MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas fluorescens SBW25 chromosome

Total Repeats: 127366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012660	CAG	3	9	270385	270393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587812
5002	NC_012660	GTTGCC	2	12	270397	270408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587812
5003	NC_012660	CAG	2	6	270445	270450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587812
5004	NC_012660	CAGC	2	8	270477	270484	25 %	0 %	25 %	50 %	229587812
5005	NC_012660	CGG	2	6	270522	270527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587812
5006	NC_012660	CGG	2	6	270561	270566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587812
5007	NC_012660	GCG	2	6	270609	270614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587812
5008	NC_012660	GTC	2	6	270619	270624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587812
5009	NC_012660	GCC	2	6	270691	270696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587812
5010	NC_012660	CAG	2	6	270697	270702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587812
5011	NC_012660	TGT	2	6	270728	270733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587812
5012	NC_012660	GTGA	2	8	270908	270915	25 %	25 %	50 %	0 %	229587813
5013	NC_012660	GCG	2	6	270960	270965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587813
5014	NC_012660	GTG	2	6	271002	271007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587813
5015	NC_012660	GGC	2	6	271013	271018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587813
5016	NC_012660	CG	3	6	271032	271037	0 %	0 %	50 %	50 %	229587813
5017	NC_012660	GTT	2	6	271075	271080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587813
5018	NC_012660	GAA	2	6	271112	271117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587813
5019	NC_012660	GC	3	6	271178	271183	0 %	0 %	50 %	50 %	229587813
5020	NC_012660	CGC	2	6	271198	271203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587813
5021	NC_012660	GC	3	6	271202	271207	0 %	0 %	50 %	50 %	229587813
5022	NC_012660	GGC	2	6	271211	271216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587813
5023	NC_012660	GCC	2	6	271316	271321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587813
5024	NC_012660	CG	3	6	271339	271344	0 %	0 %	50 %	50 %	229587813
5025	NC_012660	TGC	2	6	271359	271364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587813
5026	NC_012660	CAC	2	6	271409	271414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587813
5027	NC_012660	GC	3	6	271442	271447	0 %	0 %	50 %	50 %	229587813
5028	NC_012660	CTT	2	6	271516	271521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587813
5029	NC_012660	ACGGG	2	10	271530	271539	20 %	0 %	60 %	20 %	229587813
5030	NC_012660	GTG	2	6	271541	271546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587813
5031	NC_012660	ATC	2	6	271562	271567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587813
5032	NC_012660	GCGA	2	8	271569	271576	25 %	0 %	50 %	25 %	229587813
5033	NC_012660	CGG	2	6	271620	271625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587813
5034	NC_012660	TCG	2	6	271668	271673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587813
5035	NC_012660	GTG	2	6	271682	271687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587813
5036	NC_012660	CGA	2	6	271701	271706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587813
5037	NC_012660	CGG	2	6	271744	271749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587813
5038	NC_012660	TG	3	6	271753	271758	0 %	50 %	50 %	0 %	229587813
5039	NC_012660	CGG	2	6	271776	271781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587813
5040	NC_012660	GCA	2	6	271807	271812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587813
5041	NC_012660	GC	3	6	271821	271826	0 %	0 %	50 %	50 %	229587813
5042	NC_012660	CAGC	2	8	272211	272218	25 %	0 %	25 %	50 %	229587814
5043	NC_012660	TCT	2	6	272244	272249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587814
5044	NC_012660	CTG	2	6	272270	272275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587814
5045	NC_012660	GGC	2	6	272326	272331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587814
5046	NC_012660	GGC	2	6	272341	272346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587814
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5049	NC_012660	ACG	2	6	272451	272456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587814
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5051	NC_012660	GCATCA	2	12	272505	272516	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	229587814
5052	NC_012660	GC	3	6	272574	272579	0 %	0 %	50 %	50 %	229587814
5053	NC_012660	ACGCCG	2	12	272586	272597	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	229587814
5054	NC_012660	CG	3	6	272596	272601	0 %	0 %	50 %	50 %	229587814
5055	NC_012660	CAT	2	6	272788	272793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587814
5056	NC_012660	TGC	2	6	272835	272840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587814
5057	NC_012660	TGA	2	6	272913	272918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587814
5058	NC_012660	TGC	2	6	272988	272993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587814
5059	NC_012660	GCT	3	9	273004	273012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587814
5060	NC_012660	GTT	2	6	273019	273024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587814
5061	NC_012660	CCCA	2	8	273032	273039	25 %	0 %	0 %	75 %	229587814
5062	NC_012660	ACT	2	6	273075	273080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587814
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5064	NC_012660	TGG	2	6	273170	273175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587814
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5069	NC_012660	CGG	2	6	273468	273473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587814
5070	NC_012660	CGT	2	6	273484	273489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587814
5071	NC_012660	GTC	2	6	273502	273507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587814
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5099	NC_012660	AG	3	6	274982	274987	50 %	0 %	50 %	0 %	229587815
5100	NC_012660	CGG	2	6	275003	275008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587815
5101	NC_012660	TAC	2	6	275070	275075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587815
5102	NC_012660	CAG	2	6	275076	275081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587815
5103	NC_012660	TTC	2	6	275082	275087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587815
5104	NC_012660	TGGGCG	2	12	275158	275169	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	229587815
5105	NC_012660	GCG	2	6	275196	275201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587815
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5107	NC_012660	AGA	2	6	275308	275313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587815
5108	NC_012660	GCG	2	6	275317	275322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587815
5109	NC_012660	GCG	2	6	275359	275364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587815
5110	NC_012660	CTGG	2	8	275453	275460	0 %	25 %	50 %	25 %	229587815
5111	NC_012660	CCG	2	6	275512	275517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587815
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5120	NC_012660	ATC	2	6	276111	276116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587816
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5241	NC_012660	GCG	2	6	282589	282594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587822
5242	NC_012660	CTG	2	6	282682	282687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587822
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5351	NC_012660	ACAGC	2	10	288704	288713	40 %	0 %	20 %	40 %	229587826
5352	NC_012660	GCA	2	6	288723	288728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587827
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5354	NC_012660	TCAA	2	8	288810	288817	50 %	25 %	0 %	25 %	229587827
5355	NC_012660	CCAGCG	2	12	288898	288909	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	229587827
5356	NC_012660	TGA	2	6	288916	288921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587827
5357	NC_012660	CAC	2	6	289007	289012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587827
5358	NC_012660	CGCA	2	8	289118	289125	25 %	0 %	25 %	50 %	229587827
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5360	NC_012660	TCAGG	2	10	289457	289466	20 %	20 %	40 %	20 %	229587828
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5481	NC_012660	AGA	2	6	296511	296516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587837
5482	NC_012660	TGC	2	6	296535	296540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587837
5483	NC_012660	GC	3	6	296550	296555	0 %	0 %	50 %	50 %	229587837
5484	NC_012660	CTG	2	6	296630	296635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587837
5485	NC_012660	ATC	2	6	296636	296641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587837
5486	NC_012660	AAG	2	6	296642	296647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587837
5487	NC_012660	TGG	2	6	296664	296669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587837
5488	NC_012660	GTG	2	6	296738	296743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587837
5489	NC_012660	TGGATG	2	12	296841	296852	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	229587837
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5491	NC_012660	GGC	2	6	296942	296947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587837
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5493	NC_012660	GAC	2	6	297164	297169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587837
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