MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus sp. ST04 chromosome

Total Repeats: 32038

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_017946	GCC	2	6	81316	81321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389851529
1503	NC_017946	T	6	6	81330	81335	0 %	100 %	0 %	0 %	389851529
1504	NC_017946	TCC	2	6	81343	81348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851529
1505	NC_017946	CTTT	2	8	81356	81363	0 %	75 %	0 %	25 %	389851529
1506	NC_017946	CA	3	6	81409	81414	50 %	0 %	0 %	50 %	389851529
1507	NC_017946	TGG	2	6	81453	81458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389851529
1508	NC_017946	CTC	2	6	81507	81512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851529
1509	NC_017946	ATC	2	6	81523	81528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389851529
1510	NC_017946	CCA	2	6	81662	81667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389851529
1511	NC_017946	ATC	2	6	81670	81675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389851530
1512	NC_017946	CCT	2	6	81710	81715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851530
1513	NC_017946	GAA	2	6	81719	81724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389851530
1514	NC_017946	GTA	2	6	81742	81747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389851530
1515	NC_017946	AGC	2	6	81785	81790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389851530
1516	NC_017946	AG	3	6	81815	81820	50 %	0 %	50 %	0 %	389851530
1517	NC_017946	CTGGG	2	10	81824	81833	0 %	20 %	60 %	20 %	389851530
1518	NC_017946	GTTCT	2	10	81837	81846	0 %	60 %	20 %	20 %	389851530
1519	NC_017946	GCC	3	9	81909	81917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389851530
1520	NC_017946	TAT	2	6	82169	82174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389851530
1521	NC_017946	GTA	2	6	82376	82381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389851530
1522	NC_017946	TTG	2	6	82390	82395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389851530
1523	NC_017946	TAT	2	6	82418	82423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389851530
1524	NC_017946	TTC	2	6	82476	82481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851530
1525	NC_017946	GAG	2	6	82558	82563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389851531
1526	NC_017946	GAC	2	6	82684	82689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389851531
1527	NC_017946	TCC	2	6	82767	82772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851531
1528	NC_017946	GCC	2	6	82808	82813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389851531
1529	NC_017946	CTTA	2	8	82825	82832	25 %	50 %	0 %	25 %	389851531
1530	NC_017946	CAT	2	6	82915	82920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389851531
1531	NC_017946	AAG	2	6	82937	82942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389851531
1532	NC_017946	GCA	2	6	83030	83035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389851531
1533	NC_017946	ATT	2	6	83057	83062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389851531
1534	NC_017946	AT	3	6	83068	83073	50 %	50 %	0 %	0 %	389851531
1535	NC_017946	CCT	2	6	83212	83217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851531
1536	NC_017946	TCT	2	6	83482	83487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851532
1537	NC_017946	GGA	2	6	83492	83497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389851532
1538	NC_017946	CAC	2	6	83537	83542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389851532
1539	NC_017946	CAG	2	6	83648	83653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389851532
1540	NC_017946	CCT	2	6	83654	83659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851532
1541	NC_017946	GAA	2	6	83670	83675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389851532
1542	NC_017946	AGT	2	6	83720	83725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389851532
1543	NC_017946	TGGAAC	2	12	83820	83831	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	389851532
1544	NC_017946	TAG	2	6	83852	83857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389851532
1545	NC_017946	GTT	2	6	83941	83946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389851532
1546	NC_017946	AGT	2	6	83981	83986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389851532
1547	NC_017946	CTT	2	6	84018	84023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851532
1548	NC_017946	TGAA	2	8	84061	84068	50 %	25 %	25 %	0 %	389851532
1549	NC_017946	CTG	2	6	84092	84097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389851532
1550	NC_017946	CTT	2	6	84111	84116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851532
1551	NC_017946	AT	3	6	84129	84134	50 %	50 %	0 %	0 %	389851532
1552	NC_017946	CCT	2	6	84230	84235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851532
1553	NC_017946	AGA	2	6	84278	84283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389851532
1554	NC_017946	TCCT	2	8	84332	84339	0 %	50 %	0 %	50 %	389851532
1555	NC_017946	AGCC	2	8	84373	84380	25 %	0 %	25 %	50 %	389851532
1556	NC_017946	TAATC	2	10	84394	84403	40 %	40 %	0 %	20 %	389851532
1557	NC_017946	CAA	2	6	84419	84424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389851532
1558	NC_017946	CTC	2	6	84450	84455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851532
1559	NC_017946	CT	3	6	84562	84567	0 %	50 %	0 %	50 %	389851532
1560	NC_017946	TGG	2	6	84570	84575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389851532
1561	NC_017946	TCC	2	6	84612	84617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851532
1562	NC_017946	GAA	2	6	84912	84917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389851533
1563	NC_017946	AT	3	6	84935	84940	50 %	50 %	0 %	0 %	389851533
1564	NC_017946	AGA	2	6	84984	84989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389851533
1565	NC_017946	CATA	2	8	85054	85061	50 %	25 %	0 %	25 %	389851533
1566	NC_017946	A	6	6	85102	85107	100 %	0 %	0 %	0 %	389851533
1567	NC_017946	A	6	6	85115	85120	100 %	0 %	0 %	0 %	389851533
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1571	NC_017946	GAA	2	6	85315	85320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389851533
1572	NC_017946	AT	3	6	85349	85354	50 %	50 %	0 %	0 %	389851533
1573	NC_017946	ACG	2	6	85433	85438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389851533
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1581	NC_017946	TCA	2	6	86098	86103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389851534
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1584	NC_017946	ATT	2	6	86239	86244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389851535
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1590	NC_017946	CTT	2	6	86943	86948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851536
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1592	NC_017946	AGGC	2	8	87047	87054	25 %	0 %	50 %	25 %	389851536
1593	NC_017946	TCC	2	6	87098	87103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851536
1594	NC_017946	ATA	2	6	87142	87147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389851536
1595	NC_017946	ATA	2	6	87160	87165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389851536
1596	NC_017946	AGA	2	6	87297	87302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389851537
1597	NC_017946	TGG	2	6	87442	87447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389851537
1598	NC_017946	A	7	7	87486	87492	100 %	0 %	0 %	0 %	389851537
1599	NC_017946	A	6	6	87503	87508	100 %	0 %	0 %	0 %	389851537
1600	NC_017946	GGAA	2	8	87533	87540	50 %	0 %	50 %	0 %	389851537
1601	NC_017946	AGGAA	2	10	87579	87588	60 %	0 %	40 %	0 %	389851537
1602	NC_017946	GA	3	6	87654	87659	50 %	0 %	50 %	0 %	389851537
1603	NC_017946	TTC	2	6	87770	87775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851538
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1606	NC_017946	CACT	2	8	88003	88010	25 %	25 %	0 %	50 %	389851538
1607	NC_017946	GAAC	2	8	88048	88055	50 %	0 %	25 %	25 %	389851538
1608	NC_017946	AC	3	6	88058	88063	50 %	0 %	0 %	50 %	389851538
1609	NC_017946	AGGG	2	8	88107	88114	25 %	0 %	75 %	0 %	389851538
1610	NC_017946	CGG	2	6	88192	88197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389851538
1611	NC_017946	TCCT	2	8	88222	88229	0 %	50 %	0 %	50 %	389851538
1612	NC_017946	CT	3	6	88306	88311	0 %	50 %	0 %	50 %	389851538
1613	NC_017946	CTC	2	6	88344	88349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851538
1614	NC_017946	ATC	2	6	88356	88361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389851538
1615	NC_017946	TTC	2	6	88373	88378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851538
1616	NC_017946	TTA	2	6	88429	88434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389851538
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1619	NC_017946	TTCAAC	2	12	88619	88630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389851538
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1621	NC_017946	CCAG	2	8	88710	88717	25 %	0 %	25 %	50 %	389851538
1622	NC_017946	GT	3	6	88824	88829	0 %	50 %	50 %	0 %	389851538
1623	NC_017946	TTC	2	6	88886	88891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851538
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1625	NC_017946	TAT	2	6	89192	89197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389851538
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