MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 113947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015733	AGC	2	6	120277	120282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485056
2502	NC_015733	AGC	2	6	120298	120303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485056
2503	NC_015733	GCAC	2	8	120307	120314	25 %	0 %	25 %	50 %	339485056
2504	NC_015733	CG	3	6	120364	120369	0 %	0 %	50 %	50 %	339485057
2505	NC_015733	GCC	2	6	120402	120407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485057
2506	NC_015733	CAC	2	6	120418	120423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485057
2507	NC_015733	CGA	2	6	120442	120447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485057
2508	NC_015733	GGC	2	6	120452	120457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485057
2509	NC_015733	GTC	2	6	120458	120463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485057
2510	NC_015733	CAC	2	6	120476	120481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485057
2511	NC_015733	GGT	3	9	120500	120508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485057
2512	NC_015733	TCGA	2	8	120522	120529	25 %	25 %	25 %	25 %	339485057
2513	NC_015733	GCAC	2	8	120540	120547	25 %	0 %	25 %	50 %	339485057
2514	NC_015733	GAT	2	6	120548	120553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485057
2515	NC_015733	TGG	2	6	120559	120564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485057
2516	NC_015733	CCA	2	6	120565	120570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485057
2517	NC_015733	CAG	2	6	120596	120601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485057
2518	NC_015733	TTGC	2	8	120690	120697	0 %	50 %	25 %	25 %	339485058
2519	NC_015733	GCC	2	6	120755	120760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485058
2520	NC_015733	CGA	2	6	120795	120800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485058
2521	NC_015733	GGC	3	9	120802	120810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485058
2522	NC_015733	TCG	2	6	120812	120817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485058
2523	NC_015733	CGGTG	2	10	120847	120856	0 %	20 %	60 %	20 %	339485058
2524	NC_015733	CTGG	2	8	120862	120869	0 %	25 %	50 %	25 %	339485058
2525	NC_015733	TGA	2	6	120882	120887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485058
2526	NC_015733	GTG	2	6	120899	120904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485058
2527	NC_015733	CAA	2	6	120933	120938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485058
2528	NC_015733	GGC	2	6	121187	121192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485059
2529	NC_015733	GTC	2	6	121193	121198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485059
2530	NC_015733	GTC	2	6	121220	121225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485059
2531	NC_015733	CGA	2	6	121279	121284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485059
2532	NC_015733	GTG	2	6	121293	121298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485059
2533	NC_015733	ACG	2	6	121299	121304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485059
2534	NC_015733	TGG	2	6	121309	121314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485059
2535	NC_015733	CAG	2	6	121753	121758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485060
2536	NC_015733	CGG	2	6	121784	121789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485060
2537	NC_015733	CAG	3	9	121810	121818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485060
2538	NC_015733	GCAGCG	2	12	121833	121844	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339485060
2539	NC_015733	ATG	2	6	121904	121909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485060
2540	NC_015733	TTC	2	6	122333	122338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485061
2541	NC_015733	GCC	2	6	122387	122392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485061
2542	NC_015733	AGT	2	6	122413	122418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485061
2543	NC_015733	CAGCG	2	10	122423	122432	20 %	0 %	40 %	40 %	339485061
2544	NC_015733	GAT	2	6	122459	122464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485061
2545	NC_015733	CG	3	6	122479	122484	0 %	0 %	50 %	50 %	339485061
2546	NC_015733	CGT	2	6	122536	122541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485061
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2549	NC_015733	CCA	2	6	122658	122663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485061
2550	NC_015733	TCA	2	6	122671	122676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485061
2551	NC_015733	GTGG	2	8	122693	122700	0 %	25 %	75 %	0 %	339485061
2552	NC_015733	GAT	2	6	122747	122752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485061
2553	NC_015733	CAC	2	6	122765	122770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485061
2554	NC_015733	GGT	2	6	122776	122781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485061
2555	NC_015733	GCG	2	6	122852	122857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485061
2556	NC_015733	TGC	2	6	123004	123009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485061
2557	NC_015733	TTG	2	6	123036	123041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485061
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2559	NC_015733	GGT	2	6	123085	123090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485061
2560	NC_015733	TCG	2	6	123108	123113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485061
2561	NC_015733	CGG	2	6	123116	123121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485061
2562	NC_015733	TGA	2	6	123154	123159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485061
2563	NC_015733	CGA	2	6	123166	123171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485061
2564	NC_015733	TGC	2	6	123199	123204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485061
2565	NC_015733	CGA	2	6	123316	123321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485061
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2568	NC_015733	CGT	2	6	123502	123507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485061
2569	NC_015733	GCG	2	6	123548	123553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485061
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2571	NC_015733	GGA	2	6	123773	123778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339485061
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2573	NC_015733	CAT	2	6	124043	124048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485062
2574	NC_015733	TTG	2	6	124110	124115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485062
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2578	NC_015733	CGT	2	6	124204	124209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485062
2579	NC_015733	TCGGCC	2	12	124293	124304	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339485062
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2582	NC_015733	CAG	2	6	124472	124477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485062
2583	NC_015733	TCG	2	6	124488	124493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485062
2584	NC_015733	GCT	2	6	124516	124521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485062
2585	NC_015733	CGGTAT	2	12	124543	124554	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	339485062
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2587	NC_015733	GCC	2	6	124565	124570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485062
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2590	NC_015733	GAT	2	6	124658	124663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485062
2591	NC_015733	GTT	2	6	124673	124678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485062
2592	NC_015733	GCC	2	6	124701	124706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485062
2593	NC_015733	ACC	2	6	124734	124739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485062
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2595	NC_015733	ATG	2	6	124785	124790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485062
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2600	NC_015733	CGG	2	6	125110	125115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485062
2601	NC_015733	CGG	2	6	125194	125199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485062
2602	NC_015733	CCG	2	6	125202	125207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485062
2603	NC_015733	CAG	2	6	125210	125215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485062
2604	NC_015733	CGA	2	6	125218	125223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485062
2605	NC_015733	CGG	2	6	125239	125244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485062
2606	NC_015733	AG	3	6	125264	125269	50 %	0 %	50 %	0 %	339485062
2607	NC_015733	TA	4	8	125281	125288	50 %	50 %	0 %	0 %	339485062
2608	NC_015733	CCGCG	2	10	125343	125352	0 %	0 %	40 %	60 %	339485062
2609	NC_015733	GGT	2	6	125354	125359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485062
2610	NC_015733	TCATGC	2	12	125431	125442	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339485062
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2612	NC_015733	GCG	2	6	125491	125496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485063
2613	NC_015733	TGCC	2	8	125562	125569	0 %	25 %	25 %	50 %	339485063
2614	NC_015733	CAGC	2	8	125589	125596	25 %	0 %	25 %	50 %	339485063
2615	NC_015733	CGA	2	6	125604	125609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485063
2616	NC_015733	GCG	2	6	125646	125651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485063
2617	NC_015733	CAC	2	6	125677	125682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485063
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2857	NC_015733	GGCG	2	8	144485	144492	0 %	0 %	75 %	25 %	339485073
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2980	NC_015733	GCT	2	6	151236	151241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485078
2981	NC_015733	CGA	2	6	151247	151252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485078
2982	NC_015733	GAA	2	6	151286	151291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485078
2983	NC_015733	GTC	2	6	151316	151321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485078
2984	NC_015733	CGC	2	6	151336	151341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485078
2985	NC_015733	G	6	6	151373	151378	0 %	0 %	100 %	0 %	339485078
2986	NC_015733	CTC	2	6	151437	151442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339485078
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2990	NC_015733	CTG	2	6	151605	151610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485078
2991	NC_015733	CTG	2	6	151650	151655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485078
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2994	NC_015733	TGA	2	6	151756	151761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485078
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2997	NC_015733	CAG	2	6	152043	152048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485078
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2999	NC_015733	GCG	2	6	152105	152110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485078
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