %	50 %	50 %	428216391
1987	NC_019701	TCGA	2	8	135510	135517	25 %	25 %	25 %	25 %	428216391
1988	NC_019701	CCA	2	6	135570	135575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216391
1989	NC_019701	TGA	2	6	135759	135764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216391
1990	NC_019701	CGC	2	6	135775	135780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216391
1991	NC_019701	CTG	2	6	135875	135880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216391
1992	NC_019701	CTT	2	6	135900	135905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216391
1993	NC_019701	CAT	2	6	136033	136038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216391
1994	NC_019701	CTG	2	6	136197	136202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216391
1995	NC_019701	TCA	2	6	136235	136240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216391
1996	NC_019701	TA	3	6	136258	136263	50 %	50 %	0 %	0 %	428216391
1997	NC_019701	A	6	6	136277	136282	100 %	0 %	0 %	0 %	428216391
1998	NC_019701	CAA	2	6	136306	136311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216391
1999	NC_019701	AAT	2	6	136367	136372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216391
2000	NC_019701	CTG	2	6	136403	136408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216391

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