MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017530	GGC	2	6	186225	186230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009812
3502	NC_017530	GCA	2	6	186240	186245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009812
3503	NC_017530	GGC	2	6	186247	186252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009812
3504	NC_017530	GCA	2	6	186253	186258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009812
3505	NC_017530	GGT	2	6	186268	186273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009812
3506	NC_017530	CACCGT	2	12	186276	186287	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386009812
3507	NC_017530	CGAG	2	8	186288	186295	25 %	0 %	50 %	25 %	386009812
3508	NC_017530	ACC	2	6	186296	186301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009812
3509	NC_017530	CCGA	2	8	186320	186327	25 %	0 %	25 %	50 %	386009812
3510	NC_017530	ATC	2	6	186398	186403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009812
3511	NC_017530	CAT	2	6	186472	186477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009812
3512	NC_017530	ACC	2	6	186499	186504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009812
3513	NC_017530	TGA	2	6	186585	186590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009812
3514	NC_017530	AGGT	2	8	186877	186884	25 %	25 %	50 %	0 %	386009813
3515	NC_017530	TGG	2	6	187004	187009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009813
3516	NC_017530	CGAGC	2	10	187056	187065	20 %	0 %	40 %	40 %	386009813
3517	NC_017530	CGAT	2	8	187154	187161	25 %	25 %	25 %	25 %	386009813
3518	NC_017530	CCA	2	6	187339	187344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009814
3519	NC_017530	CAG	2	6	187431	187436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009814
3520	NC_017530	CT	3	6	187491	187496	0 %	50 %	0 %	50 %	386009814
3521	NC_017530	TCT	2	6	187522	187527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009814
3522	NC_017530	GGC	2	6	187571	187576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009814
3523	NC_017530	TGC	2	6	187631	187636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009814
3524	NC_017530	TGC	2	6	187647	187652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009814
3525	NC_017530	GCT	2	6	187667	187672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009814
3526	NC_017530	CAG	2	6	187689	187694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009814
3527	NC_017530	AAGCAG	2	12	187722	187733	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386009814
3528	NC_017530	GCT	2	6	187778	187783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009814
3529	NC_017530	GCCA	2	8	187795	187802	25 %	0 %	25 %	50 %	386009814
3530	NC_017530	GCTT	2	8	187816	187823	0 %	50 %	25 %	25 %	386009814
3531	NC_017530	CG	3	6	187910	187915	0 %	0 %	50 %	50 %	386009814
3532	NC_017530	ATG	2	6	187981	187986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009814
3533	NC_017530	GCA	2	6	188027	188032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009814
3534	NC_017530	GTT	2	6	188055	188060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386009814
3535	NC_017530	AGT	2	6	188072	188077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009814
3536	NC_017530	CGG	2	6	188102	188107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009814
3537	NC_017530	TCG	2	6	188131	188136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009814
3538	NC_017530	TCG	2	6	188191	188196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009814
3539	NC_017530	GCA	2	6	188213	188218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009814
3540	NC_017530	CGT	2	6	188273	188278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009814
3541	NC_017530	GGC	2	6	188324	188329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009814
3542	NC_017530	GGC	2	6	188345	188350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009814
3543	NC_017530	GCA	2	6	188372	188377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009814
3544	NC_017530	CAGC	2	8	188417	188424	25 %	0 %	25 %	50 %	386009814
3545	NC_017530	GGCG	2	8	188474	188481	0 %	0 %	75 %	25 %	386009814
3546	NC_017530	TGA	2	6	188498	188503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009814
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3548	NC_017530	GCT	2	6	188646	188651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009814
3549	NC_017530	CGC	2	6	188705	188710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009814
3550	NC_017530	CTG	2	6	188724	188729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009814
3551	NC_017530	GTC	2	6	188757	188762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009814
3552	NC_017530	TTC	2	6	188799	188804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009814
3553	NC_017530	GCA	2	6	188915	188920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009814
3554	NC_017530	CAG	2	6	188928	188933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009814
3555	NC_017530	CGGT	2	8	188959	188966	0 %	25 %	50 %	25 %	386009814
3556	NC_017530	CGG	3	9	188972	188980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009814
3557	NC_017530	GCA	2	6	189002	189007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009814
3558	NC_017530	GCG	2	6	189009	189014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009814
3559	NC_017530	GGCA	2	8	189060	189067	25 %	0 %	50 %	25 %	386009814
3560	NC_017530	TGT	2	6	189068	189073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386009814
3561	NC_017530	TCG	2	6	189142	189147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009814
3562	NC_017530	TGTT	2	8	189168	189175	0 %	75 %	25 %	0 %	386009814
3563	NC_017530	GGCG	2	8	189222	189229	0 %	0 %	75 %	25 %	386009814
3564	NC_017530	AGC	2	6	189235	189240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009814
3565	NC_017530	AGC	2	6	189256	189261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009814
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3567	NC_017530	CG	3	6	189322	189327	0 %	0 %	50 %	50 %	386009815
3568	NC_017530	CTCG	2	8	189337	189344	0 %	25 %	25 %	50 %	386009815
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3585	NC_017530	TCG	2	6	189771	189776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009816
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3587	NC_017530	CTGG	2	8	189821	189828	0 %	25 %	50 %	25 %	386009816
3588	NC_017530	TGA	2	6	189841	189846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009816
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3590	NC_017530	CATGG	2	10	189869	189878	20 %	20 %	40 %	20 %	386009816
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3593	NC_017530	GCTG	2	8	190142	190149	0 %	25 %	50 %	25 %	386009817
3594	NC_017530	GTC	2	6	190178	190183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009817
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3599	NC_017530	GCCA	2	8	190283	190290	25 %	0 %	25 %	50 %	386009817
3600	NC_017530	AGC	2	6	190296	190301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009817
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3602	NC_017530	ATG	2	6	190332	190337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009817
3603	NC_017530	CAG	2	6	190705	190710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009818
3604	NC_017530	GAC	2	6	190734	190739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009818
3605	NC_017530	CAG	3	9	190762	190770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009818
3606	NC_017530	GC	3	6	190781	190786	0 %	0 %	50 %	50 %	386009818
3607	NC_017530	ATG	2	6	190856	190861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009818
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3611	NC_017530	CAGCG	2	10	191345	191354	20 %	0 %	40 %	40 %	386009819
3612	NC_017530	CA	3	6	191369	191374	50 %	0 %	0 %	50 %	386009819
3613	NC_017530	TCGC	2	8	191386	191393	0 %	25 %	25 %	50 %	386009819
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3619	NC_017530	GAT	2	6	191669	191674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009819
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3621	NC_017530	GCG	2	6	191774	191779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009819
3622	NC_017530	AAGCT	2	10	191811	191820	40 %	20 %	20 %	20 %	386009819
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3983	NC_017530	CAG	2	6	221043	221048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009833
3984	NC_017530	CCA	2	6	221102	221107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009833
3985	NC_017530	GCC	2	6	221109	221114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009833
3986	NC_017530	GAT	2	6	221133	221138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009833
3987	NC_017530	CAG	2	6	221187	221192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009833
3988	NC_017530	GAT	2	6	221439	221444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009833
3989	NC_017530	ATG	2	6	221470	221475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009833
3990	NC_017530	GGTCAG	2	12	221523	221534	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386009833
3991	NC_017530	CGAGG	2	10	221535	221544	20 %	0 %	60 %	20 %	386009833
3992	NC_017530	GCCG	2	8	221599	221606	0 %	0 %	50 %	50 %	386009833
3993	NC_017530	GAT	2	6	221652	221657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009833
3994	NC_017530	GGTC	2	8	221660	221667	0 %	25 %	50 %	25 %	386009833
3995	NC_017530	CAC	2	6	221784	221789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009833
3996	NC_017530	TCA	2	6	221804	221809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009833
3997	NC_017530	GCG	2	6	221816	221821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009833
3998	NC_017530	GGC	2	6	221853	221858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009833
3999	NC_017530	TGC	2	6	221882	221887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009833
4000	NC_017530	GCA	2	6	221888	221893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009833

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