MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514 chromosome

Total Repeats: 1171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009376	TAGCC	2	10	5855	5864	20 %	20 %	20 %	40 %	145590275
2	NC_009376	GAGAC	2	10	6111	6120	40 %	0 %	40 %	20 %	145590275
3	NC_009376	ATAAA	2	10	12272	12281	80 %	20 %	0 %	0 %	145590283
4	NC_009376	CTCTC	2	10	16384	16393	0 %	40 %	0 %	60 %	145590290
5	NC_009376	AAAGT	2	10	17149	17158	60 %	20 %	20 %	0 %	145590291
6	NC_009376	TGGCT	2	10	18504	18513	0 %	40 %	40 %	20 %	145590292
7	NC_009376	GGAGA	2	10	19092	19101	40 %	0 %	60 %	0 %	145590292
8	NC_009376	TACCC	2	10	20341	20350	20 %	20 %	0 %	60 %	145590293
9	NC_009376	CAAGG	2	10	20405	20414	40 %	0 %	40 %	20 %	145590293
10	NC_009376	CAAGA	2	10	20481	20490	60 %	0 %	20 %	20 %	145590293
11	NC_009376	CGAGG	2	10	22549	22558	20 %	0 %	60 %	20 %	145590296
12	NC_009376	GAGAA	2	10	26557	26566	60 %	0 %	40 %	0 %	145590299
13	NC_009376	TTGGG	2	10	27099	27108	0 %	40 %	60 %	0 %	145590300
14	NC_009376	AAGAG	2	10	27794	27803	60 %	0 %	40 %	0 %	145590300
15	NC_009376	TTAAG	2	10	29377	29386	40 %	40 %	20 %	0 %	145590302
16	NC_009376	CTTTC	2	10	29470	29479	0 %	60 %	0 %	40 %	145590302
17	NC_009376	GTGGA	2	10	30015	30024	20 %	20 %	60 %	0 %	145590303
18	NC_009376	AGCGA	2	10	30705	30714	40 %	0 %	40 %	20 %	145590303
19	NC_009376	TAATT	2	10	34981	34990	40 %	60 %	0 %	0 %	145590313
20	NC_009376	CGGCG	2	10	35059	35068	0 %	0 %	60 %	40 %	145590313
21	NC_009376	CTGCG	2	10	39518	39527	0 %	20 %	40 %	40 %	145590318
22	NC_009376	GGACG	2	10	42789	42798	20 %	0 %	60 %	20 %	145590323
23	NC_009376	CAGAG	2	10	44170	44179	40 %	0 %	40 %	20 %	145590324
24	NC_009376	TGTGG	2	10	48398	48407	0 %	40 %	60 %	0 %	145590329
25	NC_009376	ACTTT	2	10	48778	48787	20 %	60 %	0 %	20 %	145590330
26	NC_009376	TGTAG	2	10	49375	49384	20 %	40 %	40 %	0 %	145590330
27	NC_009376	ATCCT	2	10	50564	50573	20 %	40 %	0 %	40 %	145590331
28	NC_009376	CCACG	2	10	58518	58527	20 %	0 %	20 %	60 %	145590335
29	NC_009376	TAGAA	2	10	60971	60980	60 %	20 %	20 %	0 %	145590336
30	NC_009376	AGACC	2	10	61537	61546	40 %	0 %	20 %	40 %	145590337
31	NC_009376	TACGT	2	10	61831	61840	20 %	40 %	20 %	20 %	145590337
32	NC_009376	TAACC	2	10	63381	63390	40 %	20 %	0 %	40 %	145590337
33	NC_009376	AACGT	2	10	64081	64090	40 %	20 %	20 %	20 %	145590337
34	NC_009376	GCCTC	2	10	64220	64229	0 %	20 %	20 %	60 %	145590337
35	NC_009376	TGTGG	2	10	64509	64518	0 %	40 %	60 %	0 %	145590337
36	NC_009376	GAGTT	2	10	65687	65696	20 %	40 %	40 %	0 %	145590337
37	NC_009376	GCAAG	2	10	67812	67821	40 %	0 %	40 %	20 %	145590337
38	NC_009376	TATTC	2	10	69360	69369	20 %	60 %	0 %	20 %	145590338
39	NC_009376	GCCTC	2	10	70175	70184	0 %	20 %	20 %	60 %	145590339
40	NC_009376	AGGCG	2	10	71298	71307	20 %	0 %	60 %	20 %	145590341
41	NC_009376	GCTGG	2	10	74621	74630	0 %	20 %	60 %	20 %	145590345
42	NC_009376	AGAAA	2	10	76444	76453	80 %	0 %	20 %	0 %	145590347
43	NC_009376	GCATT	2	10	78941	78950	20 %	40 %	20 %	20 %	145590350
44	NC_009376	GCCTC	2	10	80225	80234	0 %	20 %	20 %	60 %	145590351
45	NC_009376	GCTGG	2	10	81295	81304	0 %	20 %	60 %	20 %	145590353
46	NC_009376	GGTGG	2	10	82607	82616	0 %	20 %	80 %	0 %	145590355
47	NC_009376	CAGGA	2	10	85088	85097	40 %	0 %	40 %	20 %	145590359
48	NC_009376	AGGCG	2	10	87283	87292	20 %	0 %	60 %	20 %	145590362
49	NC_009376	TGTGG	2	10	91235	91244	0 %	40 %	60 %	0 %	145590369
50	NC_009376	AGAGA	2	10	92382	92391	60 %	0 %	40 %	0 %	145590370
51	NC_009376	GAGGC	2	10	92911	92920	20 %	0 %	60 %	20 %	145590370
52	NC_009376	AAGCT	2	10	95384	95393	40 %	20 %	20 %	20 %	145590374
53	NC_009376	CCGCG	2	10	96098	96107	0 %	0 %	40 %	60 %	145590375
54	NC_009376	ATCGC	2	10	96945	96954	20 %	20 %	20 %	40 %	145590376
55	NC_009376	CTCGC	2	10	97035	97044	0 %	20 %	20 %	60 %	145590376
56	NC_009376	GAACA	2	10	100944	100953	60 %	0 %	20 %	20 %	145590378
57	NC_009376	CGTGG	2	10	104995	105004	0 %	20 %	60 %	20 %	145590383
58	NC_009376	GCTTA	2	10	105787	105796	20 %	40 %	20 %	20 %	145590384
59	NC_009376	TGGCG	2	10	106152	106161	0 %	20 %	60 %	20 %	145590384
60	NC_009376	CCGCT	2	10	107705	107714	0 %	20 %	20 %	60 %	145590384
61	NC_009376	TCGTC	2	10	109042	109051	0 %	40 %	20 %	40 %	145590386
62	NC_009376	TTCTC	2	10	109075	109084	0 %	60 %	0 %	40 %	145590386
63	NC_009376	AGCCC	2	10	111025	111034	20 %	0 %	20 %	60 %	145590388
64	NC_009376	CGTGG	2	10	113537	113546	0 %	20 %	60 %	20 %	145590392
65	NC_009376	TTAGA	2	10	116999	117008	40 %	40 %	20 %	0 %	145590394
66	NC_009376	CTGGC	2	10	117131	117140	0 %	20 %	40 %	40 %	145590394
67	NC_009376	AGGGG	2	10	119460	119469	20 %	0 %	80 %	0 %	145590397
68	NC_009376	TCCAC	2	10	119935	119944	20 %	20 %	0 %	60 %	145590398
69	NC_009376	CACCT	2	10	120060	120069	20 %	20 %	0 %	60 %	145590398
70	NC_009376	GGGGA	2	10	120538	120547	20 %	0 %	80 %	0 %	145590398
71	NC_009376	CAGCC	2	10	120785	120794	20 %	0 %	20 %	60 %	145590398
72	NC_009376	TACCC	2	10	122742	122751	20 %	20 %	0 %	60 %	145590399
73	NC_009376	CCTCG	2	10	123510	123519	0 %	20 %	20 %	60 %	145590400
74	NC_009376	TCAGC	2	10	127014	127023	20 %	20 %	20 %	40 %	145590403
75	NC_009376	GAGAA	2	10	127924	127933	60 %	0 %	40 %	0 %	145590404
76	NC_009376	TGTCT	2	10	130715	130724	0 %	60 %	20 %	20 %	145590406
77	NC_009376	GGGCT	2	10	133291	133300	0 %	20 %	60 %	20 %	145590409
78	NC_009376	GGCGA	2	10	133945	133954	20 %	0 %	60 %	20 %	145590409
79	NC_009376	CGCGG	2	10	138572	138581	0 %	0 %	60 %	40 %	145590412
80	NC_009376	GGGCG	2	10	139353	139362	0 %	0 %	80 %	20 %	145590414
81	NC_009376	TCTGG	2	10	140027	140036	0 %	40 %	40 %	20 %	145590414
82	NC_009376	AGGCG	2	10	141266	141275	20 %	0 %	60 %	20 %	145590416
83	NC_009376	CCCCA	2	10	145800	145809	20 %	0 %	0 %	80 %	145590424
84	NC_009376	CCTCG	2	10	147716	147725	0 %	20 %	20 %	60 %	145590426
85	NC_009376	CCCTA	2	10	148084	148093	20 %	20 %	0 %	60 %	145590426
86	NC_009376	CCTCC	2	10	154151	154160	0 %	20 %	0 %	80 %	145590433
87	NC_009376	GGCGG	2	10	154904	154913	0 %	0 %	80 %	20 %	145590435
88	NC_009376	TCCCT	2	10	155706	155715	0 %	40 %	0 %	60 %	145590436
89	NC_009376	GGCTG	2	10	156800	156809	0 %	20 %	60 %	20 %	145590437
90	NC_009376	AGAGG	2	10	156826	156835	40 %	0 %	60 %	0 %	145590437
91	NC_009376	TGAAG	2	10	158730	158739	40 %	20 %	40 %	0 %	145590439
92	NC_009376	GCGAG	2	10	159677	159686	20 %	0 %	60 %	20 %	145590441
93	NC_009376	ACCTC	2	10	161348	161357	20 %	20 %	0 %	60 %	145590442
94	NC_009376	GCTCT	2	10	161969	161978	0 %	40 %	20 %	40 %	145590443
95	NC_009376	TGGCG	2	10	163061	163070	0 %	20 %	60 %	20 %	145590445
96	NC_009376	GACTT	2	10	167458	167467	20 %	40 %	20 %	20 %	145590451
97	NC_009376	CGTCT	2	10	167744	167753	0 %	40 %	20 %	40 %	145590452
98	NC_009376	CCCCT	2	10	168112	168121	0 %	20 %	0 %	80 %	145590452
99	NC_009376	AGCCC	2	10	168326	168335	20 %	0 %	20 %	60 %	145590452
100	NC_009376	GGAGA	2	10	175287	175296	40 %	0 %	60 %	0 %	145590461
101	NC_009376	CAAGT	2	10	176962	176971	40 %	20 %	20 %	20 %	145590462
102	NC_009376	GAGAC	2	10	180356	180365	40 %	0 %	40 %	20 %	145590465
103	NC_009376	GGGGA	2	10	180377	180386	20 %	0 %	80 %	0 %	145590465
104	NC_009376	GCCCA	2	10	183962	183971	20 %	0 %	20 %	60 %	145590468
105	NC_009376	GAGGC	2	10	189368	189377	20 %	0 %	60 %	20 %	145590473
106	NC_009376	GTGGG	2	10	190988	190997	0 %	20 %	80 %	0 %	145590476
107	NC_009376	CAGCC	2	10	191918	191927	20 %	0 %	20 %	60 %	145590477
108	NC_009376	GCGCC	2	10	192297	192306	0 %	0 %	40 %	60 %	145590477
109	NC_009376	TGTGG	2	10	192399	192408	0 %	40 %	60 %	0 %	145590478
110	NC_009376	CTTCT	2	10	192472	192481	0 %	60 %	0 %	40 %	145590478
111	NC_009376	GCAGT	2	10	193550	193559	20 %	20 %	40 %	20 %	145590479
112	NC_009376	GCCTC	2	10	195336	195345	0 %	20 %	20 %	60 %	145590481
113	NC_009376	GGCGG	2	10	196494	196503	0 %	0 %	80 %	20 %	145590482
114	NC_009376	GGCCC	2	10	201300	201309	0 %	0 %	40 %	60 %	145590489
115	NC_009376	CTCCG	2	10	202406	202415	0 %	20 %	20 %	60 %	145590489
116	NC_009376	TCAGC	2	10	205060	205069	20 %	20 %	20 %	40 %	145590492
117	NC_009376	CAGCC	2	10	207348	207357	20 %	0 %	20 %	60 %	145590495
118	NC_009376	TGTTC	2	10	207511	207520	0 %	60 %	20 %	20 %	145590495
119	NC_009376	GGGCC	2	10	207936	207945	0 %	0 %	60 %	40 %	145590495
120	NC_009376	GGGAT	2	10	208118	208127	20 %	20 %	60 %	0 %	145590496
121	NC_009376	GCCTG	2	10	209370	209379	0 %	20 %	40 %	40 %	145590498
122	NC_009376	GGAGG	2	10	210094	210103	20 %	0 %	80 %	0 %	145590499
123	NC_009376	GGGGT	2	10	210760	210769	0 %	20 %	80 %	0 %	145590500
124	NC_009376	GAGGC	2	10	213583	213592	20 %	0 %	60 %	20 %	145590503
125	NC_009376	CGAGG	2	10	213609	213618	20 %	0 %	60 %	20 %	145590503
126	NC_009376	CCTCG	2	10	214134	214143	0 %	20 %	20 %	60 %	145590504
127	NC_009376	TACTC	2	10	214440	214449	20 %	40 %	0 %	40 %	145590504
128	NC_009376	GCCCA	2	10	216299	216308	20 %	0 %	20 %	60 %	145590507
129	NC_009376	GAGAG	2	10	217688	217697	40 %	0 %	60 %	0 %	145590508
130	NC_009376	GACGC	2	10	219297	219306	20 %	0 %	40 %	40 %	145590510
131	NC_009376	ACCTC	2	10	219531	219540	20 %	20 %	0 %	60 %	145590511
132	NC_009376	GCACC	2	10	220161	220170	20 %	0 %	20 %	60 %	145590512
133	NC_009376	AGGAG	2	10	221279	221288	40 %	0 %	60 %	0 %	145590514
134	NC_009376	GGGCG	2	10	227391	227400	0 %	0 %	80 %	20 %	145590520
135	NC_009376	GCTGA	2	10	229750	229759	20 %	20 %	40 %	20 %	145590522
136	NC_009376	TGGGT	2	10	230891	230900	0 %	40 %	60 %	0 %	145590522
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138	NC_009376	CCCCT	2	10	232425	232434	0 %	20 %	0 %	80 %	145590523
139	NC_009376	GGTGC	2	10	232463	232472	0 %	20 %	60 %	20 %	145590523
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176	NC_009376	CGAGG	2	10	293179	293188	20 %	0 %	60 %	20 %	145590600
177	NC_009376	CTCAG	2	10	294176	294185	20 %	20 %	20 %	40 %	145590601
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249	NC_009376	GGCGA	2	10	439366	439375	20 %	0 %	60 %	20 %	145590736
250	NC_009376	GAGGG	2	10	439814	439823	20 %	0 %	80 %	0 %	145590737
251	NC_009376	CTGAG	2	10	440052	440061	20 %	20 %	40 %	20 %	145590737
252	NC_009376	ACAGC	2	10	440494	440503	40 %	0 %	20 %	40 %	145590737
253	NC_009376	CCTCC	2	10	443133	443142	0 %	20 %	0 %	80 %	145590740
254	NC_009376	GCAAC	2	10	444071	444080	40 %	0 %	20 %	40 %	145590742
255	NC_009376	GTCGC	2	10	444520	444529	0 %	20 %	40 %	40 %	145590742
256	NC_009376	AGGCC	2	10	444657	444666	20 %	0 %	40 %	40 %	145590742
257	NC_009376	CAGCT	2	10	446306	446315	20 %	20 %	20 %	40 %	145590744
258	NC_009376	TGTTA	2	10	452221	452230	20 %	60 %	20 %	0 %	145590747
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260	NC_009376	GGCTA	2	10	453842	453851	20 %	20 %	40 %	20 %	145590747
261	NC_009376	CTCCC	2	10	456177	456186	0 %	20 %	0 %	80 %	145590749
262	NC_009376	TGGGC	2	10	459422	459431	0 %	20 %	60 %	20 %	145590754
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