MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Pseudomonas putida ND6 plasmid pND6-2

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018746	TC	3	6	3696	3701	0 %	50 %	0 %	50 %	408669195
2	NC_018746	TC	3	6	5367	5372	0 %	50 %	0 %	50 %	408669197
3	NC_018746	TC	3	6	6525	6530	0 %	50 %	0 %	50 %	408669198
4	NC_018746	TC	4	8	7659	7666	0 %	50 %	0 %	50 %	408669199
5	NC_018746	AG	3	6	8681	8686	50 %	0 %	50 %	0 %	408669201
6	NC_018746	CT	3	6	9142	9147	0 %	50 %	0 %	50 %	408669202
7	NC_018746	CA	3	6	10038	10043	50 %	0 %	0 %	50 %	408669203
8	NC_018746	TG	3	6	11577	11582	0 %	50 %	50 %	0 %	408669206
9	NC_018746	TC	3	6	12222	12227	0 %	50 %	0 %	50 %	408669207
10	NC_018746	TA	3	6	12361	12366	50 %	50 %	0 %	0 %	408669208
11	NC_018746	GC	3	6	13365	13370	0 %	0 %	50 %	50 %	408669209
12	NC_018746	CT	3	6	16868	16873	0 %	50 %	0 %	50 %	408669213
13	NC_018746	CA	3	6	17299	17304	50 %	0 %	0 %	50 %	408669213
14	NC_018746	TC	3	6	18649	18654	0 %	50 %	0 %	50 %	408669216
15	NC_018746	TC	3	6	19248	19253	0 %	50 %	0 %	50 %	408669216
16	NC_018746	TC	3	6	19578	19583	0 %	50 %	0 %	50 %	408669217
17	NC_018746	TC	3	6	20400	20405	0 %	50 %	0 %	50 %	408669219
18	NC_018746	TC	3	6	21531	21536	0 %	50 %	0 %	50 %	408669222
19	NC_018746	AC	3	6	21551	21556	50 %	0 %	0 %	50 %	408669222
20	NC_018746	CT	3	6	21842	21847	0 %	50 %	0 %	50 %	408669222
21	NC_018746	AC	3	6	22584	22589	50 %	0 %	0 %	50 %	408669223
22	NC_018746	CT	3	6	24257	24262	0 %	50 %	0 %	50 %	408669223
23	NC_018746	AC	3	6	27707	27712	50 %	0 %	0 %	50 %	408669228
24	NC_018746	TC	3	6	27774	27779	0 %	50 %	0 %	50 %	408669228
25	NC_018746	GA	3	6	28019	28024	50 %	0 %	50 %	0 %	408669228
26	NC_018746	GT	3	6	29092	29097	0 %	50 %	50 %	0 %	408669229
27	NC_018746	TG	3	6	29577	29582	0 %	50 %	50 %	0 %	408669229
28	NC_018746	AC	3	6	30504	30509	50 %	0 %	0 %	50 %	408669231
29	NC_018746	TC	3	6	30894	30899	0 %	50 %	0 %	50 %	408669231
30	NC_018746	CT	3	6	32360	32365	0 %	50 %	0 %	50 %	408669233
31	NC_018746	CA	3	6	32440	32445	50 %	0 %	0 %	50 %	408669233
32	NC_018746	CT	3	6	35451	35456	0 %	50 %	0 %	50 %	408669233
33	NC_018746	CA	3	6	37452	37457	50 %	0 %	0 %	50 %	408669233
34	NC_018746	GC	3	6	37993	37998	0 %	0 %	50 %	50 %	408669234
35	NC_018746	GC	3	6	39929	39934	0 %	0 %	50 %	50 %	408669235
36	NC_018746	GA	3	6	41459	41464	50 %	0 %	50 %	0 %	408669238
37	NC_018746	CT	3	6	43563	43568	0 %	50 %	0 %	50 %	408669242
38	NC_018746	TG	3	6	45838	45843	0 %	50 %	50 %	0 %	408669243
39	NC_018746	CT	3	6	47658	47663	0 %	50 %	0 %	50 %	408669247
40	NC_018746	CA	3	6	50031	50036	50 %	0 %	0 %	50 %	408669253
41	NC_018746	GT	3	6	52574	52579	0 %	50 %	50 %	0 %	408669256
42	NC_018746	GC	3	6	53830	53835	0 %	0 %	50 %	50 %	408669257
43	NC_018746	CA	3	6	54044	54049	50 %	0 %	0 %	50 %	408669257
44	NC_018746	AG	3	6	58289	58294	50 %	0 %	50 %	0 %	408669264
45	NC_018746	GA	3	6	59233	59238	50 %	0 %	50 %	0 %	408669265
46	NC_018746	GC	3	6	60454	60459	0 %	0 %	50 %	50 %	408669267
47	NC_018746	TC	3	6	61467	61472	0 %	50 %	0 %	50 %	408669268
48	NC_018746	GA	3	6	61730	61735	50 %	0 %	50 %	0 %	408669268
49	NC_018746	GC	3	6	62386	62391	0 %	0 %	50 %	50 %	408669270
50	NC_018746	TC	3	6	62412	62417	0 %	50 %	0 %	50 %	408669270
51	NC_018746	TC	3	6	64185	64190	0 %	50 %	0 %	50 %	408669273
52	NC_018746	GC	3	6	65603	65608	0 %	0 %	50 %	50 %	408669274
53	NC_018746	GC	3	6	67121	67126	0 %	0 %	50 %	50 %	408669277
54	NC_018746	GC	3	6	69979	69984	0 %	0 %	50 %	50 %	408669277
55	NC_018746	GA	3	6	70391	70396	50 %	0 %	50 %	0 %	408669277
56	NC_018746	TC	3	6	71246	71251	0 %	50 %	0 %	50 %	408669277
57	NC_018746	CT	3	6	71569	71574	0 %	50 %	0 %	50 %	408669277
58	NC_018746	AG	3	6	71587	71592	50 %	0 %	50 %	0 %	408669277
59	NC_018746	GC	3	6	76142	76147	0 %	0 %	50 %	50 %	408669281
60	NC_018746	AG	3	6	76316	76321	50 %	0 %	50 %	0 %	408669281
61	NC_018746	AC	3	6	76722	76727	50 %	0 %	0 %	50 %	408669281
62	NC_018746	GT	3	6	77342	77347	0 %	50 %	50 %	0 %	408669282
63	NC_018746	CA	3	6	78091	78096	50 %	0 %	0 %	50 %	408669284
64	NC_018746	CT	4	8	78866	78873	0 %	50 %	0 %	50 %	408669286
65	NC_018746	GT	3	6	79595	79600	0 %	50 %	50 %	0 %	408669288
66	NC_018746	AT	3	6	81546	81551	50 %	50 %	0 %	0 %	408669288
67	NC_018746	TG	3	6	83465	83470	0 %	50 %	50 %	0 %	408669290
68	NC_018746	TA	3	6	83709	83714	50 %	50 %	0 %	0 %	408669290
69	NC_018746	CA	3	6	88847	88852	50 %	0 %	0 %	50 %	408669297
70	NC_018746	GA	3	6	95443	95448	50 %	0 %	50 %	0 %	408669303
71	NC_018746	CG	3	6	95838	95843	0 %	0 %	50 %	50 %	408669304
72	NC_018746	TC	3	6	97100	97105	0 %	50 %	0 %	50 %	408669305
73	NC_018746	GC	3	6	100315	100320	0 %	0 %	50 %	50 %	408669310
74	NC_018746	CT	3	6	101274	101279	0 %	50 %	0 %	50 %	408669311
75	NC_018746	CT	3	6	101514	101519	0 %	50 %	0 %	50 %	408669311
76	NC_018746	TC	3	6	106094	106099	0 %	50 %	0 %	50 %	408669317
77	NC_018746	GA	3	6	109481	109486	50 %	0 %	50 %	0 %	408669319
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79	NC_018746	GC	3	6	110976	110981	0 %	0 %	50 %	50 %	408669321
80	NC_018746	GT	3	6	111324	111329	0 %	50 %	50 %	0 %	408669321
81	NC_018746	GA	3	6	111427	111432	50 %	0 %	50 %	0 %	408669321
82	NC_018746	GT	3	6	111521	111526	0 %	50 %	50 %	0 %	408669321
83	NC_018746	GC	3	6	113029	113034	0 %	0 %	50 %	50 %	408669323
84	NC_018746	TC	3	6	113717	113722	0 %	50 %	0 %	50 %	408669324
85	NC_018746	GA	3	6	115202	115207	50 %	0 %	50 %	0 %	408669325

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.