MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP02

Total Repeats: 3101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008758	CGG	2	6	65123	65128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583070
1002	NC_008758	GCT	2	6	65130	65135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583070
1003	NC_008758	CGG	2	6	65361	65366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583070
1004	NC_008758	CGC	2	6	65397	65402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583070
1005	NC_008758	GCC	2	6	65471	65476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583070
1006	NC_008758	CGC	2	6	65505	65510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583070
1007	NC_008758	ATC	2	6	65526	65531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583070
1008	NC_008758	GAC	2	6	65534	65539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583070
1009	NC_008758	CCT	2	6	65552	65557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583071
1010	NC_008758	TGG	2	6	65574	65579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583071
1011	NC_008758	GCT	2	6	65630	65635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583071
1012	NC_008758	CA	3	6	65656	65661	50 %	0 %	0 %	50 %	121583071
1013	NC_008758	CAC	2	6	65690	65695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583071
1014	NC_008758	CGG	2	6	65783	65788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583071
1015	NC_008758	TGG	2	6	65797	65802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583071
1016	NC_008758	GTAC	2	8	65806	65813	25 %	25 %	25 %	25 %	121583071
1017	NC_008758	CG	3	6	65851	65856	0 %	0 %	50 %	50 %	121583071
1018	NC_008758	GGC	2	6	65952	65957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583071
1019	NC_008758	TCG	2	6	66028	66033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583071
1020	NC_008758	GC	3	6	66055	66060	0 %	0 %	50 %	50 %	121583071
1021	NC_008758	GC	3	6	66099	66104	0 %	0 %	50 %	50 %	121583071
1022	NC_008758	TGC	2	6	66115	66120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583071
1023	NC_008758	GC	3	6	66168	66173	0 %	0 %	50 %	50 %	121583071
1024	NC_008758	GGA	2	6	66182	66187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583071
1025	NC_008758	TGC	2	6	66199	66204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583071
1026	NC_008758	CGA	2	6	66239	66244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583071
1027	NC_008758	CG	3	6	66320	66325	0 %	0 %	50 %	50 %	121583071
1028	NC_008758	GAT	2	6	66368	66373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583071
1029	NC_008758	AGG	2	6	66409	66414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583071
1030	NC_008758	GGCG	2	8	66442	66449	0 %	0 %	75 %	25 %	121583071
1031	NC_008758	GAA	2	6	66561	66566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583071
1032	NC_008758	GCA	2	6	66570	66575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583071
1033	NC_008758	CACC	2	8	66580	66587	25 %	0 %	0 %	75 %	121583071
1034	NC_008758	CGG	2	6	66623	66628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583071
1035	NC_008758	GGC	2	6	66693	66698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583071
1036	NC_008758	CG	3	6	66715	66720	0 %	0 %	50 %	50 %	121583071
1037	NC_008758	CGGTG	2	10	66815	66824	0 %	20 %	60 %	20 %	121583071
1038	NC_008758	GGCT	2	8	66930	66937	0 %	25 %	50 %	25 %	121583071
1039	NC_008758	CTG	2	6	66948	66953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583071
1040	NC_008758	CAT	2	6	66998	67003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583071
1041	NC_008758	GCA	2	6	67109	67114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583071
1042	NC_008758	TGG	2	6	67159	67164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583071
1043	NC_008758	GTG	2	6	67182	67187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583071
1044	NC_008758	ATCT	2	8	67191	67198	25 %	50 %	0 %	25 %	121583071
1045	NC_008758	CTGC	2	8	67214	67221	0 %	25 %	25 %	50 %	121583071
1046	NC_008758	CTGC	2	8	67238	67245	0 %	25 %	25 %	50 %	121583071
1047	NC_008758	ATC	2	6	67269	67274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583071
1048	NC_008758	CAC	2	6	67323	67328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583071
1049	NC_008758	GCTG	2	8	67439	67446	0 %	25 %	50 %	25 %	121583071
1050	NC_008758	GCT	2	6	67454	67459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583071
1051	NC_008758	CATCCG	2	12	67478	67489	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	121583071
1052	NC_008758	CGT	2	6	67592	67597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583071
1053	NC_008758	CCG	2	6	67643	67648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583071
1054	NC_008758	GAA	2	6	67686	67691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583071
1055	NC_008758	ACG	2	6	67695	67700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583071
1056	NC_008758	TGG	2	6	67717	67722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583071
1057	NC_008758	AAC	2	6	67728	67733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583071
1058	NC_008758	GAC	2	6	67797	67802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583071
1059	NC_008758	TCG	3	9	67946	67954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583072
1060	NC_008758	TGG	2	6	67974	67979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583072
1061	NC_008758	TGC	2	6	67998	68003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583072
1062	NC_008758	GAA	2	6	68015	68020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583072
1063	NC_008758	GCAG	2	8	68035	68042	25 %	0 %	50 %	25 %	121583072
1064	NC_008758	GCGCA	2	10	68057	68066	20 %	0 %	40 %	40 %	121583072
1065	NC_008758	GCC	3	9	68133	68141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583072
1066	NC_008758	GCG	2	6	68180	68185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583072
1067	NC_008758	GCC	2	6	68209	68214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583072
1068	NC_008758	GCG	2	6	68234	68239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583072
1069	NC_008758	CG	3	6	68331	68336	0 %	0 %	50 %	50 %	121583072
1070	NC_008758	GC	4	8	68341	68348	0 %	0 %	50 %	50 %	121583072
1071	NC_008758	ATCG	2	8	68389	68396	25 %	25 %	25 %	25 %	121583072
1072	NC_008758	GCC	2	6	68419	68424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583072
1073	NC_008758	GTG	2	6	68429	68434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583072
1074	NC_008758	GGC	2	6	68519	68524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583072
1075	NC_008758	GCG	2	6	68544	68549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583072
1076	NC_008758	GATC	2	8	68620	68627	25 %	25 %	25 %	25 %	121583072
1077	NC_008758	GCG	2	6	68661	68666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583072
1078	NC_008758	GCG	2	6	68790	68795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583072
1079	NC_008758	CCT	2	6	68800	68805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583072
1080	NC_008758	GGT	2	6	68816	68821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583072
1081	NC_008758	CG	3	6	68844	68849	0 %	0 %	50 %	50 %	121583072
1082	NC_008758	GAA	3	9	68918	68926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583072
1083	NC_008758	AC	3	6	68999	69004	50 %	0 %	0 %	50 %	121583073
1084	NC_008758	CAG	2	6	69010	69015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583073
1085	NC_008758	GCGCC	2	10	69092	69101	0 %	0 %	40 %	60 %	121583073
1086	NC_008758	CCGA	2	8	69161	69168	25 %	0 %	25 %	50 %	121583073
1087	NC_008758	CTG	2	6	69217	69222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583073
1088	NC_008758	CGA	2	6	69249	69254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583073
1089	NC_008758	GCA	2	6	69278	69283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583073
1090	NC_008758	CAC	2	6	69330	69335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583073
1091	NC_008758	CCGG	2	8	69411	69418	0 %	0 %	50 %	50 %	121583073
1092	NC_008758	CAC	2	6	69436	69441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583073
1093	NC_008758	TCG	2	6	69452	69457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583073
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1095	NC_008758	ACG	2	6	69542	69547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583073
1096	NC_008758	GCT	2	6	69601	69606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583073
1097	NC_008758	TGGC	2	8	69621	69628	0 %	25 %	50 %	25 %	121583073
1098	NC_008758	GTGGCG	2	12	69634	69645	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	121583073
1099	NC_008758	GCG	2	6	69685	69690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583073
1100	NC_008758	GCAC	2	8	69728	69735	25 %	0 %	25 %	50 %	121583073
1101	NC_008758	CGC	2	6	69785	69790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583073
1102	NC_008758	AGC	2	6	69818	69823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583073
1103	NC_008758	TGGC	2	8	69828	69835	0 %	25 %	50 %	25 %	121583073
1104	NC_008758	CG	4	8	69894	69901	0 %	0 %	50 %	50 %	121583073
1105	NC_008758	GCA	2	6	69967	69972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583073
1106	NC_008758	TGCAG	2	10	69977	69986	20 %	20 %	40 %	20 %	121583073
1107	NC_008758	GCG	2	6	69992	69997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583073
1108	NC_008758	CTG	2	6	70037	70042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583073
1109	NC_008758	TGA	2	6	70082	70087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583073
1110	NC_008758	CGG	2	6	70119	70124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583073
1111	NC_008758	TCC	2	6	70182	70187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583073
1112	NC_008758	CGA	2	6	70200	70205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583073
1113	NC_008758	GCG	2	6	70223	70228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583073
1114	NC_008758	CTG	2	6	70238	70243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583073
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1118	NC_008758	AGC	2	6	70469	70474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583073
1119	NC_008758	GC	3	6	70485	70490	0 %	0 %	50 %	50 %	121583073
1120	NC_008758	AGG	2	6	70601	70606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583073
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1123	NC_008758	GCC	3	9	70741	70749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583073
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1363	NC_008758	GC	3	6	83652	83657	0 %	0 %	50 %	50 %	121583087
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1365	NC_008758	CTCG	2	8	83717	83724	0 %	25 %	25 %	50 %	121583087
1366	NC_008758	CGG	2	6	83876	83881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583087
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1372	NC_008758	CGG	2	6	84191	84196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583087
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1497	NC_008758	AT	3	6	90854	90859	50 %	50 %	0 %	0 %	121583094
1498	NC_008758	GATT	2	8	90866	90873	25 %	50 %	25 %	0 %	121583094
1499	NC_008758	CGG	2	6	90947	90952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583094
1500	NC_008758	GGC	2	6	91008	91013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583094

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