MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Prevotella ruminicola 23 chromosome

Total Repeats: 49249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014033	CTG	2	6	181	186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672794
2	NC_014033	CTT	2	6	218	223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672794
3	NC_014033	TAA	2	6	401	406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672794
4	NC_014033	GTT	2	6	425	430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672794
5	NC_014033	AAT	2	6	470	475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672794
6	NC_014033	GCT	2	6	516	521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672794
7	NC_014033	TCT	2	6	540	545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672794
8	NC_014033	TAA	2	6	615	620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672794
9	NC_014033	TAA	2	6	682	687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672794
10	NC_014033	CCG	2	6	798	803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294672794
11	NC_014033	AGC	2	6	887	892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672794
12	NC_014033	TCT	2	6	985	990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672794
13	NC_014033	TAA	2	6	1027	1032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672794
14	NC_014033	GTT	2	6	1337	1342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672794
15	NC_014033	CTT	2	6	1357	1362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672794
16	NC_014033	CGC	2	6	1372	1377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294672794
17	NC_014033	CAA	3	9	1378	1386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672794
18	NC_014033	TGT	2	6	1483	1488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672794
19	NC_014033	TGA	2	6	1664	1669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672794
20	NC_014033	TTC	2	6	1745	1750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672794
21	NC_014033	CAC	2	6	1801	1806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294672794
22	NC_014033	TAT	2	6	1846	1851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672794
23	NC_014033	TGG	2	6	1990	1995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294672794
24	NC_014033	GTA	2	6	2076	2081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672794
25	NC_014033	TAG	2	6	2125	2130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672794
26	NC_014033	TCA	2	6	2160	2165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672794
27	NC_014033	AGT	2	6	2209	2214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672794
28	NC_014033	CTA	2	6	2248	2253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672794
29	NC_014033	ATT	2	6	2489	2494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672795
30	NC_014033	CTT	2	6	2505	2510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672795
31	NC_014033	ATC	2	6	2583	2588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672795
32	NC_014033	GCT	2	6	2640	2645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672795
33	NC_014033	TGG	2	6	2735	2740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294672795
34	NC_014033	CGT	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672795
35	NC_014033	TGC	2	6	2789	2794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672795
36	NC_014033	TCG	2	6	2797	2802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672795
37	NC_014033	TGG	2	6	2828	2833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294672795
38	NC_014033	GTT	2	6	2878	2883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672795
39	NC_014033	TTG	3	9	2905	2913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672795
40	NC_014033	TGC	3	9	2924	2932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672795
41	NC_014033	GCA	2	6	2953	2958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672795
42	NC_014033	ATA	2	6	3018	3023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672795
43	NC_014033	TGC	2	6	3042	3047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672795
44	NC_014033	GTA	2	6	3078	3083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672795
45	NC_014033	GTT	2	6	3123	3128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672795
46	NC_014033	TCT	2	6	3208	3213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672795
47	NC_014033	GAT	2	6	3375	3380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672795
48	NC_014033	TGT	2	6	3561	3566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672795
49	NC_014033	TGC	2	6	3776	3781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672796
50	NC_014033	CTT	2	6	3791	3796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672796
51	NC_014033	AAC	3	9	3806	3814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672796
52	NC_014033	CAG	2	6	3826	3831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672796
53	NC_014033	CTA	2	6	3922	3927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672796
54	NC_014033	CTG	2	6	3941	3946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672796
55	NC_014033	GAA	2	6	3980	3985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672796
56	NC_014033	CGG	2	6	3993	3998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294672796
57	NC_014033	CTC	2	6	4022	4027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294672796
58	NC_014033	CAA	2	6	4045	4050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672796
59	NC_014033	TCT	2	6	4051	4056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672796
60	NC_014033	CAA	2	6	4057	4062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672796
61	NC_014033	TCT	2	6	4063	4068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672796
62	NC_014033	CTT	2	6	4181	4186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672796
63	NC_014033	AGT	2	6	4340	4345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672796
64	NC_014033	CAG	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672796
65	NC_014033	TTC	2	6	4827	4832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672796
66	NC_014033	TGT	2	6	4891	4896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672797
67	NC_014033	CTT	2	6	4898	4903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672797
68	NC_014033	TCT	2	6	4978	4983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672797
69	NC_014033	CAG	2	6	5035	5040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672797
70	NC_014033	CTT	2	6	5057	5062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672797
71	NC_014033	GAA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672797
72	NC_014033	AAG	2	6	5256	5261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672797
73	NC_014033	TGA	2	6	5338	5343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672797
74	NC_014033	GCA	2	6	5409	5414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672797
75	NC_014033	GTA	2	6	5448	5453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672797
76	NC_014033	TTG	2	6	5592	5597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672797
77	NC_014033	AGC	2	6	5732	5737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672797
78	NC_014033	AGT	2	6	5743	5748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672797
79	NC_014033	TCC	2	6	5778	5783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294672797
80	NC_014033	GCA	2	6	5830	5835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672797
81	NC_014033	TTC	2	6	5859	5864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672797
82	NC_014033	GTT	2	6	5903	5908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672797
83	NC_014033	AGC	3	9	5924	5932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672797
84	NC_014033	CAG	2	6	5962	5967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672797
85	NC_014033	TAG	2	6	6004	6009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672797
86	NC_014033	GTA	2	6	6105	6110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672797
87	NC_014033	CAG	2	6	6319	6324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672797
88	NC_014033	GTT	3	9	6354	6362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672797
89	NC_014033	TCT	2	6	6493	6498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672797
90	NC_014033	TTC	2	6	6612	6617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672797
91	NC_014033	CAG	2	6	6658	6663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672797
92	NC_014033	ATG	2	6	6799	6804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672797
93	NC_014033	ATT	3	9	7217	7225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672798
94	NC_014033	TAT	2	6	7247	7252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672798
95	NC_014033	TCG	2	6	7278	7283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672798
96	NC_014033	CCA	2	6	7413	7418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294672798
97	NC_014033	GGT	2	6	7466	7471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294672798
98	NC_014033	GCA	2	6	7482	7487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672798
99	NC_014033	ACC	2	6	7515	7520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294672798
100	NC_014033	TGC	2	6	7540	7545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672798
101	NC_014033	GGC	2	6	7646	7651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294672798
102	NC_014033	CCG	2	6	7680	7685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294672798
103	NC_014033	TCG	2	6	7740	7745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672798
104	NC_014033	ATA	2	6	7781	7786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672798
105	NC_014033	TCG	2	6	7803	7808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672798
106	NC_014033	ACG	2	6	7859	7864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672798
107	NC_014033	TGG	2	6	7885	7890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294672798
108	NC_014033	GCT	2	6	7996	8001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672798
109	NC_014033	AGT	2	6	8083	8088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672798
110	NC_014033	GAT	2	6	8096	8101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672798
111	NC_014033	TTC	2	6	8144	8149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672798
112	NC_014033	TGC	2	6	8252	8257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672799
113	NC_014033	GTT	2	6	8263	8268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672799
114	NC_014033	GTG	2	6	8378	8383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294672799
115	NC_014033	GTA	2	6	8425	8430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672799
116	NC_014033	GAC	2	6	8505	8510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672799
117	NC_014033	ATG	2	6	8546	8551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672799
118	NC_014033	GTT	2	6	8578	8583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672799
119	NC_014033	GCT	2	6	8584	8589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672799
120	NC_014033	TGT	2	6	8595	8600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672799
121	NC_014033	GGC	2	6	8623	8628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294672799
122	NC_014033	GTA	2	6	8674	8679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672799
123	NC_014033	CGG	2	6	8783	8788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294672799
124	NC_014033	GTG	2	6	8789	8794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294672799
125	NC_014033	GCT	2	6	8799	8804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672799
126	NC_014033	AGC	2	6	8926	8931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672799
127	NC_014033	TCG	2	6	9000	9005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672800
128	NC_014033	CTG	2	6	9011	9016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672800
129	NC_014033	TCT	2	6	9045	9050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672800
130	NC_014033	CTC	2	6	9116	9121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294672800
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499	NC_014033	GCA	2	6	35946	35951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672821
500	NC_014033	TTG	2	6	35956	35961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672821

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