MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas mendocina ymp chromosome

Total Repeats: 113949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009439	GGC	2	6	236448	236453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305271
5502	NC_009439	CTG	2	6	236499	236504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305271
5503	NC_009439	TCG	3	9	236608	236616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305271
5504	NC_009439	TGC	2	6	236626	236631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305271
5505	NC_009439	GCT	2	6	237766	237771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305272
5506	NC_009439	AAC	2	6	237836	237841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305272
5507	NC_009439	ATC	2	6	237857	237862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305272
5508	NC_009439	GCC	2	6	237911	237916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305272
5509	NC_009439	GC	3	6	237958	237963	0 %	0 %	50 %	50 %	146305272
5510	NC_009439	CAA	2	6	237964	237969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305272
5511	NC_009439	TGA	2	6	238023	238028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305272
5512	NC_009439	GCC	2	6	238079	238084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305272
5513	NC_009439	GAA	2	6	238106	238111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305272
5514	NC_009439	CCA	2	6	238144	238149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305272
5515	NC_009439	AGC	2	6	238176	238181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305272
5516	NC_009439	CCG	2	6	238194	238199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305272
5517	NC_009439	GAT	2	6	238228	238233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305272
5518	NC_009439	GGCC	2	8	238243	238250	0 %	0 %	50 %	50 %	146305272
5519	NC_009439	GCC	2	6	238259	238264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305272
5520	NC_009439	GCCCTG	2	12	238310	238321	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	146305272
5521	NC_009439	GC	3	6	238336	238341	0 %	0 %	50 %	50 %	146305272
5522	NC_009439	GTC	2	6	238458	238463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305272
5523	NC_009439	AAG	2	6	238493	238498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305272
5524	NC_009439	GGC	2	6	238514	238519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305272
5525	NC_009439	TGA	2	6	238540	238545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305272
5526	NC_009439	GC	3	6	238572	238577	0 %	0 %	50 %	50 %	146305272
5527	NC_009439	CAA	2	6	238594	238599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305272
5528	NC_009439	CGC	2	6	238675	238680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305272
5529	NC_009439	GGA	2	6	238711	238716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146305272
5530	NC_009439	CAC	3	9	238720	238728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305272
5531	NC_009439	CGA	2	6	238741	238746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305272
5532	NC_009439	GGC	2	6	238814	238819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305272
5533	NC_009439	CTT	2	6	238843	238848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146305272
5534	NC_009439	TGG	2	6	238863	238868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305272
5535	NC_009439	TGG	2	6	239055	239060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305272
5536	NC_009439	CGG	2	6	239101	239106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305272
5537	NC_009439	GGC	2	6	239186	239191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305272
5538	NC_009439	CTG	2	6	239358	239363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305273
5539	NC_009439	GCC	3	9	239373	239381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305273
5540	NC_009439	CG	3	6	239386	239391	0 %	0 %	50 %	50 %	146305273
5541	NC_009439	TCG	2	6	239413	239418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305273
5542	NC_009439	GC	3	6	239423	239428	0 %	0 %	50 %	50 %	146305273
5543	NC_009439	CGG	2	6	239480	239485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305273
5544	NC_009439	GGT	2	6	239522	239527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305273
5545	NC_009439	CGC	2	6	239528	239533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305273
5546	NC_009439	AAG	2	6	239646	239651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305273
5547	NC_009439	CTG	2	6	239655	239660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305273
5548	NC_009439	CGC	2	6	239708	239713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305273
5549	NC_009439	ATG	2	6	239766	239771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305273
5550	NC_009439	GGT	2	6	239792	239797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305273
5551	NC_009439	CCG	2	6	239806	239811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305273
5552	NC_009439	ACG	2	6	239917	239922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305273
5553	NC_009439	CGC	2	6	239939	239944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305273
5554	NC_009439	ATC	3	9	239946	239954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305273
5555	NC_009439	AGGGCG	2	12	239965	239976	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	146305273
5556	NC_009439	GC	4	8	240014	240021	0 %	0 %	50 %	50 %	146305273
5557	NC_009439	TCC	2	6	240040	240045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146305273
5558	NC_009439	CTT	2	6	240089	240094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146305273
5559	NC_009439	GTG	2	6	240114	240119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305273
5560	NC_009439	ACC	2	6	240129	240134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305273
5561	NC_009439	CGG	3	9	240149	240157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305273
5562	NC_009439	GGC	2	6	240222	240227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305273
5563	NC_009439	CGA	2	6	240284	240289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305273
5564	NC_009439	CTG	2	6	240297	240302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305273
5565	NC_009439	GGCC	2	8	240335	240342	0 %	0 %	50 %	50 %	146305273
5566	NC_009439	ACGT	2	8	240379	240386	25 %	25 %	25 %	25 %	146305273
5567	NC_009439	GGC	2	6	240423	240428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305273
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5569	NC_009439	TGG	2	6	240454	240459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305273
5570	NC_009439	TCG	2	6	240466	240471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305273
5571	NC_009439	GC	3	6	240477	240482	0 %	0 %	50 %	50 %	146305273
5572	NC_009439	CTG	2	6	240498	240503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305273
5573	NC_009439	CTA	2	6	240515	240520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305273
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5580	NC_009439	GA	3	6	241096	241101	50 %	0 %	50 %	0 %	146305274
5581	NC_009439	GGC	2	6	241177	241182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305274
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5587	NC_009439	GAA	2	6	241351	241356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305274
5588	NC_009439	TAC	2	6	241364	241369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305274
5589	NC_009439	ACGG	2	8	241400	241407	25 %	0 %	50 %	25 %	146305274
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5592	NC_009439	CGC	2	6	241659	241664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305274
5593	NC_009439	CGCGGC	2	12	241669	241680	0 %	0 %	50 %	50 %	146305274
5594	NC_009439	GCA	2	6	241711	241716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305274
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5601	NC_009439	CTG	2	6	241937	241942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305274
5602	NC_009439	AGCC	2	8	241943	241950	25 %	0 %	25 %	50 %	146305274
5603	NC_009439	CGG	2	6	241996	242001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305274
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5605	NC_009439	CGGCG	2	10	242116	242125	0 %	0 %	60 %	40 %	146305274
5606	NC_009439	GCG	2	6	242129	242134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305274
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5621	NC_009439	GCC	3	9	243103	243111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305275
5622	NC_009439	CGTGG	2	10	243118	243127	0 %	20 %	60 %	20 %	146305275
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5733	NC_009439	CTGATC	2	12	247723	247734	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146305279
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5982	NC_009439	TGC	2	6	259194	259199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305291
5983	NC_009439	CGG	2	6	259201	259206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305291
5984	NC_009439	CTT	2	6	259207	259212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146305291
5985	NC_009439	GCC	2	6	259236	259241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305291
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5990	NC_009439	GCG	2	6	259431	259436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305291
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5994	NC_009439	CTG	3	9	259496	259504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305291
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