MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Paenibacillus polymyxa SC2 chromosome

Total Repeats: 3307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014622	ATCGG	2	10	692	701	20 %	20 %	40 %	20 %	310639472
2	NC_014622	ATTCA	2	10	974	983	40 %	40 %	0 %	20 %	310639472
3	NC_014622	TCATC	2	10	2178	2187	20 %	40 %	0 %	40 %	310639473
4	NC_014622	TGAGC	2	10	2494	2503	20 %	20 %	40 %	20 %	310639473
5	NC_014622	TATCC	2	10	4248	4257	20 %	40 %	0 %	40 %	310639475
6	NC_014622	TTGCA	2	10	5499	5508	20 %	40 %	20 %	20 %	310639477
7	NC_014622	TGCCT	2	10	8178	8187	0 %	40 %	20 %	40 %	310639479
8	NC_014622	GCACA	2	10	10064	10073	40 %	0 %	20 %	40 %	310639479
9	NC_014622	TAATG	2	10	11241	11250	40 %	40 %	20 %	0 %	310639481
10	NC_014622	CCATG	2	10	11649	11658	20 %	20 %	20 %	40 %	310639481
11	NC_014622	CAAAT	2	10	11710	11719	60 %	20 %	0 %	20 %	310639481
12	NC_014622	TAGCC	2	10	18555	18564	20 %	20 %	20 %	40 %	310639483
13	NC_014622	ACTCA	2	10	20589	20598	40 %	20 %	0 %	40 %	310639486
14	NC_014622	GGGAT	2	10	22779	22788	20 %	20 %	60 %	0 %	310639489
15	NC_014622	TAGTG	2	10	24335	24344	20 %	40 %	40 %	0 %	310639492
16	NC_014622	TAAAT	2	10	25163	25172	60 %	40 %	0 %	0 %	310639493
17	NC_014622	ATCTT	2	10	28104	28113	20 %	60 %	0 %	20 %	310639497
18	NC_014622	GGAGC	2	10	28123	28132	20 %	0 %	60 %	20 %	310639497
19	NC_014622	GAGTG	2	10	33869	33878	20 %	20 %	60 %	0 %	310639502
20	NC_014622	TTAAT	2	10	35496	35505	40 %	60 %	0 %	0 %	310639505
21	NC_014622	CAAGC	2	10	35625	35634	40 %	0 %	20 %	40 %	310639505
22	NC_014622	GCAGG	2	10	38167	38176	20 %	0 %	60 %	20 %	310639509
23	NC_014622	CAAAG	2	10	39507	39516	60 %	0 %	20 %	20 %	310639509
24	NC_014622	AGTGA	2	10	40203	40212	40 %	20 %	40 %	0 %	310639510
25	NC_014622	TCCAG	2	10	42190	42199	20 %	20 %	20 %	40 %	310639514
26	NC_014622	GCTTT	2	10	43679	43688	0 %	60 %	20 %	20 %	310639514
27	NC_014622	TGAAA	2	10	46698	46707	60 %	20 %	20 %	0 %	310639516
28	NC_014622	CCGTT	2	10	48166	48175	0 %	40 %	20 %	40 %	310639517
29	NC_014622	CGCTG	2	10	48397	48406	0 %	20 %	40 %	40 %	310639517
30	NC_014622	CGGCA	2	10	48659	48668	20 %	0 %	40 %	40 %	310639517
31	NC_014622	GTGCT	2	10	48838	48847	0 %	40 %	40 %	20 %	310639517
32	NC_014622	CTGGG	2	10	48855	48864	0 %	20 %	60 %	20 %	310639517
33	NC_014622	AAGCC	2	10	51413	51422	40 %	0 %	20 %	40 %	310639520
34	NC_014622	ATTTC	2	10	57261	57270	20 %	60 %	0 %	20 %	310639526
35	NC_014622	TTATG	2	10	57793	57802	20 %	60 %	20 %	0 %	310639527
36	NC_014622	GAAGA	2	10	61094	61103	60 %	0 %	40 %	0 %	310639530
37	NC_014622	CGGAT	2	10	65762	65771	20 %	20 %	40 %	20 %	310639533
38	NC_014622	AGTTC	2	10	71709	71718	20 %	40 %	20 %	20 %	310639538
39	NC_014622	AACCG	2	10	74776	74785	40 %	0 %	20 %	40 %	310639543
40	NC_014622	TGAAA	2	10	74967	74976	60 %	20 %	20 %	0 %	310639544
41	NC_014622	TAGCA	2	10	76991	77000	40 %	20 %	20 %	20 %	310639546
42	NC_014622	GGCGG	2	10	77430	77439	0 %	0 %	80 %	20 %	310639546
43	NC_014622	ACCGT	2	10	78289	78298	20 %	20 %	20 %	40 %	310639546
44	NC_014622	ATAAC	2	10	78302	78311	60 %	20 %	0 %	20 %	310639546
45	NC_014622	TCTTT	2	10	78793	78802	0 %	80 %	0 %	20 %	310639547
46	NC_014622	TGAAC	2	10	79163	79172	40 %	20 %	20 %	20 %	310639547
47	NC_014622	GTTTT	2	10	80047	80056	0 %	80 %	20 %	0 %	310639548
48	NC_014622	CTGGC	2	10	80210	80219	0 %	20 %	40 %	40 %	310639548
49	NC_014622	TTGGT	2	10	80292	80301	0 %	60 %	40 %	0 %	310639548
50	NC_014622	TGGGC	2	10	80378	80387	0 %	20 %	60 %	20 %	310639548
51	NC_014622	TGGAA	2	10	80677	80686	40 %	20 %	40 %	0 %	310639549
52	NC_014622	CAGGA	2	10	85932	85941	40 %	0 %	40 %	20 %	310639553
53	NC_014622	GACAG	2	10	86229	86238	40 %	0 %	40 %	20 %	310639554
54	NC_014622	CATAT	2	10	87005	87014	40 %	40 %	0 %	20 %	310639554
55	NC_014622	CCGGC	2	10	87038	87047	0 %	0 %	40 %	60 %	310639554
56	NC_014622	CTGAA	2	10	87329	87338	40 %	20 %	20 %	20 %	310639554
57	NC_014622	TCCAG	2	10	94227	94236	20 %	20 %	20 %	40 %	310639556
58	NC_014622	AATCC	2	10	94472	94481	40 %	20 %	0 %	40 %	310639556
59	NC_014622	ATGGT	2	10	95378	95387	20 %	40 %	40 %	0 %	310639556
60	NC_014622	ATCTC	2	10	96632	96641	20 %	40 %	0 %	40 %	310639556
61	NC_014622	GAGCT	2	10	98803	98812	20 %	20 %	40 %	20 %	310639556
62	NC_014622	CTTCA	2	10	99407	99416	20 %	40 %	0 %	40 %	310639556
63	NC_014622	TGTTC	2	10	103179	103188	0 %	60 %	20 %	20 %	310639556
64	NC_014622	TTGAC	2	10	105206	105215	20 %	40 %	20 %	20 %	310639556
65	NC_014622	GATTG	2	10	105564	105573	20 %	40 %	40 %	0 %	310639556
66	NC_014622	AATAT	2	10	119678	119687	60 %	40 %	0 %	0 %	310639558
67	NC_014622	TGAAG	2	10	121476	121485	40 %	20 %	40 %	0 %	310639559
68	NC_014622	ACAGA	2	10	123546	123555	60 %	0 %	20 %	20 %	310639562
69	NC_014622	TGGAA	2	10	126963	126972	40 %	20 %	40 %	0 %	310639565
70	NC_014622	TCCGT	2	10	127868	127877	0 %	40 %	20 %	40 %	310639567
71	NC_014622	GTATT	2	10	131887	131896	20 %	60 %	20 %	0 %	310639570
72	NC_014622	TCAAA	2	10	133373	133382	60 %	20 %	0 %	20 %	310639572
73	NC_014622	TTTGA	2	10	135238	135247	20 %	60 %	20 %	0 %	310639574
74	NC_014622	AAAGT	2	10	140615	140624	60 %	20 %	20 %	0 %	310639581
75	NC_014622	AGGGT	2	10	141387	141396	20 %	20 %	60 %	0 %	310639582
76	NC_014622	GTCCA	2	10	142864	142873	20 %	20 %	20 %	40 %	310639584
77	NC_014622	AAGGC	2	10	145193	145202	40 %	0 %	40 %	20 %	310639587
78	NC_014622	ATCAG	2	10	145725	145734	40 %	20 %	20 %	20 %	310639588
79	NC_014622	TTCCT	2	10	149487	149496	0 %	60 %	0 %	40 %	310639593
80	NC_014622	CCAGC	2	10	152137	152146	20 %	0 %	20 %	60 %	310639595
81	NC_014622	GTAAT	2	10	155179	155188	40 %	40 %	20 %	0 %	310639597
82	NC_014622	CGCAT	2	10	159085	159094	20 %	20 %	20 %	40 %	310639600
83	NC_014622	TTTCA	2	10	160256	160265	20 %	60 %	0 %	20 %	310639601
84	NC_014622	CAAGG	2	10	161839	161848	40 %	0 %	40 %	20 %	310639603
85	NC_014622	ATCCA	2	10	165593	165602	40 %	20 %	0 %	40 %	310639606
86	NC_014622	GTGTG	2	10	165641	165650	0 %	40 %	60 %	0 %	310639606
87	NC_014622	GGAAG	2	10	165727	165736	40 %	0 %	60 %	0 %	310639606
88	NC_014622	GGGGA	2	10	165809	165818	20 %	0 %	80 %	0 %	310639606
89	NC_014622	CATGG	2	10	167483	167492	20 %	20 %	40 %	20 %	310639607
90	NC_014622	TAGCC	2	10	167629	167638	20 %	20 %	20 %	40 %	310639607
91	NC_014622	GTACA	2	10	169495	169504	40 %	20 %	20 %	20 %	310639610
92	NC_014622	ACCAA	2	10	169731	169740	60 %	0 %	0 %	40 %	310639610
93	NC_014622	GAAAA	2	10	170985	170994	80 %	0 %	20 %	0 %	310639612
94	NC_014622	TCAAT	2	10	171661	171670	40 %	40 %	0 %	20 %	310639614
95	NC_014622	CATGA	2	10	171812	171821	40 %	20 %	20 %	20 %	310639614
96	NC_014622	TTTGA	2	10	175428	175437	20 %	60 %	20 %	0 %	310639617
97	NC_014622	TGCAA	2	10	178984	178993	40 %	20 %	20 %	20 %	310639621
98	NC_014622	TGGCT	2	10	178996	179005	0 %	40 %	40 %	20 %	310639621
99	NC_014622	ACGAT	2	10	190084	190093	40 %	20 %	20 %	20 %	310639628
100	NC_014622	CGTGG	2	10	191182	191191	0 %	20 %	60 %	20 %	310639629
101	NC_014622	TATGG	2	10	192301	192310	20 %	40 %	40 %	0 %	310639630
102	NC_014622	TATGA	2	10	193204	193213	40 %	40 %	20 %	0 %	310639631
103	NC_014622	GTTTT	2	10	194079	194088	0 %	80 %	20 %	0 %	310639633
104	NC_014622	GATCG	2	10	200178	200187	20 %	20 %	40 %	20 %	310639640
105	NC_014622	AGCAG	2	10	201037	201046	40 %	0 %	40 %	20 %	310639641
106	NC_014622	AATGG	2	10	211975	211984	40 %	20 %	40 %	0 %	310639652
107	NC_014622	GAGAA	2	10	216819	216828	60 %	0 %	40 %	0 %	310639657
108	NC_014622	GATTT	2	10	221820	221829	20 %	60 %	20 %	0 %	310639662
109	NC_014622	GCTTT	2	10	222327	222336	0 %	60 %	20 %	20 %	310639663
110	NC_014622	GTTTT	2	10	222537	222546	0 %	80 %	20 %	0 %	310639663
111	NC_014622	ACAGA	2	10	223934	223943	60 %	0 %	20 %	20 %	310639663
112	NC_014622	TGGAA	2	10	226849	226858	40 %	20 %	40 %	0 %	310639665
113	NC_014622	ATTTT	2	10	227890	227899	20 %	80 %	0 %	0 %	310639666
114	NC_014622	AGTGA	2	10	228749	228758	40 %	20 %	40 %	0 %	310639666
115	NC_014622	CGATT	2	10	229127	229136	20 %	40 %	20 %	20 %	310639667
116	NC_014622	ATTGG	2	10	230020	230029	20 %	40 %	40 %	0 %	310639667
117	NC_014622	TCGGA	2	10	230313	230322	20 %	20 %	40 %	20 %	310639668
118	NC_014622	TGGAG	2	10	230356	230365	20 %	20 %	60 %	0 %	310639668
119	NC_014622	GCCTC	2	10	231646	231655	0 %	20 %	20 %	60 %	310639670
120	NC_014622	GCAGG	2	10	232443	232452	20 %	0 %	60 %	20 %	310639670
121	NC_014622	ACAGC	2	10	232672	232681	40 %	0 %	20 %	40 %	310639670
122	NC_014622	AAGGT	2	10	234007	234016	40 %	20 %	40 %	0 %	310639670
123	NC_014622	AAAGG	2	10	239835	239844	60 %	0 %	40 %	0 %	310639675
124	NC_014622	AAGGG	2	10	240344	240353	40 %	0 %	60 %	0 %	310639676
125	NC_014622	CTTTT	2	10	241508	241517	0 %	80 %	0 %	20 %	310639677
126	NC_014622	TTATG	2	10	241723	241732	20 %	60 %	20 %	0 %	310639677
127	NC_014622	AACTT	2	10	241887	241896	40 %	40 %	0 %	20 %	310639677
128	NC_014622	TACAT	2	10	243265	243274	40 %	40 %	0 %	20 %	310639678
129	NC_014622	AAGAT	2	10	245325	245334	60 %	20 %	20 %	0 %	310639680
130	NC_014622	TTCTG	2	10	247241	247250	0 %	60 %	20 %	20 %	310639681
131	NC_014622	GAGAA	2	10	249597	249606	60 %	0 %	40 %	0 %	310639682
132	NC_014622	AAATG	2	10	250569	250578	60 %	20 %	20 %	0 %	310639682
133	NC_014622	ATATT	2	10	251446	251455	40 %	60 %	0 %	0 %	310639682
134	NC_014622	AGATG	2	10	252188	252197	40 %	20 %	40 %	0 %	310639683
135	NC_014622	ACTGA	2	10	260765	260774	40 %	20 %	20 %	20 %	310639691
136	NC_014622	AAGCG	2	10	261950	261959	40 %	0 %	40 %	20 %	310639692
137	NC_014622	GAAAG	2	10	264492	264501	60 %	0 %	40 %	0 %	310639694
138	NC_014622	TACAG	2	10	264727	264736	40 %	20 %	20 %	20 %	310639695
139	NC_014622	AAGAG	2	10	264830	264839	60 %	0 %	40 %	0 %	310639695
140	NC_014622	TAATT	2	10	272135	272144	40 %	60 %	0 %	0 %	310639704
141	NC_014622	ATAAA	2	10	272770	272779	80 %	20 %	0 %	0 %	310639704
142	NC_014622	TGGTT	2	10	273081	273090	0 %	60 %	40 %	0 %	310639704
143	NC_014622	TCTAA	2	10	274062	274071	40 %	40 %	0 %	20 %	310639704
144	NC_014622	TATAA	2	10	274610	274619	60 %	40 %	0 %	0 %	310639705
145	NC_014622	GCTTG	2	10	277133	277142	0 %	40 %	40 %	20 %	310639709
146	NC_014622	GATTT	2	10	277525	277534	20 %	60 %	20 %	0 %	310639710
147	NC_014622	ATCAG	2	10	277958	277967	40 %	20 %	20 %	20 %	310639710
148	NC_014622	AAAGA	2	10	278900	278909	80 %	0 %	20 %	0 %	310639711
149	NC_014622	ATAGA	2	10	286543	286552	60 %	20 %	20 %	0 %	310639719
150	NC_014622	ATATA	2	10	286799	286808	60 %	40 %	0 %	0 %	310639719
151	NC_014622	AAAGC	2	10	287089	287098	60 %	0 %	20 %	20 %	310639719
152	NC_014622	GAGTT	2	10	287848	287857	20 %	40 %	40 %	0 %	310639719
153	NC_014622	ACGGA	2	10	288735	288744	40 %	0 %	40 %	20 %	310639720
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155	NC_014622	ATTTT	2	10	291125	291134	20 %	80 %	0 %	0 %	310639725
156	NC_014622	AGTGA	2	10	291856	291865	40 %	20 %	40 %	0 %	310639725
157	NC_014622	AAGGA	3	15	292129	292143	60 %	0 %	40 %	0 %	310639726
158	NC_014622	CCGAT	2	10	292245	292254	20 %	20 %	20 %	40 %	310639726
159	NC_014622	TAAAT	2	10	294585	294594	60 %	40 %	0 %	0 %	310639729
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161	NC_014622	AATTT	2	10	295382	295391	40 %	60 %	0 %	0 %	310639730
162	NC_014622	AATGA	2	10	297944	297953	60 %	20 %	20 %	0 %	310639733
163	NC_014622	AGGAT	2	10	298070	298079	40 %	20 %	40 %	0 %	310639733
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166	NC_014622	AATGA	2	10	306615	306624	60 %	20 %	20 %	0 %	310639739
167	NC_014622	CTGGT	2	10	308254	308263	0 %	40 %	40 %	20 %	310639740
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169	NC_014622	GTCGA	2	10	310604	310613	20 %	20 %	40 %	20 %	310639740
170	NC_014622	GTTTT	2	10	312719	312728	0 %	80 %	20 %	0 %	310639742
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174	NC_014622	ATTGT	2	10	321392	321401	20 %	60 %	20 %	0 %	310639748
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253	NC_014622	TGTCA	2	10	437802	437811	20 %	40 %	20 %	20 %	310639849
254	NC_014622	ACCTT	2	10	438013	438022	20 %	40 %	0 %	40 %	310639849
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262	NC_014622	TTTAC	2	10	444436	444445	20 %	60 %	0 %	20 %	310639855
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264	NC_014622	TGATT	2	10	450823	450832	20 %	60 %	20 %	0 %	310639860
265	NC_014622	GCTAC	2	10	451168	451177	20 %	20 %	20 %	40 %	310639860
266	NC_014622	AGGCA	2	10	455038	455047	40 %	0 %	40 %	20 %	310639864
267	NC_014622	GTTCA	2	10	465447	465456	20 %	40 %	20 %	20 %	310639867
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272	NC_014622	TGGGA	2	10	480437	480446	20 %	20 %	60 %	0 %	310639876
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282	NC_014622	AGAGT	2	10	506344	506353	40 %	20 %	40 %	0 %	310639900
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288	NC_014622	CATGA	2	10	521186	521195	40 %	20 %	20 %	20 %	310639911
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379	NC_014622	CCGTC	2	10	693114	693123	0 %	20 %	20 %	60 %	310640064
380	NC_014622	AACTT	2	10	694110	694119	40 %	40 %	0 %	20 %	310640065
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382	NC_014622	CTATT	2	10	696556	696565	20 %	60 %	0 %	20 %	310640068
383	NC_014622	GTATT	2	10	697293	697302	20 %	60 %	20 %	0 %	310640068
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389	NC_014622	CTTTT	2	10	706378	706387	0 %	80 %	0 %	20 %	310640079
390	NC_014622	AGATA	2	10	707191	707200	60 %	20 %	20 %	0 %	310640080
391	NC_014622	TCCTT	2	10	708037	708046	0 %	60 %	0 %	40 %	310640081
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