MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_017530	GGC	3	9	644296	644304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010195
12002	NC_017530	CTGC	2	8	644324	644331	0 %	25 %	25 %	50 %	386010195
12003	NC_017530	TGC	2	6	644364	644369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010195
12004	NC_017530	GAA	2	6	644375	644380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010195
12005	NC_017530	CGG	2	6	644383	644388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010195
12006	NC_017530	CCG	2	6	644526	644531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010195
12007	NC_017530	TCG	2	6	644564	644569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010195
12008	NC_017530	ACCGT	2	10	644645	644654	20 %	20 %	20 %	40 %	386010195
12009	NC_017530	CCGG	2	8	644693	644700	0 %	0 %	50 %	50 %	386010195
12010	NC_017530	CAG	2	6	644707	644712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010195
12011	NC_017530	CCG	2	6	644760	644765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010195
12012	NC_017530	ACCA	2	8	644807	644814	50 %	0 %	0 %	50 %	386010195
12013	NC_017530	GAA	2	6	644816	644821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010195
12014	NC_017530	CGG	2	6	644848	644853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010195
12015	NC_017530	GAC	2	6	644885	644890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010195
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12017	NC_017530	GAA	2	6	645001	645006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010195
12018	NC_017530	ACT	2	6	645093	645098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010195
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12020	NC_017530	CGG	2	6	645151	645156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010195
12021	NC_017530	CCA	2	6	645219	645224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010195
12022	NC_017530	CAGC	2	8	645304	645311	25 %	0 %	25 %	50 %	386010195
12023	NC_017530	GTG	2	6	645344	645349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010195
12024	NC_017530	CAC	2	6	645391	645396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010195
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12028	NC_017530	CCGACA	2	12	645729	645740	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386010195
12029	NC_017530	AGC	2	6	645797	645802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010195
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12032	NC_017530	CTG	2	6	645980	645985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010195
12033	NC_017530	TGGA	2	8	645998	646005	25 %	25 %	50 %	0 %	386010195
12034	NC_017530	TTC	2	6	646040	646045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010195
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12041	NC_017530	ATA	2	6	646642	646647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386010196
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12048	NC_017530	AGTC	2	8	647789	647796	25 %	25 %	25 %	25 %	386010197
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12050	NC_017530	GGCT	2	8	647866	647873	0 %	25 %	50 %	25 %	386010197
12051	NC_017530	TGA	2	6	647991	647996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010197
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12063	NC_017530	TGCT	2	8	650611	650618	0 %	50 %	25 %	25 %	386010198
12064	NC_017530	CGAG	2	8	650672	650679	25 %	0 %	50 %	25 %	386010198
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12108	NC_017530	GTA	2	6	653861	653866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010201
12109	NC_017530	GA	3	6	653958	653963	50 %	0 %	50 %	0 %	386010201
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12119	NC_017530	TAA	2	6	654869	654874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386010201
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12348	NC_017530	CTT	2	6	667460	667465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010213
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12352	NC_017530	GCTTCG	2	12	667623	667634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010213
12353	NC_017530	GGT	2	6	667643	667648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010213
12354	NC_017530	ACC	2	6	667656	667661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010213
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12356	NC_017530	TTG	3	9	667695	667703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010213
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12474	NC_017530	CCA	2	6	672988	672993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010216
12475	NC_017530	CGG	2	6	673045	673050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010216
12476	NC_017530	CGA	2	6	673082	673087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010216
12477	NC_017530	CTG	2	6	673122	673127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010216
12478	NC_017530	CAC	2	6	673164	673169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010216
12479	NC_017530	GAT	2	6	673179	673184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010216
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12481	NC_017530	CAA	2	6	673258	673263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010217
12482	NC_017530	GGT	2	6	673276	673281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010217
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12485	NC_017530	CTG	3	9	673406	673414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010217
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12490	NC_017530	TCC	2	6	673556	673561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386010218
12491	NC_017530	GCC	2	6	673569	673574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010218
12492	NC_017530	TCAG	2	8	673655	673662	25 %	25 %	25 %	25 %	386010218
12493	NC_017530	TCGC	2	8	673675	673682	0 %	25 %	25 %	50 %	386010218
12494	NC_017530	CAG	2	6	673684	673689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010218
12495	NC_017530	CTT	2	6	673740	673745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010218
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12498	NC_017530	ACC	2	6	673808	673813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010218
12499	NC_017530	ACC	2	6	673859	673864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010218
12500	NC_017530	GTG	2	6	673916	673921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010218

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