MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017530	TGC	2	6	221956	221961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009833
4002	NC_017530	GAA	2	6	221970	221975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009833
4003	NC_017530	GC	3	6	222054	222059	0 %	0 %	50 %	50 %	386009833
4004	NC_017530	AGC	3	9	222109	222117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009833
4005	NC_017530	GC	3	6	222196	222201	0 %	0 %	50 %	50 %	386009833
4006	NC_017530	GCA	2	6	222203	222208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009833
4007	NC_017530	TGT	2	6	222246	222251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386009833
4008	NC_017530	AC	3	6	222286	222291	50 %	0 %	0 %	50 %	386009833
4009	NC_017530	CAG	2	6	222297	222302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009833
4010	NC_017530	CAG	2	6	222309	222314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009833
4011	NC_017530	GACT	2	8	222359	222366	25 %	25 %	25 %	25 %	386009833
4012	NC_017530	AGC	2	6	223374	223379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4013	NC_017530	GCTG	2	8	223520	223527	0 %	25 %	50 %	25 %	386009834
4014	NC_017530	GGC	2	6	223604	223609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4015	NC_017530	GCA	2	6	223640	223645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4016	NC_017530	TGC	2	6	223652	223657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4017	NC_017530	ACT	2	6	223671	223676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009834
4018	NC_017530	CCG	2	6	223690	223695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009834
4019	NC_017530	TCA	2	6	223704	223709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009834
4020	NC_017530	GGT	3	9	223713	223721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009834
4021	NC_017530	CGG	2	6	223727	223732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4022	NC_017530	GGGCT	2	10	223803	223812	0 %	20 %	60 %	20 %	386009834
4023	NC_017530	GAA	2	6	223833	223838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009834
4024	NC_017530	CTG	2	6	223845	223850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4025	NC_017530	CAA	2	6	223862	223867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
4026	NC_017530	ACC	2	6	223890	223895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009834
4027	NC_017530	ACC	2	6	223986	223991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009834
4028	NC_017530	TACT	2	8	223999	224006	25 %	50 %	0 %	25 %	386009834
4029	NC_017530	AC	3	6	224083	224088	50 %	0 %	0 %	50 %	386009834
4030	NC_017530	GTA	2	6	224128	224133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009834
4031	NC_017530	GGT	2	6	224139	224144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009834
4032	NC_017530	ACC	2	6	224205	224210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009834
4033	NC_017530	GTGACC	2	12	224298	224309	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4034	NC_017530	TCA	2	6	224326	224331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009834
4035	NC_017530	ACA	2	6	224392	224397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
4036	NC_017530	CGG	2	6	224435	224440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4037	NC_017530	ACC	3	9	224505	224513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009834
4038	NC_017530	GGC	2	6	224547	224552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4039	NC_017530	ACA	2	6	224692	224697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
4040	NC_017530	GGC	2	6	224736	224741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4041	NC_017530	ACC	3	9	224805	224813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009834
4042	NC_017530	GGC	2	6	224847	224852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4043	NC_017530	ACA	2	6	224992	224997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
4044	NC_017530	GGC	2	6	225147	225152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4045	NC_017530	ACA	2	6	225292	225297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
4046	NC_017530	CGG	2	6	225335	225340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4047	NC_017530	CCA	2	6	225406	225411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009834
4048	NC_017530	GGC	2	6	225447	225452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4049	NC_017530	ACA	2	6	225592	225597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
4050	NC_017530	GGC	2	6	225636	225641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4051	NC_017530	CCA	2	6	225706	225711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009834
4052	NC_017530	GGC	2	6	225747	225752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4053	NC_017530	ACA	2	6	225892	225897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
4054	NC_017530	CCA	2	6	226006	226011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009834
4055	NC_017530	GGC	2	6	226047	226052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4056	NC_017530	TCA	2	6	226126	226131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009834
4057	NC_017530	ACA	2	6	226192	226197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
4058	NC_017530	CGG	2	6	226235	226240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4059	NC_017530	CCA	2	6	226306	226311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009834
4060	NC_017530	GGC	2	6	226347	226352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4061	NC_017530	ACA	2	6	226492	226497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
4062	NC_017530	ACT	2	6	226608	226613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009834
4063	NC_017530	GGC	2	6	226647	226652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4064	NC_017530	ACA	2	6	226792	226797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
4065	NC_017530	GGC	2	6	226836	226841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4066	NC_017530	TCA	2	6	226885	226890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009834
4067	NC_017530	GCAATG	2	12	226927	226938	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386009834
4068	NC_017530	CAG	2	6	226950	226955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4069	NC_017530	CCTT	2	8	226956	226963	0 %	50 %	0 %	50 %	386009834
4070	NC_017530	CCGT	2	8	226991	226998	0 %	25 %	25 %	50 %	386009834
4071	NC_017530	GTG	2	6	227211	227216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009834
4072	NC_017530	ACTG	2	8	227222	227229	25 %	25 %	25 %	25 %	386009834
4073	NC_017530	CAA	2	6	227282	227287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
4074	NC_017530	ACT	2	6	227343	227348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009834
4075	NC_017530	GTC	2	6	227349	227354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4076	NC_017530	CAC	2	6	227369	227374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009834
4077	NC_017530	GCC	2	6	227391	227396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009834
4078	NC_017530	ACCA	2	8	227418	227425	50 %	0 %	0 %	50 %	386009834
4079	NC_017530	GGT	2	6	227429	227434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009834
4080	NC_017530	GCG	2	6	227455	227460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4081	NC_017530	AACCTG	2	12	227481	227492	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386009834
4082	NC_017530	CGA	2	6	227522	227527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4083	NC_017530	CAA	2	6	227669	227674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
4084	NC_017530	ACG	2	6	227722	227727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4085	NC_017530	CGG	2	6	227782	227787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4086	NC_017530	TGC	2	6	227801	227806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4087	NC_017530	CGA	2	6	227861	227866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4088	NC_017530	GGT	2	6	227867	227872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009834
4089	NC_017530	GGC	2	6	227907	227912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4090	NC_017530	CAA	2	6	227939	227944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
4091	NC_017530	ACT	2	6	228000	228005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009834
4092	NC_017530	GTC	2	6	228006	228011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4093	NC_017530	CAC	2	6	228026	228031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009834
4094	NC_017530	GCC	2	6	228048	228053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009834
4095	NC_017530	ACCA	2	8	228075	228082	50 %	0 %	0 %	50 %	386009834
4096	NC_017530	GGT	2	6	228086	228091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009834
4097	NC_017530	GCG	2	6	228112	228117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4098	NC_017530	AACCTG	2	12	228138	228149	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386009834
4099	NC_017530	CGA	2	6	228179	228184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4100	NC_017530	CAA	2	6	228326	228331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
4101	NC_017530	GC	3	6	228364	228369	0 %	0 %	50 %	50 %	386009834
4102	NC_017530	ACG	2	6	228379	228384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4103	NC_017530	CGG	2	6	228439	228444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4104	NC_017530	TGC	2	6	228458	228463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4105	NC_017530	TGC	2	6	228488	228493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4106	NC_017530	CGA	2	6	228518	228523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4107	NC_017530	GTG	2	6	228525	228530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009834
4108	NC_017530	CAA	2	6	228596	228601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
4109	NC_017530	CAC	2	6	228656	228661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009834
4110	NC_017530	GTC	2	6	228663	228668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4111	NC_017530	CAC	2	6	228683	228688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009834
4112	NC_017530	GCG	2	6	228769	228774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4113	NC_017530	AACCTG	2	12	228795	228806	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386009834
4114	NC_017530	CGA	2	6	228836	228841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4115	NC_017530	CAA	2	6	228983	228988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
4116	NC_017530	GC	3	6	229021	229026	0 %	0 %	50 %	50 %	386009834
4117	NC_017530	TGC	2	6	229115	229120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4118	NC_017530	CGA	2	6	229175	229180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4119	NC_017530	GTG	2	6	229182	229187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009834
4120	NC_017530	CAA	2	6	229253	229258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
4121	NC_017530	CAA	2	6	229274	229279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
4122	NC_017530	CAC	2	6	229313	229318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009834
4123	NC_017530	CGT	3	9	229319	229327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4124	NC_017530	CAC	2	6	229340	229345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009834
4125	NC_017530	GGT	2	6	229400	229405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009834
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4237	NC_017530	CGA	2	6	234809	234814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009834
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4360	NC_017530	ACC	2	6	241773	241778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009834
4361	NC_017530	GGC	2	6	241824	241829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
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4477	NC_017530	GGC	2	6	248559	248564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4478	NC_017530	CAT	2	6	248756	248761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009834
4479	NC_017530	GTC	2	6	248790	248795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4480	NC_017530	ACGT	2	8	248820	248827	25 %	25 %	25 %	25 %	386009834
4481	NC_017530	AGA	2	6	248833	248838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009834
4482	NC_017530	TGGCAA	2	12	248951	248962	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386009834
4483	NC_017530	GGT	2	6	248982	248987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009834
4484	NC_017530	TGG	2	6	249002	249007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009834
4485	NC_017530	CTG	2	6	249024	249029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4486	NC_017530	CGA	2	6	249068	249073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4487	NC_017530	ACG	2	6	249133	249138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4488	NC_017530	CAA	2	6	249152	249157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
4489	NC_017530	CTG	2	6	249189	249194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4490	NC_017530	GCA	2	6	249208	249213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4491	NC_017530	CAC	2	6	249236	249241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009834
4492	NC_017530	CAG	2	6	249269	249274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4493	NC_017530	GGT	2	6	249297	249302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009834
4494	NC_017530	GCG	2	6	249376	249381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4495	NC_017530	CAT	3	9	249392	249400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009834
4496	NC_017530	CAA	2	6	249404	249409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
4497	NC_017530	GCAAC	2	10	249576	249585	40 %	0 %	20 %	40 %	386009835
4498	NC_017530	GCC	2	6	249586	249591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009835
4499	NC_017530	TGC	2	6	249599	249604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009835
4500	NC_017530	AGC	2	6	249612	249617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009835

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