MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 chromosome

Total Repeats: 77202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014562	TGGC	2	8	77460	77467	0 %	25 %	50 %	25 %	308185611
1502	NC_014562	AGC	2	6	77474	77479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185611
1503	NC_014562	GCG	2	6	77482	77487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185611
1504	NC_014562	ATTA	2	8	77508	77515	50 %	50 %	0 %	0 %	308185612
1505	NC_014562	CG	3	6	77547	77552	0 %	0 %	50 %	50 %	308185612
1506	NC_014562	TGC	2	6	77567	77572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185612
1507	NC_014562	AGGGG	2	10	77659	77668	20 %	0 %	80 %	0 %	308185612
1508	NC_014562	CTG	3	9	77775	77783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185612
1509	NC_014562	CT	3	6	77805	77810	0 %	50 %	0 %	50 %	308185612
1510	NC_014562	TGC	2	6	77896	77901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185612
1511	NC_014562	AGC	2	6	77905	77910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185612
1512	NC_014562	TCAG	2	8	77911	77918	25 %	25 %	25 %	25 %	308185612
1513	NC_014562	CAG	2	6	77964	77969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185612
1514	NC_014562	TC	3	6	78038	78043	0 %	50 %	0 %	50 %	308185612
1515	NC_014562	GCCT	2	8	78051	78058	0 %	25 %	25 %	50 %	308185612
1516	NC_014562	CTG	2	6	78072	78077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185612
1517	NC_014562	CGC	2	6	78087	78092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185612
1518	NC_014562	TGA	2	6	78164	78169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185612
1519	NC_014562	TGA	2	6	78178	78183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185612
1520	NC_014562	T	6	6	78210	78215	0 %	100 %	0 %	0 %	308185612
1521	NC_014562	AGC	3	9	78218	78226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185612
1522	NC_014562	CAG	2	6	78240	78245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185612
1523	NC_014562	A	8	8	78391	78398	100 %	0 %	0 %	0 %	308185612
1524	NC_014562	TTG	2	6	78454	78459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308185613
1525	NC_014562	GCA	2	6	78568	78573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185613
1526	NC_014562	CGC	2	6	78594	78599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185613
1527	NC_014562	CAT	2	6	78624	78629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185613
1528	NC_014562	GCG	2	6	78633	78638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185613
1529	NC_014562	GCG	2	6	78654	78659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185613
1530	NC_014562	GCCA	2	8	79007	79014	25 %	0 %	25 %	50 %	308185614
1531	NC_014562	AGC	2	6	79048	79053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185614
1532	NC_014562	TG	3	6	79126	79131	0 %	50 %	50 %	0 %	308185614
1533	NC_014562	TG	4	8	79282	79289	0 %	50 %	50 %	0 %	308185614
1534	NC_014562	CTG	2	6	79341	79346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185614
1535	NC_014562	GAT	2	6	79383	79388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185614
1536	NC_014562	TTA	2	6	79425	79430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308185614
1537	NC_014562	CGG	2	6	79487	79492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185614
1538	NC_014562	CAG	2	6	79502	79507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185614
1539	NC_014562	CCG	2	6	79510	79515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185614
1540	NC_014562	GAT	2	6	79536	79541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185614
1541	NC_014562	CGT	2	6	79592	79597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185614
1542	NC_014562	ACGC	2	8	79616	79623	25 %	0 %	25 %	50 %	308185614
1543	NC_014562	CCTT	2	8	79643	79650	0 %	50 %	0 %	50 %	308185614
1544	NC_014562	CGC	2	6	79653	79658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185614
1545	NC_014562	CAG	2	6	79770	79775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185614
1546	NC_014562	GTC	2	6	79816	79821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185614
1547	NC_014562	AGC	2	6	79858	79863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185614
1548	NC_014562	GCT	2	6	79934	79939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185614
1549	NC_014562	TGA	2	6	79971	79976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185615
1550	NC_014562	A	6	6	80105	80110	100 %	0 %	0 %	0 %	308185615
1551	NC_014562	A	7	7	80114	80120	100 %	0 %	0 %	0 %	308185615
1552	NC_014562	ATG	2	6	80133	80138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185615
1553	NC_014562	GCA	2	6	80157	80162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185615
1554	NC_014562	GAT	2	6	80296	80301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185615
1555	NC_014562	CAT	2	6	80464	80469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185615
1556	NC_014562	ATC	2	6	80486	80491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185615
1557	NC_014562	TGATG	2	10	80602	80611	20 %	40 %	40 %	0 %	308185615
1558	NC_014562	ACG	2	6	80696	80701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185615
1559	NC_014562	TC	3	6	80730	80735	0 %	50 %	0 %	50 %	308185615
1560	NC_014562	GCGCT	2	10	80865	80874	0 %	20 %	40 %	40 %	308185615
1561	NC_014562	TGG	2	6	80919	80924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185615
1562	NC_014562	GCT	2	6	81127	81132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185615
1563	NC_014562	GC	3	6	81144	81149	0 %	0 %	50 %	50 %	308185615
1564	NC_014562	CTG	2	6	81167	81172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185615
1565	NC_014562	CTG	2	6	81187	81192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185615
1566	NC_014562	ATC	2	6	81209	81214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185615
1567	NC_014562	CGC	2	6	81225	81230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185615
1568	NC_014562	TCA	2	6	81237	81242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185615
1569	NC_014562	TGCG	2	8	81261	81268	0 %	25 %	50 %	25 %	308185615
1570	NC_014562	ATCGA	2	10	81326	81335	40 %	20 %	20 %	20 %	308185615
1571	NC_014562	TGG	2	6	81336	81341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185615
1572	NC_014562	GTTC	2	8	81400	81407	0 %	50 %	25 %	25 %	308185615
1573	NC_014562	AG	3	6	81412	81417	50 %	0 %	50 %	0 %	308185615
1574	NC_014562	TGG	2	6	81494	81499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185615
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1581	NC_014562	TGA	2	6	81819	81824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185615
1582	NC_014562	ACT	2	6	81870	81875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185615
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1589	NC_014562	CGG	2	6	82281	82286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185615
1590	NC_014562	CG	3	6	82316	82321	0 %	0 %	50 %	50 %	308185615
1591	NC_014562	GCT	2	6	82405	82410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185615
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1595	NC_014562	GCA	2	6	82612	82617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185615
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1598	NC_014562	CTGGCT	2	12	82821	82832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185616
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1602	NC_014562	ACA	2	6	82883	82888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185616
1603	NC_014562	TGC	2	6	82892	82897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185616
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1605	NC_014562	TGGC	2	8	82983	82990	0 %	25 %	50 %	25 %	308185616
1606	NC_014562	TTC	2	6	82999	83004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185616
1607	NC_014562	TGA	2	6	83042	83047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185616
1608	NC_014562	GCCA	2	8	83062	83069	25 %	0 %	25 %	50 %	308185616
1609	NC_014562	CGG	2	6	83103	83108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185616
1610	NC_014562	TGG	2	6	83237	83242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185616
1611	NC_014562	TGA	2	6	83297	83302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185617
1612	NC_014562	CGG	2	6	83369	83374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185617
1613	NC_014562	CT	3	6	83428	83433	0 %	50 %	0 %	50 %	308185617
1614	NC_014562	CTG	2	6	83452	83457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185617
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1619	NC_014562	CG	3	6	83772	83777	0 %	0 %	50 %	50 %	308185618
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1621	NC_014562	GC	4	8	83818	83825	0 %	0 %	50 %	50 %	308185618
1622	NC_014562	GC	3	6	83838	83843	0 %	0 %	50 %	50 %	308185618
1623	NC_014562	GTG	2	6	83864	83869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185618
1624	NC_014562	GTG	2	6	83882	83887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185618
1625	NC_014562	TCT	2	6	83958	83963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185618
1626	NC_014562	CGTG	2	8	83986	83993	0 %	25 %	50 %	25 %	308185618
1627	NC_014562	GC	3	6	84005	84010	0 %	0 %	50 %	50 %	308185618
1628	NC_014562	GC	4	8	84071	84078	0 %	0 %	50 %	50 %	308185618
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1632	NC_014562	CAT	2	6	84280	84285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185618
1633	NC_014562	ATC	2	6	84314	84319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185618
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1644	NC_014562	TTA	2	6	84834	84839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308185619
1645	NC_014562	TGA	2	6	84882	84887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185619
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1649	NC_014562	CCCG	2	8	85159	85166	0 %	0 %	25 %	75 %	308185620
1650	NC_014562	TGA	2	6	85238	85243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185620
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1653	NC_014562	AGA	2	6	85274	85279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185620
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1657	NC_014562	GAT	2	6	85479	85484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185620
1658	NC_014562	GC	3	6	85553	85558	0 %	0 %	50 %	50 %	308185620
1659	NC_014562	TCG	2	6	85567	85572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185620
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1661	NC_014562	CTG	2	6	85944	85949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185621
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1670	NC_014562	CAA	2	6	86523	86528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185622
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1673	NC_014562	TGC	2	6	86628	86633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185622
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1736	NC_014562	CG	4	8	89969	89976	0 %	0 %	50 %	50 %	308185623
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1744	NC_014562	GTG	2	6	90309	90314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185623
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1746	NC_014562	CA	3	6	90370	90375	50 %	0 %	0 %	50 %	308185623
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1748	NC_014562	CGG	2	6	90424	90429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185623
1749	NC_014562	GTC	2	6	90430	90435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185623
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1752	NC_014562	ATGC	2	8	90576	90583	25 %	25 %	25 %	25 %	308185623
1753	NC_014562	AAAATG	2	12	90851	90862	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	308185624
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1872	NC_014562	CTT	2	6	97877	97882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185631
1873	NC_014562	GC	3	6	97915	97920	0 %	0 %	50 %	50 %	308185631
1874	NC_014562	TTC	2	6	98020	98025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185631
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1881	NC_014562	GTC	2	6	98202	98207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185631
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1884	NC_014562	CGA	2	6	98336	98341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185631
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1886	NC_014562	TCA	2	6	98524	98529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185631
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1975	NC_014562	CGA	2	6	104006	104011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185635
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1981	NC_014562	CAGT	2	8	104176	104183	25 %	25 %	25 %	25 %	308185635
1982	NC_014562	GCA	3	9	104318	104326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185635
1983	NC_014562	GAC	2	6	104396	104401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185635
1984	NC_014562	GCT	2	6	104408	104413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185635
1985	NC_014562	CAG	2	6	104415	104420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185635
1986	NC_014562	CAG	2	6	104502	104507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185635
1987	NC_014562	GC	3	6	104513	104518	0 %	0 %	50 %	50 %	308185635
1988	NC_014562	TCT	2	6	104524	104529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185635
1989	NC_014562	GGC	2	6	104541	104546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185635
1990	NC_014562	CGCGG	2	10	104589	104598	0 %	0 %	60 %	40 %	308185635
1991	NC_014562	TTCACG	2	12	104604	104615	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	308185635
1992	NC_014562	GGC	2	6	104643	104648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185635
1993	NC_014562	CG	3	6	104714	104719	0 %	0 %	50 %	50 %	308185635
1994	NC_014562	CCA	2	6	104730	104735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185635
1995	NC_014562	CG	3	6	104789	104794	0 %	0 %	50 %	50 %	308185635
1996	NC_014562	CTC	2	6	104799	104804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308185635
1997	NC_014562	GCAG	2	8	104860	104867	25 %	0 %	50 %	25 %	308185635
1998	NC_014562	GC	3	6	104985	104990	0 %	0 %	50 %	50 %	308185635
1999	NC_014562	TCC	2	6	105079	105084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308185635
2000	NC_014562	CAG	2	6	105105	105110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185635

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