MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 plasmid pPECL-4

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016607	TGGCT	2	10	354	363	0 %	40 %	40 %	20 %	381184518
2	NC_016607	GTTAA	2	10	3293	3302	40 %	40 %	20 %	0 %	381184520
3	NC_016607	ATGTT	2	10	6530	6539	20 %	60 %	20 %	0 %	381184525
4	NC_016607	CGGAT	2	10	6758	6767	20 %	20 %	40 %	20 %	381184525
5	NC_016607	AGCTT	2	10	7790	7799	20 %	40 %	20 %	20 %	381184525
6	NC_016607	GGACT	2	10	11626	11635	20 %	20 %	40 %	20 %	381184526
7	NC_016607	TAAAT	2	10	12146	12155	60 %	40 %	0 %	0 %	381184526
8	NC_016607	TGCAT	2	10	12194	12203	20 %	40 %	20 %	20 %	381184526
9	NC_016607	GGGCT	2	10	14117	14126	0 %	20 %	60 %	20 %	381184526
10	NC_016607	TTTGG	2	10	14675	14684	0 %	60 %	40 %	0 %	381184526
11	NC_016607	AACTT	2	10	15101	15110	40 %	40 %	0 %	20 %	381184527
12	NC_016607	TCCAT	2	10	17473	17482	20 %	40 %	0 %	40 %	381184528
13	NC_016607	AGCCA	2	10	17692	17701	40 %	0 %	20 %	40 %	381184528
14	NC_016607	ACTGG	2	10	18457	18466	20 %	20 %	40 %	20 %	381184529
15	NC_016607	CAAAT	2	10	19495	19504	60 %	20 %	0 %	20 %	381184530
16	NC_016607	TTCTT	2	10	21349	21358	0 %	80 %	0 %	20 %	381184532
17	NC_016607	TTTTC	2	10	21905	21914	0 %	80 %	0 %	20 %	381184533

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.