MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 123957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012914	GGC	2	6	183821	183826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794204
3002	NC_012914	CGG	2	6	183858	183863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794204
3003	NC_012914	CGT	2	6	183868	183873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794204
3004	NC_012914	A	7	7	183930	183936	100 %	0 %	0 %	0 %	251794204
3005	NC_012914	CGA	2	6	183938	183943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794204
3006	NC_012914	ATT	2	6	184428	184433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794205
3007	NC_012914	GGC	2	6	184521	184526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794205
3008	NC_012914	ACG	2	6	184539	184544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794205
3009	NC_012914	AAC	2	6	184656	184661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794205
3010	NC_012914	ATC	2	6	184731	184736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794205
3011	NC_012914	ATA	2	6	184783	184788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794205
3012	NC_012914	CTT	2	6	184826	184831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794205
3013	NC_012914	AAG	2	6	184842	184847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794205
3014	NC_012914	CGG	3	9	184859	184867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794205
3015	NC_012914	GGA	2	6	184880	184885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794205
3016	NC_012914	CGT	2	6	184932	184937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794205
3017	NC_012914	CGC	2	6	185014	185019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794205
3018	NC_012914	AAT	2	6	185067	185072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794205
3019	NC_012914	ACGG	2	8	185100	185107	25 %	0 %	50 %	25 %	251794205
3020	NC_012914	CGA	2	6	185168	185173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794205
3021	NC_012914	ACA	2	6	185251	185256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794205
3022	NC_012914	CGG	2	6	185275	185280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794205
3023	NC_012914	GGC	2	6	185297	185302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794205
3024	NC_012914	A	6	6	185344	185349	100 %	0 %	0 %	0 %	251794205
3025	NC_012914	CGG	2	6	185544	185549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794206
3026	NC_012914	GGAG	2	8	185580	185587	25 %	0 %	75 %	0 %	251794206
3027	NC_012914	ATA	2	6	185648	185653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794206
3028	NC_012914	GAG	3	9	185815	185823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794206
3029	NC_012914	TAA	2	6	185844	185849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794206
3030	NC_012914	GGC	2	6	185941	185946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794206
3031	NC_012914	TAT	3	9	185949	185957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794206
3032	NC_012914	CGG	2	6	185958	185963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794206
3033	NC_012914	TGCGGC	2	12	186043	186054	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	251794206
3034	NC_012914	TCC	2	6	186079	186084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794206
3035	NC_012914	TAT	2	6	186093	186098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794206
3036	NC_012914	CGA	2	6	186198	186203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794206
3037	NC_012914	TAC	2	6	186235	186240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794206
3038	NC_012914	TAT	2	6	186291	186296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794206
3039	NC_012914	CGG	3	9	186297	186305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794206
3040	NC_012914	GAAG	2	8	186369	186376	50 %	0 %	50 %	0 %	251794206
3041	NC_012914	AAG	2	6	186380	186385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794206
3042	NC_012914	ACC	2	6	186617	186622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251794207
3043	NC_012914	T	6	6	186714	186719	0 %	100 %	0 %	0 %	251794207
3044	NC_012914	GCC	3	9	186829	186837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794207
3045	NC_012914	GA	3	6	186885	186890	50 %	0 %	50 %	0 %	251794207
3046	NC_012914	GGA	2	6	186899	186904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794207
3047	NC_012914	TAT	2	6	186971	186976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794207
3048	NC_012914	AAC	2	6	186999	187004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794207
3049	NC_012914	CCT	2	6	187024	187029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794207
3050	NC_012914	CGAT	2	8	187051	187058	25 %	25 %	25 %	25 %	251794207
3051	NC_012914	GATTT	2	10	187062	187071	20 %	60 %	20 %	0 %	251794207
3052	NC_012914	T	6	6	187082	187087	0 %	100 %	0 %	0 %	251794207
3053	NC_012914	TGA	2	6	187156	187161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794207
3054	NC_012914	GCT	2	6	187193	187198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794207
3055	NC_012914	TCT	2	6	187214	187219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794207
3056	NC_012914	AAG	2	6	187234	187239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794207
3057	NC_012914	GGC	2	6	187275	187280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794207
3058	NC_012914	GCA	2	6	187327	187332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794207
3059	NC_012914	GGC	2	6	187426	187431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794208
3060	NC_012914	TTG	2	6	187438	187443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794208
3061	NC_012914	GGC	2	6	187449	187454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794208
3062	NC_012914	TGC	2	6	187474	187479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794208
3063	NC_012914	TTA	2	6	187600	187605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794208
3064	NC_012914	TGCGGA	2	12	187613	187624	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	251794208
3065	NC_012914	GCTG	2	8	187703	187710	0 %	25 %	50 %	25 %	251794208
3066	NC_012914	TGAC	2	8	187828	187835	25 %	25 %	25 %	25 %	251794208
3067	NC_012914	AGA	2	6	187879	187884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794208
3068	NC_012914	TA	3	6	187984	187989	50 %	50 %	0 %	0 %	251794208
3069	NC_012914	TAT	2	6	187994	187999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794208
3070	NC_012914	ATC	2	6	188116	188121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794208
3071	NC_012914	AAT	2	6	188276	188281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794208
3072	NC_012914	TCA	2	6	188339	188344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794208
3073	NC_012914	AAGA	2	8	188375	188382	75 %	0 %	25 %	0 %	251794208
3074	NC_012914	GAA	2	6	188415	188420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794209
3075	NC_012914	CTG	2	6	188448	188453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794209
3076	NC_012914	GAAT	2	8	188483	188490	50 %	25 %	25 %	0 %	251794209
3077	NC_012914	GTC	2	6	188518	188523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794209
3078	NC_012914	GCA	2	6	188545	188550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794209
3079	NC_012914	CCG	2	6	188556	188561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794209
3080	NC_012914	AAG	2	6	188578	188583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794209
3081	NC_012914	A	7	7	188617	188623	100 %	0 %	0 %	0 %	251794209
3082	NC_012914	A	8	8	188632	188639	100 %	0 %	0 %	0 %	251794209
3083	NC_012914	TA	3	6	188645	188650	50 %	50 %	0 %	0 %	251794209
3084	NC_012914	CGA	2	6	188663	188668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794209
3085	NC_012914	AAG	2	6	188749	188754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794209
3086	NC_012914	TGC	2	6	188758	188763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794209
3087	NC_012914	CGG	2	6	188796	188801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794209
3088	NC_012914	CAA	2	6	188808	188813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794209
3089	NC_012914	GAA	2	6	188925	188930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794209
3090	NC_012914	GCT	2	6	188973	188978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794209
3091	NC_012914	ATT	2	6	188983	188988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794209
3092	NC_012914	TAT	2	6	189027	189032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794209
3093	NC_012914	ATA	2	6	189122	189127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794209
3094	NC_012914	GCT	2	6	189132	189137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794209
3095	NC_012914	AG	3	6	189178	189183	50 %	0 %	50 %	0 %	251794209
3096	NC_012914	ACC	2	6	189272	189277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251794209
3097	NC_012914	TGA	2	6	189291	189296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794209
3098	NC_012914	A	6	6	189305	189310	100 %	0 %	0 %	0 %	251794209
3099	NC_012914	TCGT	2	8	189499	189506	0 %	50 %	25 %	25 %	251794210
3100	NC_012914	ATT	2	6	189539	189544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794210
3101	NC_012914	AAG	2	6	189550	189555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794210
3102	NC_012914	TCC	2	6	189567	189572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794210
3103	NC_012914	TTG	2	6	189580	189585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794210
3104	NC_012914	GAC	2	6	189591	189596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794210
3105	NC_012914	AGA	2	6	189728	189733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794210
3106	NC_012914	CTT	2	6	189931	189936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794211
3107	NC_012914	CGGT	2	8	189957	189964	0 %	25 %	50 %	25 %	251794211
3108	NC_012914	GCG	2	6	190043	190048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794211
3109	NC_012914	GCTT	2	8	190067	190074	0 %	50 %	25 %	25 %	251794211
3110	NC_012914	GCC	2	6	190085	190090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794211
3111	NC_012914	ATC	2	6	190104	190109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794211
3112	NC_012914	GCC	2	6	190179	190184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794211
3113	NC_012914	TCG	2	6	190198	190203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794211
3114	NC_012914	ATAG	2	8	190235	190242	50 %	25 %	25 %	0 %	251794211
3115	NC_012914	TGCC	2	8	190246	190253	0 %	25 %	25 %	50 %	251794211
3116	NC_012914	AG	3	6	190282	190287	50 %	0 %	50 %	0 %	251794211
3117	NC_012914	TCT	2	6	190305	190310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794211
3118	NC_012914	AAT	2	6	190334	190339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794211
3119	NC_012914	CTA	2	6	190348	190353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794211
3120	NC_012914	GAT	2	6	190379	190384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794211
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3122	NC_012914	ATT	2	6	190971	190976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794212
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3124	NC_012914	GAA	2	6	191018	191023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794212
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3243	NC_012914	ATC	2	6	197114	197119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794217
3244	NC_012914	AAGCT	2	10	197187	197196	40 %	20 %	20 %	20 %	251794217
3245	NC_012914	CGG	2	6	197281	197286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794217
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3247	NC_012914	CAT	2	6	197323	197328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794217
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3344	NC_012914	A	6	6	202263	202268	100 %	0 %	0 %	0 %	251794221
3345	NC_012914	GCT	3	9	202478	202486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794221
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3349	NC_012914	GCT	2	6	202583	202588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794221
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3351	NC_012914	GCGT	2	8	202667	202674	0 %	25 %	50 %	25 %	251794221
3352	NC_012914	ATGC	2	8	204037	204044	25 %	25 %	25 %	25 %	251794222
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3354	NC_012914	T	6	6	204398	204403	0 %	100 %	0 %	0 %	251794222
3355	NC_012914	GTT	2	6	204432	204437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794222
3356	NC_012914	GAACG	2	10	204451	204460	40 %	0 %	40 %	20 %	251794222
3357	NC_012914	GCTG	2	8	204471	204478	0 %	25 %	50 %	25 %	251794222
3358	NC_012914	CAT	2	6	204499	204504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794222
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3362	NC_012914	TCATG	2	10	204899	204908	20 %	40 %	20 %	20 %	251794223
3363	NC_012914	A	7	7	204993	204999	100 %	0 %	0 %	0 %	251794223
3364	NC_012914	GAT	2	6	205109	205114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794224
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3366	NC_012914	GCA	3	9	205212	205220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794224
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3369	NC_012914	CTA	2	6	212416	212421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794225
3370	NC_012914	ATG	2	6	212520	212525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794225
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3372	NC_012914	TTC	2	6	212611	212616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794225
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3375	NC_012914	TTCGA	2	10	212871	212880	20 %	40 %	20 %	20 %	251794225
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3377	NC_012914	CGAA	2	8	212952	212959	50 %	0 %	25 %	25 %	251794225
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3391	NC_012914	GCT	2	6	213610	213615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794225
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3481	NC_012914	TTTA	2	8	217762	217769	25 %	75 %	0 %	0 %	251794228
3482	NC_012914	TCT	2	6	217823	217828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794228
3483	NC_012914	GCG	2	6	217932	217937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794229
3484	NC_012914	GCC	2	6	217941	217946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794229
3485	NC_012914	ATC	2	6	218106	218111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794229
3486	NC_012914	GC	3	6	218169	218174	0 %	0 %	50 %	50 %	251794229
3487	NC_012914	CAA	2	6	218177	218182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794229
3488	NC_012914	CTT	2	6	218195	218200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794229
3489	NC_012914	TGT	2	6	218206	218211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794229
3490	NC_012914	ATG	2	6	218223	218228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794229
3491	NC_012914	TCG	2	6	218305	218310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794229
3492	NC_012914	CGG	2	6	218318	218323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794229
3493	NC_012914	GTTCT	2	10	218343	218352	0 %	60 %	20 %	20 %	251794229
3494	NC_012914	AGA	2	6	218387	218392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794229
3495	NC_012914	GCC	2	6	218394	218399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794229
3496	NC_012914	GCT	2	6	218410	218415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794229
3497	NC_012914	GCT	2	6	218450	218455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794229
3498	NC_012914	CTT	2	6	218510	218515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794229
3499	NC_012914	GCA	2	6	218564	218569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794229
3500	NC_012914	CTT	3	9	218573	218581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794229

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