MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Prosthecochloris aestuarii DSM 271 plasmid pPAES01

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011061	GGCC	2	8	269	276	0 %	0 %	50 %	50 %	194335118
2	NC_011061	GGGA	2	8	322	329	25 %	0 %	75 %	0 %	194335118
3	NC_011061	CAGA	3	12	962	973	50 %	0 %	25 %	25 %	194335119
4	NC_011061	AATG	2	8	2650	2657	50 %	25 %	25 %	0 %	194335122
5	NC_011061	AGGC	2	8	3427	3434	25 %	0 %	50 %	25 %	194335122
6	NC_011061	GCAG	2	8	3521	3528	25 %	0 %	50 %	25 %	194335122
7	NC_011061	CTGG	2	8	3934	3941	0 %	25 %	50 %	25 %	194335122
8	NC_011061	AGCG	2	8	4232	4239	25 %	0 %	50 %	25 %	194335122
9	NC_011061	CACG	2	8	4311	4318	25 %	0 %	25 %	50 %	194335122
10	NC_011061	GGCA	2	8	4687	4694	25 %	0 %	50 %	25 %	194335123
11	NC_011061	GTAC	2	8	4696	4703	25 %	25 %	25 %	25 %	194335123
12	NC_011061	TGGA	2	8	6189	6196	25 %	25 %	50 %	0 %	194335123
13	NC_011061	GAAA	2	8	6207	6214	75 %	0 %	25 %	0 %	194335123
14	NC_011061	AAGA	2	8	6565	6572	75 %	0 %	25 %	0 %	194335124
15	NC_011061	ACAT	2	8	6573	6580	50 %	25 %	0 %	25 %	194335124
16	NC_011061	TTTC	2	8	7440	7447	0 %	75 %	0 %	25 %	194335125
17	NC_011061	CCTC	2	8	7530	7537	0 %	25 %	0 %	75 %	194335125
18	NC_011061	GCAG	2	8	7607	7614	25 %	0 %	50 %	25 %	194335125
19	NC_011061	CGCT	2	8	8702	8709	0 %	25 %	25 %	50 %	194335127
20	NC_011061	GACC	2	8	10295	10302	25 %	0 %	25 %	50 %	194335128
21	NC_011061	GAAA	2	8	10551	10558	75 %	0 %	25 %	0 %	194335128
22	NC_011061	ATCT	2	8	11044	11051	25 %	50 %	0 %	25 %	194335128
23	NC_011061	GCTG	2	8	11983	11990	0 %	25 %	50 %	25 %	194335129
24	NC_011061	CCTT	2	8	12373	12380	0 %	50 %	0 %	50 %	194335130
25	NC_011061	TTTG	2	8	12644	12651	0 %	75 %	25 %	0 %	194335131
26	NC_011061	ATCT	2	8	13803	13810	25 %	50 %	0 %	25 %	194335132
27	NC_011061	GGCA	2	8	14261	14268	25 %	0 %	50 %	25 %	194335132
28	NC_011061	GCCC	2	8	14441	14448	0 %	0 %	25 %	75 %	194335133
29	NC_011061	GATC	2	8	15338	15345	25 %	25 %	25 %	25 %	194335134
30	NC_011061	GAAG	2	8	15491	15498	50 %	0 %	50 %	0 %	194335134
31	NC_011061	GGAA	2	8	15630	15637	50 %	0 %	50 %	0 %	194335134
32	NC_011061	GGCA	2	8	15770	15777	25 %	0 %	50 %	25 %	194335134
33	NC_011061	ATGC	2	8	16250	16257	25 %	25 %	25 %	25 %	194335134
34	NC_011061	TGGA	2	8	17134	17141	25 %	25 %	50 %	0 %	194335136
35	NC_011061	GATG	2	8	18203	18210	25 %	25 %	50 %	0 %	194335137
36	NC_011061	CGTG	2	8	18413	18420	0 %	25 %	50 %	25 %	194335137
37	NC_011061	GATG	2	8	18620	18627	25 %	25 %	50 %	0 %	194335137
38	NC_011061	ATGG	2	8	20067	20074	25 %	25 %	50 %	0 %	194335139
39	NC_011061	GCCA	2	8	20837	20844	25 %	0 %	25 %	50 %	194335140
40	NC_011061	TTCC	2	8	21227	21234	0 %	50 %	0 %	50 %	194335141
41	NC_011061	GGCA	2	8	21964	21971	25 %	0 %	50 %	25 %	194335142
42	NC_011061	CGGA	2	8	22085	22092	25 %	0 %	50 %	25 %	194335142
43	NC_011061	TCAT	2	8	22995	23002	25 %	50 %	0 %	25 %	194335143
44	NC_011061	GCAG	2	8	23383	23390	25 %	0 %	50 %	25 %	194335144
45	NC_011061	AGAC	2	8	23735	23742	50 %	0 %	25 %	25 %	194335145
46	NC_011061	CTGG	2	8	24074	24081	0 %	25 %	50 %	25 %	194335145
47	NC_011061	TGCT	2	8	24164	24171	0 %	50 %	25 %	25 %	194335145
48	NC_011061	CGAC	2	8	24473	24480	25 %	0 %	25 %	50 %	194335145
49	NC_011061	ATGG	2	8	24536	24543	25 %	25 %	50 %	0 %	194335145
50	NC_011061	GCTG	2	8	25071	25078	0 %	25 %	50 %	25 %	194335145
51	NC_011061	CAGG	2	8	25145	25152	25 %	0 %	50 %	25 %	194335145
52	NC_011061	GGCC	2	8	25891	25898	0 %	0 %	50 %	50 %	194335146
53	NC_011061	CCGG	2	8	26047	26054	0 %	0 %	50 %	50 %	194335146
54	NC_011061	GAGC	2	8	26277	26284	25 %	0 %	50 %	25 %	194335146
55	NC_011061	AGTG	2	8	26982	26989	25 %	25 %	50 %	0 %	194335146
56	NC_011061	AGTG	2	8	26994	27001	25 %	25 %	50 %	0 %	194335146
57	NC_011061	AGTG	2	8	27006	27013	25 %	25 %	50 %	0 %	194335146
58	NC_011061	AGGA	2	8	27216	27223	50 %	0 %	50 %	0 %	194335146
59	NC_011061	AGCC	2	8	27550	27557	25 %	0 %	25 %	50 %	194335147
60	NC_011061	AAAC	2	8	28450	28457	75 %	0 %	0 %	25 %	194335148
61	NC_011061	CAGT	2	8	28674	28681	25 %	25 %	25 %	25 %	194335148
62	NC_011061	AACA	2	8	29993	30000	75 %	0 %	0 %	25 %	194335149
63	NC_011061	GATC	2	8	30221	30228	25 %	25 %	25 %	25 %	194335149
64	NC_011061	TTGT	2	8	31046	31053	0 %	75 %	25 %	0 %	194335151
65	NC_011061	CAGT	2	8	31738	31745	25 %	25 %	25 %	25 %	194335151
66	NC_011061	TCCC	2	8	32145	32152	0 %	25 %	0 %	75 %	194335151
67	NC_011061	ATCC	2	8	33208	33215	25 %	25 %	0 %	50 %	194335153
68	NC_011061	GAAA	2	8	33824	33831	75 %	0 %	25 %	0 %	194335154
69	NC_011061	AGGA	2	8	34095	34102	50 %	0 %	50 %	0 %	194335154
70	NC_011061	TCGA	2	8	34472	34479	25 %	25 %	25 %	25 %	194335155
71	NC_011061	CCTT	2	8	35481	35488	0 %	50 %	0 %	50 %	194335157
72	NC_011061	AGGC	2	8	35618	35625	25 %	0 %	50 %	25 %	194335157
73	NC_011061	CTGT	2	8	35788	35795	0 %	50 %	25 %	25 %	194335157
74	NC_011061	AGGA	2	8	36006	36013	50 %	0 %	50 %	0 %	194335157
75	NC_011061	CCGG	2	8	36241	36248	0 %	0 %	50 %	50 %	194335157
76	NC_011061	TGGC	2	8	37252	37259	0 %	25 %	50 %	25 %	194335158
77	NC_011061	AAAC	2	8	37332	37339	75 %	0 %	0 %	25 %	194335158
78	NC_011061	AGTC	2	8	37635	37642	25 %	25 %	25 %	25 %	194335158
79	NC_011061	GATG	2	8	38984	38991	25 %	25 %	50 %	0 %	194335159
80	NC_011061	ATCG	2	8	39066	39073	25 %	25 %	25 %	25 %	194335159
81	NC_011061	AGCC	2	8	39607	39614	25 %	0 %	25 %	50 %	194335159
82	NC_011061	GTCA	2	8	39867	39874	25 %	25 %	25 %	25 %	194335159
83	NC_011061	TACA	2	8	40622	40629	50 %	25 %	0 %	25 %	194335160
84	NC_011061	ATCG	2	8	40716	40723	25 %	25 %	25 %	25 %	194335160
85	NC_011061	CACT	2	8	41346	41353	25 %	25 %	0 %	50 %	194335161
86	NC_011061	GAAT	2	8	42272	42279	50 %	25 %	25 %	0 %	194335161
87	NC_011061	TTCT	2	8	42633	42640	0 %	75 %	0 %	25 %	194335161
88	NC_011061	ACCG	2	8	42772	42779	25 %	0 %	25 %	50 %	194335161
89	NC_011061	ACGC	2	8	44095	44102	25 %	0 %	25 %	50 %	194335162
90	NC_011061	TGGC	2	8	44116	44123	0 %	25 %	50 %	25 %	194335162
91	NC_011061	TCAT	2	8	44325	44332	25 %	50 %	0 %	25 %	194335163
92	NC_011061	CCAC	2	8	44695	44702	25 %	0 %	0 %	75 %	194335163
93	NC_011061	ATAC	2	8	44748	44755	50 %	25 %	0 %	25 %	194335163
94	NC_011061	CTGC	2	8	44872	44879	0 %	25 %	25 %	50 %	194335163
95	NC_011061	TGAG	2	8	44886	44893	25 %	25 %	50 %	0 %	194335163
96	NC_011061	CTGG	2	8	44900	44907	0 %	25 %	50 %	25 %	194335163
97	NC_011061	CATC	2	8	45835	45842	25 %	25 %	0 %	50 %	194335165
98	NC_011061	ATGC	2	8	46828	46835	25 %	25 %	25 %	25 %	194335166
99	NC_011061	TCAA	2	8	46925	46932	50 %	25 %	0 %	25 %	194335166
100	NC_011061	TTGA	2	8	46957	46964	25 %	50 %	25 %	0 %	194335166
101	NC_011061	CCTT	2	8	47250	47257	0 %	50 %	0 %	50 %	194335167
102	NC_011061	TCAT	2	8	47952	47959	25 %	50 %	0 %	25 %	194335168
103	NC_011061	CTGC	2	8	49784	49791	0 %	25 %	25 %	50 %	194335169
104	NC_011061	TGCA	2	8	49798	49805	25 %	25 %	25 %	25 %	194335169
105	NC_011061	CGCT	2	8	49838	49845	0 %	25 %	25 %	50 %	194335169
106	NC_011061	TCTG	2	8	51032	51039	0 %	50 %	25 %	25 %	194335171
107	NC_011061	TTCC	2	8	51270	51277	0 %	50 %	0 %	50 %	194335171
108	NC_011061	CCTG	2	8	53419	53426	0 %	25 %	25 %	50 %	194335172
109	NC_011061	GGTA	2	8	53500	53507	25 %	25 %	50 %	0 %	194335172
110	NC_011061	CAAA	2	8	54259	54266	75 %	0 %	0 %	25 %	194335172
111	NC_011061	GAGG	2	8	54454	54461	25 %	0 %	75 %	0 %	194335173
112	NC_011061	TTGT	2	8	54526	54533	0 %	75 %	25 %	0 %	194335173
113	NC_011061	CTGT	2	8	54593	54600	0 %	50 %	25 %	25 %	194335173
114	NC_011061	TGTC	2	8	54771	54778	0 %	50 %	25 %	25 %	194335173
115	NC_011061	TACA	2	8	55257	55264	50 %	25 %	0 %	25 %	194335173
116	NC_011061	CTCA	2	8	55886	55893	25 %	25 %	0 %	50 %	194335174
117	NC_011061	GCCT	2	8	55901	55908	0 %	25 %	25 %	50 %	194335174
118	NC_011061	CCAG	2	8	56452	56459	25 %	0 %	25 %	50 %	194335174
119	NC_011061	TACA	2	8	56630	56637	50 %	25 %	0 %	25 %	194335174
120	NC_011061	TTGT	2	8	56703	56710	0 %	75 %	25 %	0 %	194335174
121	NC_011061	TGGT	2	8	56796	56803	0 %	50 %	50 %	0 %	194335174
122	NC_011061	AGCA	2	8	57056	57063	50 %	0 %	25 %	25 %	194335174
123	NC_011061	TGAA	2	8	57787	57794	50 %	25 %	25 %	0 %	194335174
124	NC_011061	GCTG	2	8	58078	58085	0 %	25 %	50 %	25 %	194335174
125	NC_011061	CAGG	2	8	58255	58262	25 %	0 %	50 %	25 %	194335174
126	NC_011061	GTCA	2	8	58490	58497	25 %	25 %	25 %	25 %	194335174
127	NC_011061	AACA	2	8	59421	59428	75 %	0 %	0 %	25 %	194335176
128	NC_011061	CCAT	2	8	61012	61019	25 %	25 %	0 %	50 %	194335176
129	NC_011061	CCAT	2	8	61206	61213	25 %	25 %	0 %	50 %	194335176
130	NC_011061	AATG	2	8	61257	61264	50 %	25 %	25 %	0 %	194335176
131	NC_011061	ACAA	2	8	61651	61658	75 %	0 %	0 %	25 %	194335177
132	NC_011061	TCCT	2	8	61748	61755	0 %	50 %	0 %	50 %	194335178
133	NC_011061	CTGC	2	8	62096	62103	0 %	25 %	25 %	50 %	194335178
134	NC_011061	TGCC	2	8	62399	62406	0 %	25 %	25 %	50 %	194335178
135	NC_011061	ACAG	2	8	63304	63311	50 %	0 %	25 %	25 %	194335179

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.