MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Planctomyces brasiliensis DSM 5305 chromosome

Total Repeats: 75629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015174	GCC	2	6	61	66	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325106587
2	NC_015174	AAC	2	6	83	88	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325106587
3	NC_015174	TTC	2	6	100	105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325106587
4	NC_015174	ACC	2	6	165	170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325106587
5	NC_015174	AAC	2	6	179	184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325106587
6	NC_015174	CAG	2	6	188	193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106587
7	NC_015174	TGC	2	6	333	338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106587
8	NC_015174	TCA	2	6	363	368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106587
9	NC_015174	TGC	2	6	375	380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106587
10	NC_015174	CAG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106587
11	NC_015174	GCA	2	6	467	472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106587
12	NC_015174	GCA	2	6	475	480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106587
13	NC_015174	GGA	2	6	493	498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325106587
14	NC_015174	GCC	2	6	499	504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325106587
15	NC_015174	CTC	2	6	582	587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325106587
16	NC_015174	CAA	2	6	644	649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325106587
17	NC_015174	CTG	2	6	681	686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106587
18	NC_015174	CGC	2	6	728	733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325106587
19	NC_015174	GAT	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325106587
20	NC_015174	GAA	2	6	761	766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325106587
21	NC_015174	AAC	2	6	767	772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325106587
22	NC_015174	GTC	2	6	797	802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106587
23	NC_015174	CGG	2	6	844	849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106587
24	NC_015174	TAC	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106587
25	NC_015174	CGT	2	6	990	995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106587
26	NC_015174	CGT	2	6	1001	1006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106587
27	NC_015174	CGA	2	6	1033	1038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106587
28	NC_015174	GCA	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106587
29	NC_015174	CAT	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106587
30	NC_015174	CAG	2	6	1610	1615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106587
31	NC_015174	CGG	2	6	1618	1623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106587
32	NC_015174	GCA	2	6	1663	1668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106587
33	NC_015174	TGC	2	6	1737	1742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106587
34	NC_015174	CTT	2	6	1898	1903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325106588
35	NC_015174	GGC	2	6	1913	1918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106588
36	NC_015174	CTT	2	6	1919	1924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325106588
37	NC_015174	GCG	2	6	1953	1958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106588
38	NC_015174	TCT	3	9	1975	1983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325106588
39	NC_015174	CCG	2	6	2010	2015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325106588
40	NC_015174	TGA	2	6	2272	2277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325106589
41	NC_015174	CCA	2	6	2296	2301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325106589
42	NC_015174	CTA	2	6	2345	2350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106589
43	NC_015174	CGG	2	6	2461	2466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106589
44	NC_015174	CGT	2	6	2633	2638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106589
45	NC_015174	GCT	2	6	2678	2683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106589
46	NC_015174	TGC	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106589
47	NC_015174	ATC	2	6	2890	2895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106589
48	NC_015174	CGC	2	6	3011	3016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325106589
49	NC_015174	ATG	2	6	3105	3110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325106589
50	NC_015174	GCA	2	6	3148	3153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106589
51	NC_015174	CTG	2	6	3174	3179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106589
52	NC_015174	GAC	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106589
53	NC_015174	GGC	2	6	3255	3260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106589
54	NC_015174	CGG	2	6	3341	3346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106589
55	NC_015174	GAT	2	6	3408	3413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325106589
56	NC_015174	GCG	2	6	3445	3450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106589
57	NC_015174	GTC	2	6	3541	3546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106589
58	NC_015174	ATC	2	6	3564	3569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106589
59	NC_015174	GCT	2	6	3621	3626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106590
60	NC_015174	GAC	2	6	3627	3632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106590
61	NC_015174	GCT	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106590
62	NC_015174	GCT	2	6	3813	3818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106590
63	NC_015174	CGC	2	6	3971	3976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325106591
64	NC_015174	TGG	2	6	4011	4016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325106591
65	NC_015174	CGG	2	6	4180	4185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106591
66	NC_015174	GCT	2	6	4204	4209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106591
67	NC_015174	GGC	2	6	4267	4272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106591
68	NC_015174	CGG	2	6	4288	4293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106591
69	NC_015174	GGC	2	6	4366	4371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106591
70	NC_015174	CTG	2	6	4509	4514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106591
71	NC_015174	GAA	2	6	4606	4611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325106591
72	NC_015174	GAA	2	6	4676	4681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325106591
73	NC_015174	CGA	2	6	4735	4740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106591
74	NC_015174	GGA	2	6	4787	4792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325106591
75	NC_015174	GCT	2	6	5024	5029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106591
76	NC_015174	CGG	2	6	5140	5145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106591
77	NC_015174	GTC	2	6	5249	5254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106591
78	NC_015174	ACG	2	6	5327	5332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106591
79	NC_015174	GCG	2	6	5340	5345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106591
80	NC_015174	CAC	2	6	5383	5388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325106591
81	NC_015174	CCA	2	6	5398	5403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325106591
82	NC_015174	TCA	2	6	5484	5489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106591
83	NC_015174	ACC	2	6	5579	5584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325106591
84	NC_015174	CTG	2	6	5609	5614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106591
85	NC_015174	GAC	2	6	5651	5656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106591
86	NC_015174	GTG	2	6	5678	5683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325106591
87	NC_015174	ACG	2	6	5730	5735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106591
88	NC_015174	GAT	2	6	5800	5805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325106591
89	NC_015174	CTG	2	6	5809	5814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106591
90	NC_015174	ACG	2	6	5849	5854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106591
91	NC_015174	CGA	2	6	5872	5877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106591
92	NC_015174	GCT	2	6	5889	5894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106591
93	NC_015174	TGG	2	6	5936	5941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325106591
94	NC_015174	CAA	2	6	6025	6030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325106591
95	NC_015174	CCA	2	6	6094	6099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325106591
96	NC_015174	TGG	2	6	6174	6179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325106591
97	NC_015174	AGA	2	6	6199	6204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325106591
98	NC_015174	CAG	2	6	6236	6241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106591
99	NC_015174	CAC	2	6	6592	6597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325106592
100	NC_015174	GAT	2	6	6769	6774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325106592
101	NC_015174	CAC	3	9	6792	6800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325106592
102	NC_015174	CTT	2	6	6946	6951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325106592
103	NC_015174	TAA	2	6	7083	7088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325106592
104	NC_015174	ATC	2	6	7152	7157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106592
105	NC_015174	CGA	2	6	7281	7286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106592
106	NC_015174	GAC	2	6	7356	7361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106592
107	NC_015174	CGG	2	6	7730	7735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106593
108	NC_015174	CGA	2	6	7823	7828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106593
109	NC_015174	GAA	2	6	7857	7862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325106593
110	NC_015174	AAG	2	6	7924	7929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325106593
111	NC_015174	GAA	2	6	8184	8189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325106593
112	NC_015174	TCA	2	6	8401	8406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106593
113	NC_015174	CTG	2	6	8496	8501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106593
114	NC_015174	GAC	2	6	8520	8525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106593
115	NC_015174	CAG	2	6	8547	8552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106593
116	NC_015174	TGC	2	6	8659	8664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106593
117	NC_015174	TCA	2	6	8683	8688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106593
118	NC_015174	GCT	2	6	8720	8725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106593
119	NC_015174	CGA	2	6	8758	8763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106593
120	NC_015174	GGC	2	6	8769	8774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106593
121	NC_015174	TGA	2	6	8851	8856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325106593
122	NC_015174	GAA	2	6	8883	8888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325106593
123	NC_015174	CCG	2	6	8945	8950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325106593
124	NC_015174	AAG	2	6	9015	9020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325106593
125	NC_015174	ACA	2	6	9064	9069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325106593
126	NC_015174	CGG	2	6	9166	9171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106593
127	NC_015174	TTG	2	6	9213	9218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325106593
128	NC_015174	CGA	2	6	9329	9334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106593
129	NC_015174	CGT	2	6	9467	9472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106593
130	NC_015174	CGG	2	6	9512	9517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106593
131	NC_015174	CTG	2	6	9540	9545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106593
132	NC_015174	GTC	2	6	9633	9638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106593
133	NC_015174	GAA	2	6	9671	9676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325106593
134	NC_015174	CAT	2	6	9719	9724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106593
135	NC_015174	TAC	2	6	9738	9743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106593
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137	NC_015174	CTT	3	9	9975	9983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325106594
138	NC_015174	CGC	2	6	10005	10010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325106594
139	NC_015174	GAA	2	6	10044	10049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325106594
140	NC_015174	GAC	2	6	10075	10080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106594
141	NC_015174	TGG	2	6	10100	10105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325106594
142	NC_015174	GCG	2	6	10106	10111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106594
143	NC_015174	GTT	2	6	10209	10214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325106594
144	NC_015174	GGC	2	6	10240	10245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106594
145	NC_015174	CGA	2	6	10374	10379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106594
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151	NC_015174	GCT	2	6	10911	10916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106594
152	NC_015174	GCC	2	6	10947	10952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325106594
153	NC_015174	ACG	2	6	10985	10990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106594
154	NC_015174	CGA	3	9	11007	11015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106594
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157	NC_015174	CGA	2	6	11193	11198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106594
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159	NC_015174	CAT	2	6	11235	11240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106594
160	NC_015174	CTG	2	6	11242	11247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106594
161	NC_015174	CAT	2	6	11253	11258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106594
162	NC_015174	CGG	2	6	11268	11273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106594
163	NC_015174	GAA	2	6	11296	11301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325106594
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244	NC_015174	TCC	3	9	16875	16883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325106598
245	NC_015174	ACA	2	6	16926	16931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325106598
246	NC_015174	TTC	2	6	17122	17127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325106599
247	NC_015174	TCG	2	6	17141	17146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106599
248	NC_015174	ATC	2	6	17206	17211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106599
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251	NC_015174	CAT	2	6	17479	17484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106599
252	NC_015174	ACT	2	6	17570	17575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106600
253	NC_015174	GCG	2	6	17659	17664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106600
254	NC_015174	CGC	2	6	17748	17753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325106600
255	NC_015174	GCC	2	6	17770	17775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325106600
256	NC_015174	CAT	2	6	17805	17810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106600
257	NC_015174	TCT	2	6	17956	17961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325106600
258	NC_015174	CGC	2	6	17991	17996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325106600
259	NC_015174	GAT	2	6	18047	18052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325106600
260	NC_015174	CTT	2	6	18149	18154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325106600
261	NC_015174	GCG	2	6	18304	18309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106600
262	NC_015174	CGA	2	6	18587	18592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106601
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282	NC_015174	ATC	2	6	20115	20120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106601
283	NC_015174	CAG	2	6	20169	20174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106601
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285	NC_015174	CTG	2	6	20358	20363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106601
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375	NC_015174	CGG	2	6	26807	26812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106604
376	NC_015174	AGC	2	6	26925	26930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106604
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401	NC_015174	TTC	2	6	28985	28990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325106604
402	NC_015174	GTG	2	6	29127	29132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325106604
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497	NC_015174	CGG	2	6	37605	37610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106609
498	NC_015174	TGC	3	9	37615	37623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106609
499	NC_015174	TTG	2	6	37663	37668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325106609
500	NC_015174	TCG	2	6	37726	37731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106609

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