MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017530	ATC	2	6	57765	57770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009691
1002	NC_017530	TGG	2	6	57894	57899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009692
1003	NC_017530	AAG	2	6	57918	57923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009692
1004	NC_017530	CTG	2	6	57947	57952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009692
1005	NC_017530	GAG	2	6	57977	57982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386009692
1006	NC_017530	CCA	2	6	58048	58053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009692
1007	NC_017530	GAT	2	6	58069	58074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009692
1008	NC_017530	GCG	2	6	58077	58082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009692
1009	NC_017530	GCG	2	6	58182	58187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009692
1010	NC_017530	TGA	3	9	58224	58232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009692
1011	NC_017530	ACC	2	6	58233	58238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009692
1012	NC_017530	AAGC	2	8	58255	58262	50 %	0 %	25 %	25 %	386009692
1013	NC_017530	CCG	2	6	58283	58288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009692
1014	NC_017530	TAA	2	6	58848	58853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386009693
1015	NC_017530	TCG	2	6	58959	58964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009693
1016	NC_017530	CCA	2	6	58983	58988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009693
1017	NC_017530	GCAC	2	8	58992	58999	25 %	0 %	25 %	50 %	386009693
1018	NC_017530	CAG	2	6	59027	59032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009693
1019	NC_017530	GTT	2	6	59036	59041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386009693
1020	NC_017530	ACC	2	6	59055	59060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009693
1021	NC_017530	CCA	2	6	59074	59079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009693
1022	NC_017530	GC	3	6	59182	59187	0 %	0 %	50 %	50 %	386009693
1023	NC_017530	CAGCT	2	10	59306	59315	20 %	20 %	20 %	40 %	386009693
1024	NC_017530	CAG	2	6	59363	59368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009693
1025	NC_017530	GTG	2	6	59388	59393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009693
1026	NC_017530	CAG	2	6	59438	59443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009693
1027	NC_017530	CGG	2	6	59548	59553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009693
1028	NC_017530	CAC	3	9	59597	59605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009693
1029	NC_017530	CCAG	2	8	59665	59672	25 %	0 %	25 %	50 %	386009693
1030	NC_017530	GGC	2	6	59797	59802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009693
1031	NC_017530	AAC	2	6	59819	59824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009693
1032	NC_017530	CTG	2	6	59933	59938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009693
1033	NC_017530	CGG	2	6	59961	59966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009693
1034	NC_017530	CTT	2	6	59983	59988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009693
1035	NC_017530	TGCG	2	8	60088	60095	0 %	25 %	50 %	25 %	386009693
1036	NC_017530	CCA	2	6	60097	60102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009693
1037	NC_017530	GCT	2	6	60112	60117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009693
1038	NC_017530	GTG	2	6	60209	60214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009693
1039	NC_017530	AGCCC	2	10	60262	60271	20 %	0 %	20 %	60 %	386009693
1040	NC_017530	CTC	2	6	60290	60295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386009693
1041	NC_017530	GAT	2	6	60305	60310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009693
1042	NC_017530	CAC	2	6	60320	60325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009693
1043	NC_017530	GC	3	6	60373	60378	0 %	0 %	50 %	50 %	386009693
1044	NC_017530	TCA	2	6	60429	60434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009693
1045	NC_017530	CGG	2	6	60474	60479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009693
1046	NC_017530	CA	3	6	60607	60612	50 %	0 %	0 %	50 %	386009693
1047	NC_017530	CGC	2	6	60655	60660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009694
1048	NC_017530	CG	3	6	60676	60681	0 %	0 %	50 %	50 %	386009694
1049	NC_017530	CTG	3	9	60682	60690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009694
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1053	NC_017530	GCA	2	6	60979	60984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009694
1054	NC_017530	TCA	2	6	61036	61041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009694
1055	NC_017530	CCA	2	6	61042	61047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009694
1056	NC_017530	CTGG	2	8	61051	61058	0 %	25 %	50 %	25 %	386009694
1057	NC_017530	GCC	2	6	61080	61085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009694
1058	NC_017530	GTG	2	6	61086	61091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009694
1059	NC_017530	GAT	2	6	61103	61108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009694
1060	NC_017530	CAG	2	6	61138	61143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009694
1061	NC_017530	CGGCAC	2	12	61205	61216	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386009694
1062	NC_017530	GCG	2	6	61229	61234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009694
1063	NC_017530	AAC	2	6	61236	61241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009694
1064	NC_017530	GGC	2	6	61259	61264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009694
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1085	NC_017530	GTA	2	6	62376	62381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009695
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1088	NC_017530	GC	3	6	62430	62435	0 %	0 %	50 %	50 %	386009695
1089	NC_017530	CCTT	2	8	62464	62471	0 %	50 %	0 %	50 %	386009695
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1094	NC_017530	ACA	2	6	62663	62668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009695
1095	NC_017530	GTC	2	6	62757	62762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009695
1096	NC_017530	AGC	2	6	62763	62768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009695
1097	NC_017530	GC	4	8	62835	62842	0 %	0 %	50 %	50 %	386009695
1098	NC_017530	GCCA	2	8	62871	62878	25 %	0 %	25 %	50 %	386009695
1099	NC_017530	CGG	2	6	62927	62932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009695
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1102	NC_017530	GCA	2	6	63233	63238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009696
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1105	NC_017530	TC	3	6	63450	63455	0 %	50 %	0 %	50 %	386009696
1106	NC_017530	TCG	2	6	63567	63572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009697
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1109	NC_017530	GAA	2	6	63704	63709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009697
1110	NC_017530	ATG	2	6	63798	63803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009697
1111	NC_017530	ACG	2	6	63960	63965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009697
1112	NC_017530	GGT	2	6	63986	63991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009697
1113	NC_017530	GTC	2	6	64013	64018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009697
1114	NC_017530	CCTT	2	8	64056	64063	0 %	50 %	0 %	50 %	386009697
1115	NC_017530	CCG	2	6	64126	64131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009697
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1122	NC_017530	CAT	2	6	64439	64444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009697
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1125	NC_017530	CAG	2	6	64541	64546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009697
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1240	NC_017530	GC	3	6	70922	70927	0 %	0 %	50 %	50 %	386009704
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1243	NC_017530	TTCT	2	8	71107	71114	0 %	75 %	0 %	25 %	386009704
1244	NC_017530	GC	3	6	71142	71147	0 %	0 %	50 %	50 %	386009704
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1246	NC_017530	GCCAGG	2	12	71276	71287	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386009705
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1497	NC_017530	CGT	2	6	84636	84641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009715
1498	NC_017530	GAT	2	6	84648	84653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009715
1499	NC_017530	CCG	2	6	84702	84707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009715
1500	NC_017530	CT	3	6	84773	84778	0 %	50 %	0 %	50 %	386009715

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