MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas fluorescens SBW25 chromosome

Total Repeats: 127366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012660	GCC	2	6	50888	50893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587629
1002	NC_012660	TGC	2	6	50993	50998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587629
1003	NC_012660	GCC	2	6	51031	51036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587629
1004	NC_012660	TGC	2	6	51059	51064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587629
1005	NC_012660	GCC	2	6	51080	51085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587629
1006	NC_012660	TTC	2	6	51093	51098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587629
1007	NC_012660	TGC	2	6	51106	51111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587629
1008	NC_012660	AAGG	2	8	51120	51127	50 %	0 %	50 %	0 %	229587629
1009	NC_012660	TTC	2	6	51129	51134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587629
1010	NC_012660	CGG	2	6	51149	51154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587629
1011	NC_012660	CAA	2	6	51155	51160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587629
1012	NC_012660	CAT	2	6	51292	51297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587630
1013	NC_012660	GAA	2	6	51298	51303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587630
1014	NC_012660	CGA	2	6	51445	51450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587630
1015	NC_012660	GCGT	2	8	51462	51469	0 %	25 %	50 %	25 %	229587630
1016	NC_012660	G	6	6	51580	51585	0 %	0 %	100 %	0 %	229587630
1017	NC_012660	GGC	2	6	51818	51823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587630
1018	NC_012660	AGA	2	6	51870	51875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587630
1019	NC_012660	GC	3	6	51981	51986	0 %	0 %	50 %	50 %	229587630
1020	NC_012660	AGC	2	6	52200	52205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587630
1021	NC_012660	TGT	2	6	52260	52265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587630
1022	NC_012660	GTG	2	6	52307	52312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587630
1023	NC_012660	TTC	2	6	52355	52360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587630
1024	NC_012660	CAA	2	6	52378	52383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587630
1025	NC_012660	GCGG	2	8	52394	52401	0 %	0 %	75 %	25 %	229587630
1026	NC_012660	CCGA	2	8	52501	52508	25 %	0 %	25 %	50 %	229587630
1027	NC_012660	CCG	2	6	52526	52531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587630
1028	NC_012660	GC	3	6	52561	52566	0 %	0 %	50 %	50 %	229587630
1029	NC_012660	CCG	2	6	52569	52574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587630
1030	NC_012660	TAC	2	6	52577	52582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587630
1031	NC_012660	GATG	2	8	52597	52604	25 %	25 %	50 %	0 %	229587630
1032	NC_012660	ACT	2	6	52635	52640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587630
1033	NC_012660	GCT	2	6	52681	52686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587630
1034	NC_012660	ACC	2	6	52838	52843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587630
1035	NC_012660	TGG	2	6	52986	52991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587630
1036	NC_012660	CAG	2	6	53116	53121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587631
1037	NC_012660	CAAG	2	8	53155	53162	50 %	0 %	25 %	25 %	229587631
1038	NC_012660	GGC	2	6	53213	53218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587631
1039	NC_012660	CGG	2	6	53230	53235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587631
1040	NC_012660	CCA	2	6	53271	53276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587631
1041	NC_012660	GTA	2	6	53361	53366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587631
1042	NC_012660	ACGC	2	8	53397	53404	25 %	0 %	25 %	50 %	229587631
1043	NC_012660	GGC	2	6	53521	53526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587631
1044	NC_012660	GATG	2	8	53532	53539	25 %	25 %	50 %	0 %	229587631
1045	NC_012660	TGG	2	6	53610	53615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587631
1046	NC_012660	GCG	2	6	53631	53636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587631
1047	NC_012660	GC	3	6	53715	53720	0 %	0 %	50 %	50 %	229587631
1048	NC_012660	GAG	2	6	53786	53791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229587631
1049	NC_012660	TGG	2	6	53842	53847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587631
1050	NC_012660	TGT	2	6	53857	53862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587631
1051	NC_012660	CGG	2	6	53931	53936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587631
1052	NC_012660	CAGC	2	8	54004	54011	25 %	0 %	25 %	50 %	229587631
1053	NC_012660	GCG	2	6	54012	54017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587631
1054	NC_012660	GCC	2	6	54041	54046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587631
1055	NC_012660	CGG	2	6	54117	54122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587631
1056	NC_012660	CGG	2	6	54154	54159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587631
1057	NC_012660	AGG	2	6	54231	54236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229587631
1058	NC_012660	GC	3	6	54282	54287	0 %	0 %	50 %	50 %	229587631
1059	NC_012660	ACC	2	6	54335	54340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587631
1060	NC_012660	CCA	2	6	54498	54503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587632
1061	NC_012660	GAC	2	6	54545	54550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587632
1062	NC_012660	GCC	2	6	54568	54573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587632
1063	NC_012660	CAT	2	6	54613	54618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587632
1064	NC_012660	CAA	2	6	54625	54630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587632
1065	NC_012660	AGC	2	6	54795	54800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587632
1066	NC_012660	GT	3	6	54821	54826	0 %	50 %	50 %	0 %	229587632
1067	NC_012660	TGC	3	9	54909	54917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587632
1068	NC_012660	CAT	2	6	54937	54942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587632
1069	NC_012660	GACCTG	2	12	54968	54979	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	229587632
1070	NC_012660	TGG	2	6	55005	55010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587632
1071	NC_012660	TGA	2	6	55014	55019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587632
1072	NC_012660	GAT	2	6	55037	55042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587632
1073	NC_012660	CACG	2	8	55065	55072	25 %	0 %	25 %	50 %	229587632
1074	NC_012660	GCG	2	6	55073	55078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587632
1075	NC_012660	GTGCT	2	10	55136	55145	0 %	40 %	40 %	20 %	229587632
1076	NC_012660	GAT	2	6	55150	55155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587632
1077	NC_012660	GAT	2	6	55159	55164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587632
1078	NC_012660	GC	3	6	55212	55217	0 %	0 %	50 %	50 %	229587632
1079	NC_012660	ATG	2	6	55232	55237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587632
1080	NC_012660	GTT	2	6	55264	55269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587632
1081	NC_012660	GAG	2	6	55271	55276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229587632
1082	NC_012660	TGGC	2	8	55277	55284	0 %	25 %	50 %	25 %	229587632
1083	NC_012660	CG	3	6	55301	55306	0 %	0 %	50 %	50 %	229587632
1084	NC_012660	TGA	2	6	55314	55319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587632
1085	NC_012660	CGG	2	6	55451	55456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587632
1086	NC_012660	GCAG	2	8	55497	55504	25 %	0 %	50 %	25 %	229587632
1087	NC_012660	TGT	2	6	55512	55517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587632
1088	NC_012660	CCG	2	6	55808	55813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587633
1089	NC_012660	GCA	2	6	55824	55829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587633
1090	NC_012660	ACG	2	6	55859	55864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587633
1091	NC_012660	CAG	2	6	55873	55878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587633
1092	NC_012660	GAA	2	6	55879	55884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587633
1093	NC_012660	GCC	2	6	56022	56027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587633
1094	NC_012660	CGG	2	6	56043	56048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587633
1095	NC_012660	GCA	2	6	56091	56096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587633
1096	NC_012660	CAT	2	6	56097	56102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587633
1097	NC_012660	GCG	2	6	56123	56128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587633
1098	NC_012660	GCGG	2	8	56133	56140	0 %	0 %	75 %	25 %	229587633
1099	NC_012660	ACTGCG	2	12	56228	56239	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	229587633
1100	NC_012660	GAA	2	6	56272	56277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587633
1101	NC_012660	GCA	2	6	56295	56300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587633
1102	NC_012660	ACCC	2	8	56308	56315	25 %	0 %	0 %	75 %	229587633
1103	NC_012660	ACA	2	6	56369	56374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587633
1104	NC_012660	GCG	2	6	56432	56437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587633
1105	NC_012660	TTCC	2	8	56447	56454	0 %	50 %	0 %	50 %	229587633
1106	NC_012660	GC	3	6	56467	56472	0 %	0 %	50 %	50 %	229587633
1107	NC_012660	TCA	2	6	56559	56564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587634
1108	NC_012660	TGC	2	6	56569	56574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587634
1109	NC_012660	GGT	2	6	56614	56619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587634
1110	NC_012660	GCC	2	6	56674	56679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587634
1111	NC_012660	ATC	2	6	56702	56707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587634
1112	NC_012660	TGG	3	9	56715	56723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587634
1113	NC_012660	TGGC	2	8	56726	56733	0 %	25 %	50 %	25 %	229587634
1114	NC_012660	CGG	3	9	56760	56768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587634
1115	NC_012660	GGTGTT	2	12	56776	56787	0 %	50 %	50 %	0 %	229587634
1116	NC_012660	GAT	3	9	56809	56817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587634
1117	NC_012660	CTG	3	9	56831	56839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587634
1118	NC_012660	TGG	2	6	56856	56861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587634
1119	NC_012660	GTG	2	6	56909	56914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587634
1120	NC_012660	GC	3	6	56979	56984	0 %	0 %	50 %	50 %	229587634
1121	NC_012660	CGG	2	6	57021	57026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587634
1122	NC_012660	GCG	2	6	57054	57059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587634
1123	NC_012660	GGCA	2	8	57069	57076	25 %	0 %	50 %	25 %	229587634
1124	NC_012660	CGA	2	6	57093	57098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587634
1125	NC_012660	CCGC	2	8	57127	57134	0 %	0 %	25 %	75 %	229587634
1126	NC_012660	ACC	2	6	57179	57184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587634
1127	NC_012660	GTC	2	6	57185	57190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587634
1128	NC_012660	CTG	2	6	57275	57280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587634
1129	NC_012660	CCG	3	9	57354	57362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587634
1130	NC_012660	ACC	2	6	57512	57517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587634
1131	NC_012660	GT	3	6	57540	57545	0 %	50 %	50 %	0 %	229587634
1132	NC_012660	TGC	2	6	57564	57569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587634
1133	NC_012660	GT	3	6	57576	57581	0 %	50 %	50 %	0 %	229587634
1134	NC_012660	GCG	2	6	57701	57706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587634
1135	NC_012660	ATC	2	6	57719	57724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587634
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1138	NC_012660	GCG	2	6	57860	57865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587634
1139	NC_012660	CCTG	2	8	57966	57973	0 %	25 %	25 %	50 %	229587634
1140	NC_012660	GGA	2	6	57982	57987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229587634
1141	NC_012660	GCG	2	6	58004	58009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587634
1142	NC_012660	GAC	3	9	58072	58080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587634
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1147	NC_012660	CT	3	6	58310	58315	0 %	50 %	0 %	50 %	229587635
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1155	NC_012660	GGT	2	6	58544	58549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587635
1156	NC_012660	A	6	6	58556	58561	100 %	0 %	0 %	0 %	229587635
1157	NC_012660	GGC	2	6	58627	58632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587635
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1160	NC_012660	ATG	2	6	59196	59201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587636
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1162	NC_012660	CGC	2	6	59258	59263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587636
1163	NC_012660	AGTC	2	8	59297	59304	25 %	25 %	25 %	25 %	229587636
1164	NC_012660	TG	3	6	59343	59348	0 %	50 %	50 %	0 %	229587636
1165	NC_012660	CAT	2	6	59357	59362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587636
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1237	NC_012660	GCTA	2	8	62663	62670	25 %	25 %	25 %	25 %	229587638
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1241	NC_012660	GC	3	6	62820	62825	0 %	0 %	50 %	50 %	229587639
1242	NC_012660	CTG	2	6	62865	62870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587639
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1245	NC_012660	AAC	2	6	63126	63131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587639
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1247	NC_012660	ACCATC	2	12	63225	63236	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	229587639
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1249	NC_012660	CTGG	2	8	63281	63288	0 %	25 %	50 %	25 %	229587639
1250	NC_012660	TGC	2	6	63298	63303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587639
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1495	NC_012660	T	6	6	75298	75303	0 %	100 %	0 %	0 %	229587653
1496	NC_012660	GGC	2	6	75317	75322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587653
1497	NC_012660	CGA	2	6	75382	75387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587653
1498	NC_012660	GCGAT	3	15	75397	75411	20 %	20 %	40 %	20 %	229587653
1499	NC_012660	CAG	2	6	75428	75433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587653
1500	NC_012660	GC	3	6	75442	75447	0 %	0 %	50 %	50 %	229587653

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