MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pedobacter saltans DSM 12145 chromosome

Total Repeats: 84590

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015177	A	6	6	110	115	100 %	0 %	0 %	0 %	325102758
2	NC_015177	ATA	2	6	158	163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325102758
3	NC_015177	CAC	2	6	203	208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325102758
4	NC_015177	GTTT	2	8	248	255	0 %	75 %	25 %	0 %	325102758
5	NC_015177	GGA	2	6	270	275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325102758
6	NC_015177	TTG	2	6	347	352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325102758
7	NC_015177	ATC	2	6	360	365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325102758
8	NC_015177	TAC	2	6	381	386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325102758
9	NC_015177	AATC	2	8	424	431	50 %	25 %	0 %	25 %	325102758
10	NC_015177	CGG	2	6	578	583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325102758
11	NC_015177	GCA	2	6	595	600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325102758
12	NC_015177	TGA	2	6	629	634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325102758
13	NC_015177	GGT	2	6	640	645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325102758
14	NC_015177	CAG	2	6	748	753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325102758
15	NC_015177	ATA	2	6	773	778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325102758
16	NC_015177	TTC	2	6	874	879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325102758
17	NC_015177	AGA	2	6	960	965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325102758
18	NC_015177	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325102758
19	NC_015177	GAA	2	6	1044	1049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325102758
20	NC_015177	A	7	7	1048	1054	100 %	0 %	0 %	0 %	325102758
21	NC_015177	ATA	2	6	1106	1111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325102758
22	NC_015177	ATA	2	6	1115	1120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325102758
23	NC_015177	AAGA	2	8	1177	1184	75 %	0 %	25 %	0 %	325102758
24	NC_015177	TTTGGC	2	12	1191	1202	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	325102758
25	NC_015177	GAA	2	6	1215	1220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325102758
26	NC_015177	AT	3	6	1257	1262	50 %	50 %	0 %	0 %	325102758
27	NC_015177	AG	3	6	1325	1330	50 %	0 %	50 %	0 %	325102758
28	NC_015177	TGG	2	6	1413	1418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325102758
29	NC_015177	AGA	2	6	1511	1516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325102758
30	NC_015177	ATTT	2	8	1688	1695	25 %	75 %	0 %	0 %	325102759
31	NC_015177	T	6	6	1701	1706	0 %	100 %	0 %	0 %	325102759
32	NC_015177	GT	3	6	1724	1729	0 %	50 %	50 %	0 %	325102759
33	NC_015177	TGA	2	6	1734	1739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325102759
34	NC_015177	AATT	2	8	1745	1752	50 %	50 %	0 %	0 %	325102759
35	NC_015177	TAA	2	6	1791	1796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325102759
36	NC_015177	TTG	2	6	1829	1834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325102759
37	NC_015177	GAA	2	6	1843	1848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325102759
38	NC_015177	TCAA	2	8	1916	1923	50 %	25 %	0 %	25 %	325102759
39	NC_015177	TA	3	6	1933	1938	50 %	50 %	0 %	0 %	325102759
40	NC_015177	ATT	2	6	1954	1959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325102759
41	NC_015177	ACT	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325102759
42	NC_015177	ATA	2	6	2069	2074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325102759
43	NC_015177	GAA	2	6	2167	2172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325102759
44	NC_015177	TTA	2	6	2180	2185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325102759
45	NC_015177	ATT	2	6	2200	2205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325102759
46	NC_015177	ATA	2	6	2291	2296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325102759
47	NC_015177	A	6	6	2296	2301	100 %	0 %	0 %	0 %	325102759
48	NC_015177	AGC	2	6	2393	2398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325102759
49	NC_015177	TACT	2	8	2402	2409	25 %	50 %	0 %	25 %	325102759
50	NC_015177	AGATAA	2	12	2424	2435	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325102759
51	NC_015177	GGA	2	6	2449	2454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325102759
52	NC_015177	AGT	2	6	2476	2481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325102759
53	NC_015177	TTA	2	6	2485	2490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325102759
54	NC_015177	GGA	2	6	2503	2508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325102759
55	NC_015177	GA	3	6	2507	2512	50 %	0 %	50 %	0 %	325102759
56	NC_015177	ATT	2	6	2546	2551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325102759
57	NC_015177	AT	3	6	2586	2591	50 %	50 %	0 %	0 %	325102759
58	NC_015177	AGG	2	6	2595	2600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325102759
59	NC_015177	ATA	2	6	2612	2617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325102759
60	NC_015177	GGA	2	6	2644	2649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325102759
61	NC_015177	TTC	2	6	2676	2681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325102759
62	NC_015177	AAT	2	6	2710	2715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325102759
63	NC_015177	ATGG	2	8	2731	2738	25 %	25 %	50 %	0 %	325102759
64	NC_015177	AACT	2	8	2961	2968	50 %	25 %	0 %	25 %	325102760
65	NC_015177	ATT	2	6	3043	3048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325102760
66	NC_015177	TAG	2	6	3072	3077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325102760
67	NC_015177	CAAA	2	8	3096	3103	75 %	0 %	0 %	25 %	325102760
68	NC_015177	TCT	2	6	3113	3118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325102760
69	NC_015177	CT	3	6	3124	3129	0 %	50 %	0 %	50 %	325102760
70	NC_015177	CCG	2	6	3170	3175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325102760
71	NC_015177	GA	4	8	3184	3191	50 %	0 %	50 %	0 %	325102760
72	NC_015177	GCA	2	6	3200	3205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325102760
73	NC_015177	TTAA	2	8	3218	3225	50 %	50 %	0 %	0 %	325102760
74	NC_015177	ATT	2	6	3235	3240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325102760
75	NC_015177	TAA	2	6	3287	3292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325102760
76	NC_015177	GCTA	2	8	3295	3302	25 %	25 %	25 %	25 %	325102760
77	NC_015177	AT	3	6	3362	3367	50 %	50 %	0 %	0 %	325102760
78	NC_015177	AGTT	2	8	3373	3380	25 %	50 %	25 %	0 %	325102760
79	NC_015177	T	6	6	3389	3394	0 %	100 %	0 %	0 %	325102760
80	NC_015177	TTG	2	6	3396	3401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325102760
81	NC_015177	CTA	2	6	3615	3620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325102761
82	NC_015177	CCG	2	6	3621	3626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325102761
83	NC_015177	CCA	2	6	3627	3632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325102761
84	NC_015177	CCA	2	6	3660	3665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325102761
85	NC_015177	CCT	2	6	3672	3677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325102761
86	NC_015177	TCC	2	6	3683	3688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325102761
87	NC_015177	ACC	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325102761
88	NC_015177	A	6	6	3736	3741	100 %	0 %	0 %	0 %	325102761
89	NC_015177	CCA	3	9	3777	3785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325102761
90	NC_015177	CCG	2	6	3789	3794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325102761
91	NC_015177	ACGATA	2	12	3807	3818	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325102761
92	NC_015177	ATT	2	6	3909	3914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325102761
93	NC_015177	TAA	2	6	3942	3947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325102761
94	NC_015177	TTCCA	2	10	4019	4028	20 %	40 %	0 %	40 %	325102761
95	NC_015177	AGC	2	6	4064	4069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325102761
96	NC_015177	T	7	7	4089	4095	0 %	100 %	0 %	0 %	325102761
97	NC_015177	C	6	6	4101	4106	0 %	0 %	0 %	100 %	325102761
98	NC_015177	ACG	2	6	4176	4181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325102761
99	NC_015177	GTC	2	6	4202	4207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325102761
100	NC_015177	GTTT	2	8	4219	4226	0 %	75 %	25 %	0 %	325102761
101	NC_015177	TGG	2	6	4292	4297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325102761
102	NC_015177	T	7	7	4354	4360	0 %	100 %	0 %	0 %	325102761
103	NC_015177	A	6	6	4431	4436	100 %	0 %	0 %	0 %	325102762
104	NC_015177	ATT	2	6	4491	4496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325102762
105	NC_015177	TTG	2	6	4558	4563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325102762
106	NC_015177	TCA	2	6	4570	4575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325102762
107	NC_015177	AT	3	6	4609	4614	50 %	50 %	0 %	0 %	325102762
108	NC_015177	T	6	6	4627	4632	0 %	100 %	0 %	0 %	325102762
109	NC_015177	GTTTG	2	10	4634	4643	0 %	60 %	40 %	0 %	325102762
110	NC_015177	AGAC	2	8	4711	4718	50 %	0 %	25 %	25 %	325102762
111	NC_015177	TTCT	2	8	4779	4786	0 %	75 %	0 %	25 %	325102762
112	NC_015177	AACTT	2	10	4882	4891	40 %	40 %	0 %	20 %	325102763
113	NC_015177	TTA	2	6	4900	4905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325102763
114	NC_015177	TTA	2	6	4966	4971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325102763
115	NC_015177	TCT	2	6	4977	4982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325102763
116	NC_015177	TGTAT	2	10	4989	4998	20 %	60 %	20 %	0 %	325102763
117	NC_015177	TCT	2	6	5022	5027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325102763
118	NC_015177	GCCT	2	8	5129	5136	0 %	25 %	25 %	50 %	325102763
119	NC_015177	TCT	2	6	5185	5190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325102763
120	NC_015177	TTTC	2	8	5258	5265	0 %	75 %	0 %	25 %	325102763
121	NC_015177	CTT	2	6	5320	5325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325102763
122	NC_015177	C	6	6	5345	5350	0 %	0 %	0 %	100 %	325102763
123	NC_015177	AGT	2	6	5443	5448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325102763
124	NC_015177	T	6	6	5448	5453	0 %	100 %	0 %	0 %	325102763
125	NC_015177	AGT	2	6	5564	5569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325102764
126	NC_015177	TA	3	6	5583	5588	50 %	50 %	0 %	0 %	325102764
127	NC_015177	CAA	2	6	5591	5596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325102764
128	NC_015177	ATT	2	6	5656	5661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325102764
129	NC_015177	GTT	2	6	5718	5723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325102764
130	NC_015177	TA	3	6	5725	5730	50 %	50 %	0 %	0 %	325102764
131	NC_015177	CGA	2	6	5732	5737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325102764
132	NC_015177	GTT	2	6	5802	5807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325102764
133	NC_015177	CGG	2	6	5818	5823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325102764
134	NC_015177	TGC	2	6	5831	5836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325102764
135	NC_015177	TGT	2	6	5867	5872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325102764
136	NC_015177	TAA	2	6	5924	5929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325102764
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