MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP04

Total Repeats: 1604

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008760	GAT	2	6	271	276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583344
2	NC_008760	CTC	2	6	302	307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583344
3	NC_008760	GCT	2	6	325	330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583344
4	NC_008760	GCG	2	6	339	344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583344
5	NC_008760	CGT	2	6	499	504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583344
6	NC_008760	GCC	2	6	509	514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583344
7	NC_008760	CTG	2	6	548	553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583344
8	NC_008760	CAA	2	6	691	696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583344
9	NC_008760	AGC	2	6	702	707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583344
10	NC_008760	GCC	2	6	713	718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583344
11	NC_008760	ACG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583344
12	NC_008760	GCT	2	6	817	822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583344
13	NC_008760	CGG	2	6	868	873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583344
14	NC_008760	CCG	2	6	1023	1028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583344
15	NC_008760	GTC	2	6	1043	1048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583344
16	NC_008760	GGC	2	6	1183	1188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583344
17	NC_008760	CCG	2	6	1289	1294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583345
18	NC_008760	TCG	2	6	1367	1372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583345
19	NC_008760	GGC	3	9	1392	1400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583345
20	NC_008760	TGA	2	6	1423	1428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583345
21	NC_008760	GCC	2	6	1659	1664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583346
22	NC_008760	CCG	2	6	2119	2124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583346
23	NC_008760	GGT	2	6	2273	2278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583346
24	NC_008760	GCG	2	6	2389	2394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583346
25	NC_008760	TCC	2	6	2424	2429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583346
26	NC_008760	CTG	2	6	2441	2446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583346
27	NC_008760	GGC	2	6	2480	2485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583346
28	NC_008760	ATA	2	6	2565	2570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121583346
29	NC_008760	CTT	2	6	2723	2728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583347
30	NC_008760	AGA	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583347
31	NC_008760	GCC	2	6	2901	2906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583347
32	NC_008760	GGC	2	6	2907	2912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583347
33	NC_008760	CTG	2	6	2928	2933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583347
34	NC_008760	CCG	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583347
35	NC_008760	GCT	2	6	2984	2989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583347
36	NC_008760	GGC	2	6	3039	3044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583347
37	NC_008760	GCA	2	6	3083	3088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583347
38	NC_008760	GGT	2	6	3305	3310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583347
39	NC_008760	TGC	2	6	3341	3346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583347
40	NC_008760	CCG	3	9	3355	3363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583347
41	NC_008760	TCG	2	6	3385	3390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583347
42	NC_008760	CTG	2	6	3411	3416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583347
43	NC_008760	GCC	2	6	3429	3434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583347
44	NC_008760	TCG	2	6	3457	3462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583347
45	NC_008760	GGC	2	6	3522	3527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583347
46	NC_008760	GGC	2	6	3534	3539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583347
47	NC_008760	GGC	2	6	3743	3748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583347
48	NC_008760	GGT	2	6	3752	3757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583347
49	NC_008760	GCC	3	9	3858	3866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583347
50	NC_008760	AGC	2	6	3928	3933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583347
51	NC_008760	GAC	2	6	3971	3976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583347
52	NC_008760	CGG	2	6	3977	3982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583347
53	NC_008760	CTT	2	6	4036	4041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583347
54	NC_008760	CCG	3	9	4102	4110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583348
55	NC_008760	GCC	2	6	4161	4166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583348
56	NC_008760	TGG	2	6	4225	4230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583348
57	NC_008760	GCC	2	6	4231	4236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583348
58	NC_008760	CAT	2	6	4307	4312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583348
59	NC_008760	ACG	2	6	4374	4379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583348
60	NC_008760	CTG	2	6	4455	4460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583348
61	NC_008760	CAA	2	6	4481	4486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583348
62	NC_008760	TCG	2	6	4498	4503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583348
63	NC_008760	CCG	2	6	4504	4509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583348
64	NC_008760	CAC	2	6	4556	4561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583348
65	NC_008760	CAC	2	6	4592	4597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583348
66	NC_008760	GCC	2	6	4695	4700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583348
67	NC_008760	CAC	2	6	4742	4747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583348
68	NC_008760	GCT	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583348
69	NC_008760	TCG	2	6	4831	4836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583348
70	NC_008760	CGC	2	6	4837	4842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583348
71	NC_008760	GCC	2	6	4850	4855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583348
72	NC_008760	GGC	2	6	6424	6429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583349
73	NC_008760	CGG	2	6	6439	6444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583349
74	NC_008760	CTG	2	6	6455	6460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583349
75	NC_008760	CTG	2	6	6506	6511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583349
76	NC_008760	ACC	2	6	6512	6517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583349
77	NC_008760	TGG	2	6	6567	6572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583349
78	NC_008760	CGG	2	6	6700	6705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583349
79	NC_008760	CTC	2	6	6706	6711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583349
80	NC_008760	GGC	2	6	6713	6718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583349
81	NC_008760	TGC	2	6	6744	6749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583349
82	NC_008760	CGG	2	6	6772	6777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583349
83	NC_008760	GCC	2	6	6794	6799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583349
84	NC_008760	GCG	2	6	6804	6809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583349
85	NC_008760	GTG	2	6	6836	6841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583349
86	NC_008760	GTC	2	6	6881	6886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583349
87	NC_008760	CGC	2	6	7099	7104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583349
88	NC_008760	CAC	2	6	7160	7165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583349
89	NC_008760	TCG	2	6	7194	7199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583349
90	NC_008760	GCC	2	6	7274	7279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583349
91	NC_008760	GGC	2	6	7342	7347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583349
92	NC_008760	CAT	2	6	7363	7368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583349
93	NC_008760	CAC	2	6	7378	7383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583349
94	NC_008760	AGC	2	6	7437	7442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583349
95	NC_008760	ACT	2	6	7449	7454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583349
96	NC_008760	CAC	2	6	7480	7485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583349
97	NC_008760	TCG	2	6	7557	7562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583349
98	NC_008760	GCG	2	6	7639	7644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583349
99	NC_008760	GGC	2	6	7741	7746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583349
100	NC_008760	GTG	2	6	8242	8247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583350
101	NC_008760	CGA	2	6	8274	8279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583350
102	NC_008760	AGC	2	6	8355	8360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583350
103	NC_008760	ACC	2	6	8444	8449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583350
104	NC_008760	TTG	2	6	8786	8791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583351
105	NC_008760	TCG	2	6	8847	8852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583351
106	NC_008760	ATC	2	6	8854	8859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583351
107	NC_008760	TCT	2	6	8889	8894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583351
108	NC_008760	CTT	2	6	8911	8916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583351
109	NC_008760	ACG	2	6	8931	8936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583351
110	NC_008760	CCT	2	6	9004	9009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583352
111	NC_008760	GCC	2	6	9123	9128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583352
112	NC_008760	TGT	2	6	9503	9508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583353
113	NC_008760	TCT	2	6	9543	9548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583353
114	NC_008760	GGT	2	6	9600	9605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583353
115	NC_008760	TCA	2	6	9648	9653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583353
116	NC_008760	AGC	2	6	9669	9674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583353
117	NC_008760	GCC	2	6	10009	10014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583353
118	NC_008760	CAA	2	6	10325	10330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583354
119	NC_008760	TCG	2	6	10554	10559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583354
120	NC_008760	CAT	2	6	10630	10635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583354
121	NC_008760	GAA	2	6	10663	10668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583354
122	NC_008760	TCA	2	6	10783	10788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583354
123	NC_008760	AGC	2	6	11212	11217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583355
124	NC_008760	TCA	2	6	11299	11304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583355
125	NC_008760	TGA	2	6	11417	11422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583355
126	NC_008760	CTT	2	6	11528	11533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583355
127	NC_008760	GCG	2	6	11566	11571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583355
128	NC_008760	CGC	2	6	11606	11611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583355
129	NC_008760	CAC	2	6	11620	11625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583355
130	NC_008760	CAG	2	6	11691	11696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583355
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