MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Pseudomonas putida DOT-T1E chromosome

Total Repeats: 87383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018220	CAT	2	6	172	177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397692771
2	NC_018220	CGT	2	6	325	330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692771
3	NC_018220	CGC	2	6	331	336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692771
4	NC_018220	GGC	2	6	370	375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692771
5	NC_018220	CTG	2	6	380	385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692771
6	NC_018220	GGC	2	6	425	430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692771
7	NC_018220	TGC	2	6	435	440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692771
8	NC_018220	GTT	2	6	452	457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397692771
9	NC_018220	GTT	2	6	467	472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397692771
10	NC_018220	GTT	2	6	482	487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397692771
11	NC_018220	TTG	2	6	516	521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397692771
12	NC_018220	CGA	2	6	550	555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692771
13	NC_018220	CCA	2	6	586	591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692771
14	NC_018220	GTA	2	6	605	610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397692771
15	NC_018220	GCG	3	9	616	624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692771
16	NC_018220	CGG	2	6	635	640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692771
17	NC_018220	GGT	3	9	668	676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397692771
18	NC_018220	TGG	3	9	730	738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397692771
19	NC_018220	GCT	2	6	743	748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692771
20	NC_018220	GCT	2	6	830	835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692771
21	NC_018220	CGG	2	6	847	852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692771
22	NC_018220	TGG	2	6	861	866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397692771
23	NC_018220	CAT	2	6	892	897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397692771
24	NC_018220	CCA	2	6	979	984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692771
25	NC_018220	GCT	2	6	1009	1014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692771
26	NC_018220	TCG	2	6	1035	1040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692771
27	NC_018220	CCG	2	6	1664	1669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692772
28	NC_018220	AGC	2	6	1733	1738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692772
29	NC_018220	CGG	2	6	1741	1746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692772
30	NC_018220	GCC	2	6	1786	1791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692772
31	NC_018220	TGC	2	6	1926	1931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692773
32	NC_018220	GCT	2	6	1932	1937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692773
33	NC_018220	CAG	2	6	1960	1965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692773
34	NC_018220	CAC	2	6	2004	2009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692773
35	NC_018220	GCA	2	6	2018	2023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692773
36	NC_018220	CAG	2	6	2190	2195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692773
37	NC_018220	CGG	2	6	2298	2303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692773
38	NC_018220	CAC	2	6	2401	2406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692773
39	NC_018220	GCC	2	6	2646	2651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692774
40	NC_018220	ACC	2	6	2656	2661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692774
41	NC_018220	CAA	2	6	2673	2678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397692774
42	NC_018220	CGC	2	6	2754	2759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692774
43	NC_018220	ACA	2	6	2843	2848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397692774
44	NC_018220	AGC	3	9	2896	2904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692774
45	NC_018220	CGG	2	6	3033	3038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692774
46	NC_018220	CAG	2	6	3057	3062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692774
47	NC_018220	CAG	2	6	3066	3071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692774
48	NC_018220	CAG	2	6	3096	3101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692774
49	NC_018220	CAA	2	6	3174	3179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397692774
50	NC_018220	CGC	2	6	3210	3215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692774
51	NC_018220	GCC	2	6	3249	3254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692774
52	NC_018220	CCA	2	6	3255	3260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692774
53	NC_018220	GCC	2	6	3264	3269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692774
54	NC_018220	CAG	2	6	3306	3311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692774
55	NC_018220	CAC	2	6	3320	3325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692774
56	NC_018220	GGC	2	6	3402	3407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692774
57	NC_018220	CCA	2	6	3413	3418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692774
58	NC_018220	CGG	2	6	3657	3662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692775
59	NC_018220	CCA	2	6	3678	3683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692775
60	NC_018220	GCC	2	6	3741	3746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692775
61	NC_018220	TCC	2	6	3929	3934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397692775
62	NC_018220	CAG	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692775
63	NC_018220	GCT	2	6	4706	4711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692776
64	NC_018220	CAC	2	6	4733	4738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692776
65	NC_018220	TGG	2	6	4846	4851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397692776
66	NC_018220	GCA	2	6	4951	4956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692777
67	NC_018220	GAT	2	6	5075	5080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397692777
68	NC_018220	CAG	2	6	5102	5107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692777
69	NC_018220	GAT	3	9	5123	5131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397692777
70	NC_018220	GTG	2	6	5264	5269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397692778
71	NC_018220	CGC	2	6	5292	5297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692778
72	NC_018220	CTG	2	6	5334	5339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692778
73	NC_018220	CCT	2	6	5363	5368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397692778
74	NC_018220	AGC	2	6	5407	5412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692778
75	NC_018220	GCG	2	6	5500	5505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692778
76	NC_018220	GCT	2	6	5528	5533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692778
77	NC_018220	GCC	2	6	5542	5547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692778
78	NC_018220	CCA	2	6	5579	5584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692778
79	NC_018220	GCA	2	6	5602	5607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692778
80	NC_018220	TCA	2	6	5723	5728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397692778
81	NC_018220	AGC	2	6	5951	5956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692779
82	NC_018220	GCG	2	6	6158	6163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692779
83	NC_018220	TGG	2	6	6183	6188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397692779
84	NC_018220	GCG	2	6	6192	6197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692779
85	NC_018220	CAC	2	6	6207	6212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692779
86	NC_018220	CTG	2	6	6236	6241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692779
87	NC_018220	GGC	2	6	6272	6277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692779
88	NC_018220	GAC	2	6	6320	6325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692779
89	NC_018220	GCA	2	6	6333	6338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692779
90	NC_018220	GAA	2	6	6565	6570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397692779
91	NC_018220	AAC	2	6	6614	6619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397692779
92	NC_018220	GCC	2	6	6650	6655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692779
93	NC_018220	CGG	2	6	6671	6676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692779
94	NC_018220	GCC	2	6	6753	6758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692779
95	NC_018220	GCT	2	6	6760	6765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692779
96	NC_018220	GCG	2	6	6845	6850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692779
97	NC_018220	TCA	2	6	7010	7015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397692780
98	NC_018220	TCA	2	6	7083	7088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397692780
99	NC_018220	GCT	2	6	7180	7185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692780
100	NC_018220	GAT	2	6	7246	7251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397692780
101	NC_018220	CCA	2	6	7296	7301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692780
102	NC_018220	CGG	2	6	7304	7309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692780
103	NC_018220	GCT	2	6	7401	7406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692780
104	NC_018220	TGC	2	6	7410	7415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692780
105	NC_018220	AGT	3	9	7419	7427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397692780
106	NC_018220	GGC	2	6	7513	7518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692780
107	NC_018220	GGA	2	6	7521	7526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397692780
108	NC_018220	GTT	2	6	7549	7554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397692780
109	NC_018220	GCA	2	6	7810	7815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692781
110	NC_018220	GAT	2	6	7865	7870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397692781
111	NC_018220	GCA	2	6	7930	7935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692781
112	NC_018220	ACC	3	9	8019	8027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692781
113	NC_018220	TCG	2	6	8040	8045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692781
114	NC_018220	CAG	2	6	8084	8089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692781
115	NC_018220	GCT	2	6	8159	8164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692781
116	NC_018220	GCC	2	6	8333	8338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692781
117	NC_018220	TGC	2	6	8419	8424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692781
118	NC_018220	CAG	2	6	8453	8458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692781
119	NC_018220	GGC	2	6	8486	8491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692781
120	NC_018220	GAA	2	6	8567	8572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397692781
121	NC_018220	CTG	2	6	8944	8949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692782
122	NC_018220	CGG	2	6	8952	8957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692782
123	NC_018220	CTG	2	6	8983	8988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692782
124	NC_018220	CGA	2	6	9009	9014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692782
125	NC_018220	GCG	2	6	9074	9079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692782
126	NC_018220	CGC	2	6	9132	9137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692782
127	NC_018220	GCC	2	6	9220	9225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692782
128	NC_018220	GCC	2	6	9247	9252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692782
129	NC_018220	AAC	2	6	9254	9259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397692782
130	NC_018220	ACC	2	6	9299	9304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692782
131	NC_018220	CTG	2	6	9370	9375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692782
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252	NC_018220	CGG	2	6	18128	18133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692792
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