MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP02

Total Repeats: 3101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008758	TTA	2	6	31672	31677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121583047
502	NC_008758	ATC	2	6	31757	31762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583047
503	NC_008758	GCA	2	6	31933	31938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583047
504	NC_008758	CGCTG	2	10	31954	31963	0 %	20 %	40 %	40 %	121583047
505	NC_008758	AGT	2	6	31979	31984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583047
506	NC_008758	TGGC	2	8	32021	32028	0 %	25 %	50 %	25 %	121583047
507	NC_008758	AGC	2	6	32087	32092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583047
508	NC_008758	AAG	2	6	32117	32122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583047
509	NC_008758	GCA	2	6	33246	33251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583048
510	NC_008758	GCT	2	6	33416	33421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583048
511	NC_008758	GGCAAT	2	12	33430	33441	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	121583048
512	NC_008758	CAG	2	6	33489	33494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583048
513	NC_008758	GTT	2	6	33578	33583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583048
514	NC_008758	CAA	2	6	33594	33599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583048
515	NC_008758	TG	3	6	33617	33622	0 %	50 %	50 %	0 %	121583048
516	NC_008758	CTT	2	6	33636	33641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583048
517	NC_008758	GTT	2	6	33730	33735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583048
518	NC_008758	AAC	2	6	33746	33751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583048
519	NC_008758	TG	3	6	33762	33767	0 %	50 %	50 %	0 %	121583048
520	NC_008758	CCA	2	6	33806	33811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583048
521	NC_008758	TGCCGG	2	12	33850	33861	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	121583048
522	NC_008758	TGCG	2	8	33927	33934	0 %	25 %	50 %	25 %	121583048
523	NC_008758	AGG	2	6	34045	34050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583048
524	NC_008758	TCTT	2	8	34354	34361	0 %	75 %	0 %	25 %	121583049
525	NC_008758	TCA	2	6	34370	34375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583049
526	NC_008758	TCA	2	6	34384	34389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583049
527	NC_008758	TCT	2	6	34447	34452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583049
528	NC_008758	AAG	2	6	34542	34547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583049
529	NC_008758	TATT	2	8	34606	34613	25 %	75 %	0 %	0 %	121583049
530	NC_008758	AAG	2	6	34790	34795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583049
531	NC_008758	ACC	2	6	34812	34817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583049
532	NC_008758	ATAG	2	8	36231	36238	50 %	25 %	25 %	0 %	121583050
533	NC_008758	GTG	2	6	36241	36246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583050
534	NC_008758	CCGCTC	2	12	36360	36371	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	121583050
535	NC_008758	CAG	2	6	36477	36482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583050
536	NC_008758	GC	3	6	36483	36488	0 %	0 %	50 %	50 %	121583050
537	NC_008758	GCG	2	6	36494	36499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583050
538	NC_008758	CACC	2	8	36612	36619	25 %	0 %	0 %	75 %	121583050
539	NC_008758	AAG	2	6	36657	36662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583050
540	NC_008758	GC	3	6	36718	36723	0 %	0 %	50 %	50 %	121583050
541	NC_008758	GCA	2	6	36755	36760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583050
542	NC_008758	CGC	2	6	36771	36776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583050
543	NC_008758	TCT	2	6	36803	36808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583050
544	NC_008758	AG	3	6	36858	36863	50 %	0 %	50 %	0 %	121583050
545	NC_008758	GAT	2	6	36900	36905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583050
546	NC_008758	AGCGCG	2	12	36978	36989	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	121583050
547	NC_008758	CAGCG	2	10	36997	37006	20 %	0 %	40 %	40 %	121583050
548	NC_008758	TGC	2	6	37012	37017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583050
549	NC_008758	CGC	2	6	37034	37039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583050
550	NC_008758	C	6	6	37070	37075	0 %	0 %	0 %	100 %	121583050
551	NC_008758	CAG	2	6	37200	37205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583050
552	NC_008758	GCA	2	6	37211	37216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583050
553	NC_008758	CCA	2	6	37238	37243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583050
554	NC_008758	GGT	2	6	37345	37350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583050
555	NC_008758	CG	3	6	37358	37363	0 %	0 %	50 %	50 %	121583050
556	NC_008758	CTG	2	6	37415	37420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583050
557	NC_008758	GCCC	2	8	37439	37446	0 %	0 %	25 %	75 %	121583050
558	NC_008758	GGCC	2	8	37484	37491	0 %	0 %	50 %	50 %	121583050
559	NC_008758	CGG	2	6	37559	37564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583050
560	NC_008758	GCG	2	6	37578	37583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583050
561	NC_008758	TGC	3	9	37699	37707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583050
562	NC_008758	CCA	2	6	37763	37768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583050
563	NC_008758	GC	3	6	37804	37809	0 %	0 %	50 %	50 %	121583050
564	NC_008758	GTG	2	6	37827	37832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583050
565	NC_008758	GC	3	6	37912	37917	0 %	0 %	50 %	50 %	121583050
566	NC_008758	GTG	2	6	37929	37934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583050
567	NC_008758	GGC	2	6	37943	37948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583050
568	NC_008758	TTGC	2	8	37967	37974	0 %	50 %	25 %	25 %	121583050
569	NC_008758	AGG	2	6	37988	37993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583050
570	NC_008758	ACC	2	6	39941	39946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583051
571	NC_008758	CCA	2	6	39950	39955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583051
572	NC_008758	CTGG	2	8	40002	40009	0 %	25 %	50 %	25 %	121583051
573	NC_008758	TCG	2	6	40010	40015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583051
574	NC_008758	CG	3	6	40048	40053	0 %	0 %	50 %	50 %	121583051
575	NC_008758	GAT	2	6	40093	40098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583051
576	NC_008758	CAC	2	6	40132	40137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583051
577	NC_008758	GCA	2	6	40194	40199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583051
578	NC_008758	CCA	2	6	40210	40215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583051
579	NC_008758	GCC	3	9	40386	40394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583051
580	NC_008758	GAT	2	6	40402	40407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583051
581	NC_008758	T	7	7	40407	40413	0 %	100 %	0 %	0 %	121583051
582	NC_008758	GCG	2	6	40482	40487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583051
583	NC_008758	TCATG	2	10	40491	40500	20 %	40 %	20 %	20 %	121583051
584	NC_008758	GGC	2	6	40510	40515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583051
585	NC_008758	TGA	2	6	40593	40598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583051
586	NC_008758	GCT	2	6	40612	40617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583051
587	NC_008758	GAT	2	6	40668	40673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583051
588	NC_008758	CGA	2	6	40689	40694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583051
589	NC_008758	GTGC	2	8	40709	40716	0 %	25 %	50 %	25 %	121583051
590	NC_008758	GCC	2	6	40736	40741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583051
591	NC_008758	GGT	2	6	40744	40749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583051
592	NC_008758	CGA	2	6	40794	40799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583051
593	NC_008758	AGC	2	6	40829	40834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583051
594	NC_008758	TGCTT	2	10	40866	40875	0 %	60 %	20 %	20 %	121583051
595	NC_008758	ATG	2	6	41366	41371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583052
596	NC_008758	TGCCGC	8	48	41431	41478	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	121583052
597	NC_008758	GTT	2	6	41557	41562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583052
598	NC_008758	TGC	2	6	43697	43702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583053
599	NC_008758	TGG	2	6	43859	43864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583053
600	NC_008758	CCG	2	6	43966	43971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583053
601	NC_008758	CAC	2	6	44038	44043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583053
602	NC_008758	GC	3	6	44046	44051	0 %	0 %	50 %	50 %	121583053
603	NC_008758	ATCG	2	8	44052	44059	25 %	25 %	25 %	25 %	121583053
604	NC_008758	CAGGGC	2	12	44121	44132	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	121583053
605	NC_008758	GCA	2	6	44186	44191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583053
606	NC_008758	CAC	2	6	44235	44240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583053
607	NC_008758	CGA	2	6	44342	44347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583053
608	NC_008758	TGG	2	6	44348	44353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583053
609	NC_008758	GTC	2	6	44361	44366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583053
610	NC_008758	GCC	2	6	44437	44442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583053
611	NC_008758	CG	3	6	44545	44550	0 %	0 %	50 %	50 %	121583053
612	NC_008758	CGG	2	6	44570	44575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583053
613	NC_008758	GCGG	2	8	44664	44671	0 %	0 %	75 %	25 %	121583053
614	NC_008758	ATC	2	6	44695	44700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583053
615	NC_008758	CGG	2	6	44757	44762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583053
616	NC_008758	AAT	2	6	44766	44771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121583053
617	NC_008758	AG	3	6	44883	44888	50 %	0 %	50 %	0 %	121583053
618	NC_008758	CG	4	8	44911	44918	0 %	0 %	50 %	50 %	121583053
619	NC_008758	GAAGG	2	10	44931	44940	40 %	0 %	60 %	0 %	121583053
620	NC_008758	CACGCG	2	12	44952	44963	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	121583053
621	NC_008758	AGC	2	6	44977	44982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583053
622	NC_008758	GC	3	6	44990	44995	0 %	0 %	50 %	50 %	121583053
623	NC_008758	CAT	2	6	45051	45056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583053
624	NC_008758	GCGCC	2	10	45108	45117	0 %	0 %	40 %	60 %	121583053
625	NC_008758	CCA	2	6	45140	45145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583053
626	NC_008758	CGC	2	6	45150	45155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583053
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628	NC_008758	CAC	2	6	45240	45245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583053
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