MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Porphyromonas gingivalis TDC60

Total Repeats: 25783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015571	TTC	2	6	157	162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334145812
2	NC_015571	AGC	2	6	191	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145812
3	NC_015571	CAT	2	6	233	238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145812
4	NC_015571	ACA	2	6	260	265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334145812
5	NC_015571	CGC	2	6	486	491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145812
6	NC_015571	ATC	2	6	715	720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145812
7	NC_015571	AAG	2	6	745	750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334145812
8	NC_015571	TTC	2	6	766	771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334145812
9	NC_015571	CCT	2	6	829	834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334145812
10	NC_015571	GGA	2	6	852	857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334145812
11	NC_015571	CGT	2	6	922	927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145812
12	NC_015571	CAG	2	6	937	942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145812
13	NC_015571	GGT	2	6	1059	1064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334145812
14	NC_015571	CAG	2	6	1156	1161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145812
15	NC_015571	CAG	2	6	1167	1172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145812
16	NC_015571	GGT	2	6	1242	1247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334145812
17	NC_015571	GGA	2	6	1306	1311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334145812
18	NC_015571	TAG	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145813
19	NC_015571	AAC	2	6	1606	1611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334145813
20	NC_015571	GTG	2	6	1625	1630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334145813
21	NC_015571	GTG	2	6	1822	1827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334145813
22	NC_015571	GAA	2	6	1972	1977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334145813
23	NC_015571	TCA	2	6	2041	2046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145814
24	NC_015571	GAA	2	6	2069	2074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334145814
25	NC_015571	GGT	2	6	2129	2134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334145814
26	NC_015571	CAC	2	6	2153	2158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334145814
27	NC_015571	TCC	2	6	2231	2236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334145814
28	NC_015571	TCC	2	6	2240	2245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334145814
29	NC_015571	GAA	2	6	2354	2359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334145814
30	NC_015571	AAT	2	6	2455	2460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334145814
31	NC_015571	ATA	2	6	2518	2523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334145814
32	NC_015571	CAG	2	6	2528	2533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145814
33	NC_015571	AGC	2	6	2570	2575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145814
34	NC_015571	ATT	2	6	2604	2609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334145814
35	NC_015571	CAG	2	6	2642	2647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145814
36	NC_015571	CAC	2	6	2651	2656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334145814
37	NC_015571	ATC	2	6	2714	2719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145814
38	NC_015571	AGT	2	6	2766	2771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145814
39	NC_015571	CAG	2	6	2774	2779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145814
40	NC_015571	TCG	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145815
41	NC_015571	ATG	2	6	3349	3354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145815
42	NC_015571	ATC	2	6	3360	3365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145815
43	NC_015571	GAT	2	6	3378	3383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145815
44	NC_015571	TGA	2	6	3433	3438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145815
45	NC_015571	GAT	2	6	3572	3577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145815
46	NC_015571	CTC	2	6	3673	3678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334145815
47	NC_015571	GCA	2	6	3718	3723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145815
48	NC_015571	GCT	2	6	3974	3979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145816
49	NC_015571	GGC	2	6	4395	4400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145816
50	NC_015571	CGA	2	6	4424	4429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145816
51	NC_015571	CCA	2	6	4503	4508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334145816
52	NC_015571	TCA	2	6	4857	4862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145816
53	NC_015571	TCC	2	6	4975	4980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334145816
54	NC_015571	AGT	2	6	5108	5113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145817
55	NC_015571	CCA	2	6	5201	5206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334145817
56	NC_015571	GAT	2	6	5261	5266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145817
57	NC_015571	GAA	2	6	5318	5323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334145817
58	NC_015571	CGT	2	6	5327	5332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145817
59	NC_015571	ATC	2	6	5400	5405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145817
60	NC_015571	GAT	2	6	5585	5590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145817
61	NC_015571	TGA	2	6	5620	5625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145817
62	NC_015571	CTG	2	6	5659	5664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145817
63	NC_015571	ATG	2	6	5694	5699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145817
64	NC_015571	CAC	2	6	5933	5938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334145817
65	NC_015571	GAT	2	6	5954	5959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145817
66	NC_015571	AGC	2	6	6111	6116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145817
67	NC_015571	AAG	2	6	6162	6167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334145817
68	NC_015571	CCT	2	6	6202	6207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334145817
69	NC_015571	CAG	2	6	6224	6229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145817
70	NC_015571	TGT	2	6	6367	6372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334145817
71	NC_015571	CTG	2	6	6385	6390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145817
72	NC_015571	CAC	2	6	6395	6400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334145817
73	NC_015571	CAG	2	6	6422	6427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145817
74	NC_015571	GAC	2	6	6468	6473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145817
75	NC_015571	CCA	2	6	6868	6873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334145818
76	NC_015571	GCC	2	6	6919	6924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145818
77	NC_015571	CAA	2	6	7106	7111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334145819
78	NC_015571	CGT	2	6	7473	7478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145820
79	NC_015571	CAT	2	6	7542	7547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145820
80	NC_015571	ATG	2	6	7673	7678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145820
81	NC_015571	GGA	2	6	7701	7706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334145820
82	NC_015571	CGA	3	9	7902	7910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145820
83	NC_015571	CGG	2	6	7986	7991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145820
84	NC_015571	TAC	2	6	7998	8003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145820
85	NC_015571	CAC	2	6	8004	8009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334145820
86	NC_015571	GCA	3	9	8071	8079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145820
87	NC_015571	ATC	2	6	8266	8271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145820
88	NC_015571	GAA	3	9	8355	8363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334145820
89	NC_015571	ATC	2	6	8371	8376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145820
90	NC_015571	TTC	2	6	8377	8382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334145820
91	NC_015571	CGA	2	6	8385	8390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145820
92	NC_015571	CGC	2	6	8545	8550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145820
93	NC_015571	AGA	2	6	8583	8588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334145820
94	NC_015571	TTC	2	6	8707	8712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334145820
95	NC_015571	TGG	2	6	8771	8776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334145820
96	NC_015571	CCT	2	6	8870	8875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334145820
97	NC_015571	GCG	2	6	8889	8894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145820
98	NC_015571	CAG	3	9	8899	8907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145820
99	NC_015571	TGA	2	6	8996	9001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145820
100	NC_015571	GAT	2	6	9061	9066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145820
101	NC_015571	AGT	2	6	9078	9083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145820
102	NC_015571	AAG	2	6	9217	9222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334145820
103	NC_015571	GAA	2	6	9340	9345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334145820
104	NC_015571	GGC	2	6	9346	9351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145820
105	NC_015571	ATC	3	9	9511	9519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145820
106	NC_015571	GAC	2	6	9673	9678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145820
107	NC_015571	ATC	2	6	9679	9684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145820
108	NC_015571	TGG	2	6	9722	9727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334145820
109	NC_015571	CGA	2	6	9812	9817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145820
110	NC_015571	GGA	2	6	9876	9881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334145820
111	NC_015571	ATC	2	6	9958	9963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145820
112	NC_015571	AAC	2	6	9980	9985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334145820
113	NC_015571	CAG	2	6	10220	10225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145821
114	NC_015571	GAC	2	6	10289	10294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145821
115	NC_015571	GGA	2	6	10315	10320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334145821
116	NC_015571	GCT	2	6	10333	10338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145821
117	NC_015571	GAA	2	6	10367	10372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334145821
118	NC_015571	CGC	2	6	10466	10471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145821
119	NC_015571	AGC	2	6	10480	10485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145821
120	NC_015571	CTC	2	6	10496	10501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334145821
121	NC_015571	CTC	2	6	10598	10603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334145821
122	NC_015571	AAC	2	6	10682	10687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334145821
123	NC_015571	GAA	2	6	10693	10698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334145821
124	NC_015571	GGA	2	6	10777	10782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334145821
125	NC_015571	GGA	2	6	10784	10789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334145821
126	NC_015571	TGA	2	6	10941	10946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145821
127	NC_015571	TCC	2	6	10994	10999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334145821
128	NC_015571	TCC	2	6	11145	11150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334145821
129	NC_015571	TCA	2	6	11271	11276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145821
130	NC_015571	AGG	2	6	11295	11300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334145821
131	NC_015571	AAG	2	6	11396	11401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334145821
132	NC_015571	TCC	2	6	11406	11411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334145821
133	NC_015571	GGA	2	6	11419	11424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334145821
134	NC_015571	GCA	2	6	11523	11528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145821
135	NC_015571	TCT	2	6	11664	11669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334145821
136	NC_015571	AGG	2	6	11751	11756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334145821
137	NC_015571	AGG	2	6	11835	11840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334145821
138	NC_015571	ATG	2	6	11861	11866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145821
139	NC_015571	CCG	2	6	11867	11872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334145821
140	NC_015571	GTC	2	6	11881	11886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145821
141	NC_015571	CGG	2	6	11904	11909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145821
142	NC_015571	AAG	2	6	11925	11930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334145821
143	NC_015571	GGT	2	6	11986	11991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334145821
144	NC_015571	TCT	2	6	12044	12049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334145821
145	NC_015571	CCA	2	6	12051	12056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334145821
146	NC_015571	ACT	2	6	12092	12097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145821
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149	NC_015571	TTC	2	6	12353	12358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334145821
150	NC_015571	TTC	2	6	12415	12420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334145821
151	NC_015571	GAA	2	6	12581	12586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334145821
152	NC_015571	GAC	2	6	12713	12718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145821
153	NC_015571	GCT	2	6	12722	12727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145821
154	NC_015571	GGA	2	6	12775	12780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334145821
155	NC_015571	ATC	2	6	12836	12841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145821
156	NC_015571	TGA	2	6	13062	13067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145821
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158	NC_015571	CGG	2	6	13409	13414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145822
159	NC_015571	CTT	2	6	13469	13474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334145822
160	NC_015571	CTG	2	6	13575	13580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145822
161	NC_015571	CTG	2	6	13612	13617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145822
162	NC_015571	ATC	2	6	13649	13654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145822
163	NC_015571	GGC	2	6	13836	13841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145822
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166	NC_015571	GGA	2	6	14070	14075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334145822
167	NC_015571	ATA	2	6	14078	14083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334145822
168	NC_015571	CAC	2	6	14139	14144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334145822
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223	NC_015571	TGC	2	6	18514	18519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145826
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225	NC_015571	TGA	2	6	18686	18691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145826
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238	NC_015571	TGA	2	6	19618	19623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145826
239	NC_015571	GCT	2	6	19628	19633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145826
240	NC_015571	GAT	2	6	19662	19667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145826
241	NC_015571	TCA	2	6	19847	19852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145826
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243	NC_015571	CGG	2	6	19912	19917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145826
244	NC_015571	CCA	2	6	20018	20023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334145826
245	NC_015571	CAG	2	6	20040	20045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145826
246	NC_015571	GCT	2	6	20187	20192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145826
247	NC_015571	CTG	2	6	20268	20273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145826
248	NC_015571	ACG	2	6	20308	20313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145826
249	NC_015571	TGG	2	6	20420	20425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334145826
250	NC_015571	ACG	2	6	20626	20631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145827
251	NC_015571	AGG	2	6	20704	20709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334145827
252	NC_015571	AAG	2	6	20710	20715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334145827
253	NC_015571	AGC	2	6	20738	20743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145827
254	NC_015571	CCT	2	6	20774	20779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334145827
255	NC_015571	TGA	2	6	20866	20871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334145827
256	NC_015571	AAC	2	6	20901	20906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334145827
257	NC_015571	CGT	2	6	20946	20951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145827
258	NC_015571	CTG	2	6	20952	20957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145827
259	NC_015571	GAG	2	6	20988	20993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334145827
260	NC_015571	ATC	2	6	21124	21129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145827
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262	NC_015571	ATC	2	6	21283	21288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145828
263	NC_015571	CTC	2	6	21318	21323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334145828
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265	NC_015571	TCG	2	6	21426	21431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145828
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270	NC_015571	CTT	2	6	21623	21628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334145828
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272	NC_015571	CTA	2	6	21797	21802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334145828
273	NC_015571	GGC	2	6	22005	22010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334145828
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276	NC_015571	TTC	2	6	22355	22360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334145829
277	NC_015571	CTT	2	6	22402	22407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334145829
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280	NC_015571	TGG	2	6	22611	22616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334145829
281	NC_015571	CAG	2	6	22910	22915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145829
282	NC_015571	CAG	2	6	22919	22924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145829
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285	NC_015571	ACC	2	6	23018	23023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334145829
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288	NC_015571	CAG	2	6	23120	23125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334145829
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312	NC_015571	CGT	2	6	25960	25965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334145832
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