MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas fluorescens SBW25 chromosome

Total Repeats: 127366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012660	TGG	2	6	159459	159464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587720
3002	NC_012660	TCG	2	6	159570	159575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587720
3003	NC_012660	AGA	2	6	159594	159599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587720
3004	NC_012660	CCG	2	6	159693	159698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587721
3005	NC_012660	ACG	2	6	159762	159767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587721
3006	NC_012660	GGT	2	6	159793	159798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587721
3007	NC_012660	CTGGC	2	10	159830	159839	0 %	20 %	40 %	40 %	229587721
3008	NC_012660	GGC	2	6	159900	159905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587721
3009	NC_012660	CAT	2	6	159922	159927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587721
3010	NC_012660	AC	3	6	159960	159965	50 %	0 %	0 %	50 %	229587721
3011	NC_012660	GC	3	6	159982	159987	0 %	0 %	50 %	50 %	229587721
3012	NC_012660	GCA	2	6	160099	160104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587721
3013	NC_012660	TGG	2	6	160131	160136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587721
3014	NC_012660	GCG	2	6	160142	160147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587721
3015	NC_012660	GCCA	2	8	160157	160164	25 %	0 %	25 %	50 %	229587721
3016	NC_012660	CGG	2	6	160203	160208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587721
3017	NC_012660	GC	3	6	160268	160273	0 %	0 %	50 %	50 %	229587721
3018	NC_012660	TGG	2	6	160287	160292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587721
3019	NC_012660	CAA	2	6	160300	160305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587721
3020	NC_012660	TGA	2	6	160449	160454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587721
3021	NC_012660	TGC	2	6	160545	160550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587721
3022	NC_012660	GACCCG	2	12	160574	160585	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	229587721
3023	NC_012660	GC	3	6	160595	160600	0 %	0 %	50 %	50 %	229587721
3024	NC_012660	AG	3	6	160620	160625	50 %	0 %	50 %	0 %	229587721
3025	NC_012660	CG	3	6	160836	160841	0 %	0 %	50 %	50 %	229587721
3026	NC_012660	GC	3	6	160958	160963	0 %	0 %	50 %	50 %	229587721
3027	NC_012660	AAC	2	6	160964	160969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587721
3028	NC_012660	ACG	2	6	160992	160997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587721
3029	NC_012660	GCC	2	6	161051	161056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587721
3030	NC_012660	GGT	2	6	161183	161188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587721
3031	NC_012660	CG	3	6	161203	161208	0 %	0 %	50 %	50 %	229587721
3032	NC_012660	GCCGA	2	10	161219	161228	20 %	0 %	40 %	40 %	229587721
3033	NC_012660	TGA	2	6	161269	161274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587721
3034	NC_012660	TCC	2	6	161277	161282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229587721
3035	NC_012660	CTGG	2	8	161353	161360	0 %	25 %	50 %	25 %	229587721
3036	NC_012660	TGG	2	6	161367	161372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587721
3037	NC_012660	ATGG	2	8	161482	161489	25 %	25 %	50 %	0 %	229587721
3038	NC_012660	TAC	2	6	161525	161530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587721
3039	NC_012660	CCAA	2	8	161586	161593	50 %	0 %	0 %	50 %	229587721
3040	NC_012660	GGC	2	6	161749	161754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587722
3041	NC_012660	GAA	2	6	161794	161799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587722
3042	NC_012660	AC	3	6	161801	161806	50 %	0 %	0 %	50 %	229587722
3043	NC_012660	ATC	3	9	161842	161850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587722
3044	NC_012660	CGC	2	6	161874	161879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587722
3045	NC_012660	CCAT	2	8	161885	161892	25 %	25 %	0 %	50 %	229587722
3046	NC_012660	GCG	2	6	161893	161898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587722
3047	NC_012660	ACG	2	6	161939	161944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587722
3048	NC_012660	ACA	2	6	161954	161959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587722
3049	NC_012660	CCG	3	9	161960	161968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587722
3050	NC_012660	GCACTG	2	12	161977	161988	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	229587722
3051	NC_012660	CAAGG	2	10	162028	162037	40 %	0 %	40 %	20 %	229587722
3052	NC_012660	CGCA	2	8	162066	162073	25 %	0 %	25 %	50 %	229587722
3053	NC_012660	CGG	2	6	162122	162127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587722
3054	NC_012660	ATC	2	6	162244	162249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587722
3055	NC_012660	GTG	2	6	162304	162309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587722
3056	NC_012660	ACT	2	6	162344	162349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587722
3057	NC_012660	TCT	2	6	162416	162421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587722
3058	NC_012660	CG	3	6	162428	162433	0 %	0 %	50 %	50 %	229587722
3059	NC_012660	CGG	2	6	162465	162470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587722
3060	NC_012660	GCT	2	6	162570	162575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587722
3061	NC_012660	CTG	2	6	162616	162621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587722
3062	NC_012660	G	6	6	162635	162640	0 %	0 %	100 %	0 %	229587722
3063	NC_012660	GCC	2	6	162690	162695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587722
3064	NC_012660	CCG	2	6	162762	162767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587722
3065	NC_012660	CTGG	2	8	162825	162832	0 %	25 %	50 %	25 %	229587722
3066	NC_012660	CAC	2	6	162843	162848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587722
3067	NC_012660	GC	3	6	162895	162900	0 %	0 %	50 %	50 %	229587722
3068	NC_012660	AGG	2	6	162938	162943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229587722
3069	NC_012660	ATC	2	6	162990	162995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587723
3070	NC_012660	GCT	2	6	163037	163042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587723
3071	NC_012660	CG	3	6	163218	163223	0 %	0 %	50 %	50 %	229587723
3072	NC_012660	ACG	2	6	163324	163329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587723
3073	NC_012660	CGG	2	6	163334	163339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587723
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3078	NC_012660	GCT	2	6	164151	164156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587724
3079	NC_012660	TCA	2	6	164162	164167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587724
3080	NC_012660	GCA	2	6	164217	164222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587724
3081	NC_012660	TGG	3	9	164252	164260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587724
3082	NC_012660	GGC	2	6	164284	164289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587724
3083	NC_012660	GCA	2	6	164294	164299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587724
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3085	NC_012660	GGTG	2	8	164340	164347	0 %	25 %	75 %	0 %	229587724
3086	NC_012660	GGC	2	6	164446	164451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587724
3087	NC_012660	GTG	2	6	164458	164463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587724
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3089	NC_012660	AAC	2	6	164509	164514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587724
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3091	NC_012660	ACG	2	6	164612	164617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587724
3092	NC_012660	ACC	2	6	164627	164632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587724
3093	NC_012660	CTA	2	6	164658	164663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587724
3094	NC_012660	TGG	2	6	164680	164685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587724
3095	NC_012660	TTCAAG	2	12	164743	164754	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	229587724
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3097	NC_012660	CAA	2	6	164859	164864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587724
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3099	NC_012660	GCG	2	6	164937	164942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587724
3100	NC_012660	CACGCC	2	12	165045	165056	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	229587724
3101	NC_012660	GCCC	2	8	165277	165284	0 %	0 %	25 %	75 %	229587724
3102	NC_012660	TGA	2	6	165482	165487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587724
3103	NC_012660	GTC	2	6	165676	165681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587725
3104	NC_012660	CAC	2	6	165693	165698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587725
3105	NC_012660	CAGG	2	8	165706	165713	25 %	0 %	50 %	25 %	229587725
3106	NC_012660	GGT	2	6	165726	165731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587725
3107	NC_012660	AAC	2	6	165814	165819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587725
3108	NC_012660	ATC	2	6	165856	165861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587725
3109	NC_012660	GCG	2	6	165884	165889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587725
3110	NC_012660	GGC	2	6	165919	165924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587725
3111	NC_012660	TCG	2	6	165980	165985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587725
3112	NC_012660	TCA	2	6	166022	166027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587725
3113	NC_012660	ACC	2	6	166048	166053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587725
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3116	NC_012660	GCAA	2	8	166141	166148	50 %	0 %	25 %	25 %	229587725
3117	NC_012660	ATC	2	6	166165	166170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587725
3118	NC_012660	CGCC	2	8	166203	166210	0 %	0 %	25 %	75 %	229587725
3119	NC_012660	GCCG	2	8	166225	166232	0 %	0 %	50 %	50 %	229587725
3120	NC_012660	ACG	2	6	166235	166240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587725
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3122	NC_012660	CGA	2	6	166275	166280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587725
3123	NC_012660	TCG	2	6	166312	166317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587725
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3241	NC_012660	TGG	2	6	171183	171188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587725
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3245	NC_012660	ACC	2	6	171439	171444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587725
3246	NC_012660	ACG	2	6	171455	171460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587725
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3248	NC_012660	CGG	2	6	171681	171686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587725
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3253	NC_012660	CTG	2	6	171964	171969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587725
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3271	NC_012660	A	7	7	172993	172999	100 %	0 %	0 %	0 %	229587725
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3366	NC_012660	AGGC	2	8	180399	180406	25 %	0 %	50 %	25 %	229587737
3367	NC_012660	ACTC	2	8	180443	180450	25 %	25 %	0 %	50 %	229587737
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3370	NC_012660	GAT	2	6	180531	180536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587737
3371	NC_012660	TTC	2	6	180579	180584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587737
3372	NC_012660	TTG	2	6	180586	180591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587737
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3387	NC_012660	GAGG	2	8	181216	181223	25 %	0 %	75 %	0 %	229587738
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3395	NC_012660	CGA	2	6	181497	181502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587738
3396	NC_012660	GCCT	2	8	181832	181839	0 %	25 %	25 %	50 %	229587739
3397	NC_012660	CTAC	2	8	181908	181915	25 %	25 %	0 %	50 %	229587739
3398	NC_012660	GGC	2	6	181943	181948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587739
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3466	NC_012660	CTG	2	6	185422	185427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587743
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3471	NC_012660	G	8	8	185643	185650	0 %	0 %	100 %	0 %	229587743
3472	NC_012660	CAGT	2	8	185652	185659	25 %	25 %	25 %	25 %	229587743
3473	NC_012660	AGCG	2	8	185694	185701	25 %	0 %	50 %	25 %	229587743
3474	NC_012660	CGG	2	6	185717	185722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587743
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3479	NC_012660	CG	3	6	186114	186119	0 %	0 %	50 %	50 %	229587744
3480	NC_012660	CAA	2	6	186159	186164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587744
3481	NC_012660	ACG	2	6	186335	186340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587744
3482	NC_012660	CGA	2	6	186360	186365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587744
3483	NC_012660	AGC	2	6	186380	186385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587744
3484	NC_012660	CTGAGC	2	12	186388	186399	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	229587744
3485	NC_012660	CGC	2	6	186420	186425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587744
3486	NC_012660	CTG	2	6	186463	186468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587744
3487	NC_012660	CGC	2	6	186501	186506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587744
3488	NC_012660	GCC	2	6	186539	186544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587744
3489	NC_012660	CAG	2	6	186556	186561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587744
3490	NC_012660	CTG	2	6	186574	186579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587744
3491	NC_012660	GAG	2	6	186583	186588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229587744
3492	NC_012660	GACC	2	8	186599	186606	25 %	0 %	25 %	50 %	229587744
3493	NC_012660	AC	3	6	186611	186616	50 %	0 %	0 %	50 %	229587745
3494	NC_012660	CGA	2	6	186626	186631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587745
3495	NC_012660	TGC	2	6	186634	186639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587745
3496	NC_012660	CCGC	2	8	186672	186679	0 %	0 %	25 %	75 %	229587745
3497	NC_012660	CCGC	2	8	186706	186713	0 %	0 %	25 %	75 %	229587745
3498	NC_012660	GCTG	2	8	186751	186758	0 %	25 %	50 %	25 %	229587745
3499	NC_012660	TGA	2	6	186817	186822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587745
3500	NC_012660	CCCCGA	2	12	186910	186921	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	229587745

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