MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 plasmid pPECL-8

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017019	CATT	2	8	920	927	25 %	50 %	0 %	25 %	381280287
2	NC_017019	GCCA	2	8	972	979	25 %	0 %	25 %	50 %	381280287
3	NC_017019	GAAT	2	8	1638	1645	50 %	25 %	25 %	0 %	381280287
4	NC_017019	CCAG	2	8	1797	1804	25 %	0 %	25 %	50 %	381280287
5	NC_017019	TATG	2	8	1991	1998	25 %	50 %	25 %	0 %	381280287
6	NC_017019	TCAA	2	8	2714	2721	50 %	25 %	0 %	25 %	381280288
7	NC_017019	TTGA	2	8	2731	2738	25 %	50 %	25 %	0 %	381280288
8	NC_017019	GGAA	2	8	3102	3109	50 %	0 %	50 %	0 %	381280288
9	NC_017019	ATCA	2	8	3446	3453	50 %	25 %	0 %	25 %	381280288
10	NC_017019	AAAT	2	8	3506	3513	75 %	25 %	0 %	0 %	381280288
11	NC_017019	AAAT	2	8	3791	3798	75 %	25 %	0 %	0 %	381280289
12	NC_017019	AAAT	2	8	4310	4317	75 %	25 %	0 %	0 %	381280290
13	NC_017019	ATGA	2	8	4332	4339	50 %	25 %	25 %	0 %	381280290
14	NC_017019	TAAT	2	8	4403	4410	50 %	50 %	0 %	0 %	381280290
15	NC_017019	ATCA	2	8	4411	4418	50 %	25 %	0 %	25 %	381280290
16	NC_017019	GAAA	2	8	4807	4814	75 %	0 %	25 %	0 %	381280291
17	NC_017019	GACC	2	8	6052	6059	25 %	0 %	25 %	50 %	381280292
18	NC_017019	GACG	2	8	6189	6196	25 %	0 %	50 %	25 %	381280292
19	NC_017019	CTTG	2	8	6275	6282	0 %	50 %	25 %	25 %	381280293
20	NC_017019	GTTT	2	8	6421	6428	0 %	75 %	25 %	0 %	381280293
21	NC_017019	AATC	2	8	6725	6732	50 %	25 %	0 %	25 %	381280293
22	NC_017019	AAAT	2	8	6922	6929	75 %	25 %	0 %	0 %	381280293
23	NC_017019	AAAC	2	8	7004	7011	75 %	0 %	0 %	25 %	381280293
24	NC_017019	TGAT	2	8	7229	7236	25 %	50 %	25 %	0 %	381280294
25	NC_017019	GATA	2	8	7519	7526	50 %	25 %	25 %	0 %	381280294
26	NC_017019	CGCC	2	8	7679	7686	0 %	0 %	25 %	75 %	381280294
27	NC_017019	GTTT	2	8	7786	7793	0 %	75 %	25 %	0 %	381280294
28	NC_017019	CTGC	2	8	8759	8766	0 %	25 %	25 %	50 %	381280295
29	NC_017019	GAAC	2	8	8895	8902	50 %	0 %	25 %	25 %	381280295
30	NC_017019	ATTT	2	8	9858	9865	25 %	75 %	0 %	0 %	381280295
31	NC_017019	CTCA	2	8	10245	10252	25 %	25 %	0 %	50 %	381280296
32	NC_017019	TGAT	2	8	10699	10706	25 %	50 %	25 %	0 %	381280296
33	NC_017019	CGGC	2	8	10723	10730	0 %	0 %	50 %	50 %	381280296
34	NC_017019	GTCA	2	8	10942	10949	25 %	25 %	25 %	25 %	381280296
35	NC_017019	TAAT	2	8	12840	12847	50 %	50 %	0 %	0 %	381280297
36	NC_017019	GTTA	2	8	13471	13478	25 %	50 %	25 %	0 %	381280297
37	NC_017019	TAGT	2	8	13649	13656	25 %	50 %	25 %	0 %	381280297
38	NC_017019	ATCA	2	8	14694	14701	50 %	25 %	0 %	25 %	381280300
39	NC_017019	TCAA	2	8	14979	14986	50 %	25 %	0 %	25 %	381280300
40	NC_017019	ATTT	2	8	15526	15533	25 %	75 %	0 %	0 %	381280300
41	NC_017019	TGAT	2	8	15577	15584	25 %	50 %	25 %	0 %	381280300
42	NC_017019	AAAG	2	8	15995	16002	75 %	0 %	25 %	0 %	381280301
43	NC_017019	TGAA	2	8	16149	16156	50 %	25 %	25 %	0 %	381280302
44	NC_017019	CATT	2	8	16923	16930	25 %	50 %	0 %	25 %	381280303
45	NC_017019	TTTG	2	8	18624	18631	0 %	75 %	25 %	0 %	381280304
46	NC_017019	GAAA	2	8	19250	19257	75 %	0 %	25 %	0 %	381280304
47	NC_017019	GTCA	2	8	19346	19353	25 %	25 %	25 %	25 %	381280304
48	NC_017019	AAAT	2	8	19783	19790	75 %	25 %	0 %	0 %	381280304
49	NC_017019	AATT	2	8	20407	20414	50 %	50 %	0 %	0 %	381280304
50	NC_017019	AATT	2	8	20551	20558	50 %	50 %	0 %	0 %	381280304
51	NC_017019	ACAT	2	8	24013	24020	50 %	25 %	0 %	25 %	381280306
52	NC_017019	AGTT	2	8	25038	25045	25 %	50 %	25 %	0 %	381280307
53	NC_017019	TTTA	2	8	25086	25093	25 %	75 %	0 %	0 %	381280307
54	NC_017019	TGGC	2	8	25138	25145	0 %	25 %	50 %	25 %	381280307
55	NC_017019	AGTT	2	8	25242	25249	25 %	50 %	25 %	0 %	381280307
56	NC_017019	TTTA	2	8	25868	25875	25 %	75 %	0 %	0 %	381280309
57	NC_017019	TGCT	2	8	25922	25929	0 %	50 %	25 %	25 %	381280309
58	NC_017019	TGAT	2	8	25935	25942	25 %	50 %	25 %	0 %	381280309
59	NC_017019	TGCT	2	8	26069	26076	0 %	50 %	25 %	25 %	381280309
60	NC_017019	TGGC	2	8	26871	26878	0 %	25 %	50 %	25 %	381280309
61	NC_017019	ATAA	2	8	28300	28307	75 %	25 %	0 %	0 %	381280310
62	NC_017019	TTGC	2	8	28354	28361	0 %	50 %	25 %	25 %	381280310
63	NC_017019	CGTT	2	8	28776	28783	0 %	50 %	25 %	25 %	381280310
64	NC_017019	TGTT	2	8	28805	28812	0 %	75 %	25 %	0 %	381280310
65	NC_017019	TTAA	2	8	28827	28834	50 %	50 %	0 %	0 %	381280310
66	NC_017019	TTTA	2	8	28910	28917	25 %	75 %	0 %	0 %	381280310
67	NC_017019	TTAA	2	8	29001	29008	50 %	50 %	0 %	0 %	381280310
68	NC_017019	TTTC	2	8	29232	29239	0 %	75 %	0 %	25 %	381280310
69	NC_017019	ATTG	2	8	29380	29387	25 %	50 %	25 %	0 %	381280310
70	NC_017019	GTTA	2	8	29537	29544	25 %	50 %	25 %	0 %	381280310
71	NC_017019	ACCG	2	8	29817	29824	25 %	0 %	25 %	50 %	381280310
72	NC_017019	CTTT	2	8	30838	30845	0 %	75 %	0 %	25 %	381280313
73	NC_017019	TTTC	2	8	31139	31146	0 %	75 %	0 %	25 %	381280314
74	NC_017019	TGAA	2	8	31884	31891	50 %	25 %	25 %	0 %	381280315
75	NC_017019	TTCC	2	8	31904	31911	0 %	50 %	0 %	50 %	381280315
76	NC_017019	TTAC	2	8	31969	31976	25 %	50 %	0 %	25 %	381280315
77	NC_017019	CTTG	2	8	31995	32002	0 %	50 %	25 %	25 %	381280315
78	NC_017019	CATC	2	8	32207	32214	25 %	25 %	0 %	50 %	381280315
79	NC_017019	TTTC	2	8	32502	32509	0 %	75 %	0 %	25 %	381280316
80	NC_017019	CTAC	2	8	32910	32917	25 %	25 %	0 %	50 %	381280316

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.