MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Pyrobaculum islandicum DSM 4184 chromosome

Total Repeats: 526

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008701	GTGAGG	2	12	1636	1647	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	119871521
2	NC_008701	CTCCAC	2	12	4046	4057	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	119871524
3	NC_008701	CCAATC	2	12	4394	4405	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	119871524
4	NC_008701	AAGGAG	2	12	6970	6981	50 %	0 %	50 %	0 %	119871528
5	NC_008701	AGAGCG	2	12	11812	11823	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	119871534
6	NC_008701	GGTAGA	2	12	11867	11878	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	119871534
7	NC_008701	TGAGGT	2	12	12931	12942	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	119871535
8	NC_008701	CATTTT	2	12	16538	16549	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	119871539
9	NC_008701	CATATT	2	12	16625	16636	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	119871539
10	NC_008701	TTACAT	2	12	17059	17070	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	119871539
11	NC_008701	ACGCCT	2	12	17771	17782	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119871540
12	NC_008701	GGAGCC	2	12	18711	18722	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119871541
13	NC_008701	GGGGGA	2	12	19038	19049	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	119871541
14	NC_008701	GCCGAG	2	12	22296	22307	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119871544
15	NC_008701	CAGACG	2	12	22874	22885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119871545
16	NC_008701	CTCTCC	2	12	23146	23157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119871545
17	NC_008701	ATGGCG	2	12	26587	26598	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119871549
18	NC_008701	GCCCAT	2	12	26751	26762	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119871549
19	NC_008701	CCCCAG	2	12	33004	33015	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119871556
20	NC_008701	GGGGAG	2	12	40066	40077	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	119871564
21	NC_008701	AGCCAC	2	12	48919	48930	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119871574
22	NC_008701	CCCAAG	2	12	50315	50326	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119871575
23	NC_008701	ATAGCC	2	12	52651	52662	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119871577
24	NC_008701	GGCGGG	2	12	54246	54257	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	119871579
25	NC_008701	GAGGTG	2	12	55829	55840	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	119871580
26	NC_008701	GCAGAT	2	12	64801	64812	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119871589
27	NC_008701	GCTGTG	2	12	66904	66915	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119871592
28	NC_008701	TGTCAC	2	12	67730	67741	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119871593
29	NC_008701	CGTGGT	2	12	68575	68586	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119871593
30	NC_008701	AGTCGG	2	12	70005	70016	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119871594
31	NC_008701	GTAGGC	2	12	72514	72525	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119871596
32	NC_008701	AAGCCC	2	12	75694	75705	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119871598
33	NC_008701	GGTAGC	2	12	79341	79352	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119871601
34	NC_008701	CACCTC	2	12	79438	79449	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	119871601
35	NC_008701	AGGGCG	2	12	80382	80393	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	119871603
36	NC_008701	CAAGAT	2	12	80703	80714	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	119871604
37	NC_008701	TAGAGA	2	12	88174	88185	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	119871613
38	NC_008701	ATAGAT	2	12	98157	98168	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	119871621
39	NC_008701	TTGTGA	2	12	98270	98281	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	119871622
40	NC_008701	ACCAAC	2	12	100666	100677	50 %	0 %	0 %	50 %	119871624
41	NC_008701	GCCATT	2	12	101581	101592	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119871625
42	NC_008701	GTAAAT	2	12	104495	104506	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	119871629
43	NC_008701	GCCCTT	2	12	106918	106929	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119871632
44	NC_008701	AAAAGA	2	12	112814	112825	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	119871638
45	NC_008701	TATGGC	2	12	116217	116228	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119871643
46	NC_008701	CTACAT	2	12	122123	122134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119871650
47	NC_008701	TCCCTC	2	12	130835	130846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119871657
48	NC_008701	CTCTAC	2	12	132256	132267	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	119871659
49	NC_008701	CCTAAG	2	12	135535	135546	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119871661
50	NC_008701	ACAAAG	2	12	135861	135872	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	119871662
51	NC_008701	TGTGGG	2	12	136950	136961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119871663
52	NC_008701	CAACCT	2	12	147652	147663	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	119871672
53	NC_008701	TATTGC	2	12	171945	171956	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	119871696
54	NC_008701	CCTACA	2	12	172580	172591	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	119871696
55	NC_008701	GGCCGC	2	12	175411	175422	0 %	0 %	50 %	50 %	119871698
56	NC_008701	AGGGCG	2	12	176791	176802	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	119871700
57	NC_008701	GCCCCA	2	12	176864	176875	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119871700
58	NC_008701	GAACTA	2	12	178957	178968	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	119871703
59	NC_008701	ATAAAC	2	12	179497	179508	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	119871704
60	NC_008701	CGCCGG	2	12	190439	190450	0 %	0 %	50 %	50 %	119871718
61	NC_008701	GCTTCA	2	12	192373	192384	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119871720
62	NC_008701	ACCGCC	2	12	202281	202292	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119871733
63	NC_008701	GAGGTA	2	12	202517	202528	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	119871733
64	NC_008701	CCCCGC	2	12	202718	202729	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	119871733
65	NC_008701	GCTGAG	2	12	209685	209696	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119871740
66	NC_008701	ATCAGT	2	12	209968	209979	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	119871740
67	NC_008701	TCCAGC	2	12	211042	211053	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119871741
68	NC_008701	CCTCCA	2	12	212359	212370	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	119871743
69	NC_008701	GCCTCT	2	12	219548	219559	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119871745
70	NC_008701	GCCTCT	2	12	219690	219701	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119871746
71	NC_008701	TGGGGC	2	12	230556	230567	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119871751
72	NC_008701	TAGACA	2	12	234235	234246	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	119871755
73	NC_008701	ATAGAG	2	12	238868	238879	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	119871761
74	NC_008701	AGACCG	2	12	246322	246333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119871766
75	NC_008701	ACGAAA	2	12	250374	250385	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	119871770
76	NC_008701	GCTTAT	2	12	250405	250416	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	119871770
77	NC_008701	TATGGT	2	12	252884	252895	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	119871774
78	NC_008701	AGGCCA	2	12	256340	256351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119871777
79	NC_008701	TTCATC	2	12	257790	257801	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	119871777
80	NC_008701	TTATCT	2	12	262519	262530	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	119871780
81	NC_008701	TGTGGG	2	12	263227	263238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119871781
82	NC_008701	GCCTCG	2	12	265296	265307	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119871781
83	NC_008701	ACCTCT	2	12	267879	267890	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	119871783
84	NC_008701	GCCCTA	2	12	281501	281512	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119871796
85	NC_008701	AGAGCC	2	12	281675	281686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119871796
86	NC_008701	CGTCTG	2	12	290750	290761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119871806
87	NC_008701	TTACTT	2	12	294211	294222	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	119871810
88	NC_008701	CGCCAC	2	12	298962	298973	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119871814
89	NC_008701	CCCTTG	2	12	307902	307913	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119871822
90	NC_008701	AGAGCT	2	12	311117	311128	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119871826
91	NC_008701	TTTTGA	2	12	313093	313104	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	119871827
92	NC_008701	ATATAG	2	12	313245	313256	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	119871827
93	NC_008701	TAACAG	2	12	317543	317554	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	119871832
94	NC_008701	GCTATG	2	12	317593	317604	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119871832
95	NC_008701	GGCTAT	2	12	318081	318092	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119871832
96	NC_008701	ACCTTC	2	12	318175	318186	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	119871832
97	NC_008701	TCGACT	2	12	324293	324304	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119871838
98	NC_008701	TCGCCT	2	12	336265	336276	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119871852
99	NC_008701	CGCCAA	2	12	336631	336642	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119871853
100	NC_008701	GTCGTA	2	12	337369	337380	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119871854
101	NC_008701	AACACC	2	12	343662	343673	50 %	0 %	0 %	50 %	119871861
102	NC_008701	GCCACA	2	12	346817	346828	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119871865
103	NC_008701	TGTATA	2	12	347611	347622	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	119871865
104	NC_008701	TCGGCC	2	12	353079	353090	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119871873
105	NC_008701	CAAAGG	2	12	356925	356936	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	119871879
106	NC_008701	CTCCGT	2	12	358367	358378	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119871883
107	NC_008701	TCTGGA	2	12	362927	362938	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119871888
108	NC_008701	TAGAGA	2	12	367946	367957	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	119871894
109	NC_008701	CTCTTA	2	12	375136	375147	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	119871903
110	NC_008701	AGGCCG	2	12	378272	378283	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119871906
111	NC_008701	GTATAG	2	12	380133	380144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119871907
112	NC_008701	CAGACT	2	12	380557	380568	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119871908
113	NC_008701	AGGCGG	2	12	387399	387410	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	119871916
114	NC_008701	GGCCTT	2	12	389230	389241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119871917
115	NC_008701	TACTTA	2	12	391949	391960	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	119871919
116	NC_008701	GCCAGG	2	12	400072	400083	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119871925
117	NC_008701	TAGCGT	2	12	405379	405390	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119871935
118	NC_008701	GCCTCA	2	12	408402	408413	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119871937
119	NC_008701	GTGGCT	2	12	410154	410165	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119871939
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230	NC_008701	CGGCGC	2	12	809135	809146	0 %	0 %	50 %	50 %	119872420
231	NC_008701	ATGCCT	2	12	810273	810284	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119872422
232	NC_008701	AGTTGG	2	12	813126	813137	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	119872425
233	NC_008701	CAGCCG	2	12	815300	815311	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119872425
234	NC_008701	AGCCTC	2	12	819573	819584	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119872431
235	NC_008701	TTTCTA	2	12	823011	823022	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	119872435
236	NC_008701	TTCAAA	2	12	828733	828744	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	119872444
237	NC_008701	GCCGGC	2	12	834557	834568	0 %	0 %	50 %	50 %	119872450
238	NC_008701	TACATC	2	12	837474	837485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119872453
239	NC_008701	ATCTAG	2	12	838327	838338	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	119872453
240	NC_008701	TGAGCT	2	12	839762	839773	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119872455
241	NC_008701	ACGCCT	2	12	845041	845052	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119872464
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244	NC_008701	TCTCTA	2	12	852950	852961	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	119872471
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251	NC_008701	CTAGGC	2	12	878069	878080	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119872492
252	NC_008701	AGTAGC	2	12	878550	878561	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119872492
253	NC_008701	TAGAGC	2	12	889896	889907	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119872502
254	NC_008701	TTACAA	2	12	890630	890641	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	119872502
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256	NC_008701	GAGCTA	2	12	893385	893396	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119872504
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259	NC_008701	GAGGTG	2	12	904146	904157	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	119872516
260	NC_008701	TGGAAA	2	12	905225	905236	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	119872518
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302	NC_008701	AGGTGG	2	12	1057940	1057951	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	119872671
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338	NC_008701	GACGTA	2	12	1175204	1175215	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119872796
339	NC_008701	GTAGTT	2	12	1175441	1175452	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	119872796
340	NC_008701	CTGCAA	2	12	1176047	1176058	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119872797
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342	NC_008701	TGGAAA	2	12	1193163	1193174	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	119872815
343	NC_008701	CCGAGA	2	12	1194564	1194575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119872818
344	NC_008701	GCCTCC	2	12	1195071	1195082	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	119872819
345	NC_008701	TTAGAG	2	12	1200433	1200444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119872824
346	NC_008701	GGCCTT	2	12	1206002	1206013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119872830
347	NC_008701	GTGTAA	2	12	1207395	1207406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119872831
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349	NC_008701	TCATGC	2	12	1214562	1214573	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119872838
350	NC_008701	CTACGT	2	12	1229404	1229415	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119872849
351	NC_008701	CCTTCG	2	12	1230032	1230043	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119872850
352	NC_008701	GGGCTG	2	12	1231386	1231397	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119872851
353	NC_008701	ATAGCG	2	12	1231647	1231658	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119872851
354	NC_008701	CGCCAT	2	12	1231679	1231690	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119872851
355	NC_008701	TTCGGC	2	12	1231995	1232006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119872851
356	NC_008701	GCCCTC	2	12	1234930	1234941	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	119872855
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360	NC_008701	GTCTAG	2	12	1250157	1250168	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119872874
361	NC_008701	CGTCGA	2	12	1251013	1251024	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119872875
362	NC_008701	TACAAG	2	12	1261528	1261539	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	119872887
363	NC_008701	CTCGCC	2	12	1264313	1264324	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	119872890
364	NC_008701	ACCTAT	2	12	1266020	1266031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119872893
365	NC_008701	GGGCCG	2	12	1273138	1273149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119872899
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450	NC_008701	AAGGAG	2	12	1534476	1534487	50 %	0 %	50 %	0 %	119873181
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452	NC_008701	TAGGTA	2	12	1541219	1541230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119873190
453	NC_008701	AAAAGA	2	12	1543168	1543179	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	119873192
454	NC_008701	CTGGGC	2	12	1554097	1554108	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119873205
455	NC_008701	TTGTCG	2	12	1556190	1556201	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	119873207
456	NC_008701	GTGACA	2	12	1562612	1562623	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119873211
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