MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas mendocina ymp chromosome

Total Repeats: 113949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009439	TCA	2	6	176154	176159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305216
4002	NC_009439	CAG	2	6	176161	176166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305216
4003	NC_009439	CGG	2	6	176205	176210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305216
4004	NC_009439	GAC	2	6	176224	176229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305216
4005	NC_009439	CTG	2	6	176236	176241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305216
4006	NC_009439	CAG	2	6	176245	176250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305216
4007	NC_009439	GCCA	2	8	176293	176300	25 %	0 %	25 %	50 %	146305216
4008	NC_009439	GCG	2	6	176307	176312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305216
4009	NC_009439	TGC	2	6	176433	176438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305216
4010	NC_009439	CAG	2	6	176491	176496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305216
4011	NC_009439	TCG	2	6	176504	176509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305216
4012	NC_009439	CGG	2	6	176544	176549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305216
4013	NC_009439	AGC	3	9	176612	176620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305216
4014	NC_009439	CAG	2	6	176623	176628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305216
4015	NC_009439	GGC	2	6	176768	176773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305217
4016	NC_009439	TGC	2	6	176788	176793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305217
4017	NC_009439	CTC	2	6	176828	176833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146305217
4018	NC_009439	GC	3	6	176845	176850	0 %	0 %	50 %	50 %	146305217
4019	NC_009439	GCT	2	6	176879	176884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305217
4020	NC_009439	GCC	2	6	176885	176890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305217
4021	NC_009439	CCT	2	6	176917	176922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146305217
4022	NC_009439	GAT	2	6	176930	176935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305217
4023	NC_009439	GC	3	6	176940	176945	0 %	0 %	50 %	50 %	146305217
4024	NC_009439	GCG	2	6	177000	177005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305217
4025	NC_009439	GGC	2	6	177034	177039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305217
4026	NC_009439	GCG	2	6	177109	177114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305217
4027	NC_009439	TGA	2	6	177127	177132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305217
4028	NC_009439	CAG	2	6	177146	177151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305217
4029	NC_009439	TGG	2	6	177199	177204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305217
4030	NC_009439	CGA	2	6	177208	177213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305217
4031	NC_009439	CGGCG	2	10	177223	177232	0 %	0 %	60 %	40 %	146305217
4032	NC_009439	GCA	2	6	177280	177285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305217
4033	NC_009439	GCC	2	6	177338	177343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305217
4034	NC_009439	CGG	2	6	177433	177438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305217
4035	NC_009439	GCG	2	6	177479	177484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305217
4036	NC_009439	TGCCGG	2	12	177520	177531	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	146305217
4037	NC_009439	GAGGAT	2	12	177539	177550	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	146305217
4038	NC_009439	GCC	2	6	177564	177569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305217
4039	NC_009439	GC	3	6	177575	177580	0 %	0 %	50 %	50 %	146305217
4040	NC_009439	CAT	2	6	177596	177601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305217
4041	NC_009439	GCCGC	2	10	177664	177673	0 %	0 %	40 %	60 %	146305217
4042	NC_009439	GC	3	6	177678	177683	0 %	0 %	50 %	50 %	146305217
4043	NC_009439	GCT	2	6	177691	177696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305217
4044	NC_009439	GGC	2	6	177701	177706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305217
4045	NC_009439	CAC	2	6	177809	177814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305217
4046	NC_009439	CAG	2	6	177848	177853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305217
4047	NC_009439	GCT	2	6	177941	177946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305217
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4049	NC_009439	TCG	2	6	178011	178016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305217
4050	NC_009439	CCA	2	6	178018	178023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305217
4051	NC_009439	TGT	2	6	178060	178065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146305217
4052	NC_009439	TTG	2	6	178289	178294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146305218
4053	NC_009439	GCT	3	9	178312	178320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305218
4054	NC_009439	GCCA	2	8	178337	178344	25 %	0 %	25 %	50 %	146305218
4055	NC_009439	TGC	2	6	178345	178350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305218
4056	NC_009439	ACGG	2	8	178352	178359	25 %	0 %	50 %	25 %	146305218
4057	NC_009439	AGG	2	6	178389	178394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146305218
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4059	NC_009439	GAG	2	6	178520	178525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146305218
4060	NC_009439	GCC	2	6	178580	178585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305218
4061	NC_009439	CCG	2	6	178587	178592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305218
4062	NC_009439	GCC	2	6	178600	178605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305218
4063	NC_009439	GGA	2	6	178624	178629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146305218
4064	NC_009439	GGC	2	6	178639	178644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305218
4065	NC_009439	GCT	2	6	178660	178665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305218
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4068	NC_009439	CGC	2	6	178777	178782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305218
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4073	NC_009439	CAG	2	6	179092	179097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305218
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4082	NC_009439	TGCG	2	8	179573	179580	0 %	25 %	50 %	25 %	146305219
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4101	NC_009439	CTGG	2	8	181276	181283	0 %	25 %	50 %	25 %	146305220
4102	NC_009439	CTT	2	6	181302	181307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146305220
4103	NC_009439	CTACGT	2	12	181308	181319	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146305220
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4105	NC_009439	CAAG	2	8	181383	181390	50 %	0 %	25 %	25 %	146305220
4106	NC_009439	GTG	2	6	181399	181404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305220
4107	NC_009439	ACCG	2	8	181667	181674	25 %	0 %	25 %	50 %	146305221
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4120	NC_009439	TCA	2	6	182162	182167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305221
4121	NC_009439	GAG	2	6	182356	182361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146305221
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4123	NC_009439	GCT	2	6	182544	182549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305221
4124	NC_009439	GGC	2	6	182551	182556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305221
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4134	NC_009439	TGG	2	6	182837	182842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305221
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4152	NC_009439	TGA	2	6	183863	183868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305221
4153	NC_009439	TCG	2	6	183913	183918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305221
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4157	NC_009439	CTG	2	6	184045	184050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305222
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4161	NC_009439	GCC	3	9	184189	184197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305222
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4193	NC_009439	CTG	3	9	185524	185532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305222
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4200	NC_009439	CGC	2	6	186013	186018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305223
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4223	NC_009439	CGCC	2	8	186908	186915	0 %	0 %	25 %	75 %	146305224
4224	NC_009439	CGG	2	6	186922	186927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305224
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4227	NC_009439	TG	3	6	187027	187032	0 %	50 %	50 %	0 %	146305224
4228	NC_009439	AAG	2	6	187033	187038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305224
4229	NC_009439	CGC	2	6	187045	187050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305224
4230	NC_009439	AGG	2	6	187102	187107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146305224
4231	NC_009439	ATG	2	6	187218	187223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305224
4232	NC_009439	GCGCT	2	10	187266	187275	0 %	20 %	40 %	40 %	146305224
4233	NC_009439	CG	3	6	187298	187303	0 %	0 %	50 %	50 %	146305224
4234	NC_009439	TGG	3	9	187561	187569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305225
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4237	NC_009439	GCT	2	6	187739	187744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305225
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4360	NC_009439	GC	3	6	192446	192451	0 %	0 %	50 %	50 %	146305230
4361	NC_009439	TGC	2	6	192515	192520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305230
4362	NC_009439	CCA	2	6	192572	192577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305230
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4364	NC_009439	GCT	2	6	192681	192686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305230
4365	NC_009439	GCA	2	6	192687	192692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305230
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4367	NC_009439	CCG	2	6	192758	192763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305230
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4401	NC_009439	AGCA	2	8	194111	194118	50 %	0 %	25 %	25 %	146305232
4402	NC_009439	GA	3	6	194150	194155	50 %	0 %	50 %	0 %	146305232
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4469	NC_009439	GGCA	2	8	196529	196536	25 %	0 %	50 %	25 %	146305236
4470	NC_009439	TCG	2	6	196550	196555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305236
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4472	NC_009439	TGCA	2	8	196613	196620	25 %	25 %	25 %	25 %	146305236
4473	NC_009439	GAA	2	6	196630	196635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305236
4474	NC_009439	GCC	2	6	196636	196641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305236
4475	NC_009439	GAT	2	6	196651	196656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305236
4476	NC_009439	GGC	2	6	196689	196694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305236
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4478	NC_009439	GCT	2	6	196786	196791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305236
4479	NC_009439	GGCG	2	8	196797	196804	0 %	0 %	75 %	25 %	146305236
4480	NC_009439	CGA	2	6	196827	196832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305236
4481	NC_009439	CAG	2	6	196864	196869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305236
4482	NC_009439	CCAG	2	8	196872	196879	25 %	0 %	25 %	50 %	146305236
4483	NC_009439	CGG	2	6	196889	196894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305236
4484	NC_009439	CGG	2	6	196915	196920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305236
4485	NC_009439	CCT	2	6	196938	196943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146305236
4486	NC_009439	GTC	2	6	196957	196962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305236
4487	NC_009439	CGG	2	6	196969	196974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305236
4488	NC_009439	CGCGG	2	10	197007	197016	0 %	0 %	60 %	40 %	146305236
4489	NC_009439	GAT	2	6	197026	197031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305236
4490	NC_009439	CTG	2	6	197077	197082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305236
4491	NC_009439	CAC	2	6	197101	197106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305236
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