MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Paenibacillus terrae HPL-003 chromosome

Total Repeats: 97097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016641	AGC	2	6	346003	346008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320219
5502	NC_016641	GCC	2	6	346113	346118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320220
5503	NC_016641	CCGC	2	8	346208	346215	0 %	0 %	25 %	75 %	374320220
5504	NC_016641	TC	3	6	346265	346270	0 %	50 %	0 %	50 %	374320220
5505	NC_016641	CA	3	6	346283	346288	50 %	0 %	0 %	50 %	374320220
5506	NC_016641	GC	3	6	346289	346294	0 %	0 %	50 %	50 %	374320220
5507	NC_016641	TCA	2	6	346405	346410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320220
5508	NC_016641	ATCC	2	8	346499	346506	25 %	25 %	0 %	50 %	374320220
5509	NC_016641	AT	3	6	346519	346524	50 %	50 %	0 %	0 %	374320220
5510	NC_016641	ATG	2	6	346585	346590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320220
5511	NC_016641	GCTTG	2	10	346749	346758	0 %	40 %	40 %	20 %	374320221
5512	NC_016641	TA	3	6	346777	346782	50 %	50 %	0 %	0 %	374320221
5513	NC_016641	CTG	2	6	346998	347003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320221
5514	NC_016641	GGA	2	6	347033	347038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374320221
5515	NC_016641	AGG	2	6	347049	347054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374320221
5516	NC_016641	TGT	2	6	347071	347076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320221
5517	NC_016641	A	7	7	347088	347094	100 %	0 %	0 %	0 %	374320221
5518	NC_016641	TCA	3	9	347096	347104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320221
5519	NC_016641	TTC	2	6	347165	347170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320221
5520	NC_016641	CCG	2	6	347471	347476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320222
5521	NC_016641	GAA	2	6	347546	347551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374320222
5522	NC_016641	AGC	2	6	347618	347623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320222
5523	NC_016641	CTT	2	6	347649	347654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320222
5524	NC_016641	CAG	2	6	347928	347933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320222
5525	NC_016641	TCC	2	6	347972	347977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320222
5526	NC_016641	TCT	2	6	347978	347983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320222
5527	NC_016641	AATC	2	8	348052	348059	50 %	25 %	0 %	25 %	374320222
5528	NC_016641	CCA	2	6	348074	348079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320222
5529	NC_016641	AGA	2	6	348087	348092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374320222
5530	NC_016641	CAC	2	6	348159	348164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320222
5531	NC_016641	CCG	2	6	348173	348178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320222
5532	NC_016641	ATA	2	6	348179	348184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320222
5533	NC_016641	T	6	6	348296	348301	0 %	100 %	0 %	0 %	374320222
5534	NC_016641	TTA	2	6	348395	348400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320222
5535	NC_016641	AGCA	2	8	348453	348460	50 %	0 %	25 %	25 %	374320222
5536	NC_016641	CAA	2	6	348478	348483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320222
5537	NC_016641	TCAGAG	2	12	348561	348572	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374320222
5538	NC_016641	TAA	2	6	348603	348608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320222
5539	NC_016641	AAT	3	9	348676	348684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320222
5540	NC_016641	TCA	2	6	348708	348713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320222
5541	NC_016641	TCC	2	6	348787	348792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320222
5542	NC_016641	AGG	2	6	348854	348859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374320222
5543	NC_016641	GCA	2	6	348887	348892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320222
5544	NC_016641	GTAG	2	8	348904	348911	25 %	25 %	50 %	0 %	374320222
5545	NC_016641	TTTC	2	8	348912	348919	0 %	75 %	0 %	25 %	374320222
5546	NC_016641	CAGC	2	8	348925	348932	25 %	0 %	25 %	50 %	374320222
5547	NC_016641	AGC	2	6	348992	348997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320222
5548	NC_016641	TTG	2	6	349043	349048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320222
5549	NC_016641	TCT	2	6	349064	349069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320222
5550	NC_016641	T	6	6	349069	349074	0 %	100 %	0 %	0 %	374320222
5551	NC_016641	CTG	2	6	349165	349170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320222
5552	NC_016641	TGA	2	6	349176	349181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320222
5553	NC_016641	T	7	7	349277	349283	0 %	100 %	0 %	0 %	374320222
5554	NC_016641	CAC	2	6	349284	349289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320222
5555	NC_016641	ACC	2	6	349593	349598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320223
5556	NC_016641	TTCG	2	8	349631	349638	0 %	50 %	25 %	25 %	374320223
5557	NC_016641	AGC	2	6	349691	349696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320223
5558	NC_016641	GTT	2	6	349742	349747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320223
5559	NC_016641	AC	3	6	349768	349773	50 %	0 %	0 %	50 %	374320223
5560	NC_016641	TAA	2	6	349798	349803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320223
5561	NC_016641	AG	3	6	349818	349823	50 %	0 %	50 %	0 %	374320223
5562	NC_016641	TGC	2	6	349872	349877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320223
5563	NC_016641	TGG	2	6	349897	349902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374320223
5564	NC_016641	TTC	2	6	350027	350032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320223
5565	NC_016641	GTCA	2	8	350117	350124	25 %	25 %	25 %	25 %	374320223
5566	NC_016641	CAT	2	6	350173	350178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320223
5567	NC_016641	CACAAT	2	12	350192	350203	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	374320223
5568	NC_016641	GCA	3	9	350224	350232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320223
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5570	NC_016641	CCGT	2	8	350358	350365	0 %	25 %	25 %	50 %	374320223
5571	NC_016641	TTG	3	9	350385	350393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320223
5572	NC_016641	GAAT	2	8	350715	350722	50 %	25 %	25 %	0 %	374320224
5573	NC_016641	CTTTT	2	10	350745	350754	0 %	80 %	0 %	20 %	374320224
5574	NC_016641	TC	3	6	350824	350829	0 %	50 %	0 %	50 %	374320224
5575	NC_016641	TCG	2	6	350949	350954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320224
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5577	NC_016641	CGT	2	6	350980	350985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320224
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5580	NC_016641	AAT	2	6	351187	351192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320224
5581	NC_016641	ATG	2	6	351218	351223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320224
5582	NC_016641	GAA	2	6	351278	351283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374320224
5583	NC_016641	GAA	2	6	351329	351334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374320224
5584	NC_016641	CAGC	2	8	351409	351416	25 %	0 %	25 %	50 %	374320224
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5588	NC_016641	ATCA	2	8	351695	351702	50 %	25 %	0 %	25 %	374320224
5589	NC_016641	CTGG	2	8	351739	351746	0 %	25 %	50 %	25 %	374320224
5590	NC_016641	TCG	2	6	351765	351770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320224
5591	NC_016641	ATC	2	6	351776	351781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320224
5592	NC_016641	GGCGT	2	10	351807	351816	0 %	20 %	60 %	20 %	374320224
5593	NC_016641	GAT	2	6	351910	351915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320224
5594	NC_016641	AATC	2	8	351919	351926	50 %	25 %	0 %	25 %	374320224
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5601	NC_016641	GTG	2	6	352668	352673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374320225
5602	NC_016641	CTT	2	6	352711	352716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320225
5603	NC_016641	CAGGTC	2	12	352835	352846	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374320225
5604	NC_016641	ATA	2	6	352866	352871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320225
5605	NC_016641	ATA	2	6	352905	352910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320225
5606	NC_016641	ACG	2	6	352912	352917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320225
5607	NC_016641	TGC	2	6	353011	353016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320225
5608	NC_016641	TA	3	6	353049	353054	50 %	50 %	0 %	0 %	374320225
5609	NC_016641	TCAG	2	8	353127	353134	25 %	25 %	25 %	25 %	374320225
5610	NC_016641	TCC	2	6	353181	353186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320225
5611	NC_016641	AACA	2	8	353276	353283	75 %	0 %	0 %	25 %	374320225
5612	NC_016641	CTG	2	6	353291	353296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320225
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5614	NC_016641	TATTGG	2	12	353510	353521	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	374320226
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5618	NC_016641	GGC	3	9	353734	353742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320226
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5622	NC_016641	AAGG	2	8	353887	353894	50 %	0 %	50 %	0 %	374320226
5623	NC_016641	CCT	2	6	353897	353902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320226
5624	NC_016641	AAG	2	6	353968	353973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374320226
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5627	NC_016641	GCT	2	6	354189	354194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320226
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5629	NC_016641	GGA	2	6	354282	354287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374320226
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5631	NC_016641	AGCG	2	8	354460	354467	25 %	0 %	50 %	25 %	374320226
5632	NC_016641	CTG	2	6	354487	354492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320226
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5635	NC_016641	GCT	2	6	354644	354649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320227
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5644	NC_016641	TGC	2	6	355100	355105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320227
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5651	NC_016641	TGC	2	6	355753	355758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320227
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5728	NC_016641	CT	3	6	361025	361030	0 %	50 %	0 %	50 %	374320232
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5730	NC_016641	TG	3	6	361048	361053	0 %	50 %	50 %	0 %	374320232
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5732	NC_016641	ACG	2	6	361575	361580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320233
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5735	NC_016641	TGG	2	6	362041	362046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374320234
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5737	NC_016641	GGC	2	6	362095	362100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320234
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5739	NC_016641	GAGC	2	8	362406	362413	25 %	0 %	50 %	25 %	374320234
5740	NC_016641	GAA	2	6	362597	362602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374320235
5741	NC_016641	GCA	2	6	362645	362650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320235
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5987	NC_016641	TTA	2	6	376620	376625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320245
5988	NC_016641	TATTT	2	10	376638	376647	20 %	80 %	0 %	0 %	374320245
5989	NC_016641	CT	3	6	376856	376861	0 %	50 %	0 %	50 %	374320245
5990	NC_016641	A	6	6	376868	376873	100 %	0 %	0 %	0 %	374320245
5991	NC_016641	TAT	2	6	376898	376903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320245
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5998	NC_016641	ATC	2	6	377282	377287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320245
5999	NC_016641	CGA	2	6	377301	377306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320245
6000	NC_016641	CAAT	2	8	377350	377357	50 %	25 %	0 %	25 %	374320245

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