MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Pantoea ananatis AJ13355 plasmid pEA320

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017533	GGCAAA	2	12	5007	5018	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386018366
2	NC_017533	CGGTTT	2	12	5327	5338	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386018366
3	NC_017533	TGATCA	2	12	16489	16500	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386018376
4	NC_017533	ACCGTA	2	12	34776	34787	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386018390
5	NC_017533	TAAAGT	2	12	37997	38008	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386018394
6	NC_017533	CTGTTG	2	12	38340	38351	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386018394
7	NC_017533	GCCACG	2	12	42481	42492	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386018399
8	NC_017533	ATGGAT	2	12	47387	47398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386018403
9	NC_017533	CATGAC	2	12	56589	56600	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386018412
10	NC_017533	TATCAG	2	12	60866	60877	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386018417
11	NC_017533	CTCTTT	2	12	61913	61924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386018418
12	NC_017533	TGGGGC	2	12	70136	70147	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386018425
13	NC_017533	ATCAAT	2	12	71552	71563	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386018426
14	NC_017533	CCGTCA	2	12	72156	72167	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386018426
15	NC_017533	TGGCAA	2	12	73274	73285	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386018427
16	NC_017533	GCCAGC	2	12	82741	82752	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386018434
17	NC_017533	CTTGCC	2	12	89607	89618	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386018439
18	NC_017533	CTGGCG	2	12	92365	92376	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386018441
19	NC_017533	TGGCGA	2	12	95896	95907	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386018445
20	NC_017533	TGCCAG	2	12	100471	100482	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386018452
21	NC_017533	GATGAA	2	12	107154	107165	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386018457
22	NC_017533	GGTGAG	2	12	107489	107500	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386018457
23	NC_017533	TATCCA	2	12	110372	110383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386018458
24	NC_017533	AATGGC	2	12	112376	112387	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386018459
25	NC_017533	GAAGGT	2	12	113508	113519	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386018460
26	NC_017533	GTTATG	2	12	115750	115761	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386018462
27	NC_017533	TGTCAG	2	12	123423	123434	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386018471
28	NC_017533	CGTCAT	2	12	126103	126114	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386018476
29	NC_017533	GAAGTT	2	12	127760	127771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386018479
30	NC_017533	TGCCAG	2	12	131619	131630	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386018482
31	NC_017533	AAGATG	2	12	134214	134225	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386018485
32	NC_017533	CAGCAA	2	12	134841	134852	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386018485
33	NC_017533	GAATTT	2	12	144894	144905	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386018495
34	NC_017533	CTGGAG	2	12	145131	145142	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386018495
35	NC_017533	TGAACT	2	12	146686	146697	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386018496
36	NC_017533	ATTGAT	2	12	146749	146760	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386018497
37	NC_017533	GCCGTT	2	12	148506	148517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386018498
38	NC_017533	AGGGCG	2	12	149932	149943	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386018500
39	NC_017533	GCCAAA	2	12	150408	150419	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386018500
40	NC_017533	CGCTGG	2	12	151162	151173	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386018500
41	NC_017533	CGCTGG	2	12	151678	151689	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386018500
42	NC_017533	GATAGC	2	12	155868	155879	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386018502
43	NC_017533	TTATGC	2	12	159173	159184	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386018506
44	NC_017533	TGCGGC	2	12	162764	162775	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386018508
45	NC_017533	TCACGC	2	12	165178	165189	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386018509
46	NC_017533	AAAATA	2	12	181194	181205	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386018524
47	NC_017533	TTATCG	2	12	186914	186925	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386018530
48	NC_017533	TTGGCG	2	12	190309	190320	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386018532
49	NC_017533	GATTCA	2	12	191564	191575	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386018532
50	NC_017533	TCACTT	2	12	193184	193195	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386018533
51	NC_017533	CCTTAT	2	12	196232	196243	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386018536
52	NC_017533	CCGGCA	2	12	202841	202852	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386018541
53	NC_017533	GGCAAA	2	12	207028	207039	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386018545
54	NC_017533	CCGTTT	2	12	209210	209221	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386018547
55	NC_017533	GATTGC	2	12	221720	221731	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386018559
56	NC_017533	CCGCTT	2	12	235874	235885	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386018575
57	NC_017533	ACGTTC	2	12	243896	243907	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386018580
58	NC_017533	ACTTCA	2	12	252742	252753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386018585
59	NC_017533	CCTCTG	2	12	253010	253021	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386018585
60	NC_017533	TTTTAC	2	12	255142	255153	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386018587
61	NC_017533	CTTCGC	2	12	259602	259613	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386018592
62	NC_017533	TACATC	2	12	260287	260298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386018592
63	NC_017533	CAGCGG	2	12	268190	268201	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386018598
64	NC_017533	GCCGGC	2	12	268856	268867	0 %	0 %	50 %	50 %	386018599
65	NC_017533	CCAGCA	2	12	269038	269049	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386018599
66	NC_017533	TCCGGC	2	12	269831	269842	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386018600
67	NC_017533	ACCGCG	2	12	270062	270073	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386018600
68	NC_017533	CCTGTG	2	12	273028	273039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386018602
69	NC_017533	GGCAAT	2	12	273556	273567	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386018603
70	NC_017533	TCCTGA	2	12	275339	275350	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386018604
71	NC_017533	GCCGAA	2	12	277731	277742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386018606
72	NC_017533	AACAGT	2	12	278028	278039	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386018606
73	NC_017533	ATGTTG	2	12	282046	282057	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386018612
74	NC_017533	CTGAAT	2	12	287873	287884	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386018617
75	NC_017533	CCTCAC	2	12	290911	290922	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386018620
76	NC_017533	TGAAAA	2	12	295141	295152	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386018624
77	NC_017533	ATCGGC	2	12	301512	301523	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386018628
78	NC_017533	AAGATG	2	12	307661	307672	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386018635
79	NC_017533	GACCAT	2	12	309699	309710	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386018637
80	NC_017533	CCTGTG	2	12	310722	310733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386018637
81	NC_017533	CTGATA	2	12	313462	313473	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386018637
82	NC_017533	TATGCG	2	12	317577	317588	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386018637

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.