MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Pseudomonas mendocina ymp chromosome

Total Repeats: 85748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009439	GCA	2	6	93	98	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305043
2	NC_009439	CGA	2	6	117	122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305043
3	NC_009439	CGA	2	6	180	185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305043
4	NC_009439	GCC	2	6	245	250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305043
5	NC_009439	GCA	2	6	311	316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305043
6	NC_009439	GCG	2	6	373	378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305043
7	NC_009439	GCC	2	6	391	396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305043
8	NC_009439	ACC	2	6	414	419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305043
9	NC_009439	GAA	2	6	430	435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305043
10	NC_009439	CCA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305043
11	NC_009439	TCG	2	6	584	589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305043
12	NC_009439	GGC	2	6	676	681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305043
13	NC_009439	ACC	2	6	722	727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305043
14	NC_009439	GAA	2	6	735	740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305043
15	NC_009439	GGT	2	6	753	758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305043
16	NC_009439	TCG	2	6	779	784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305043
17	NC_009439	GCT	2	6	855	860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305043
18	NC_009439	CGA	2	6	864	869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305043
19	NC_009439	TTC	2	6	877	882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146305043
20	NC_009439	TTC	2	6	910	915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146305043
21	NC_009439	GGC	2	6	940	945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305043
22	NC_009439	GCC	2	6	1047	1052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305043
23	NC_009439	TGA	2	6	1079	1084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305043
24	NC_009439	TTC	2	6	1129	1134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146305043
25	NC_009439	CTG	2	6	1258	1263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305043
26	NC_009439	CAC	2	6	1305	1310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305043
27	NC_009439	TAC	2	6	1318	1323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305043
28	NC_009439	CTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305043
29	NC_009439	CGG	2	6	1449	1454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305043
30	NC_009439	CAC	2	6	1464	1469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305043
31	NC_009439	CTG	2	6	1543	1548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305043
32	NC_009439	ACG	2	6	1666	1671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305044
33	NC_009439	CTG	2	6	1700	1705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305044
34	NC_009439	CAG	2	6	1718	1723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305044
35	NC_009439	GCT	2	6	1888	1893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305044
36	NC_009439	CAG	2	6	2042	2047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305044
37	NC_009439	CTA	2	6	2056	2061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305044
38	NC_009439	TGC	2	6	2073	2078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305044
39	NC_009439	TGC	2	6	2097	2102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305044
40	NC_009439	GGC	2	6	2149	2154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305044
41	NC_009439	CAG	2	6	2159	2164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305044
42	NC_009439	GCA	2	6	2260	2265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305044
43	NC_009439	TGG	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305044
44	NC_009439	TGC	2	6	2343	2348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305044
45	NC_009439	CTG	2	6	2468	2473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305044
46	NC_009439	CAA	2	6	2485	2490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305044
47	NC_009439	TCG	3	9	2520	2528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305044
48	NC_009439	GGC	2	6	2537	2542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305044
49	NC_009439	CTG	2	6	2573	2578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305044
50	NC_009439	CAG	2	6	2635	2640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305044
51	NC_009439	CTG	2	6	2645	2650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305044
52	NC_009439	GAT	2	6	2666	2671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305044
53	NC_009439	GTC	2	6	2681	2686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305044
54	NC_009439	CAT	2	6	2726	2731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305045
55	NC_009439	GCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305045
56	NC_009439	AAC	2	6	2902	2907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305045
57	NC_009439	CTG	2	6	3084	3089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305045
58	NC_009439	CTG	2	6	3345	3350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305045
59	NC_009439	CGG	2	6	3511	3516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305045
60	NC_009439	ACA	2	6	3533	3538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305045
61	NC_009439	TGG	2	6	3544	3549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305045
62	NC_009439	TGG	2	6	3616	3621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305045
63	NC_009439	AGC	2	6	3646	3651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305045
64	NC_009439	TCA	2	6	3700	3705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305045
65	NC_009439	TTG	2	6	3723	3728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146305045
66	NC_009439	CTC	2	6	3843	3848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146305046
67	NC_009439	CAC	2	6	3934	3939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305046
68	NC_009439	GGT	2	6	3951	3956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305046
69	NC_009439	CGA	2	6	3969	3974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305046
70	NC_009439	TCA	2	6	4004	4009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305046
71	NC_009439	GAA	2	6	4078	4083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305046
72	NC_009439	TCA	2	6	4103	4108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305046
73	NC_009439	TGC	2	6	4115	4120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305046
74	NC_009439	CGG	2	6	4125	4130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305046
75	NC_009439	ACA	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305046
76	NC_009439	CGG	2	6	4161	4166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305046
77	NC_009439	GGT	2	6	4188	4193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305046
78	NC_009439	CCG	2	6	4227	4232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305046
79	NC_009439	CAC	2	6	4261	4266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305046
80	NC_009439	CTG	2	6	4432	4437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305046
81	NC_009439	TCG	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305046
82	NC_009439	CAA	2	6	4515	4520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305046
83	NC_009439	GTG	2	6	4525	4530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305046
84	NC_009439	CAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305046
85	NC_009439	GGT	2	6	4657	4662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305046
86	NC_009439	AAC	2	6	4705	4710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305046
87	NC_009439	GAA	2	6	4734	4739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305046
88	NC_009439	CCA	2	6	4751	4756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305046
89	NC_009439	ATC	2	6	4789	4794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305046
90	NC_009439	CTG	2	6	4906	4911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305046
91	NC_009439	GAT	2	6	4947	4952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305046
92	NC_009439	CGC	2	6	4956	4961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305046
93	NC_009439	GCG	2	6	4975	4980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305046
94	NC_009439	CGC	2	6	5002	5007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305046
95	NC_009439	CTC	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146305046
96	NC_009439	GAG	2	6	5266	5271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146305046
97	NC_009439	ACA	2	6	5273	5278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305046
98	NC_009439	CAT	4	12	5301	5312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305046
99	NC_009439	CTG	3	9	5350	5358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305046
100	NC_009439	CTT	3	9	5361	5369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146305046
101	NC_009439	GCC	2	6	5418	5423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305046
102	NC_009439	AAG	2	6	5437	5442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305046
103	NC_009439	GAC	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305046
104	NC_009439	CGG	2	6	5553	5558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305046
105	NC_009439	TGA	2	6	5594	5599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305046
106	NC_009439	ACC	2	6	5848	5853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305046
107	NC_009439	CTT	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146305046
108	NC_009439	AAC	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305046
109	NC_009439	CTG	2	6	5923	5928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305046
110	NC_009439	GCG	2	6	5951	5956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305046
111	NC_009439	AAG	2	6	5962	5967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305046
112	NC_009439	ACC	2	6	6082	6087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305046
113	NC_009439	CGG	2	6	6140	6145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305046
114	NC_009439	CCA	2	6	6512	6517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305047
115	NC_009439	GAA	2	6	6533	6538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305047
116	NC_009439	GCG	2	6	6546	6551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305047
117	NC_009439	GCC	2	6	6581	6586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305047
118	NC_009439	CAG	2	6	6680	6685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305047
119	NC_009439	GCC	2	6	6696	6701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305047
120	NC_009439	GCC	2	6	6737	6742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305047
121	NC_009439	CGC	2	6	6763	6768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305047
122	NC_009439	CGA	2	6	6769	6774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305047
123	NC_009439	GCA	2	6	6850	6855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305047
124	NC_009439	ACG	2	6	6870	6875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305047
125	NC_009439	CAG	3	9	6893	6901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305047
126	NC_009439	CAG	2	6	6935	6940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305047
127	NC_009439	GAG	2	6	6951	6956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146305047
128	NC_009439	ATC	2	6	6972	6977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305047
129	NC_009439	GTG	2	6	7017	7022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305047
130	NC_009439	CGC	2	6	7024	7029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305047
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251	NC_009439	ACC	2	6	13109	13114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305053
252	NC_009439	AGA	2	6	13131	13136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305053
253	NC_009439	GAC	2	6	13145	13150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305053
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255	NC_009439	CCG	2	6	13234	13239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305054
256	NC_009439	ATC	2	6	13244	13249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305054
257	NC_009439	CGG	2	6	13265	13270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305054
258	NC_009439	GCT	2	6	13358	13363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305054
259	NC_009439	CGA	2	6	13369	13374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305054
260	NC_009439	CGC	2	6	13498	13503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305054
261	NC_009439	CCA	2	6	13513	13518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305054
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285	NC_009439	CCG	2	6	14739	14744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305055
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376	NC_009439	GCA	2	6	21123	21128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305062
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378	NC_009439	GGA	2	6	21207	21212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146305062
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