MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Planctomyces brasiliensis DSM 5305 chromosome

Total Repeats: 103402

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015174	CAT	2	6	186548	186553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106721
3002	NC_015174	GCT	2	6	186572	186577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106721
3003	NC_015174	CCG	2	6	186585	186590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325106721
3004	NC_015174	CAA	2	6	186644	186649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325106721
3005	NC_015174	TGA	2	6	186841	186846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325106721
3006	NC_015174	CGG	2	6	186866	186871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106721
3007	NC_015174	CTGC	3	12	186880	186891	0 %	25 %	25 %	50 %	325106721
3008	NC_015174	GGCCG	2	10	186960	186969	0 %	0 %	60 %	40 %	325106721
3009	NC_015174	CGA	2	6	187010	187015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106721
3010	NC_015174	CTGC	2	8	187092	187099	0 %	25 %	25 %	50 %	325106722
3011	NC_015174	CAT	2	6	187105	187110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106722
3012	NC_015174	CGA	2	6	187231	187236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106722
3013	NC_015174	GAA	2	6	187282	187287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325106722
3014	NC_015174	AC	4	8	187328	187335	50 %	0 %	0 %	50 %	325106722
3015	NC_015174	CAG	2	6	187343	187348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106722
3016	NC_015174	CTG	2	6	187369	187374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106722
3017	NC_015174	CGA	2	6	187384	187389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106722
3018	NC_015174	GAA	2	6	187430	187435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325106722
3019	NC_015174	CGGAT	2	10	187491	187500	20 %	20 %	40 %	20 %	325106723
3020	NC_015174	CGG	2	6	187619	187624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106723
3021	NC_015174	CAA	2	6	187660	187665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325106723
3022	NC_015174	TCAA	2	8	187674	187681	50 %	25 %	0 %	25 %	325106723
3023	NC_015174	ACC	2	6	187703	187708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325106723
3024	NC_015174	TCGG	2	8	187731	187738	0 %	25 %	50 %	25 %	325106723
3025	NC_015174	GCA	2	6	187807	187812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106723
3026	NC_015174	GCG	2	6	187873	187878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106723
3027	NC_015174	CCA	2	6	187991	187996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325106723
3028	NC_015174	TGA	2	6	188017	188022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325106723
3029	NC_015174	CCA	2	6	188029	188034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325106723
3030	NC_015174	CAG	3	9	188221	188229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106723
3031	NC_015174	CGG	2	6	188267	188272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106723
3032	NC_015174	AGCA	2	8	188276	188283	50 %	0 %	25 %	25 %	325106723
3033	NC_015174	TCGC	2	8	188310	188317	0 %	25 %	25 %	50 %	325106723
3034	NC_015174	CT	3	6	188422	188427	0 %	50 %	0 %	50 %	325106723
3035	NC_015174	GGAA	2	8	188438	188445	50 %	0 %	50 %	0 %	325106723
3036	NC_015174	GACTGA	2	12	188460	188471	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325106723
3037	NC_015174	CCG	2	6	188506	188511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325106723
3038	NC_015174	CGGG	2	8	188599	188606	0 %	0 %	75 %	25 %	325106723
3039	NC_015174	CGT	2	6	188662	188667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106723
3040	NC_015174	CTG	2	6	188744	188749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106723
3041	NC_015174	TAC	2	6	188935	188940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106723
3042	NC_015174	CGG	2	6	189018	189023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106723
3043	NC_015174	AACGG	2	10	189028	189037	40 %	0 %	40 %	20 %	325106723
3044	NC_015174	GTC	2	6	189078	189083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106723
3045	NC_015174	T	6	6	189475	189480	0 %	100 %	0 %	0 %	325106724
3046	NC_015174	TCG	2	6	189501	189506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106724
3047	NC_015174	CCGG	2	8	189513	189520	0 %	0 %	50 %	50 %	325106724
3048	NC_015174	TGT	2	6	189546	189551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325106724
3049	NC_015174	TGCA	2	8	189613	189620	25 %	25 %	25 %	25 %	325106724
3050	NC_015174	CGC	2	6	189663	189668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325106724
3051	NC_015174	C	6	6	189668	189673	0 %	0 %	0 %	100 %	325106724
3052	NC_015174	GTT	2	6	189789	189794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325106724
3053	NC_015174	CAG	2	6	189805	189810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106724
3054	NC_015174	TGC	2	6	189885	189890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106724
3055	NC_015174	TGAA	2	8	189908	189915	50 %	25 %	25 %	0 %	325106724
3056	NC_015174	CAGC	2	8	189930	189937	25 %	0 %	25 %	50 %	325106724
3057	NC_015174	CAG	2	6	189946	189951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106724
3058	NC_015174	CCGA	2	8	189958	189965	25 %	0 %	25 %	50 %	325106724
3059	NC_015174	TCAT	2	8	189983	189990	25 %	50 %	0 %	25 %	325106724
3060	NC_015174	TTC	2	6	190018	190023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325106724
3061	NC_015174	TGAT	2	8	190133	190140	25 %	50 %	25 %	0 %	325106724
3062	NC_015174	CTG	2	6	190141	190146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106724
3063	NC_015174	CAG	2	6	190147	190152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106724
3064	NC_015174	TGG	2	6	190192	190197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325106724
3065	NC_015174	TGG	2	6	190213	190218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325106724
3066	NC_015174	CAC	2	6	190291	190296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325106724
3067	NC_015174	GCT	2	6	190303	190308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106724
3068	NC_015174	CGGC	2	8	190388	190395	0 %	0 %	50 %	50 %	325106724
3069	NC_015174	GACA	2	8	190419	190426	50 %	0 %	25 %	25 %	325106724
3070	NC_015174	CAG	2	6	190454	190459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106724
3071	NC_015174	GTC	2	6	190477	190482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106724
3072	NC_015174	GT	3	6	190496	190501	0 %	50 %	50 %	0 %	325106724
3073	NC_015174	TGCC	2	8	190743	190750	0 %	25 %	25 %	50 %	325106724
3074	NC_015174	GCG	2	6	190763	190768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106724
3075	NC_015174	GCCA	2	8	190799	190806	25 %	0 %	25 %	50 %	325106724
3076	NC_015174	ACC	2	6	190886	190891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325106724
3077	NC_015174	ACTT	2	8	191056	191063	25 %	50 %	0 %	25 %	325106725
3078	NC_015174	GAA	2	6	191095	191100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325106725
3079	NC_015174	CGG	2	6	191241	191246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106725
3080	NC_015174	ACC	2	6	191283	191288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325106725
3081	NC_015174	CAT	3	9	191298	191306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106725
3082	NC_015174	TGA	2	6	191312	191317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325106725
3083	NC_015174	CTG	2	6	191346	191351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106725
3084	NC_015174	TGC	2	6	191366	191371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106725
3085	NC_015174	T	6	6	191453	191458	0 %	100 %	0 %	0 %	325106725
3086	NC_015174	TCG	2	6	191822	191827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106726
3087	NC_015174	GACG	2	8	191868	191875	25 %	0 %	50 %	25 %	325106726
3088	NC_015174	CGTT	2	8	191876	191883	0 %	50 %	25 %	25 %	325106726
3089	NC_015174	GAT	2	6	191959	191964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325106726
3090	NC_015174	CAT	2	6	192054	192059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106726
3091	NC_015174	ACC	2	6	192071	192076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325106726
3092	NC_015174	AGT	2	6	192150	192155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325106726
3093	NC_015174	TCA	2	6	192210	192215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106726
3094	NC_015174	TCG	2	6	192242	192247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106726
3095	NC_015174	GAC	2	6	192286	192291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106726
3096	NC_015174	CAG	2	6	192313	192318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106726
3097	NC_015174	CGG	2	6	192372	192377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106726
3098	NC_015174	TGC	2	6	192399	192404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106726
3099	NC_015174	AGT	2	6	192429	192434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325106726
3100	NC_015174	TCG	2	6	192439	192444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106726
3101	NC_015174	AGC	2	6	192473	192478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106726
3102	NC_015174	GT	3	6	192502	192507	0 %	50 %	50 %	0 %	325106726
3103	NC_015174	GTG	2	6	192540	192545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325106726
3104	NC_015174	GAA	2	6	192574	192579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325106726
3105	NC_015174	AAG	2	6	192602	192607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325106726
3106	NC_015174	TTG	3	9	192703	192711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325106726
3107	NC_015174	CTT	2	6	192718	192723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325106726
3108	NC_015174	ACAG	2	8	192725	192732	50 %	0 %	25 %	25 %	325106726
3109	NC_015174	GCA	2	6	192895	192900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106727
3110	NC_015174	ATG	2	6	192939	192944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325106727
3111	NC_015174	GTT	2	6	192965	192970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325106727
3112	NC_015174	ATC	2	6	192972	192977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106727
3113	NC_015174	GGC	2	6	193049	193054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106727
3114	NC_015174	CAG	2	6	193121	193126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106727
3115	NC_015174	CCA	2	6	193213	193218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325106727
3116	NC_015174	AGC	2	6	193235	193240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106727
3117	NC_015174	CGG	2	6	193270	193275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106727
3118	NC_015174	CGA	2	6	193279	193284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106727
3119	NC_015174	GGC	2	6	193310	193315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106727
3120	NC_015174	CAG	2	6	193349	193354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106727
3121	NC_015174	CA	3	6	193363	193368	50 %	0 %	0 %	50 %	325106727
3122	NC_015174	CTT	2	6	193716	193721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325106728
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3230	NC_015174	GCT	2	6	199954	199959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106733
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3234	NC_015174	GCCC	2	8	200083	200090	0 %	0 %	25 %	75 %	325106733
3235	NC_015174	CAC	2	6	200093	200098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325106733
3236	NC_015174	TG	3	6	200196	200201	0 %	50 %	50 %	0 %	325106733
3237	NC_015174	ACC	2	6	200250	200255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325106733
3238	NC_015174	ACC	2	6	200367	200372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325106733
3239	NC_015174	ACC	2	6	200463	200468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325106733
3240	NC_015174	ACC	2	6	200511	200516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325106733
3241	NC_015174	GTCACC	2	12	200544	200555	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325106733
3242	NC_015174	TG	3	6	200559	200564	0 %	50 %	50 %	0 %	325106733
3243	NC_015174	CAT	2	6	200573	200578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106733
3244	NC_015174	CTG	2	6	200642	200647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106733
3245	NC_015174	GCG	2	6	200671	200676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106733
3246	NC_015174	CGG	2	6	200678	200683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106733
3247	NC_015174	GCG	2	6	200686	200691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106733
3248	NC_015174	GTC	2	6	201225	201230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106734
3249	NC_015174	GGCA	2	8	201247	201254	25 %	0 %	50 %	25 %	325106734
3250	NC_015174	CAT	2	6	201266	201271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106734
3251	NC_015174	CGCC	2	8	201317	201324	0 %	0 %	25 %	75 %	325106734
3252	NC_015174	CTGG	2	8	201405	201412	0 %	25 %	50 %	25 %	325106734
3253	NC_015174	CTG	2	6	201425	201430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106734
3254	NC_015174	CGG	2	6	201469	201474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106734
3255	NC_015174	GAT	2	6	201479	201484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325106734
3256	NC_015174	CT	3	6	201528	201533	0 %	50 %	0 %	50 %	325106734
3257	NC_015174	ATT	2	6	201570	201575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325106734
3258	NC_015174	CGA	2	6	201605	201610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106734
3259	NC_015174	GCTC	2	8	201635	201642	0 %	25 %	25 %	50 %	325106734
3260	NC_015174	CGGC	2	8	201688	201695	0 %	0 %	50 %	50 %	325106734
3261	NC_015174	AG	3	6	201706	201711	50 %	0 %	50 %	0 %	325106734
3262	NC_015174	GTG	3	9	201738	201746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325106734
3263	NC_015174	GGC	2	6	201756	201761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106734
3264	NC_015174	GCC	2	6	201831	201836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325106734
3265	NC_015174	T	6	6	201879	201884	0 %	100 %	0 %	0 %	325106734
3266	NC_015174	TTTC	2	8	201954	201961	0 %	75 %	0 %	25 %	325106734
3267	NC_015174	GGCC	2	8	202010	202017	0 %	0 %	50 %	50 %	325106734
3268	NC_015174	CA	3	6	202070	202075	50 %	0 %	0 %	50 %	325106734
3269	NC_015174	CGGC	3	12	202615	202626	0 %	0 %	50 %	50 %	325106735
3270	NC_015174	CTG	2	6	202664	202669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106735
3271	NC_015174	GCT	2	6	202757	202762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106735
3272	NC_015174	ATC	2	6	202793	202798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106735
3273	NC_015174	GATC	2	8	202879	202886	25 %	25 %	25 %	25 %	325106735
3274	NC_015174	A	6	6	202910	202915	100 %	0 %	0 %	0 %	325106735
3275	NC_015174	TGA	2	6	202920	202925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325106735
3276	NC_015174	CGA	2	6	202957	202962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106735
3277	NC_015174	TCG	2	6	203003	203008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106735
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3279	NC_015174	GCA	2	6	203101	203106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106735
3280	NC_015174	TGT	2	6	203127	203132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325106735
3281	NC_015174	CGA	2	6	203167	203172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106735
3282	NC_015174	A	6	6	203228	203233	100 %	0 %	0 %	0 %	325106735
3283	NC_015174	CT	3	6	203272	203277	0 %	50 %	0 %	50 %	325106735
3284	NC_015174	CGA	2	6	203278	203283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106735
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3294	NC_015174	CAGTGC	2	12	203932	203943	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325106735
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3301	NC_015174	CTG	2	6	204430	204435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106736
3302	NC_015174	CGCT	2	8	204468	204475	0 %	25 %	25 %	50 %	325106736
3303	NC_015174	GGTC	2	8	204566	204573	0 %	25 %	50 %	25 %	325106736
3304	NC_015174	TCTGC	2	10	204587	204596	0 %	40 %	20 %	40 %	325106736
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3312	NC_015174	TCGAC	2	10	205017	205026	20 %	20 %	20 %	40 %	325106736
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3314	NC_015174	CGT	2	6	205104	205109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106736
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3317	NC_015174	TCG	2	6	205398	205403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106737
3318	NC_015174	CGA	2	6	205444	205449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106737
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3320	NC_015174	TGC	2	6	205465	205470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106737
3321	NC_015174	TGC	2	6	205479	205484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106737
3322	NC_015174	CCGG	2	8	205544	205551	0 %	0 %	50 %	50 %	325106737
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3325	NC_015174	GCA	2	6	205657	205662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106737
3326	NC_015174	CTG	2	6	205664	205669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106737
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3329	NC_015174	GCT	2	6	205724	205729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106737
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3332	NC_015174	TTC	2	6	205832	205837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325106737
3333	NC_015174	GGCTTT	2	12	205877	205888	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	325106737
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3339	NC_015174	GCG	2	6	206277	206282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106737
3340	NC_015174	GCTG	2	8	206320	206327	0 %	25 %	50 %	25 %	325106737
3341	NC_015174	ATCC	2	8	206345	206352	25 %	25 %	0 %	50 %	325106737
3342	NC_015174	TGA	2	6	206356	206361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325106737
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3344	NC_015174	CTT	2	6	206470	206475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325106737
3345	NC_015174	TTCT	2	8	206564	206571	0 %	75 %	0 %	25 %	325106737
3346	NC_015174	ACG	2	6	206687	206692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106737
3347	NC_015174	TCG	2	6	206736	206741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106737
3348	NC_015174	CAG	2	6	206750	206755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106737
3349	NC_015174	GAG	2	6	206802	206807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325106737
3350	NC_015174	TCT	2	6	206893	206898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325106737
3351	NC_015174	TCT	2	6	206905	206910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325106737
3352	NC_015174	GTC	2	6	206927	206932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325106737
3353	NC_015174	TCC	2	6	206993	206998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325106737
3354	NC_015174	TCA	2	6	207061	207066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325106737
3355	NC_015174	CCGCA	2	10	207487	207496	20 %	0 %	20 %	60 %	325106738
3356	NC_015174	CGG	2	6	207643	207648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325106738
3357	NC_015174	TCCG	2	8	207650	207657	0 %	25 %	25 %	50 %	325106738
3358	NC_015174	AGA	3	9	207809	207817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325106738
3359	NC_015174	ATT	2	6	207838	207843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325106738
3360	NC_015174	GCA	2	6	207860	207865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325106738
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3362	NC_015174	A	6	6	207954	207959	100 %	0 %	0 %	0 %	325106738
3363	NC_015174	A	6	6	207972	207977	100 %	0 %	0 %	0 %	325106738
3364	NC_015174	CAGC	2	8	208046	208053	25 %	0 %	25 %	50 %	325106738
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